MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_014152	GCT	2	6	2038183	2038188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133467
33502	NC_014152	ATTA	2	8	2038196	2038203	50 %	50 %	0 %	0 %	296133467
33503	NC_014152	TTA	2	6	2038213	2038218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133467
33504	NC_014152	CAT	2	6	2038300	2038305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133468
33505	NC_014152	TCCAGA	2	12	2038322	2038333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296133468
33506	NC_014152	CAAA	2	8	2038348	2038355	75 %	0 %	0 %	25 %	296133468
33507	NC_014152	TAA	3	9	2038356	2038364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133468
33508	NC_014152	AT	3	6	2038368	2038373	50 %	50 %	0 %	0 %	296133468
33509	NC_014152	CTT	2	6	2038414	2038419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133468
33510	NC_014152	ATTT	2	8	2038441	2038448	25 %	75 %	0 %	0 %	296133468
33511	NC_014152	CTT	2	6	2038512	2038517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133468
33512	NC_014152	CTT	2	6	2038542	2038547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133468
33513	NC_014152	ATT	2	6	2038867	2038872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133469
33514	NC_014152	GGC	2	6	2038905	2038910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296133469
33515	NC_014152	TTG	2	6	2038946	2038951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296133469
33516	NC_014152	TGG	2	6	2039020	2039025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133469
33517	NC_014152	T	6	6	2039040	2039045	0 %	100 %	0 %	0 %	296133469
33518	NC_014152	CTG	2	6	2039092	2039097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133469
33519	NC_014152	CTGA	2	8	2039107	2039114	25 %	25 %	25 %	25 %	296133469
33520	NC_014152	ATC	2	6	2039116	2039121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133469
33521	NC_014152	GCC	2	6	2039173	2039178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296133469
33522	NC_014152	A	6	6	2039282	2039287	100 %	0 %	0 %	0 %	296133469
33523	NC_014152	T	6	6	2039318	2039323	0 %	100 %	0 %	0 %	296133469
33524	NC_014152	TTTAT	2	10	2039339	2039348	20 %	80 %	0 %	0 %	296133469
33525	NC_014152	ATCA	2	8	2039362	2039369	50 %	25 %	0 %	25 %	296133469
33526	NC_014152	GT	3	6	2039458	2039463	0 %	50 %	50 %	0 %	296133470
33527	NC_014152	ATG	2	6	2039495	2039500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133470
33528	NC_014152	A	6	6	2039501	2039506	100 %	0 %	0 %	0 %	296133470
33529	NC_014152	CAT	3	9	2039513	2039521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133470
33530	NC_014152	TCT	2	6	2039620	2039625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133470
33531	NC_014152	TA	3	6	2039798	2039803	50 %	50 %	0 %	0 %	296133470
33532	NC_014152	TGG	2	6	2039811	2039816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133470
33533	NC_014152	TCTG	2	8	2039817	2039824	0 %	50 %	25 %	25 %	296133470
33534	NC_014152	AAT	2	6	2039851	2039856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133470
33535	NC_014152	AGG	2	6	2039871	2039876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133470
33536	NC_014152	TTGA	2	8	2039922	2039929	25 %	50 %	25 %	0 %	296133470
33537	NC_014152	ATTT	2	8	2040560	2040567	25 %	75 %	0 %	0 %	296133471
33538	NC_014152	GAA	2	6	2040580	2040585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133471
33539	NC_014152	CAA	2	6	2040627	2040632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133471
33540	NC_014152	T	6	6	2040644	2040649	0 %	100 %	0 %	0 %	296133471
33541	NC_014152	TTA	2	6	2040680	2040685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133471
33542	NC_014152	TA	3	6	2040704	2040709	50 %	50 %	0 %	0 %	296133471
33543	NC_014152	GAC	2	6	2040757	2040762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133471
33544	NC_014152	A	6	6	2040873	2040878	100 %	0 %	0 %	0 %	296133471
33545	NC_014152	ATA	2	6	2040898	2040903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133471
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33547	NC_014152	ATC	2	6	2041058	2041063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133471
33548	NC_014152	AAT	2	6	2041137	2041142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133471
33549	NC_014152	TAC	2	6	2041162	2041167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133471
33550	NC_014152	CTG	2	6	2041168	2041173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133471
33551	NC_014152	A	6	6	2041216	2041221	100 %	0 %	0 %	0 %	296133472
33552	NC_014152	TGA	2	6	2041222	2041227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133472
33553	NC_014152	CAA	3	9	2041354	2041362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296133472
33554	NC_014152	ACTT	2	8	2041372	2041379	25 %	50 %	0 %	25 %	296133472
33555	NC_014152	ACC	2	6	2041406	2041411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296133472
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33558	NC_014152	CTT	2	6	2041807	2041812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296133473
33559	NC_014152	GAA	2	6	2041843	2041848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133473
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33561	NC_014152	GAA	2	6	2041990	2041995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133474
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33563	NC_014152	GCT	2	6	2042050	2042055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133474
33564	NC_014152	ATCA	2	8	2042117	2042124	50 %	25 %	0 %	25 %	296133474
33565	NC_014152	AAT	2	6	2042130	2042135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133474
33566	NC_014152	A	7	7	2042145	2042151	100 %	0 %	0 %	0 %	296133474
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33569	NC_014152	AGATGC	2	12	2042539	2042550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296133475
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33571	NC_014152	ATATT	2	10	2042665	2042674	40 %	60 %	0 %	0 %	296133475
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33585	NC_014152	GGAA	2	8	2043388	2043395	50 %	0 %	50 %	0 %	296133476
33586	NC_014152	GGT	2	6	2043456	2043461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296133476
33587	NC_014152	CGGG	2	8	2043491	2043498	0 %	0 %	75 %	25 %	296133476
33588	NC_014152	TTTTG	2	10	2043554	2043563	0 %	80 %	20 %	0 %	296133476
33589	NC_014152	TGC	2	6	2043632	2043637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133476
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33594	NC_014152	A	8	8	2043745	2043752	100 %	0 %	0 %	0 %	296133476
33595	NC_014152	AC	3	6	2043760	2043765	50 %	0 %	0 %	50 %	296133476
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33600	NC_014152	T	6	6	2044258	2044263	0 %	100 %	0 %	0 %	296133477
33601	NC_014152	ATT	2	6	2044385	2044390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296133477
33602	NC_014152	TC	3	6	2044405	2044410	0 %	50 %	0 %	50 %	296133477
33603	NC_014152	AT	3	6	2044548	2044553	50 %	50 %	0 %	0 %	296133478
33604	NC_014152	TCC	2	6	2044611	2044616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296133478
33605	NC_014152	TA	3	6	2044649	2044654	50 %	50 %	0 %	0 %	296133478
33606	NC_014152	A	6	6	2044687	2044692	100 %	0 %	0 %	0 %	296133478
33607	NC_014152	AGT	2	6	2044780	2044785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133478
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33610	NC_014152	AT	3	6	2045016	2045021	50 %	50 %	0 %	0 %	296133478
33611	NC_014152	GCA	2	6	2045032	2045037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133478
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33614	NC_014152	A	6	6	2045247	2045252	100 %	0 %	0 %	0 %	296133478
33615	NC_014152	ATA	2	6	2045307	2045312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133478
33616	NC_014152	GCAG	2	8	2045379	2045386	25 %	0 %	50 %	25 %	296133478
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33732	NC_014152	T	6	6	2053189	2053194	0 %	100 %	0 %	0 %	296133488
33733	NC_014152	CAG	2	6	2053308	2053313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296133489
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33970	NC_014152	TGA	2	6	2070939	2070944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296133502
33971	NC_014152	GGA	2	6	2070960	2070965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296133502
33972	NC_014152	T	6	6	2071131	2071136	0 %	100 %	0 %	0 %	296133502
33973	NC_014152	TCCG	2	8	2071157	2071164	0 %	25 %	25 %	50 %	296133502
33974	NC_014152	AAGCCC	2	12	2071166	2071177	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296133502
33975	NC_014152	TAC	2	6	2071197	2071202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133502
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33981	NC_014152	CTG	2	6	2071389	2071394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296133502
33982	NC_014152	GGTTT	2	10	2071491	2071500	0 %	60 %	40 %	0 %	296133502
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33992	NC_014152	AGA	2	6	2072306	2072311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296133503
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33996	NC_014152	AT	3	6	2072721	2072726	50 %	50 %	0 %	0 %	296133504
33997	NC_014152	AT	3	6	2072780	2072785	50 %	50 %	0 %	0 %	296133504
33998	NC_014152	ATC	2	6	2072836	2072841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296133504
33999	NC_014152	TCCA	2	8	2072848	2072855	25 %	25 %	0 %	50 %	296133504
34000	NC_014152	ATA	2	6	2073035	2073040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296133505

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