MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014152	CTG	2	6	29398	29403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131574
502	NC_014152	TG	3	6	29410	29415	0 %	50 %	50 %	0 %	296131574
503	NC_014152	TAAA	2	8	29467	29474	75 %	25 %	0 %	0 %	296131574
504	NC_014152	AAG	2	6	29506	29511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131574
505	NC_014152	TCT	2	6	29522	29527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131574
506	NC_014152	TTC	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131574
507	NC_014152	GTT	2	6	29753	29758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131574
508	NC_014152	ACC	2	6	29767	29772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131574
509	NC_014152	ATGG	2	8	29871	29878	25 %	25 %	50 %	0 %	296131574
510	NC_014152	A	7	7	29930	29936	100 %	0 %	0 %	0 %	296131574
511	NC_014152	TA	3	6	30076	30081	50 %	50 %	0 %	0 %	296131574
512	NC_014152	TGC	2	6	30100	30105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131574
513	NC_014152	ATT	2	6	30269	30274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131574
514	NC_014152	TGA	2	6	30281	30286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131574
515	NC_014152	A	6	6	30312	30317	100 %	0 %	0 %	0 %	296131574
516	NC_014152	A	6	6	30347	30352	100 %	0 %	0 %	0 %	296131574
517	NC_014152	GAA	2	6	30402	30407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131574
518	NC_014152	AGA	2	6	30499	30504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131575
519	NC_014152	CAT	2	6	30522	30527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131575
520	NC_014152	GCC	2	6	30584	30589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131575
521	NC_014152	AGA	2	6	30607	30612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131575
522	NC_014152	AAT	2	6	30667	30672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131575
523	NC_014152	T	6	6	30709	30714	0 %	100 %	0 %	0 %	296131575
524	NC_014152	ATG	2	6	30794	30799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131575
525	NC_014152	GAC	2	6	30806	30811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131575
526	NC_014152	TTGAT	2	10	30891	30900	20 %	60 %	20 %	0 %	296131575
527	NC_014152	CGG	2	6	30904	30909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131575
528	NC_014152	ATG	2	6	31005	31010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131575
529	NC_014152	AGA	2	6	31039	31044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131575
530	NC_014152	AGA	2	6	31078	31083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131575
531	NC_014152	ATT	2	6	31115	31120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131575
532	NC_014152	TCAT	2	8	31146	31153	25 %	50 %	0 %	25 %	296131575
533	NC_014152	GCCG	2	8	31235	31242	0 %	0 %	50 %	50 %	296131575
534	NC_014152	CTA	2	6	31275	31280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131575
535	NC_014152	A	6	6	31374	31379	100 %	0 %	0 %	0 %	296131576
536	NC_014152	A	7	7	31402	31408	100 %	0 %	0 %	0 %	296131576
537	NC_014152	TTC	2	6	31434	31439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131576
538	NC_014152	CTT	2	6	31443	31448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131576
539	NC_014152	AACG	2	8	31545	31552	50 %	0 %	25 %	25 %	296131576
540	NC_014152	GGC	2	6	31583	31588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131576
541	NC_014152	ATT	2	6	31951	31956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131577
542	NC_014152	GTA	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131577
543	NC_014152	TGTT	2	8	32015	32022	0 %	75 %	25 %	0 %	296131577
544	NC_014152	TG	3	6	32036	32041	0 %	50 %	50 %	0 %	296131577
545	NC_014152	GCA	2	6	32053	32058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131577
546	NC_014152	GTAAAG	2	12	32105	32116	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296131577
547	NC_014152	ATG	3	9	32173	32181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131577
548	NC_014152	TTA	2	6	32201	32206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131577
549	NC_014152	GA	3	6	32250	32255	50 %	0 %	50 %	0 %	296131577
550	NC_014152	GCT	2	6	32286	32291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131577
551	NC_014152	AGCA	2	8	32336	32343	50 %	0 %	25 %	25 %	296131577
552	NC_014152	ATTG	2	8	32466	32473	25 %	50 %	25 %	0 %	296131577
553	NC_014152	TCTTT	2	10	32597	32606	0 %	80 %	0 %	20 %	296131578
554	NC_014152	CAG	2	6	32624	32629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131578
555	NC_014152	TTTC	2	8	32654	32661	0 %	75 %	0 %	25 %	296131578
556	NC_014152	CCG	2	6	32758	32763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131578
557	NC_014152	CCG	2	6	32860	32865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131578
558	NC_014152	ACT	2	6	32881	32886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131578
559	NC_014152	ATC	2	6	32938	32943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131578
560	NC_014152	CCT	2	6	32992	32997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131578
561	NC_014152	AT	3	6	33015	33020	50 %	50 %	0 %	0 %	296131578
562	NC_014152	GCG	2	6	33160	33165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131578
563	NC_014152	GGT	2	6	33204	33209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131578
564	NC_014152	CAT	2	6	33219	33224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131578
565	NC_014152	GTG	2	6	33226	33231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131578
566	NC_014152	CTT	2	6	33258	33263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131578
567	NC_014152	CA	3	6	33333	33338	50 %	0 %	0 %	50 %	296131578
568	NC_014152	CCG	2	6	33346	33351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131578
569	NC_014152	AGG	2	6	33403	33408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131578
570	NC_014152	AT	3	6	33559	33564	50 %	50 %	0 %	0 %	296131578
571	NC_014152	T	6	6	33708	33713	0 %	100 %	0 %	0 %	296131578
572	NC_014152	GGTT	2	8	33714	33721	0 %	50 %	50 %	0 %	296131578
573	NC_014152	TTTG	2	8	33728	33735	0 %	75 %	25 %	0 %	296131578
574	NC_014152	GATC	2	8	33743	33750	25 %	25 %	25 %	25 %	296131578
575	NC_014152	TTC	2	6	33821	33826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131578
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577	NC_014152	TCA	2	6	34018	34023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131578
578	NC_014152	TTCC	2	8	34046	34053	0 %	50 %	0 %	50 %	296131578
579	NC_014152	T	6	6	34337	34342	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
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582	NC_014152	ATT	2	6	34480	34485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131579
583	NC_014152	ACC	2	6	34618	34623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131579
584	NC_014152	TGCA	2	8	34687	34694	25 %	25 %	25 %	25 %	296131579
585	NC_014152	T	6	6	34725	34730	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
586	NC_014152	AAT	2	6	34748	34753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131579
587	NC_014152	ATA	2	6	34824	34829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131579
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591	NC_014152	T	6	6	34908	34913	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
592	NC_014152	GCC	2	6	34923	34928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131579
593	NC_014152	TCA	2	6	35002	35007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131579
594	NC_014152	TGA	2	6	35144	35149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131579
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597	NC_014152	CAA	2	6	35226	35231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131579
598	NC_014152	TGCT	2	8	35287	35294	0 %	50 %	25 %	25 %	296131579
599	NC_014152	T	7	7	35325	35331	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
600	NC_014152	T	6	6	35378	35383	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
601	NC_014152	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	296131579
602	NC_014152	T	6	6	35507	35512	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
603	NC_014152	CTTT	2	8	35532	35539	0 %	75 %	0 %	25 %	296131579
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608	NC_014152	TCA	2	6	35695	35700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131579
609	NC_014152	T	7	7	35717	35723	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
610	NC_014152	T	6	6	35750	35755	0 %	100 %	0 %	0 %	296131579
611	NC_014152	CTT	2	6	36315	36320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131580
612	NC_014152	G	6	6	36404	36409	0 %	0 %	100 %	0 %	296131580
613	NC_014152	TGAT	2	8	36526	36533	25 %	50 %	25 %	0 %	296131580
614	NC_014152	TGC	2	6	36560	36565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131580
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617	NC_014152	ATG	2	6	36706	36711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131580
618	NC_014152	AGGGA	2	10	36778	36787	40 %	0 %	60 %	0 %	296131580
619	NC_014152	GAA	2	6	36857	36862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131580
620	NC_014152	GTG	2	6	37020	37025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131580
621	NC_014152	TTTTGA	2	12	37031	37042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296131580
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623	NC_014152	CTC	2	6	37201	37206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131580
624	NC_014152	CCA	2	6	37234	37239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131580
625	NC_014152	GCA	2	6	37334	37339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131580
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627	NC_014152	TC	3	6	37401	37406	0 %	50 %	0 %	50 %	296131580
628	NC_014152	TTGT	3	12	37568	37579	0 %	75 %	25 %	0 %	296131581
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630	NC_014152	A	6	6	37605	37610	100 %	0 %	0 %	0 %	296131581
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