MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 chromosome

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014153	CTCG	2	8	1164	1171	0 %	25 %	25 %	50 %	296134505
2	NC_014153	GTCG	2	8	1605	1612	0 %	25 %	50 %	25 %	296134505
3	NC_014153	CAAC	2	8	1845	1852	50 %	0 %	0 %	50 %	296134505
4	NC_014153	AGAA	2	8	2131	2138	75 %	0 %	25 %	0 %	296134506
5	NC_014153	CGAC	2	8	2508	2515	25 %	0 %	25 %	50 %	296134506
6	NC_014153	TCCT	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	296134507
7	NC_014153	CACC	2	8	4277	4284	25 %	0 %	0 %	75 %	296134507
8	NC_014153	CGAC	2	8	4534	4541	25 %	0 %	25 %	50 %	296134507
9	NC_014153	CAAG	2	8	4736	4743	50 %	0 %	25 %	25 %	296134507
10	NC_014153	TCGC	2	8	5188	5195	0 %	25 %	25 %	50 %	296134507
11	NC_014153	CCGA	2	8	5755	5762	25 %	0 %	25 %	50 %	296134507
12	NC_014153	GCGG	2	8	5828	5835	0 %	0 %	75 %	25 %	296134507
13	NC_014153	GCTG	2	8	6242	6249	0 %	25 %	50 %	25 %	296134508
14	NC_014153	GCGA	2	8	6504	6511	25 %	0 %	50 %	25 %	296134508
15	NC_014153	CCTG	2	8	6762	6769	0 %	25 %	25 %	50 %	296134508
16	NC_014153	CGAG	2	8	7013	7020	25 %	0 %	50 %	25 %	296134508
17	NC_014153	AGCC	2	8	7976	7983	25 %	0 %	25 %	50 %	296134508
18	NC_014153	CCCG	2	8	8331	8338	0 %	0 %	25 %	75 %	296134509
19	NC_014153	TGCG	2	8	8567	8574	0 %	25 %	50 %	25 %	296134509
20	NC_014153	GTGC	2	8	8695	8702	0 %	25 %	50 %	25 %	296134509
21	NC_014153	CAGC	2	8	9682	9689	25 %	0 %	25 %	50 %	296134509
22	NC_014153	CTGG	2	8	10105	10112	0 %	25 %	50 %	25 %	296134509
23	NC_014153	ACCG	2	8	10169	10176	25 %	0 %	25 %	50 %	296134509
24	NC_014153	ATTC	2	8	10753	10760	25 %	50 %	0 %	25 %	296134509
25	NC_014153	TCAG	2	8	11063	11070	25 %	25 %	25 %	25 %	296134510
26	NC_014153	CCGA	2	8	11140	11147	25 %	0 %	25 %	50 %	296134510
27	NC_014153	ATCT	2	8	11161	11168	25 %	50 %	0 %	25 %	296134510
28	NC_014153	GGCG	2	8	11262	11269	0 %	0 %	75 %	25 %	296134510
29	NC_014153	GAAA	2	8	12244	12251	75 %	0 %	25 %	0 %	296134511
30	NC_014153	CGCC	2	8	12592	12599	0 %	0 %	25 %	75 %	296134511
31	NC_014153	TGGT	2	8	12834	12841	0 %	50 %	50 %	0 %	296134511
32	NC_014153	ACCA	2	8	14133	14140	50 %	0 %	0 %	50 %	296134512
33	NC_014153	CGCC	2	8	14569	14576	0 %	0 %	25 %	75 %	296134512
34	NC_014153	GCCC	2	8	15065	15072	0 %	0 %	25 %	75 %	296134512
35	NC_014153	GCTG	2	8	15172	15179	0 %	25 %	50 %	25 %	296134513
36	NC_014153	CTGG	2	8	15643	15650	0 %	25 %	50 %	25 %	296134513
37	NC_014153	CTTC	2	8	16328	16335	0 %	50 %	0 %	50 %	296134516
38	NC_014153	CAGC	2	8	16671	16678	25 %	0 %	25 %	50 %	296134516
39	NC_014153	GGCC	2	8	16916	16923	0 %	0 %	50 %	50 %	296134516
40	NC_014153	CTTG	2	8	17563	17570	0 %	50 %	25 %	25 %	296134517
41	NC_014153	AGCC	2	8	17736	17743	25 %	0 %	25 %	50 %	296134517
42	NC_014153	GCTC	2	8	18235	18242	0 %	25 %	25 %	50 %	296134517
43	NC_014153	CGGA	2	8	19666	19673	25 %	0 %	50 %	25 %	296134518
44	NC_014153	TGAA	2	8	19782	19789	50 %	25 %	25 %	0 %	296134518
45	NC_014153	TGAA	2	8	20287	20294	50 %	25 %	25 %	0 %	296134519
46	NC_014153	CAGC	2	8	21071	21078	25 %	0 %	25 %	50 %	296134520
47	NC_014153	GCTG	2	8	21256	21263	0 %	25 %	50 %	25 %	296134520
48	NC_014153	CGGT	2	8	21375	21382	0 %	25 %	50 %	25 %	296134520
49	NC_014153	CAGC	2	8	22022	22029	25 %	0 %	25 %	50 %	296134521
50	NC_014153	CCGG	2	8	22308	22315	0 %	0 %	50 %	50 %	296134521
51	NC_014153	GCAG	2	8	22519	22526	25 %	0 %	50 %	25 %	296134521
52	NC_014153	AAAC	2	8	22840	22847	75 %	0 %	0 %	25 %	296134521
53	NC_014153	CTGG	2	8	23289	23296	0 %	25 %	50 %	25 %	296134522
54	NC_014153	TGCC	2	8	23508	23515	0 %	25 %	25 %	50 %	296134522
55	NC_014153	GCGG	2	8	23934	23941	0 %	0 %	75 %	25 %	296134523
56	NC_014153	CGGC	2	8	25392	25399	0 %	0 %	50 %	50 %	296134524
57	NC_014153	ATCG	2	8	25544	25551	25 %	25 %	25 %	25 %	296134524
58	NC_014153	GTCG	2	8	25630	25637	0 %	25 %	50 %	25 %	296134524
59	NC_014153	TGGG	2	8	25664	25671	0 %	25 %	75 %	0 %	296134524
60	NC_014153	CGCC	2	8	25960	25967	0 %	0 %	25 %	75 %	296134524
61	NC_014153	TGGA	2	8	26441	26448	25 %	25 %	50 %	0 %	296134524
62	NC_014153	GCAC	2	8	26748	26755	25 %	0 %	25 %	50 %	296134524
63	NC_014153	GCCG	2	8	29097	29104	0 %	0 %	50 %	50 %	296134526
64	NC_014153	CCTT	2	8	29756	29763	0 %	50 %	0 %	50 %	296134526
65	NC_014153	CCAT	2	8	30481	30488	25 %	25 %	0 %	50 %	296134527
66	NC_014153	GGCG	2	8	30519	30526	0 %	0 %	75 %	25 %	296134527
67	NC_014153	GCGT	2	8	30664	30671	0 %	25 %	50 %	25 %	296134527
68	NC_014153	CGCC	2	8	31683	31690	0 %	0 %	25 %	75 %	296134529
69	NC_014153	CCAG	2	8	32070	32077	25 %	0 %	25 %	50 %	296134529
70	NC_014153	CGCA	2	8	32447	32454	25 %	0 %	25 %	50 %	296134529
71	NC_014153	CTGG	2	8	32946	32953	0 %	25 %	50 %	25 %	296134530
72	NC_014153	ACCG	2	8	33442	33449	25 %	0 %	25 %	50 %	296134530
73	NC_014153	CCGC	2	8	33602	33609	0 %	0 %	25 %	75 %	296134530
74	NC_014153	GGCC	2	8	34332	34339	0 %	0 %	50 %	50 %	296134531
75	NC_014153	CACG	2	8	34532	34539	25 %	0 %	25 %	50 %	296134532
76	NC_014153	CAAG	2	8	35221	35228	50 %	0 %	25 %	25 %	296134533
77	NC_014153	CACG	2	8	35335	35342	25 %	0 %	25 %	50 %	296134533
78	NC_014153	ACCA	2	8	35648	35655	50 %	0 %	0 %	50 %	296134533
79	NC_014153	GGCG	2	8	36200	36207	0 %	0 %	75 %	25 %	296134534
80	NC_014153	CCCT	2	8	37306	37313	0 %	25 %	0 %	75 %	296134535
81	NC_014153	AAGC	2	8	37329	37336	50 %	0 %	25 %	25 %	296134535
82	NC_014153	GGAC	2	8	39373	39380	25 %	0 %	50 %	25 %	296134539
83	NC_014153	GCGT	2	8	39428	39435	0 %	25 %	50 %	25 %	296134539
84	NC_014153	GCGG	2	8	39504	39511	0 %	0 %	75 %	25 %	296134539
85	NC_014153	CGCC	2	8	39551	39558	0 %	0 %	25 %	75 %	296134539
86	NC_014153	CAGG	2	8	39585	39592	25 %	0 %	50 %	25 %	296134539
87	NC_014153	GACT	2	8	39749	39756	25 %	25 %	25 %	25 %	296134539
88	NC_014153	AGCG	2	8	42928	42935	25 %	0 %	50 %	25 %	296134543
89	NC_014153	CGGG	2	8	44244	44251	0 %	0 %	75 %	25 %	296134546
90	NC_014153	CCCG	2	8	44432	44439	0 %	0 %	25 %	75 %	296134546
91	NC_014153	GGCG	2	8	44549	44556	0 %	0 %	75 %	25 %	296134546
92	NC_014153	TGCG	2	8	44704	44711	0 %	25 %	50 %	25 %	296134546
93	NC_014153	AGCC	2	8	44911	44918	25 %	0 %	25 %	50 %	296134546
94	NC_014153	GCCA	2	8	45121	45128	25 %	0 %	25 %	50 %	296134546
95	NC_014153	CCAC	2	8	45229	45236	25 %	0 %	0 %	75 %	296134546
96	NC_014153	CGGC	2	8	45635	45642	0 %	0 %	50 %	50 %	296134546
97	NC_014153	GGCG	2	8	45945	45952	0 %	0 %	75 %	25 %	296134546
98	NC_014153	TGCG	2	8	46365	46372	0 %	25 %	50 %	25 %	296134547
99	NC_014153	CCGC	2	8	46517	46524	0 %	0 %	25 %	75 %	296134547
100	NC_014153	GCTG	2	8	46545	46552	0 %	25 %	50 %	25 %	296134547
101	NC_014153	TGGG	2	8	46661	46668	0 %	25 %	75 %	0 %	296134547
102	NC_014153	CGGT	2	8	47058	47065	0 %	25 %	50 %	25 %	296134548
103	NC_014153	TGGT	2	8	47612	47619	0 %	50 %	50 %	0 %	296134549
104	NC_014153	CCGA	2	8	47864	47871	25 %	0 %	25 %	50 %	296134550
105	NC_014153	GCCA	2	8	48289	48296	25 %	0 %	25 %	50 %	296134550
106	NC_014153	GCCG	2	8	48949	48956	0 %	0 %	50 %	50 %	296134550
107	NC_014153	CGGG	2	8	49525	49532	0 %	0 %	75 %	25 %	296134551
108	NC_014153	GTTT	2	8	49647	49654	0 %	75 %	25 %	0 %	296134552
109	NC_014153	AGCG	2	8	50185	50192	25 %	0 %	50 %	25 %	296134553
110	NC_014153	GAGC	2	8	50421	50428	25 %	0 %	50 %	25 %	296134553
111	NC_014153	GGTG	2	8	51608	51615	0 %	25 %	75 %	0 %	296134555
112	NC_014153	GAAC	2	8	51801	51808	50 %	0 %	25 %	25 %	296134555
113	NC_014153	GCTT	2	8	52075	52082	0 %	50 %	25 %	25 %	296134555
114	NC_014153	TCGG	2	8	52828	52835	0 %	25 %	50 %	25 %	296134556
115	NC_014153	GCTG	2	8	53791	53798	0 %	25 %	50 %	25 %	296134557
116	NC_014153	CAGA	2	8	53822	53829	50 %	0 %	25 %	25 %	296134557
117	NC_014153	CGCC	2	8	55555	55562	0 %	0 %	25 %	75 %	296134559
118	NC_014153	CAGC	2	8	56932	56939	25 %	0 %	25 %	50 %	296134561
119	NC_014153	CGGG	2	8	57082	57089	0 %	0 %	75 %	25 %	296134561
120	NC_014153	GCTG	2	8	58254	58261	0 %	25 %	50 %	25 %	296134562
121	NC_014153	CGGC	2	8	59510	59517	0 %	0 %	50 %	50 %	296134563
122	NC_014153	CCCA	2	8	59753	59760	25 %	0 %	0 %	75 %	296134563
123	NC_014153	GCGG	2	8	61617	61624	0 %	0 %	75 %	25 %	296134564
124	NC_014153	TTCA	2	8	61767	61774	25 %	50 %	0 %	25 %	296134564
125	NC_014153	GCGG	2	8	61906	61913	0 %	0 %	75 %	25 %	296134564
126	NC_014153	CAGC	2	8	62877	62884	25 %	0 %	25 %	50 %	296134564
127	NC_014153	GCGG	2	8	62921	62928	0 %	0 %	75 %	25 %	296134564
128	NC_014153	CTGG	2	8	63872	63879	0 %	25 %	50 %	25 %	296134566
129	NC_014153	GCCC	2	8	65402	65409	0 %	0 %	25 %	75 %	296134568
130	NC_014153	GGGC	2	8	66526	66533	0 %	0 %	75 %	25 %	296134568
131	NC_014153	GCCG	2	8	66769	66776	0 %	0 %	50 %	50 %	296134568
132	NC_014153	GGCT	2	8	66902	66909	0 %	25 %	50 %	25 %	296134568
133	NC_014153	TCCT	2	8	67781	67788	0 %	50 %	0 %	50 %	296134569
134	NC_014153	CCTG	2	8	68365	68372	0 %	25 %	25 %	50 %	296134569
135	NC_014153	TTTC	2	8	70561	70568	0 %	75 %	0 %	25 %	296134571
136	NC_014153	TTCG	2	8	71341	71348	0 %	50 %	25 %	25 %	296134571
137	NC_014153	GCGG	2	8	72439	72446	0 %	0 %	75 %	25 %	296134571
138	NC_014153	CACC	2	8	73271	73278	25 %	0 %	0 %	75 %	296134572
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