MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014152	TGC	2	6	314030	314035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131832
5002	NC_014152	TAA	2	6	314036	314041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131832
5003	NC_014152	GAA	3	9	314057	314065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131832
5004	NC_014152	AGA	2	6	314066	314071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131832
5005	NC_014152	TAT	2	6	314219	314224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131833
5006	NC_014152	ACA	2	6	314247	314252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131833
5007	NC_014152	ATG	2	6	314308	314313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131833
5008	NC_014152	CCA	2	6	314320	314325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131833
5009	NC_014152	GCT	2	6	314373	314378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131833
5010	NC_014152	ATA	2	6	314412	314417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131833
5011	NC_014152	TC	3	6	314460	314465	0 %	50 %	0 %	50 %	296131833
5012	NC_014152	CAA	2	6	314579	314584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131833
5013	NC_014152	TA	4	8	314729	314736	50 %	50 %	0 %	0 %	296131833
5014	NC_014152	GAT	2	6	314739	314744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131833
5015	NC_014152	GAAA	2	8	314786	314793	75 %	0 %	25 %	0 %	296131833
5016	NC_014152	GCG	2	6	314796	314801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131833
5017	NC_014152	GAA	2	6	314844	314849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131833
5018	NC_014152	ATG	2	6	314853	314858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131833
5019	NC_014152	AGA	2	6	314888	314893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131833
5020	NC_014152	A	6	6	314897	314902	100 %	0 %	0 %	0 %	296131833
5021	NC_014152	CTG	2	6	314985	314990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131833
5022	NC_014152	AG	3	6	315073	315078	50 %	0 %	50 %	0 %	296131833
5023	NC_014152	CGA	2	6	315086	315091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131833
5024	NC_014152	TTC	2	6	315153	315158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131833
5025	NC_014152	TCAAC	2	10	315199	315208	40 %	20 %	0 %	40 %	296131833
5026	NC_014152	CGGA	2	8	315230	315237	25 %	0 %	50 %	25 %	296131833
5027	NC_014152	GAA	2	6	315264	315269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131833
5028	NC_014152	GCG	2	6	315297	315302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131833
5029	NC_014152	TGA	2	6	315344	315349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131833
5030	NC_014152	ACAA	2	8	315512	315519	75 %	0 %	0 %	25 %	296131833
5031	NC_014152	TTG	2	6	315556	315561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131833
5032	NC_014152	TCG	2	6	315757	315762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131833
5033	NC_014152	CTGG	2	8	315834	315841	0 %	25 %	50 %	25 %	296131833
5034	NC_014152	ACG	2	6	315874	315879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131833
5035	NC_014152	TCG	2	6	315900	315905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131833
5036	NC_014152	GAA	2	6	316011	316016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131833
5037	NC_014152	CCG	2	6	316049	316054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131833
5038	NC_014152	GAA	2	6	316200	316205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131833
5039	NC_014152	CAC	2	6	316468	316473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131834
5040	NC_014152	AG	3	6	316537	316542	50 %	0 %	50 %	0 %	296131834
5041	NC_014152	AGC	2	6	316657	316662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131834
5042	NC_014152	GTA	2	6	316685	316690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131834
5043	NC_014152	GCA	2	6	316694	316699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131834
5044	NC_014152	CTG	2	6	316733	316738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131834
5045	NC_014152	GTA	2	6	316766	316771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131834
5046	NC_014152	GAC	2	6	316796	316801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131834
5047	NC_014152	GTG	2	6	316939	316944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131834
5048	NC_014152	CGA	2	6	317107	317112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131834
5049	NC_014152	AAG	2	6	317144	317149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131834
5050	NC_014152	TAA	2	6	317154	317159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131834
5051	NC_014152	T	6	6	317303	317308	0 %	100 %	0 %	0 %	296131834
5052	NC_014152	GAA	2	6	317333	317338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131834
5053	NC_014152	TTC	2	6	317357	317362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131834
5054	NC_014152	ACA	2	6	317393	317398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131834
5055	NC_014152	AGT	2	6	317410	317415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131834
5056	NC_014152	ATTGA	2	10	317471	317480	40 %	40 %	20 %	0 %	296131834
5057	NC_014152	GAA	2	6	317498	317503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131834
5058	NC_014152	A	6	6	317887	317892	100 %	0 %	0 %	0 %	296131835
5059	NC_014152	A	6	6	317902	317907	100 %	0 %	0 %	0 %	296131835
5060	NC_014152	A	6	6	318025	318030	100 %	0 %	0 %	0 %	296131835
5061	NC_014152	AAG	2	6	318343	318348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131836
5062	NC_014152	CGT	2	6	318420	318425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131836
5063	NC_014152	GAT	2	6	318586	318591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131836
5064	NC_014152	GTAG	2	8	318748	318755	25 %	25 %	50 %	0 %	296131836
5065	NC_014152	TAA	2	6	318881	318886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131836
5066	NC_014152	CT	3	6	318912	318917	0 %	50 %	0 %	50 %	296131836
5067	NC_014152	AGC	2	6	318931	318936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131836
5068	NC_014152	TA	3	6	318994	318999	50 %	50 %	0 %	0 %	296131837
5069	NC_014152	ATG	2	6	319078	319083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131837
5070	NC_014152	GTA	2	6	319086	319091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131837
5071	NC_014152	CCA	2	6	319126	319131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131837
5072	NC_014152	GGCG	2	8	319155	319162	0 %	0 %	75 %	25 %	296131837
5073	NC_014152	GGC	2	6	319171	319176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131837
5074	NC_014152	GC	3	6	319194	319199	0 %	0 %	50 %	50 %	296131837
5075	NC_014152	GGC	2	6	319230	319235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131837
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5077	NC_014152	GGCT	2	8	319297	319304	0 %	25 %	50 %	25 %	296131837
5078	NC_014152	TCT	2	6	319320	319325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131837
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5080	NC_014152	A	6	6	319422	319427	100 %	0 %	0 %	0 %	296131837
5081	NC_014152	GTT	3	9	319431	319439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131837
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5086	NC_014152	GTA	2	6	319748	319753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131838
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5089	NC_014152	AAG	2	6	319848	319853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131838
5090	NC_014152	AAG	2	6	319926	319931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131839
5091	NC_014152	TAC	2	6	319988	319993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131839
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5099	NC_014152	TGCCC	2	10	320300	320309	0 %	20 %	20 %	60 %	296131839
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5103	NC_014152	ACC	2	6	320602	320607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131839
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5105	NC_014152	GAA	3	9	320693	320701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131839
5106	NC_014152	ATT	2	6	320718	320723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131839
5107	NC_014152	A	7	7	320792	320798	100 %	0 %	0 %	0 %	296131840
5108	NC_014152	TTA	2	6	320820	320825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131840
5109	NC_014152	A	6	6	320825	320830	100 %	0 %	0 %	0 %	296131840
5110	NC_014152	GAA	2	6	320835	320840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131840
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5112	NC_014152	CCG	2	6	320882	320887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131840
5113	NC_014152	AT	4	8	320955	320962	50 %	50 %	0 %	0 %	296131840
5114	NC_014152	GAA	2	6	320967	320972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131840
5115	NC_014152	CGA	2	6	321004	321009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131840
5116	NC_014152	T	6	6	321012	321017	0 %	100 %	0 %	0 %	296131840
5117	NC_014152	AT	3	6	321104	321109	50 %	50 %	0 %	0 %	296131841
5118	NC_014152	AAG	2	6	321169	321174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131841
5119	NC_014152	AAT	2	6	321258	321263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131841
5120	NC_014152	TA	3	6	321286	321291	50 %	50 %	0 %	0 %	296131841
5121	NC_014152	AGA	2	6	321372	321377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131841
5122	NC_014152	GTA	2	6	321393	321398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131841
5123	NC_014152	AGG	2	6	321412	321417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131841
5124	NC_014152	ATT	2	6	321465	321470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131842
5125	NC_014152	T	6	6	321515	321520	0 %	100 %	0 %	0 %	296131842
5126	NC_014152	GGGCG	2	10	321654	321663	0 %	0 %	80 %	20 %	296131842
5127	NC_014152	AGTG	2	8	321716	321723	25 %	25 %	50 %	0 %	296131842
5128	NC_014152	TTG	2	6	321730	321735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131842
5129	NC_014152	TTTC	2	8	321805	321812	0 %	75 %	0 %	25 %	296131842
5130	NC_014152	CGGA	2	8	321912	321919	25 %	0 %	50 %	25 %	296131842
5131	NC_014152	TAC	2	6	321992	321997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131842
5132	NC_014152	AGG	2	6	322076	322081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131842
5133	NC_014152	AGAAT	2	10	322082	322091	60 %	20 %	20 %	0 %	296131842
5134	NC_014152	AGC	2	6	322121	322126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131843
5135	NC_014152	AGT	2	6	322374	322379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131843
5136	NC_014152	GTG	2	6	322502	322507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131843
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5138	NC_014152	TGT	3	9	322817	322825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131845
5139	NC_014152	AAG	2	6	322871	322876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131845
5140	NC_014152	A	6	6	322881	322886	100 %	0 %	0 %	0 %	296131845
5141	NC_014152	ATG	2	6	322897	322902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131845
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5144	NC_014152	GGT	2	6	323121	323126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131846
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5149	NC_014152	TGT	2	6	323213	323218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131846
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5152	NC_014152	GA	3	6	323354	323359	50 %	0 %	50 %	0 %	296131846
5153	NC_014152	TATCA	2	10	323507	323516	40 %	40 %	0 %	20 %	296131847
5154	NC_014152	GTT	2	6	323574	323579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131847
5155	NC_014152	ATT	2	6	323643	323648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131847
5156	NC_014152	AAG	2	6	323653	323658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131847
5157	NC_014152	GCAA	2	8	323722	323729	50 %	0 %	25 %	25 %	296131847
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5159	NC_014152	AGT	2	6	323848	323853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131848
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5161	NC_014152	TGT	2	6	324010	324015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131848
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5169	NC_014152	A	6	6	324547	324552	100 %	0 %	0 %	0 %	296131849
5170	NC_014152	A	6	6	324683	324688	100 %	0 %	0 %	0 %	296131850
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5172	NC_014152	TTA	2	6	324720	324725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131850
5173	NC_014152	TGA	2	6	324742	324747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131850
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5192	NC_014152	TGA	2	6	325768	325773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131852
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5200	NC_014152	GAA	2	6	326458	326463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131853
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5212	NC_014152	A	6	6	327150	327155	100 %	0 %	0 %	0 %	296131855
5213	NC_014152	TGC	2	6	327157	327162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131855
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5230	NC_014152	CTG	2	6	327825	327830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131856
5231	NC_014152	GCT	2	6	327840	327845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131856
5232	NC_014152	AGC	2	6	327854	327859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131856
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5234	NC_014152	GTCG	2	8	327918	327925	0 %	25 %	50 %	25 %	296131856
5235	NC_014152	CAT	2	6	328000	328005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131856
5236	NC_014152	CTA	2	6	328021	328026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131856
5237	NC_014152	T	6	6	328037	328042	0 %	100 %	0 %	0 %	296131856
5238	NC_014152	TAA	2	6	328046	328051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131856
5239	NC_014152	TTC	2	6	328131	328136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131856
5240	NC_014152	GATG	2	8	328169	328176	25 %	25 %	50 %	0 %	296131856
5241	NC_014152	A	6	6	328191	328196	100 %	0 %	0 %	0 %	296131856
5242	NC_014152	CCA	2	6	328333	328338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131856
5243	NC_014152	GGC	2	6	328359	328364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131856
5244	NC_014152	GTT	2	6	328380	328385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131856
5245	NC_014152	AAT	2	6	328456	328461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131856
5246	NC_014152	TCA	2	6	328619	328624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131857
5247	NC_014152	AT	3	6	328656	328661	50 %	50 %	0 %	0 %	296131857
5248	NC_014152	GTA	2	6	328702	328707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131857
5249	NC_014152	A	6	6	328725	328730	100 %	0 %	0 %	0 %	296131857
5250	NC_014152	ATT	2	6	328747	328752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131857
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5252	NC_014152	AAG	2	6	328829	328834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131857
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5254	NC_014152	TG	3	6	328936	328941	0 %	50 %	50 %	0 %	296131857
5255	NC_014152	TGT	2	6	328959	328964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131857
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5262	NC_014152	AAG	2	6	329513	329518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131858
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5278	NC_014152	AAG	2	6	330622	330627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131862
5279	NC_014152	GCCG	2	8	330654	330661	0 %	0 %	50 %	50 %	296131862
5280	NC_014152	GGC	2	6	330686	330691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131862
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5283	NC_014152	GCC	2	6	330749	330754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131862
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5352	NC_014152	TTTTG	2	10	334730	334739	0 %	80 %	20 %	0 %	296131869
5353	NC_014152	ACC	2	6	334743	334748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131869
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5356	NC_014152	TGA	3	9	334801	334809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131869
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5358	NC_014152	TAT	2	6	334883	334888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131869
5359	NC_014152	T	6	6	334990	334995	0 %	100 %	0 %	0 %	296131869
5360	NC_014152	CGA	2	6	335102	335107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131869
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5363	NC_014152	GAA	2	6	335157	335162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131869
5364	NC_014152	GC	3	6	335282	335287	0 %	0 %	50 %	50 %	296131869
5365	NC_014152	CTG	2	6	335401	335406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131869
5366	NC_014152	TTG	3	9	335413	335421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131869
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5368	NC_014152	CAT	2	6	335493	335498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131870
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5389	NC_014152	AGC	2	6	336947	336952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131872
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5470	NC_014152	TATGG	2	10	341908	341917	20 %	40 %	40 %	0 %	296131877
5471	NC_014152	A	7	7	341927	341933	100 %	0 %	0 %	0 %	296131877
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5485	NC_014152	AACC	2	8	342678	342685	50 %	0 %	0 %	50 %	296131877
5486	NC_014152	CGG	2	6	342690	342695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131877
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5490	NC_014152	CGC	2	6	343302	343307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131879
5491	NC_014152	TGA	2	6	343364	343369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131879
5492	NC_014152	CGG	2	6	343411	343416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131879
5493	NC_014152	AGT	2	6	343451	343456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131879
5494	NC_014152	GGC	2	6	343516	343521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131879
5495	NC_014152	GCA	2	6	343529	343534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131879
5496	NC_014152	T	6	6	343576	343581	0 %	100 %	0 %	0 %	296131879
5497	NC_014152	T	6	6	343642	343647	0 %	100 %	0 %	0 %	296131879
5498	NC_014152	GCG	2	6	343661	343666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131879
5499	NC_014152	CCGGT	2	10	343681	343690	0 %	20 %	40 %	40 %	296131879
5500	NC_014152	CAT	2	6	343741	343746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131879

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