MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_014152	ATT	2	6	93032	93037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131635
1503	NC_014152	TAAG	2	8	93143	93150	50 %	25 %	25 %	0 %	296131636
1504	NC_014152	GAA	2	6	93202	93207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131636
1505	NC_014152	A	6	6	93337	93342	100 %	0 %	0 %	0 %	296131636
1506	NC_014152	TTC	2	6	93344	93349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131636
1507	NC_014152	GAA	2	6	93382	93387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131636
1508	NC_014152	GAGG	2	8	93404	93411	25 %	0 %	75 %	0 %	296131636
1509	NC_014152	GAA	2	6	93478	93483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131636
1510	NC_014152	CTT	2	6	93535	93540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131636
1511	NC_014152	GCA	2	6	93613	93618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131637
1512	NC_014152	TTG	2	6	93621	93626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131637
1513	NC_014152	TTAT	2	8	93688	93695	25 %	75 %	0 %	0 %	296131637
1514	NC_014152	GGAA	2	8	93717	93724	50 %	0 %	50 %	0 %	296131637
1515	NC_014152	T	7	7	93752	93758	0 %	100 %	0 %	0 %	296131637
1516	NC_014152	AG	3	6	93769	93774	50 %	0 %	50 %	0 %	296131637
1517	NC_014152	GCA	2	6	93792	93797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131637
1518	NC_014152	AGGA	2	8	93813	93820	50 %	0 %	50 %	0 %	296131637
1519	NC_014152	CAT	2	6	93838	93843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131637
1520	NC_014152	GGA	2	6	93997	94002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131637
1521	NC_014152	T	7	7	94020	94026	0 %	100 %	0 %	0 %	296131637
1522	NC_014152	TTA	2	6	94128	94133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131637
1523	NC_014152	TAA	2	6	94164	94169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131637
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1531	NC_014152	TAA	2	6	94580	94585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131637
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1534	NC_014152	CGG	2	6	94642	94647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131638
1535	NC_014152	AT	3	6	94653	94658	50 %	50 %	0 %	0 %	296131638
1536	NC_014152	GAC	2	6	94712	94717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131638
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1539	NC_014152	GAA	2	6	94764	94769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131638
1540	NC_014152	TGG	2	6	94915	94920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131638
1541	NC_014152	T	6	6	94954	94959	0 %	100 %	0 %	0 %	296131638
1542	NC_014152	CTG	2	6	94966	94971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131638
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1545	NC_014152	TGT	2	6	95106	95111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131638
1546	NC_014152	T	6	6	95117	95122	0 %	100 %	0 %	0 %	296131638
1547	NC_014152	CTA	2	6	95182	95187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131638
1548	NC_014152	GCGG	2	8	95203	95210	0 %	0 %	75 %	25 %	296131638
1549	NC_014152	TGC	2	6	95217	95222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131638
1550	NC_014152	ATG	2	6	95236	95241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131638
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1552	NC_014152	AGC	2	6	95368	95373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131638
1553	NC_014152	TGACC	2	10	95378	95387	20 %	20 %	20 %	40 %	296131638
1554	NC_014152	A	6	6	95438	95443	100 %	0 %	0 %	0 %	296131638
1555	NC_014152	GAA	2	6	95601	95606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131639
1556	NC_014152	A	6	6	95605	95610	100 %	0 %	0 %	0 %	296131639
1557	NC_014152	AGA	2	6	95663	95668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131639
1558	NC_014152	GGAA	2	8	95686	95693	50 %	0 %	50 %	0 %	296131639
1559	NC_014152	AAG	2	6	95722	95727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131639
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1561	NC_014152	ACA	2	6	95839	95844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131639
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1563	NC_014152	ATT	2	6	95971	95976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131640
1564	NC_014152	TTA	2	6	96016	96021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131640
1565	NC_014152	A	6	6	96040	96045	100 %	0 %	0 %	0 %	296131640
1566	NC_014152	TAC	2	6	96099	96104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131640
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1602	NC_014152	T	6	6	98658	98663	0 %	100 %	0 %	0 %	296131643
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1606	NC_014152	A	6	6	99108	99113	100 %	0 %	0 %	0 %	296131643
1607	NC_014152	GA	3	6	99165	99170	50 %	0 %	50 %	0 %	296131643
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1609	NC_014152	GAAAA	2	10	99197	99206	80 %	0 %	20 %	0 %	296131643
1610	NC_014152	GA	3	6	99266	99271	50 %	0 %	50 %	0 %	296131643
1611	NC_014152	A	6	6	99309	99314	100 %	0 %	0 %	0 %	296131643
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1622	NC_014152	GATT	2	8	100464	100471	25 %	50 %	25 %	0 %	296131644
1623	NC_014152	ATG	2	6	100529	100534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131644
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1752	NC_014152	AAC	2	6	111377	111382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131652
1753	NC_014152	GCT	2	6	111410	111415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131652
1754	NC_014152	GC	3	6	111423	111428	0 %	0 %	50 %	50 %	296131652
1755	NC_014152	TGA	2	6	111448	111453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131652
1756	NC_014152	A	8	8	111512	111519	100 %	0 %	0 %	0 %	296131652
1757	NC_014152	CTT	2	6	111523	111528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131652
1758	NC_014152	AT	3	6	111609	111614	50 %	50 %	0 %	0 %	296131652
1759	NC_014152	CTA	2	6	111621	111626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131652
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1761	NC_014152	GTT	2	6	111683	111688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131652
1762	NC_014152	G	6	6	111803	111808	0 %	0 %	100 %	0 %	296131652
1763	NC_014152	TAT	2	6	111859	111864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131652
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1765	NC_014152	TAA	2	6	111894	111899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131652
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1772	NC_014152	T	6	6	112241	112246	0 %	100 %	0 %	0 %	296131653
1773	NC_014152	A	7	7	112265	112271	100 %	0 %	0 %	0 %	296131653
1774	NC_014152	A	6	6	112282	112287	100 %	0 %	0 %	0 %	296131653
1775	NC_014152	TCG	2	6	112305	112310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131653
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1781	NC_014152	CTGG	2	8	112563	112570	0 %	25 %	50 %	25 %	296131653
1782	NC_014152	GAA	2	6	112601	112606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131653
1783	NC_014152	GAA	2	6	112628	112633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131653
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1787	NC_014152	CCGCCT	2	12	113434	113445	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296131655
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1790	NC_014152	CAT	2	6	113652	113657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131655
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1793	NC_014152	ACAGG	2	10	113824	113833	40 %	0 %	40 %	20 %	296131655
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1797	NC_014152	TTGGT	2	10	113969	113978	0 %	60 %	40 %	0 %	296131655
1798	NC_014152	AT	5	10	113984	113993	50 %	50 %	0 %	0 %	296131655
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1806	NC_014152	CTG	2	6	114638	114643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131656
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1810	NC_014152	GTTT	2	8	114851	114858	0 %	75 %	25 %	0 %	296131656
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1869	NC_014152	AT	3	6	117947	117952	50 %	50 %	0 %	0 %	296131658
1870	NC_014152	A	6	6	118035	118040	100 %	0 %	0 %	0 %	296131658
1871	NC_014152	TAA	2	6	118050	118055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131658
1872	NC_014152	TAT	2	6	118103	118108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131659
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1874	NC_014152	TGC	2	6	118119	118124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131659
1875	NC_014152	GCT	2	6	118149	118154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131659
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1877	NC_014152	A	7	7	118294	118300	100 %	0 %	0 %	0 %	296131659
1878	NC_014152	GC	3	6	118331	118336	0 %	0 %	50 %	50 %	296131659
1879	NC_014152	GCA	2	6	118341	118346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131659
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1883	NC_014152	TGT	2	6	118574	118579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131660
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1885	NC_014152	A	7	7	118619	118625	100 %	0 %	0 %	0 %	296131660
1886	NC_014152	TGT	2	6	118637	118642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131660
1887	NC_014152	TGG	2	6	118699	118704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131660
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1982	NC_014152	GAA	2	6	124002	124007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131664
1983	NC_014152	GT	3	6	124068	124073	0 %	50 %	50 %	0 %	296131664
1984	NC_014152	CAA	2	6	124437	124442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131665
1985	NC_014152	TCG	2	6	124486	124491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131665
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1987	NC_014152	ACCT	2	8	124845	124852	25 %	25 %	0 %	50 %	296131665
1988	NC_014152	TCA	2	6	124876	124881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131665
1989	NC_014152	CTG	2	6	124932	124937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131665
1990	NC_014152	A	6	6	124954	124959	100 %	0 %	0 %	0 %	296131665
1991	NC_014152	AAGGCC	2	12	124968	124979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131665
1992	NC_014152	AGG	2	6	124993	124998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131665
1993	NC_014152	GAA	3	9	125080	125088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131666
1994	NC_014152	CTG	2	6	125106	125111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131666
1995	NC_014152	ACAT	2	8	125141	125148	50 %	25 %	0 %	25 %	296131666
1996	NC_014152	GGC	2	6	125174	125179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131666
1997	NC_014152	CTG	2	6	125255	125260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131666
1998	NC_014152	GTG	2	6	125342	125347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131666
1999	NC_014152	CCG	2	6	125353	125358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131666
2000	NC_014152	TATG	2	8	125368	125375	25 %	50 %	25 %	0 %	296131666

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