MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 29758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	ATC	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577266
2	NC_013921	CCA	2	6	488	493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577266
3	NC_013921	TAA	2	6	584	589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
4	NC_013921	ATT	2	6	607	612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577266
5	NC_013921	ATG	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577266
6	NC_013921	AGA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
7	NC_013921	GAA	3	9	673	681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
8	NC_013921	ACT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577266
9	NC_013921	TGT	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577266
10	NC_013921	GGA	2	6	865	870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577266
11	NC_013921	TAA	2	6	918	923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
12	NC_013921	AAT	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
13	NC_013921	GAC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577266
14	NC_013921	GAA	2	6	1009	1014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
15	NC_013921	GAT	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577266
16	NC_013921	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
17	NC_013921	CCA	2	6	1237	1242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577266
18	NC_013921	CGA	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577266
19	NC_013921	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
20	NC_013921	TAA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577266
21	NC_013921	AAG	3	9	1490	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
22	NC_013921	TAT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577266
23	NC_013921	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
24	NC_013921	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
25	NC_013921	AGA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
26	NC_013921	CTT	2	6	1705	1710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577266
27	NC_013921	GAA	2	6	1723	1728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577266
28	NC_013921	TTA	2	6	1749	1754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577266
29	NC_013921	ATT	2	6	2017	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577267
30	NC_013921	TCC	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577267
31	NC_013921	TAC	2	6	2062	2067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577267
32	NC_013921	AGA	3	9	2173	2181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
33	NC_013921	TAG	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577267
34	NC_013921	TAA	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577267
35	NC_013921	GAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
36	NC_013921	AGA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
37	NC_013921	AAT	2	6	2834	2839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577267
38	NC_013921	TTA	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577267
39	NC_013921	GAA	3	9	2996	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577267
40	NC_013921	TAA	3	9	3039	3047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577267
41	NC_013921	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
42	NC_013921	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
43	NC_013921	AAT	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
44	NC_013921	TAA	2	6	3613	3618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
45	NC_013921	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
46	NC_013921	ATA	2	6	3710	3715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
47	NC_013921	AAG	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577269
48	NC_013921	TAT	2	6	3763	3768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
49	NC_013921	AAG	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577269
50	NC_013921	TAG	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577269
51	NC_013921	AAT	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577269
52	NC_013921	ATT	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
53	NC_013921	ACA	2	6	4109	4114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577269
54	NC_013921	ATT	2	6	4145	4150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577269
55	NC_013921	TTC	2	6	4177	4182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577269
56	NC_013921	GAT	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577269
57	NC_013921	TAC	2	6	4360	4365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577269
58	NC_013921	GTT	2	6	4412	4417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577269
59	NC_013921	GGC	2	6	4456	4461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289577270
60	NC_013921	TGT	2	6	4509	4514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577270
61	NC_013921	ACT	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577270
62	NC_013921	GAA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577270
63	NC_013921	ATT	2	6	4732	4737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
64	NC_013921	ATT	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
65	NC_013921	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
66	NC_013921	AGA	2	6	4881	4886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
67	NC_013921	GAG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577271
68	NC_013921	AGA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
69	NC_013921	GGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289577271
70	NC_013921	ACT	3	9	5309	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577271
71	NC_013921	GAA	2	6	5372	5377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
72	NC_013921	GCC	2	6	5385	5390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289577271
73	NC_013921	CAA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577271
74	NC_013921	AGC	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577271
75	NC_013921	AGT	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577271
76	NC_013921	AAG	3	9	5762	5770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
77	NC_013921	TGG	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289577271
78	NC_013921	CTA	2	6	5867	5872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577271
79	NC_013921	ATA	2	6	5888	5893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577271
80	NC_013921	AAG	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
81	NC_013921	GCA	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577271
82	NC_013921	CTT	2	6	6094	6099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577271
83	NC_013921	ATG	3	9	6100	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577271
84	NC_013921	GAA	2	6	6187	6192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
85	NC_013921	GGC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289577271
86	NC_013921	AGA	2	6	6297	6302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
87	NC_013921	TAT	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
88	NC_013921	GAT	2	6	6421	6426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577271
89	NC_013921	ACG	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577271
90	NC_013921	ATT	2	6	6545	6550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
91	NC_013921	TAT	2	6	6580	6585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
92	NC_013921	AGG	2	6	6630	6635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289577271
93	NC_013921	ATT	2	6	6639	6644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577271
94	NC_013921	TTG	2	6	6665	6670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577271
95	NC_013921	ATA	3	9	6691	6699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577271
96	NC_013921	GAA	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
97	NC_013921	TGA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577271
98	NC_013921	GAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577271
99	NC_013921	TCT	2	6	7191	7196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577272
100	NC_013921	ATT	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577272
101	NC_013921	CCA	2	6	7279	7284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577272
102	NC_013921	TAC	2	6	7319	7324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577272
103	NC_013921	ATC	2	6	7332	7337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577272
104	NC_013921	ATA	2	6	7409	7414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577272
105	NC_013921	CCA	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289577272
106	NC_013921	GTC	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577272
107	NC_013921	CCT	2	6	7545	7550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577272
108	NC_013921	CTT	3	9	7635	7643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577272
109	NC_013921	TAA	2	6	7682	7687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289577272
110	NC_013921	TCC	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289577273
111	NC_013921	CAT	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577273
112	NC_013921	TTC	2	6	7795	7800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577273
113	NC_013921	TTA	2	6	7859	7864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577273
114	NC_013921	TTA	2	6	7923	7928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577273
115	NC_013921	TCT	2	6	7958	7963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577273
116	NC_013921	TAT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577273
117	NC_013921	CAA	2	6	8203	8208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289577273
118	NC_013921	GCT	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577273
119	NC_013921	TAG	2	6	8337	8342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577273
120	NC_013921	TCT	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577273
121	NC_013921	AGA	2	6	8467	8472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577273
122	NC_013921	TGT	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577273
123	NC_013921	TCA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577273
124	NC_013921	TTA	3	9	8676	8684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577273
125	NC_013921	GCT	2	6	8747	8752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577273
126	NC_013921	GCT	2	6	8779	8784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289577273
127	NC_013921	TTA	2	6	8787	8792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577273
128	NC_013921	CTT	2	6	8826	8831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289577273
129	NC_013921	TAT	2	6	8832	8837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289577273
130	NC_013921	ATC	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289577273
131	NC_013921	GCA	2	6	9523	9528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289577274
132	NC_013921	GTA	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577274
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134	NC_013921	TAG	2	6	9604	9609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289577274
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139	NC_013921	GTT	2	6	9822	9827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577274
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146	NC_013921	TTG	2	6	10270	10275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289577274
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253	NC_013921	AGA	2	6	19902	19907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289577282
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