MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_014152	TGA	2	6	279324	279329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131800
4503	NC_014152	GAA	2	6	279347	279352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131800
4504	NC_014152	GTT	2	6	279378	279383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131801
4505	NC_014152	GGGT	2	8	279418	279425	0 %	25 %	75 %	0 %	296131801
4506	NC_014152	ATTG	2	8	279515	279522	25 %	50 %	25 %	0 %	296131801
4507	NC_014152	TGC	2	6	279664	279669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131801
4508	NC_014152	ATT	2	6	279708	279713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131801
4509	NC_014152	A	6	6	279811	279816	100 %	0 %	0 %	0 %	296131801
4510	NC_014152	CAA	2	6	279818	279823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131801
4511	NC_014152	AGC	2	6	280139	280144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131802
4512	NC_014152	GCA	2	6	280303	280308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131802
4513	NC_014152	AAC	2	6	280328	280333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131802
4514	NC_014152	A	6	6	280391	280396	100 %	0 %	0 %	0 %	296131802
4515	NC_014152	GAA	2	6	280492	280497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131802
4516	NC_014152	AAAT	2	8	280503	280510	75 %	25 %	0 %	0 %	296131802
4517	NC_014152	TGG	2	6	280523	280528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131802
4518	NC_014152	TAC	2	6	280581	280586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131802
4519	NC_014152	A	6	6	280667	280672	100 %	0 %	0 %	0 %	296131802
4520	NC_014152	AT	3	6	280693	280698	50 %	50 %	0 %	0 %	296131802
4521	NC_014152	AGG	2	6	280717	280722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131802
4522	NC_014152	GAA	2	6	280750	280755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131803
4523	NC_014152	AAT	2	6	280763	280768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131803
4524	NC_014152	TGT	2	6	280783	280788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131803
4525	NC_014152	CGG	2	6	280798	280803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131803
4526	NC_014152	ATA	2	6	280825	280830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131803
4527	NC_014152	GAACG	2	10	280874	280883	40 %	0 %	40 %	20 %	296131803
4528	NC_014152	TAC	2	6	280922	280927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131803
4529	NC_014152	ACC	2	6	280993	280998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131803
4530	NC_014152	TCAG	2	8	281014	281021	25 %	25 %	25 %	25 %	296131803
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4532	NC_014152	CAGG	2	8	281441	281448	25 %	0 %	50 %	25 %	296131803
4533	NC_014152	CAG	2	6	281460	281465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131803
4534	NC_014152	CCGA	2	8	281483	281490	25 %	0 %	25 %	50 %	296131803
4535	NC_014152	CTG	2	6	281502	281507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131803
4536	NC_014152	TGA	2	6	281527	281532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131803
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4538	NC_014152	GGC	2	6	281711	281716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131803
4539	NC_014152	A	6	6	281839	281844	100 %	0 %	0 %	0 %	296131803
4540	NC_014152	CAG	2	6	281845	281850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131803
4541	NC_014152	GCACA	2	10	281885	281894	40 %	0 %	20 %	40 %	296131803
4542	NC_014152	TGA	2	6	281899	281904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131803
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4544	NC_014152	GCT	2	6	282065	282070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131803
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4546	NC_014152	TGA	2	6	282404	282409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131804
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4551	NC_014152	TGC	2	6	282866	282871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131804
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4553	NC_014152	AAG	2	6	282910	282915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131804
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4558	NC_014152	TGC	2	6	283175	283180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131804
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4560	NC_014152	GAA	2	6	283346	283351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131805
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4569	NC_014152	CA	3	6	283971	283976	50 %	0 %	0 %	50 %	296131805
4570	NC_014152	AT	3	6	283999	284004	50 %	50 %	0 %	0 %	296131805
4571	NC_014152	CGTA	2	8	284022	284029	25 %	25 %	25 %	25 %	296131805
4572	NC_014152	ATTA	2	8	284033	284040	50 %	50 %	0 %	0 %	296131805
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4592	NC_014152	GCG	3	9	285626	285634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131807
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4604	NC_014152	TAT	2	6	287173	287178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131808
4605	NC_014152	GAAA	2	8	287203	287210	75 %	0 %	25 %	0 %	296131808
4606	NC_014152	GAA	2	6	287213	287218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131808
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4609	NC_014152	CGG	2	6	287390	287395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131808
4610	NC_014152	AGGCA	2	10	287440	287449	40 %	0 %	40 %	20 %	296131808
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4614	NC_014152	A	6	6	287926	287931	100 %	0 %	0 %	0 %	296131808
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4618	NC_014152	GA	3	6	288084	288089	50 %	0 %	50 %	0 %	296131808
4619	NC_014152	A	6	6	288127	288132	100 %	0 %	0 %	0 %	296131808
4620	NC_014152	AGA	2	6	288217	288222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131808
4621	NC_014152	CGAG	2	8	288248	288255	25 %	0 %	50 %	25 %	296131808
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4623	NC_014152	TCGAC	2	10	288310	288319	20 %	20 %	20 %	40 %	296131808
4624	NC_014152	CAT	2	6	288394	288399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131808
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4637	NC_014152	CGAAAA	2	12	289252	289263	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296131809
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4639	NC_014152	TGA	2	6	289378	289383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131809
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4644	NC_014152	TCC	2	6	289611	289616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296131809
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4731	NC_014152	ATA	2	6	294778	294783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131815
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4735	NC_014152	GCA	2	6	294954	294959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131815
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4737	NC_014152	CGG	2	6	295031	295036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131815
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4739	NC_014152	TTCA	2	8	295064	295071	25 %	50 %	0 %	25 %	296131815
4740	NC_014152	GGC	2	6	295133	295138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131815
4741	NC_014152	GATGA	2	10	295575	295584	40 %	20 %	40 %	0 %	296131816
4742	NC_014152	AG	3	6	295597	295602	50 %	0 %	50 %	0 %	296131816
4743	NC_014152	GATGT	2	10	295620	295629	20 %	40 %	40 %	0 %	296131816
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4745	NC_014152	GCTC	2	8	295722	295729	0 %	25 %	25 %	50 %	296131816
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4863	NC_014152	A	6	6	306411	306416	100 %	0 %	0 %	0 %	296131828
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4990	NC_014152	TCGT	2	8	313253	313260	0 %	50 %	25 %	25 %	296131831
4991	NC_014152	TAC	3	9	313347	313355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131831
4992	NC_014152	AT	3	6	313428	313433	50 %	50 %	0 %	0 %	296131831
4993	NC_014152	CCG	2	6	313544	313549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131831
4994	NC_014152	AAT	2	6	313607	313612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131831
4995	NC_014152	AGA	2	6	313659	313664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131832
4996	NC_014152	GCA	2	6	313708	313713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131832
4997	NC_014152	A	6	6	313850	313855	100 %	0 %	0 %	0 %	296131832
4998	NC_014152	CAT	2	6	313856	313861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131832
4999	NC_014152	A	6	6	313990	313995	100 %	0 %	0 %	0 %	296131832
5000	NC_014152	GCT	2	6	314013	314018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131832

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