MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013894	TC	3	6	22194	22199	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
502	NC_013894	CAC	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547802
503	NC_013894	TC	3	6	22389	22394	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
504	NC_013894	TAT	2	6	22407	22412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547802
505	NC_013894	CT	4	8	22462	22469	0 %	50 %	0 %	50 %	289547802
506	NC_013894	T	6	6	22533	22538	0 %	100 %	0 %	0 %	289547802
507	NC_013894	AAG	2	6	22636	22641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547803
508	NC_013894	AGG	2	6	22644	22649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547803
509	NC_013894	AGA	2	6	22713	22718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547803
510	NC_013894	AGT	3	9	22778	22786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547803
511	NC_013894	TTG	2	6	22802	22807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547803
512	NC_013894	AG	3	6	22870	22875	50 %	0 %	50 %	0 %	289547803
513	NC_013894	T	6	6	22903	22908	0 %	100 %	0 %	0 %	289547803
514	NC_013894	CTC	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547803
515	NC_013894	AGT	2	6	23042	23047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547803
516	NC_013894	GAAGG	2	10	23196	23205	40 %	0 %	60 %	0 %	289547804
517	NC_013894	ATA	2	6	23275	23280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547804
518	NC_013894	TG	3	6	23294	23299	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
519	NC_013894	CTT	2	6	23333	23338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547804
520	NC_013894	GGA	2	6	23352	23357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
521	NC_013894	TGG	2	6	23390	23395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
522	NC_013894	AGAT	2	8	23555	23562	50 %	25 %	25 %	0 %	289547804
523	NC_013894	TAC	2	6	23584	23589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547804
524	NC_013894	TG	3	6	23599	23604	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
525	NC_013894	GT	3	6	23605	23610	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
526	NC_013894	GT	3	6	23626	23631	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
527	NC_013894	GGT	2	6	23637	23642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
528	NC_013894	GGA	2	6	23664	23669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
529	NC_013894	TG	4	8	23741	23748	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
530	NC_013894	AAG	2	6	23799	23804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547804
531	NC_013894	AAGA	2	8	23815	23822	75 %	0 %	25 %	0 %	289547804
532	NC_013894	GT	3	6	23839	23844	0 %	50 %	50 %	0 %	289547804
533	NC_013894	CAA	3	9	23973	23981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547804
534	NC_013894	GTG	2	6	24031	24036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
535	NC_013894	GTA	2	6	24047	24052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547804
536	NC_013894	CGG	2	6	24062	24067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289547804
537	NC_013894	AG	3	6	24138	24143	50 %	0 %	50 %	0 %	289547804
538	NC_013894	GTG	2	6	24146	24151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
539	NC_013894	CCTT	2	8	24188	24195	0 %	50 %	0 %	50 %	289547804
540	NC_013894	GAG	2	6	24229	24234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
541	NC_013894	CTT	2	6	24252	24257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547804
542	NC_013894	CT	3	6	24295	24300	0 %	50 %	0 %	50 %	289547804
543	NC_013894	TAC	2	6	24301	24306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547804
544	NC_013894	GAG	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547804
545	NC_013894	GTG	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
546	NC_013894	ACC	2	6	24790	24795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547804
547	NC_013894	TCCT	2	8	24820	24827	0 %	50 %	0 %	50 %	289547804
548	NC_013894	CTT	2	6	24865	24870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547804
549	NC_013894	TCCCA	2	10	24878	24887	20 %	20 %	0 %	60 %	289547804
550	NC_013894	TCC	2	6	24925	24930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547804
551	NC_013894	A	7	7	25004	25010	100 %	0 %	0 %	0 %	289547804
552	NC_013894	TGG	2	6	25025	25030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547804
553	NC_013894	AG	3	6	25079	25084	50 %	0 %	50 %	0 %	289547805
554	NC_013894	TGA	2	6	25153	25158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547805
555	NC_013894	AGGA	2	8	25203	25210	50 %	0 %	50 %	0 %	289547805
556	NC_013894	GAAG	2	8	25222	25229	50 %	0 %	50 %	0 %	289547805
557	NC_013894	GGA	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547805
558	NC_013894	GT	4	8	25284	25291	0 %	50 %	50 %	0 %	289547805
559	NC_013894	CTT	2	6	25314	25319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547805
560	NC_013894	TAC	2	6	25421	25426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547806
561	NC_013894	TC	4	8	25457	25464	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
562	NC_013894	CCT	2	6	25471	25476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
563	NC_013894	AC	3	6	25528	25533	50 %	0 %	0 %	50 %	289547806
564	NC_013894	CCT	2	6	25547	25552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
565	NC_013894	TGG	2	6	25636	25641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547806
566	NC_013894	CT	3	6	25653	25658	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
567	NC_013894	TCT	2	6	25675	25680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547806
568	NC_013894	T	6	6	25687	25692	0 %	100 %	0 %	0 %	289547806
569	NC_013894	GCT	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
570	NC_013894	CTC	2	6	25752	25757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547806
571	NC_013894	TCG	2	6	25903	25908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
572	NC_013894	CATC	2	8	26025	26032	25 %	25 %	0 %	50 %	289547806
573	NC_013894	ACCC	2	8	26060	26067	25 %	0 %	0 %	75 %	289547806
574	NC_013894	ACGGG	2	10	26074	26083	20 %	0 %	60 %	20 %	289547806
575	NC_013894	TCCC	2	8	26191	26198	0 %	25 %	0 %	75 %	289547806
576	NC_013894	AGT	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547806
577	NC_013894	ACA	2	6	26243	26248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289547806
578	NC_013894	GCT	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
579	NC_013894	AAG	2	6	26425	26430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547806
580	NC_013894	CCAGT	2	10	26469	26478	20 %	20 %	20 %	40 %	289547806
581	NC_013894	TGA	2	6	26497	26502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547806
582	NC_013894	AG	3	6	26685	26690	50 %	0 %	50 %	0 %	289547806
583	NC_013894	CTT	2	6	26694	26699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547806
584	NC_013894	CTG	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547806
585	NC_013894	CCAT	2	8	26768	26775	25 %	25 %	0 %	50 %	289547806
586	NC_013894	AAGC	2	8	26812	26819	50 %	0 %	25 %	25 %	289547806
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589	NC_013894	CT	3	6	27024	27029	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
590	NC_013894	CCTC	2	8	27061	27068	0 %	25 %	0 %	75 %	289547806
591	NC_013894	TG	3	6	27102	27107	0 %	50 %	50 %	0 %	289547806
592	NC_013894	CCTT	2	8	27112	27119	0 %	50 %	0 %	50 %	289547806
593	NC_013894	GA	4	8	27147	27154	50 %	0 %	50 %	0 %	289547806
594	NC_013894	T	6	6	27166	27171	0 %	100 %	0 %	0 %	289547807
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597	NC_013894	TCT	2	6	27270	27275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547807
598	NC_013894	GTA	2	6	27373	27378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547807
599	NC_013894	CT	3	6	27429	27434	0 %	50 %	0 %	50 %	289547807
600	NC_013894	GTG	3	9	27491	27499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289547807
601	NC_013894	AGGT	2	8	27532	27539	25 %	25 %	50 %	0 %	289547807
602	NC_013894	AAGA	2	8	27616	27623	75 %	0 %	25 %	0 %	289547807
603	NC_013894	CCT	2	6	27678	27683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547807
604	NC_013894	ATC	2	6	27748	27753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289547807
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608	NC_013894	AG	3	6	27919	27924	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
609	NC_013894	GA	3	6	27925	27930	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
610	NC_013894	CTT	2	6	27973	27978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
611	NC_013894	CCA	2	6	27979	27984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
612	NC_013894	CCA	2	6	27991	27996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
613	NC_013894	CT	3	6	28019	28024	0 %	50 %	0 %	50 %	289547808
614	NC_013894	TACC	2	8	28039	28046	25 %	25 %	0 %	50 %	289547808
615	NC_013894	GCT	2	6	28086	28091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289547808
616	NC_013894	TCT	2	6	28104	28109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
617	NC_013894	AG	3	6	28134	28139	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
618	NC_013894	TCC	2	6	28194	28199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
619	NC_013894	TGT	2	6	28210	28215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289547808
620	NC_013894	AGG	2	6	28245	28250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289547808
621	NC_013894	ATG	2	6	28326	28331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547808
622	NC_013894	TCC	2	6	28401	28406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
623	NC_013894	GA	4	8	28414	28421	50 %	0 %	50 %	0 %	289547808
624	NC_013894	CA	3	6	28429	28434	50 %	0 %	0 %	50 %	289547808
625	NC_013894	ATCT	2	8	28618	28625	25 %	50 %	0 %	25 %	289547808
626	NC_013894	AAT	2	6	28660	28665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289547808
627	NC_013894	AAG	2	6	28705	28710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289547808
628	NC_013894	CCA	2	6	28714	28719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
629	NC_013894	TCT	2	6	28731	28736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
630	NC_013894	TCT	2	6	28754	28759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289547808
631	NC_013894	TCC	2	6	28794	28799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
632	NC_013894	CAC	2	6	28823	28828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289547808
633	NC_013894	TCC	2	6	28862	28867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289547808
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636	NC_013894	AAACT	2	10	28935	28944	60 %	20 %	0 %	20 %	289547808
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645	NC_013894	G	6	6	29352	29357	0 %	0 %	100 %	0 %	289547809
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649	NC_013894	TAT	2	6	29599	29604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289547809
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656	NC_013894	GA	3	6	29719	29724	50 %	0 %	50 %	0 %	289547809
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752	NC_013894	GTA	2	6	33975	33980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289547813
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