MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_013894	TCC	2	6	139264	139269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
3003	NC_013894	CTT	2	6	139302	139307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3004	NC_013894	CAGA	2	8	139398	139405	50 %	0 %	25 %	25 %	289547926
3005	NC_013894	TCT	2	6	139450	139455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3006	NC_013894	TTC	2	6	139492	139497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3007	NC_013894	TC	3	6	139526	139531	0 %	50 %	0 %	50 %	289547926
3008	NC_013894	GGAA	2	8	139611	139618	50 %	0 %	50 %	0 %	289547926
3009	NC_013894	CAT	2	6	139642	139647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547926
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3011	NC_013894	TCC	2	6	139772	139777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
3012	NC_013894	CTT	2	6	139847	139852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547926
3013	NC_013894	CCT	2	6	139859	139864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547926
3014	NC_013894	CAA	2	6	139930	139935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547926
3015	NC_013894	CATA	2	8	139957	139964	50 %	25 %	0 %	25 %	289547926
3016	NC_013894	CTCTT	2	10	139976	139985	0 %	60 %	0 %	40 %	289547927
3017	NC_013894	CTAT	2	8	140005	140012	25 %	50 %	0 %	25 %	289547927
3018	NC_013894	CTT	2	6	140038	140043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547927
3019	NC_013894	TGG	2	6	140088	140093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547927
3020	NC_013894	ATG	2	6	140098	140103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547927
3021	NC_013894	TTA	2	6	140110	140115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547927
3022	NC_013894	TGT	2	6	140135	140140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547927
3023	NC_013894	GA	3	6	140185	140190	50 %	0 %	50 %	0 %	289547927
3024	NC_013894	TCT	2	6	140195	140200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547927
3025	NC_013894	GTA	2	6	140299	140304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547927
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3033	NC_013894	CTT	2	6	140518	140523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547927
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3035	NC_013894	TGG	2	6	140585	140590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547927
3036	NC_013894	CTTTT	2	10	140603	140612	0 %	80 %	0 %	20 %	289547927
3037	NC_013894	T	7	7	140609	140615	0 %	100 %	0 %	0 %	289547927
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3045	NC_013894	TTATC	2	10	140937	140946	20 %	60 %	0 %	20 %	289547927
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3052	NC_013894	TCT	2	6	141220	141225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547928
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3054	NC_013894	TCT	2	6	141280	141285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547928
3055	NC_013894	CA	3	6	141296	141301	50 %	0 %	0 %	50 %	289547928
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3060	NC_013894	GGA	2	6	141619	141624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547928
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3063	NC_013894	AGA	2	6	141676	141681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547928
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3069	NC_013894	CTT	2	6	142088	142093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547928
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3094	NC_013894	GTA	2	6	143015	143020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547929
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3105	NC_013894	CTGAG	2	10	143330	143339	20 %	20 %	40 %	20 %	289547929
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3110	NC_013894	TGA	2	6	143628	143633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547930
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3121	NC_013894	CTC	3	9	143933	143941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547930
3122	NC_013894	TGG	2	6	143949	143954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547930
3123	NC_013894	GAG	2	6	143981	143986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547930
3124	NC_013894	CTT	2	6	143987	143992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547930
3125	NC_013894	G	6	6	144003	144008	0 %	0 %	100 %	0 %	289547930
3126	NC_013894	GAA	2	6	144023	144028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547930
3127	NC_013894	TAC	2	6	144063	144068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547930
3128	NC_013894	GAA	2	6	144139	144144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547931
3129	NC_013894	CTT	2	6	144149	144154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547931
3130	NC_013894	TCCC	2	8	144161	144168	0 %	25 %	0 %	75 %	289547931
3131	NC_013894	GTG	2	6	144195	144200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547931
3132	NC_013894	GGA	2	6	144224	144229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547931
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3136	NC_013894	CTC	2	6	144395	144400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547931
3137	NC_013894	CAT	2	6	144401	144406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547931
3138	NC_013894	AC	3	6	144436	144441	50 %	0 %	0 %	50 %	289547931
3139	NC_013894	CTT	2	6	144507	144512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547931
3140	NC_013894	TTC	2	6	144514	144519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547931
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3142	NC_013894	CCA	2	6	144538	144543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547931
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3152	NC_013894	TCA	2	6	145137	145142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547932
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3154	NC_013894	TGG	3	9	145191	145199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547932
3155	NC_013894	CTT	2	6	145244	145249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547932
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3158	NC_013894	ATACG	2	10	145321	145330	40 %	20 %	20 %	20 %	289547932
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3162	NC_013894	AGA	2	6	145511	145516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547932
3163	NC_013894	CTT	2	6	145539	145544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547932
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3222	NC_013894	TCT	2	6	149017	149022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547935
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3226	NC_013894	TACAGG	2	12	149153	149164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289547935
3227	NC_013894	TGG	2	6	149208	149213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547935
3228	NC_013894	GAC	2	6	149264	149269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289547935
3229	NC_013894	CAAA	2	8	149287	149294	75 %	0 %	0 %	25 %	289547935
3230	NC_013894	ATC	2	6	149297	149302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547935
3231	NC_013894	AGA	2	6	149323	149328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547935
3232	NC_013894	TCC	2	6	149457	149462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547935
3233	NC_013894	A	6	6	149465	149470	100 %	0 %	0 %	0 %	289547935
3234	NC_013894	ATA	2	6	149474	149479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547935
3235	NC_013894	ACT	2	6	149575	149580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547935
3236	NC_013894	AGG	2	6	149613	149618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547935
3237	NC_013894	CAC	2	6	149620	149625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547935
3238	NC_013894	GTG	2	6	149681	149686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547935
3239	NC_013894	GAA	2	6	149687	149692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547935
3240	NC_013894	AAG	2	6	149984	149989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547935
3241	NC_013894	ACC	2	6	150220	150225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547935
3242	NC_013894	TGG	2	6	150234	150239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547935
3243	NC_013894	AG	3	6	150249	150254	50 %	0 %	50 %	0 %	289547935
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3245	NC_013894	GAG	2	6	150296	150301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547935
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3491	NC_013894	CT	3	6	161226	161231	0 %	50 %	0 %	50 %	289547946
3492	NC_013894	GGATG	2	10	161251	161260	20 %	20 %	60 %	0 %	289547946
3493	NC_013894	AAGG	2	8	161295	161302	50 %	0 %	50 %	0 %	289547946
3494	NC_013894	CTT	2	6	161307	161312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547946
3495	NC_013894	GCT	2	6	161345	161350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547946
3496	NC_013894	T	6	6	161390	161395	0 %	100 %	0 %	0 %	289547946
3497	NC_013894	TAC	2	6	161535	161540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547947
3498	NC_013894	GTG	2	6	161565	161570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547947
3499	NC_013894	GAG	3	9	161592	161600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547947
3500	NC_013894	GA	3	6	161624	161629	50 %	0 %	50 %	0 %	289547947

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