MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013894	TCA	2	6	161632	161637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547947
3502	NC_013894	AAG	2	6	161640	161645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547947
3503	NC_013894	GAG	2	6	161661	161666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547947
3504	NC_013894	AGC	2	6	161683	161688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547947
3505	NC_013894	GGTA	2	8	161718	161725	25 %	25 %	50 %	0 %	289547947
3506	NC_013894	CTT	2	6	161777	161782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547947
3507	NC_013894	GAT	2	6	161796	161801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547947
3508	NC_013894	TCA	3	9	161864	161872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547948
3509	NC_013894	CTTC	2	8	161908	161915	0 %	50 %	0 %	50 %	289547948
3510	NC_013894	GAG	2	6	161983	161988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547948
3511	NC_013894	T	7	7	161994	162000	0 %	100 %	0 %	0 %	289547948
3512	NC_013894	GGT	3	9	162063	162071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547948
3513	NC_013894	GGCT	2	8	162080	162087	0 %	25 %	50 %	25 %	289547948
3514	NC_013894	AAG	2	6	162107	162112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547948
3515	NC_013894	AG	3	6	162195	162200	50 %	0 %	50 %	0 %	289547948
3516	NC_013894	GAA	2	6	162208	162213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547948
3517	NC_013894	GACA	2	8	162225	162232	50 %	0 %	25 %	25 %	289547948
3518	NC_013894	GAT	2	6	162250	162255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547948
3519	NC_013894	GAA	2	6	162383	162388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547949
3520	NC_013894	AAG	2	6	162393	162398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547949
3521	NC_013894	GT	3	6	162399	162404	0 %	50 %	50 %	0 %	289547949
3522	NC_013894	AAG	2	6	162420	162425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547949
3523	NC_013894	TC	3	6	162464	162469	0 %	50 %	0 %	50 %	289547949
3524	NC_013894	AGG	2	6	162492	162497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547949
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3528	NC_013894	GA	3	6	162852	162857	50 %	0 %	50 %	0 %	289547950
3529	NC_013894	AGAA	2	8	162932	162939	75 %	0 %	25 %	0 %	289547950
3530	NC_013894	CTT	2	6	162944	162949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547950
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3533	NC_013894	AG	3	6	163124	163129	50 %	0 %	50 %	0 %	289547951
3534	NC_013894	AAG	2	6	163145	163150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547951
3535	NC_013894	GGGA	2	8	163256	163263	25 %	0 %	75 %	0 %	289547951
3536	NC_013894	CCA	2	6	163278	163283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547951
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3539	NC_013894	CTTC	2	8	163471	163478	0 %	50 %	0 %	50 %	289547951
3540	NC_013894	AGC	2	6	163491	163496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547951
3541	NC_013894	TCA	2	6	163627	163632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547951
3542	NC_013894	GGA	2	6	163682	163687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547951
3543	NC_013894	GGGA	2	8	163772	163779	25 %	0 %	75 %	0 %	289547951
3544	NC_013894	TA	3	6	163813	163818	50 %	50 %	0 %	0 %	289547951
3545	NC_013894	CATC	2	8	163833	163840	25 %	25 %	0 %	50 %	289547951
3546	NC_013894	AGT	2	6	163852	163857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547951
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3558	NC_013894	AAG	2	6	164629	164634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547952
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3562	NC_013894	GTGA	2	8	164784	164791	25 %	25 %	50 %	0 %	289547952
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3576	NC_013894	GGAC	2	8	165320	165327	25 %	0 %	50 %	25 %	289547952
3577	NC_013894	CT	3	6	165339	165344	0 %	50 %	0 %	50 %	289547952
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3595	NC_013894	AG	3	6	166142	166147	50 %	0 %	50 %	0 %	289547953
3596	NC_013894	CTC	2	6	166185	166190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547953
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3604	NC_013894	A	6	6	166481	166486	100 %	0 %	0 %	0 %	289547954
3605	NC_013894	TCT	2	6	166496	166501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547954
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3610	NC_013894	GGA	2	6	166717	166722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547954
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3612	NC_013894	CCA	2	6	166776	166781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547954
3613	NC_013894	GTCT	2	8	166837	166844	0 %	50 %	25 %	25 %	289547955
3614	NC_013894	TCC	2	6	166879	166884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547955
3615	NC_013894	ACC	2	6	166911	166916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547955
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3620	NC_013894	CAT	2	6	167118	167123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547955
3621	NC_013894	TCT	2	6	167125	167130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547955
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3994	NC_013894	TCA	2	6	186896	186901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547973
3995	NC_013894	AAG	2	6	187042	187047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547973
3996	NC_013894	AG	3	6	187063	187068	50 %	0 %	50 %	0 %	289547973
3997	NC_013894	AAG	2	6	187073	187078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547973
3998	NC_013894	TTCTGA	2	12	187144	187155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289547973
3999	NC_013894	CTC	2	6	187162	187167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547973
4000	NC_013894	GATCTG	2	12	187260	187271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289547973

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