MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013894	AGAGG	2	10	464	473	40 %	0 %	60 %	0 %	289547778
2	NC_013894	AGAGG	2	10	2282	2291	40 %	0 %	60 %	0 %	289547781
3	NC_013894	TGGTA	2	10	2389	2398	20 %	40 %	40 %	0 %	289547781
4	NC_013894	TTTGG	2	10	3177	3186	0 %	60 %	40 %	0 %	289547781
5	NC_013894	CAAAA	2	10	3810	3819	80 %	0 %	0 %	20 %	289547782
6	NC_013894	CAGGA	2	10	6979	6988	40 %	0 %	40 %	20 %	289547784
7	NC_013894	TGAGG	2	10	7355	7364	20 %	20 %	60 %	0 %	289547784
8	NC_013894	AAAGG	2	10	7988	7997	60 %	0 %	40 %	0 %	289547785
9	NC_013894	AAGGG	2	10	11136	11145	40 %	0 %	60 %	0 %	289547789
10	NC_013894	TATGA	2	10	11371	11380	40 %	40 %	20 %	0 %	289547790
11	NC_013894	CTTCT	2	10	13931	13940	0 %	60 %	0 %	40 %	289547792
12	NC_013894	TGTAG	2	10	16619	16628	20 %	40 %	40 %	0 %	289547795
13	NC_013894	AAGAG	2	10	17362	17371	60 %	0 %	40 %	0 %	289547795
14	NC_013894	AAAGG	2	10	20455	20464	60 %	0 %	40 %	0 %	289547799
15	NC_013894	TTCAG	2	10	21382	21391	20 %	40 %	20 %	20 %	289547800
16	NC_013894	TTTGT	2	10	21931	21940	0 %	80 %	20 %	0 %	289547802
17	NC_013894	GAAGG	2	10	23196	23205	40 %	0 %	60 %	0 %	289547804
18	NC_013894	TCCCA	2	10	24878	24887	20 %	20 %	0 %	60 %	289547804
19	NC_013894	ACGGG	2	10	26074	26083	20 %	0 %	60 %	20 %	289547806
20	NC_013894	CCAGT	2	10	26469	26478	20 %	20 %	20 %	40 %	289547806
21	NC_013894	AAACT	2	10	28935	28944	60 %	20 %	0 %	20 %	289547808
22	NC_013894	TCTTT	2	10	28957	28966	0 %	80 %	0 %	20 %	289547808
23	NC_013894	CGTAG	2	10	30253	30262	20 %	20 %	40 %	20 %	289547810
24	NC_013894	TCCTC	2	10	30360	30369	0 %	40 %	0 %	60 %	289547810
25	NC_013894	AAGGG	2	10	31723	31732	40 %	0 %	60 %	0 %	289547811
26	NC_013894	CAGGT	2	10	35055	35064	20 %	20 %	40 %	20 %	289547813
27	NC_013894	CCAAC	2	10	35761	35770	40 %	0 %	0 %	60 %	289547813
28	NC_013894	CCTCC	2	10	36872	36881	0 %	20 %	0 %	80 %	289547815
29	NC_013894	GTATT	2	10	37419	37428	20 %	60 %	20 %	0 %	289547816
30	NC_013894	TTGAG	2	10	38765	38774	20 %	40 %	40 %	0 %	289547818
31	NC_013894	CCTCC	2	10	42974	42983	0 %	20 %	0 %	80 %	289547824
32	NC_013894	ACCTT	2	10	44426	44435	20 %	40 %	0 %	40 %	289547825
33	NC_013894	ACACC	2	10	47987	47996	40 %	0 %	0 %	60 %	289547827
34	NC_013894	AGCCT	2	10	48067	48076	20 %	20 %	20 %	40 %	289547827
35	NC_013894	TGAGA	2	10	50415	50424	40 %	20 %	40 %	0 %	289547829
36	NC_013894	CCCAT	2	10	54014	54023	20 %	20 %	0 %	60 %	289547832
37	NC_013894	GAGAA	2	10	54466	54475	60 %	0 %	40 %	0 %	289547833
38	NC_013894	AGAGA	2	10	54946	54955	60 %	0 %	40 %	0 %	289547833
39	NC_013894	ACCTT	2	10	57740	57749	20 %	40 %	0 %	40 %	289547837
40	NC_013894	AGGAA	2	10	61780	61789	60 %	0 %	40 %	0 %	289547841
41	NC_013894	ACACC	2	10	61812	61821	40 %	0 %	0 %	60 %	289547841
42	NC_013894	GGTTC	2	10	63056	63065	0 %	40 %	40 %	20 %	289547842
43	NC_013894	GTCAT	2	10	63646	63655	20 %	40 %	20 %	20 %	289547842
44	NC_013894	ACCTT	2	10	63933	63942	20 %	40 %	0 %	40 %	289547842
45	NC_013894	ACAGA	2	10	64340	64349	60 %	0 %	20 %	20 %	289547843
46	NC_013894	CTCCC	2	10	64917	64926	0 %	20 %	0 %	80 %	289547843
47	NC_013894	CCATC	2	10	65294	65303	20 %	20 %	0 %	60 %	289547844
48	NC_013894	CCCTT	2	10	66250	66259	0 %	40 %	0 %	60 %	289547844
49	NC_013894	AAGGC	2	10	67847	67856	40 %	0 %	40 %	20 %	289547846
50	NC_013894	CTTCC	2	10	69225	69234	0 %	40 %	0 %	60 %	289547848
51	NC_013894	CAGAA	2	10	69540	69549	60 %	0 %	20 %	20 %	289547848
52	NC_013894	TATCC	2	10	70223	70232	20 %	40 %	0 %	40 %	289547849
53	NC_013894	TGGAG	2	10	79990	79999	20 %	20 %	60 %	0 %	289547858
54	NC_013894	CTTAT	2	10	81463	81472	20 %	60 %	0 %	20 %	289547860
55	NC_013894	TCCTC	2	10	82197	82206	0 %	40 %	0 %	60 %	289547862
56	NC_013894	CATCC	2	10	82495	82504	20 %	20 %	0 %	60 %	289547862
57	NC_013894	GTACA	2	10	84135	84144	40 %	20 %	20 %	20 %	289547864
58	NC_013894	CCTCT	2	10	84486	84495	0 %	40 %	0 %	60 %	289547865
59	NC_013894	GGGTT	2	10	88897	88906	0 %	40 %	60 %	0 %	289547868
60	NC_013894	TAACA	2	10	90008	90017	60 %	20 %	0 %	20 %	289547869
61	NC_013894	AGGAT	2	10	90816	90825	40 %	20 %	40 %	0 %	289547871
62	NC_013894	CACCG	2	10	91661	91670	20 %	0 %	20 %	60 %	289547873
63	NC_013894	GGTAA	2	10	94714	94723	40 %	20 %	40 %	0 %	289547876
64	NC_013894	CCATC	2	10	94744	94753	20 %	20 %	0 %	60 %	289547876
65	NC_013894	ACCTT	2	10	99921	99930	20 %	40 %	0 %	40 %	289547881
66	NC_013894	ACGCC	2	10	101592	101601	20 %	0 %	20 %	60 %	289547883
67	NC_013894	TCCCC	2	10	101913	101922	0 %	20 %	0 %	80 %	289547883
68	NC_013894	ATGGG	2	10	102409	102418	20 %	20 %	60 %	0 %	289547884
69	NC_013894	AGGGA	2	10	104597	104606	40 %	0 %	60 %	0 %	289547886
70	NC_013894	GAAAG	2	10	112572	112581	60 %	0 %	40 %	0 %	289547895
71	NC_013894	CCTAA	2	10	112856	112865	40 %	20 %	0 %	40 %	289547895
72	NC_013894	ACTCT	2	10	113339	113348	20 %	40 %	0 %	40 %	289547896
73	NC_013894	ACACC	2	10	113363	113372	40 %	0 %	0 %	60 %	289547896
74	NC_013894	GGTGC	2	10	120042	120051	0 %	20 %	60 %	20 %	289547901
75	NC_013894	GAAGA	2	10	122546	122555	60 %	0 %	40 %	0 %	289547904
76	NC_013894	TCTTT	2	10	125271	125280	0 %	80 %	0 %	20 %	289547908
77	NC_013894	TTTTG	2	10	128037	128046	0 %	80 %	20 %	0 %	289547911
78	NC_013894	ATCAA	2	10	128192	128201	60 %	20 %	0 %	20 %	289547911
79	NC_013894	AGAAA	2	10	129143	129152	80 %	0 %	20 %	0 %	289547912
80	NC_013894	CCTTT	2	10	130742	130751	0 %	60 %	0 %	40 %	289547914
81	NC_013894	GAAGA	2	10	131108	131117	60 %	0 %	40 %	0 %	289547914
82	NC_013894	GGGCT	2	10	134097	134106	0 %	20 %	60 %	20 %	289547917
83	NC_013894	TTTCT	2	10	136728	136737	0 %	80 %	0 %	20 %	289547923
84	NC_013894	AAGAT	2	10	136941	136950	60 %	20 %	20 %	0 %	289547923
85	NC_013894	CTCTT	2	10	139976	139985	0 %	60 %	0 %	40 %	289547927
86	NC_013894	CTTTT	2	10	140603	140612	0 %	80 %	0 %	20 %	289547927
87	NC_013894	TTATC	2	10	140937	140946	20 %	60 %	0 %	20 %	289547927
88	NC_013894	CTGAG	2	10	143330	143339	20 %	20 %	40 %	20 %	289547929
89	NC_013894	ATACG	2	10	145321	145330	40 %	20 %	20 %	20 %	289547932
90	NC_013894	AAGGT	2	10	146229	146238	40 %	20 %	40 %	0 %	289547932
91	NC_013894	TCCTC	2	10	147097	147106	0 %	40 %	0 %	60 %	289547933
92	NC_013894	CGGGG	2	10	148611	148620	0 %	0 %	80 %	20 %	289547934
93	NC_013894	ATAGG	2	10	152318	152327	40 %	20 %	40 %	0 %	289547938
94	NC_013894	GGTGA	2	10	153400	153409	20 %	20 %	60 %	0 %	289547938
95	NC_013894	TGGAC	2	10	154750	154759	20 %	20 %	40 %	20 %	289547940
96	NC_013894	ACACC	2	10	155088	155097	40 %	0 %	0 %	60 %	289547940
97	NC_013894	TGGGA	2	10	155444	155453	20 %	20 %	60 %	0 %	289547941
98	NC_013894	TAGTC	2	10	156107	156116	20 %	40 %	20 %	20 %	289547942
99	NC_013894	CACAG	2	10	158407	158416	40 %	0 %	20 %	40 %	289547944
100	NC_013894	TCAAC	2	10	159240	159249	40 %	20 %	0 %	40 %	289547945
101	NC_013894	TCACC	2	10	160856	160865	20 %	20 %	0 %	60 %	289547946
102	NC_013894	GGAGG	2	10	160889	160898	20 %	0 %	80 %	0 %	289547946
103	NC_013894	GGATG	2	10	161251	161260	20 %	20 %	60 %	0 %	289547946
104	NC_013894	CCAAA	2	10	167421	167430	60 %	0 %	0 %	40 %	289547955
105	NC_013894	TGTAC	2	10	168361	168370	20 %	40 %	20 %	20 %	289547956
106	NC_013894	ATCAG	2	10	169475	169484	40 %	20 %	20 %	20 %	289547957
107	NC_013894	TAAAG	2	10	171743	171752	60 %	20 %	20 %	0 %	289547960
108	NC_013894	AAGGA	2	10	172564	172573	60 %	0 %	40 %	0 %	289547960
109	NC_013894	AGAGG	2	10	182394	182403	40 %	0 %	60 %	0 %	289547969
110	NC_013894	CTTTA	2	10	185341	185350	20 %	60 %	0 %	20 %	289547971
111	NC_013894	CCTCT	2	10	188041	188050	0 %	40 %	0 %	60 %	289547974
112	NC_013894	CTAAG	2	10	189514	189523	40 %	20 %	20 %	20 %	289547975
113	NC_013894	CCCTA	2	10	192983	192992	20 %	20 %	0 %	60 %	289547978
114	NC_013894	ATGTT	2	10	199408	199417	20 %	60 %	20 %	0 %	289547986
115	NC_013894	AGGAG	2	10	204107	204116	40 %	0 %	60 %	0 %	289547990
116	NC_013894	CTGTC	2	10	204680	204689	0 %	40 %	20 %	40 %	289547990
117	NC_013894	CGTGA	2	10	208259	208268	20 %	20 %	40 %	20 %	289547991
118	NC_013894	ACCTG	2	10	208458	208467	20 %	20 %	20 %	40 %	289547992
119	NC_013894	TCTCC	2	10	209056	209065	0 %	40 %	0 %	60 %	289547992
120	NC_013894	CTTCC	2	10	210372	210381	0 %	40 %	0 %	60 %	289547993
121	NC_013894	ACCAC	2	10	212734	212743	40 %	0 %	0 %	60 %	289547994
122	NC_013894	CCCTC	2	10	214079	214088	0 %	20 %	0 %	80 %	289547996
123	NC_013894	CCCTT	2	10	214672	214681	0 %	40 %	0 %	60 %	289547997
124	NC_013894	AGCTT	2	10	215478	215487	20 %	40 %	20 %	20 %	289547998
125	NC_013894	AGGGA	2	10	216936	216945	40 %	0 %	60 %	0 %	289547999
126	NC_013894	CATAT	2	10	219039	219048	40 %	40 %	0 %	20 %	289548000
127	NC_013894	TTTGG	2	10	219447	219456	0 %	60 %	40 %	0 %	289548000
128	NC_013894	ACCAC	2	10	220862	220871	40 %	0 %	0 %	60 %	289548001
129	NC_013894	TTACT	2	10	222256	222265	20 %	60 %	0 %	20 %	289548002
130	NC_013894	GAGAG	2	10	222633	222642	40 %	0 %	60 %	0 %	289548003
131	NC_013894	TACCG	2	10	224590	224599	20 %	20 %	20 %	40 %	289548003
132	NC_013894	AGAAC	2	10	233481	233490	60 %	0 %	20 %	20 %	289548014
133	NC_013894	GGAGT	2	10	234251	234260	20 %	20 %	60 %	0 %	289548014
134	NC_013894	CCTTT	2	10	234307	234316	0 %	60 %	0 %	40 %	289548014
135	NC_013894	ATGTT	2	10	236328	236337	20 %	60 %	20 %	0 %	289548015
136	NC_013894	GTGTG	2	10	236713	236722	0 %	40 %	60 %	0 %	289548015
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140	NC_013894	TTCTA	2	10	243506	243515	20 %	60 %	0 %	20 %	289548022
141	NC_013894	CCTTT	2	10	245547	245556	0 %	60 %	0 %	40 %	289548023
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149	NC_013894	AAGTT	2	10	258382	258391	40 %	40 %	20 %	0 %	289548031
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251	NC_013894	CTCTT	2	10	428524	428533	0 %	60 %	0 %	40 %	289548211
252	NC_013894	TCCTT	2	10	429329	429338	0 %	60 %	0 %	40 %	289548212
253	NC_013894	AAACC	2	10	429428	429437	60 %	0 %	0 %	40 %	289548212
254	NC_013894	CTTTT	2	10	429921	429930	0 %	80 %	0 %	20 %	289548212
255	NC_013894	CAGAG	2	10	430892	430901	40 %	0 %	40 %	20 %	289548214
256	NC_013894	TCTCC	2	10	432885	432894	0 %	40 %	0 %	60 %	289548217
257	NC_013894	TTTTC	2	10	433180	433189	0 %	80 %	0 %	20 %	289548217
258	NC_013894	CCACA	2	10	434088	434097	40 %	0 %	0 %	60 %	289548218
259	NC_013894	TCTAC	2	10	434122	434131	20 %	40 %	0 %	40 %	289548218
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262	NC_013894	CTTCT	2	10	441202	441211	0 %	60 %	0 %	40 %	289548227
263	NC_013894	CCTTT	2	10	445475	445484	0 %	60 %	0 %	40 %	289548231
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