MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Thiomonas sp. str. 3As plasmid pTHI

Total Repeats: 927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014144	TCA	2	6	25383	25388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112197
502	NC_014144	GAA	2	6	25484	25489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296112197
503	NC_014144	G	6	6	25555	25560	0 %	0 %	100 %	0 %	296112197
504	NC_014144	GGC	3	9	25719	25727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112198
505	NC_014144	CGGCG	2	10	25872	25881	0 %	0 %	60 %	40 %	296112198
506	NC_014144	GC	3	6	25892	25897	0 %	0 %	50 %	50 %	296112198
507	NC_014144	CAC	2	6	26067	26072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112199
508	NC_014144	CAT	2	6	26226	26231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112200
509	NC_014144	CAG	2	6	26322	26327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112200
510	NC_014144	GAA	2	6	26379	26384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296112200
511	NC_014144	CAA	2	6	26402	26407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112200
512	NC_014144	ACC	2	6	26408	26413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112200
513	NC_014144	TCA	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112200
514	NC_014144	CCA	2	6	26469	26474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112200
515	NC_014144	GCC	2	6	26490	26495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112200
516	NC_014144	CAG	2	6	26577	26582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112200
517	NC_014144	CCA	2	6	26604	26609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112200
518	NC_014144	TGA	2	6	26651	26656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112200
519	NC_014144	TCA	2	6	26678	26683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112200
520	NC_014144	CCG	2	6	26797	26802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112200
521	NC_014144	CTG	2	6	26914	26919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112200
522	NC_014144	CTGG	2	8	26933	26940	0 %	25 %	50 %	25 %	296112200
523	NC_014144	TTC	2	6	26992	26997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112201
524	NC_014144	GTT	2	6	27043	27048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112201
525	NC_014144	AAT	2	6	27082	27087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112201
526	NC_014144	ATC	2	6	27215	27220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112201
527	NC_014144	GT	3	6	27264	27269	0 %	50 %	50 %	0 %	296112201
528	NC_014144	GT	3	6	27274	27279	0 %	50 %	50 %	0 %	296112201
529	NC_014144	ATT	2	6	27284	27289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112201
530	NC_014144	GCT	2	6	27372	27377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
531	NC_014144	TGC	2	6	27407	27412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
532	NC_014144	CAGC	2	8	27471	27478	25 %	0 %	25 %	50 %	296112202
533	NC_014144	GC	3	6	27487	27492	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
534	NC_014144	CGGCC	2	10	27550	27559	0 %	0 %	40 %	60 %	296112202
535	NC_014144	CATC	2	8	27648	27655	25 %	25 %	0 %	50 %	296112202
536	NC_014144	CAA	2	6	27774	27779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112202
537	NC_014144	GTT	2	6	27796	27801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112202
538	NC_014144	GC	3	6	27823	27828	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
539	NC_014144	TCC	2	6	27833	27838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296112202
540	NC_014144	GCG	2	6	27855	27860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
541	NC_014144	GC	3	6	27887	27892	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
542	NC_014144	GCG	2	6	27919	27924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
543	NC_014144	GCT	2	6	28000	28005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
544	NC_014144	CTTT	2	8	28030	28037	0 %	75 %	0 %	25 %	296112202
545	NC_014144	CGG	2	6	28056	28061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
546	NC_014144	CG	3	6	28287	28292	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
547	NC_014144	CGG	2	6	28329	28334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
548	NC_014144	GAT	2	6	28351	28356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112202
549	NC_014144	AAT	2	6	28377	28382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112202
550	NC_014144	GCT	2	6	28402	28407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
551	NC_014144	T	6	6	28463	28468	0 %	100 %	0 %	0 %	296112202
552	NC_014144	GC	3	6	28553	28558	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
553	NC_014144	GCG	2	6	28580	28585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
554	NC_014144	CG	4	8	28605	28612	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
555	NC_014144	GC	3	6	28638	28643	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
556	NC_014144	CTG	2	6	28698	28703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
557	NC_014144	GCT	3	9	28714	28722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
558	NC_014144	TG	4	8	28747	28754	0 %	50 %	50 %	0 %	296112202
559	NC_014144	TGCT	2	8	28756	28763	0 %	50 %	25 %	25 %	296112202
560	NC_014144	CTG	2	6	28795	28800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
561	NC_014144	GCG	2	6	28801	28806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
562	NC_014144	CCA	2	6	28857	28862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112202
563	NC_014144	GCGG	2	8	28943	28950	0 %	0 %	75 %	25 %	296112202
564	NC_014144	CTG	2	6	28990	28995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
565	NC_014144	CGC	2	6	29007	29012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112202
566	NC_014144	GTA	2	6	29014	29019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112202
567	NC_014144	ATC	2	6	29056	29061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112202
568	NC_014144	ATG	2	6	29125	29130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112202
569	NC_014144	TCG	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112202
570	NC_014144	GGGCAA	2	12	29184	29195	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296112202
571	NC_014144	CAA	2	6	29199	29204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112202
572	NC_014144	A	7	7	29314	29320	100 %	0 %	0 %	0 %	296112202
573	NC_014144	GCG	3	9	29327	29335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112202
574	NC_014144	TC	3	6	29357	29362	0 %	50 %	0 %	50 %	296112202
575	NC_014144	CG	3	6	29374	29379	0 %	0 %	50 %	50 %	296112202
576	NC_014144	GT	3	6	29444	29449	0 %	50 %	50 %	0 %	296112203
577	NC_014144	CCA	2	6	29623	29628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112203
578	NC_014144	GTA	2	6	29690	29695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112203
579	NC_014144	CGG	2	6	29717	29722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
580	NC_014144	GAT	3	9	29735	29743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112203
581	NC_014144	GCG	2	6	29747	29752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
582	NC_014144	AGC	2	6	29784	29789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
583	NC_014144	GCT	2	6	29797	29802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112203
584	NC_014144	GGTTC	2	10	29852	29861	0 %	40 %	40 %	20 %	296112203
585	NC_014144	GTGC	2	8	29932	29939	0 %	25 %	50 %	25 %	296112203
586	NC_014144	CGA	2	6	30052	30057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
587	NC_014144	AGC	3	9	30111	30119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
588	NC_014144	GAA	2	6	30188	30193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296112203
589	NC_014144	CAG	2	6	30194	30199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
590	NC_014144	CA	3	6	30237	30242	50 %	0 %	0 %	50 %	296112203
591	NC_014144	GCG	2	6	30263	30268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
592	NC_014144	TGA	2	6	30355	30360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112203
593	NC_014144	GGC	2	6	30380	30385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
594	NC_014144	AGCG	2	8	30405	30412	25 %	0 %	50 %	25 %	296112203
595	NC_014144	TGA	2	6	30457	30462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112203
596	NC_014144	CGT	2	6	30473	30478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112203
597	NC_014144	GCA	2	6	30505	30510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
598	NC_014144	G	6	6	30577	30582	0 %	0 %	100 %	0 %	296112203
599	NC_014144	CG	3	6	30670	30675	0 %	0 %	50 %	50 %	296112203
600	NC_014144	CAG	2	6	30696	30701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
601	NC_014144	TCT	2	6	30714	30719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112203
602	NC_014144	GCG	2	6	30720	30725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
603	NC_014144	CCG	2	6	30769	30774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112203
604	NC_014144	CAC	2	6	30806	30811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112203
605	NC_014144	CAA	2	6	30830	30835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112203
606	NC_014144	GAC	2	6	30845	30850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
607	NC_014144	GGC	2	6	30878	30883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
608	NC_014144	AGT	2	6	30907	30912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112203
609	NC_014144	GCA	2	6	30913	30918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
610	NC_014144	GCG	2	6	30920	30925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
611	NC_014144	GGCC	2	8	30964	30971	0 %	0 %	50 %	50 %	296112203
612	NC_014144	TTG	2	6	30972	30977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112203
613	NC_014144	CGG	2	6	31020	31025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
614	NC_014144	CG	3	6	31109	31114	0 %	0 %	50 %	50 %	296112203
615	NC_014144	GTA	2	6	31124	31129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112203
616	NC_014144	CAG	4	12	31184	31195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
617	NC_014144	CGA	3	9	31243	31251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112203
618	NC_014144	CGG	2	6	31255	31260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112203
619	NC_014144	CG	3	6	31280	31285	0 %	0 %	50 %	50 %	296112203
620	NC_014144	TGC	2	6	31300	31305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112203
621	NC_014144	GC	3	6	31335	31340	0 %	0 %	50 %	50 %	296112203
622	NC_014144	GGC	2	6	31361	31366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112204
623	NC_014144	AAC	2	6	31435	31440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112204
624	NC_014144	CGG	2	6	31457	31462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112204
625	NC_014144	GC	3	6	31469	31474	0 %	0 %	50 %	50 %	296112204
626	NC_014144	TGA	2	6	31490	31495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112204
627	NC_014144	TCA	2	6	31597	31602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112204
628	NC_014144	GCAG	2	8	31643	31650	25 %	0 %	50 %	25 %	296112204
629	NC_014144	ACA	2	6	31673	31678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112204
630	NC_014144	CGGCAG	2	12	31734	31745	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296112204
631	NC_014144	TCC	2	6	31756	31761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296112204
632	NC_014144	CG	3	6	31774	31779	0 %	0 %	50 %	50 %	296112204
633	NC_014144	TCAA	2	8	31795	31802	50 %	25 %	0 %	25 %	296112204
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642	NC_014144	CAT	2	6	32273	32278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112204
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650	NC_014144	TGTCG	2	10	32608	32617	0 %	40 %	40 %	20 %	296112205
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654	NC_014144	CTG	2	6	32788	32793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112205
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704	NC_014144	CAC	2	6	34735	34740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112207
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725	NC_014144	TTTGG	2	10	35842	35851	0 %	60 %	40 %	0 %	296112208
726	NC_014144	ATCAGG	2	12	35858	35869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296112208
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735	NC_014144	TA	3	6	36136	36141	50 %	50 %	0 %	0 %	296112208
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742	NC_014144	CGT	2	6	36535	36540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112208
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744	NC_014144	GAA	2	6	36581	36586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296112208
745	NC_014144	A	6	6	36620	36625	100 %	0 %	0 %	0 %	296112208
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747	NC_014144	ACC	2	6	36835	36840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112209
748	NC_014144	AT	3	6	36943	36948	50 %	50 %	0 %	0 %	296112209
749	NC_014144	GTG	2	6	36976	36981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112210
750	NC_014144	TCTT	2	8	37010	37017	0 %	75 %	0 %	25 %	296112210
751	NC_014144	CGC	2	6	37037	37042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112210
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753	NC_014144	GC	3	6	37118	37123	0 %	0 %	50 %	50 %	296112210
754	NC_014144	CTT	2	6	37219	37224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112210
755	NC_014144	TCG	2	6	37240	37245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112210
756	NC_014144	TGC	2	6	37272	37277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112210
757	NC_014144	GTT	2	6	37382	37387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112210
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759	NC_014144	TGC	2	6	37539	37544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112210
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877	NC_014144	GGCG	2	8	44216	44223	0 %	0 %	75 %	25 %	296112220
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881	NC_014144	GC	3	6	44389	44394	0 %	0 %	50 %	50 %	296112220
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883	NC_014144	GC	3	6	44437	44442	0 %	0 %	50 %	50 %	296112220
884	NC_014144	CGC	2	6	44467	44472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112220
885	NC_014144	GCT	2	6	44524	44529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112220
886	NC_014144	CGG	2	6	44534	44539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112220
887	NC_014144	A	6	6	44552	44557	100 %	0 %	0 %	0 %	296112220
888	NC_014144	CG	3	6	44789	44794	0 %	0 %	50 %	50 %	296112221
889	NC_014144	GC	3	6	44816	44821	0 %	0 %	50 %	50 %	296112221
890	NC_014144	ATG	2	6	44822	44827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112221
891	NC_014144	GCC	2	6	44834	44839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112221
892	NC_014144	GC	3	6	44841	44846	0 %	0 %	50 %	50 %	296112221
893	NC_014144	CAC	2	6	45059	45064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112222
894	NC_014144	GCG	2	6	45071	45076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112222
895	NC_014144	CGG	2	6	45080	45085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112222
896	NC_014144	C	6	6	45105	45110	0 %	0 %	0 %	100 %	296112222
897	NC_014144	CTG	2	6	45123	45128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112222
898	NC_014144	GGCG	2	8	45137	45144	0 %	0 %	75 %	25 %	296112222
899	NC_014144	GCCTGC	2	12	45188	45199	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296112222
900	NC_014144	GCA	2	6	45261	45266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112222
901	NC_014144	ATCT	2	8	45326	45333	25 %	50 %	0 %	25 %	296112223
902	NC_014144	CAG	2	6	45365	45370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112223
903	NC_014144	TGA	2	6	45417	45422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112223
904	NC_014144	CGG	2	6	45451	45456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112223
905	NC_014144	CGG	2	6	45471	45476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112223
906	NC_014144	ACC	2	6	45512	45517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112223
907	NC_014144	CG	3	6	45540	45545	0 %	0 %	50 %	50 %	296112223
908	NC_014144	GCT	2	6	45622	45627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112223
909	NC_014144	GAAAT	2	10	45768	45777	60 %	20 %	20 %	0 %	296112224
910	NC_014144	GCA	2	6	45798	45803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112224
911	NC_014144	ACG	2	6	45846	45851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112224
912	NC_014144	GAAA	2	8	45868	45875	75 %	0 %	25 %	0 %	296112224
913	NC_014144	GCG	3	9	45876	45884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112224
914	NC_014144	G	6	6	45977	45982	0 %	0 %	100 %	0 %	296112224
915	NC_014144	GCA	2	6	46034	46039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112224
916	NC_014144	CCG	2	6	46048	46053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296112224
917	NC_014144	TGA	2	6	46125	46130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112225
918	NC_014144	CGG	2	6	46159	46164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112225
919	NC_014144	CGG	2	6	46179	46184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112225
920	NC_014144	ACC	2	6	46220	46225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112225
921	NC_014144	CG	3	6	46248	46253	0 %	0 %	50 %	50 %	296112225
922	NC_014144	GCT	2	6	46330	46335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112225
923	NC_014144	ATG	2	6	46544	46549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112226
924	NC_014144	GC	3	6	46603	46608	0 %	0 %	50 %	50 %	296112226
925	NC_014144	GAT	2	6	46660	46665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112226
926	NC_014144	TCA	2	6	46706	46711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112226
927	NC_014144	CG	4	8	46738	46745	0 %	0 %	50 %	50 %	296112226

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