MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013894	ACC	2	6	285260	285265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548058
6002	NC_013894	CTC	2	6	285326	285331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548058
6003	NC_013894	ACC	2	6	285360	285365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548058
6004	NC_013894	ATC	2	6	285368	285373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548058
6005	NC_013894	CTTT	2	8	285419	285426	0 %	75 %	0 %	25 %	289548058
6006	NC_013894	CTT	2	6	285481	285486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548058
6007	NC_013894	GAA	2	6	285508	285513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548058
6008	NC_013894	AAAGT	2	10	285537	285546	60 %	20 %	20 %	0 %	289548058
6009	NC_013894	CCA	2	6	285630	285635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548058
6010	NC_013894	CT	3	6	285742	285747	0 %	50 %	0 %	50 %	289548058
6011	NC_013894	TC	4	8	285750	285757	0 %	50 %	0 %	50 %	289548058
6012	NC_013894	CCTC	2	8	285759	285766	0 %	25 %	0 %	75 %	289548058
6013	NC_013894	AGA	2	6	285827	285832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548058
6014	NC_013894	TTG	2	6	286067	286072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548059
6015	NC_013894	ATC	2	6	286092	286097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548059
6016	NC_013894	GA	3	6	286127	286132	50 %	0 %	50 %	0 %	289548059
6017	NC_013894	AGA	2	6	286138	286143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548059
6018	NC_013894	A	6	6	286160	286165	100 %	0 %	0 %	0 %	289548059
6019	NC_013894	CAG	2	6	286196	286201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548059
6020	NC_013894	ATA	2	6	286217	286222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548059
6021	NC_013894	TGG	2	6	286230	286235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548059
6022	NC_013894	AGAAGG	2	12	286257	286268	50 %	0 %	50 %	0 %	289548059
6023	NC_013894	A	7	7	286278	286284	100 %	0 %	0 %	0 %	289548059
6024	NC_013894	AGG	2	6	286312	286317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548060
6025	NC_013894	GCT	2	6	286398	286403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548060
6026	NC_013894	TG	3	6	286548	286553	0 %	50 %	50 %	0 %	289548060
6027	NC_013894	CCATAA	2	12	286612	286623	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	289548060
6028	NC_013894	GCTG	2	8	286625	286632	0 %	25 %	50 %	25 %	289548060
6029	NC_013894	G	6	6	286700	286705	0 %	0 %	100 %	0 %	289548060
6030	NC_013894	GA	3	6	286713	286718	50 %	0 %	50 %	0 %	289548060
6031	NC_013894	AGC	2	6	286733	286738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548060
6032	NC_013894	ATC	2	6	286863	286868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548060
6033	NC_013894	AG	4	8	286900	286907	50 %	0 %	50 %	0 %	289548060
6034	NC_013894	TGG	2	6	286912	286917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548060
6035	NC_013894	GAG	2	6	286995	287000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548060
6036	NC_013894	GA	3	6	287027	287032	50 %	0 %	50 %	0 %	289548060
6037	NC_013894	AGC	2	6	287123	287128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548060
6038	NC_013894	GGA	2	6	287144	287149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548060
6039	NC_013894	CAA	2	6	287207	287212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548060
6040	NC_013894	CTG	2	6	287319	287324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548060
6041	NC_013894	CTC	2	6	287349	287354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548060
6042	NC_013894	CAA	2	6	287357	287362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548060
6043	NC_013894	GGT	2	6	287402	287407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548060
6044	NC_013894	AAG	2	6	287466	287471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548060
6045	NC_013894	TAC	2	6	287548	287553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548061
6046	NC_013894	ACC	2	6	287603	287608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548061
6047	NC_013894	CCT	2	6	287722	287727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548061
6048	NC_013894	CCCTTA	2	12	287734	287745	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289548061
6049	NC_013894	TGT	2	6	287761	287766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548061
6050	NC_013894	CCA	2	6	287845	287850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548061
6051	NC_013894	CTC	2	6	287882	287887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548061
6052	NC_013894	GTA	2	6	287897	287902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548061
6053	NC_013894	CT	3	6	287949	287954	0 %	50 %	0 %	50 %	289548061
6054	NC_013894	CGAG	2	8	287970	287977	25 %	0 %	50 %	25 %	289548061
6055	NC_013894	CTG	2	6	288008	288013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548061
6056	NC_013894	AGT	2	6	288075	288080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548061
6057	NC_013894	AG	4	8	288092	288099	50 %	0 %	50 %	0 %	289548061
6058	NC_013894	ACT	2	6	288164	288169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548061
6059	NC_013894	T	7	7	288211	288217	0 %	100 %	0 %	0 %	289548061
6060	NC_013894	TGA	2	6	288220	288225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548061
6061	NC_013894	GTA	3	9	288320	288328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548061
6062	NC_013894	CTTA	2	8	288359	288366	25 %	50 %	0 %	25 %	289548061
6063	NC_013894	CCA	2	6	288368	288373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548061
6064	NC_013894	AGT	2	6	288384	288389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548061
6065	NC_013894	TCC	2	6	288391	288396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548061
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6067	NC_013894	AAG	2	6	288428	288433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548061
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6069	NC_013894	CCT	3	9	288504	288512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548062
6070	NC_013894	TTC	2	6	288516	288521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548062
6071	NC_013894	CCA	2	6	288522	288527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548062
6072	NC_013894	TCC	2	6	288546	288551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548062
6073	NC_013894	T	6	6	288556	288561	0 %	100 %	0 %	0 %	289548062
6074	NC_013894	AGGTCC	2	12	288614	288625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289548062
6075	NC_013894	TCCCAG	2	12	288631	288642	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289548062
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6077	NC_013894	TGTGT	2	10	288760	288769	0 %	60 %	40 %	0 %	289548062
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6081	NC_013894	GTT	2	6	288905	288910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548062
6082	NC_013894	TTG	2	6	288911	288916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548062
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6087	NC_013894	CTA	2	6	289032	289037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548062
6088	NC_013894	ACC	3	9	289139	289147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548062
6089	NC_013894	GGCA	2	8	289148	289155	25 %	0 %	50 %	25 %	289548062
6090	NC_013894	CAG	2	6	289165	289170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548062
6091	NC_013894	AG	3	6	289169	289174	50 %	0 %	50 %	0 %	289548062
6092	NC_013894	T	6	6	289259	289264	0 %	100 %	0 %	0 %	289548062
6093	NC_013894	TCC	2	6	289436	289441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548062
6094	NC_013894	TCC	2	6	289501	289506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548062
6095	NC_013894	ACCC	2	8	289516	289523	25 %	0 %	0 %	75 %	289548062
6096	NC_013894	TC	3	6	289538	289543	0 %	50 %	0 %	50 %	289548063
6097	NC_013894	TGA	2	6	289558	289563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548063
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6100	NC_013894	TCG	2	6	289635	289640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548063
6101	NC_013894	TCC	2	6	289656	289661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548063
6102	NC_013894	CCA	2	6	289708	289713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548063
6103	NC_013894	CCA	2	6	289786	289791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548063
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6105	NC_013894	CT	3	6	289923	289928	0 %	50 %	0 %	50 %	289548063
6106	NC_013894	TC	4	8	289935	289942	0 %	50 %	0 %	50 %	289548063
6107	NC_013894	TCTT	2	8	289973	289980	0 %	75 %	0 %	25 %	289548063
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6110	NC_013894	GGC	2	6	290027	290032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548063
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6112	NC_013894	GA	3	6	290069	290074	50 %	0 %	50 %	0 %	289548063
6113	NC_013894	CCT	2	6	290079	290084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548063
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6121	NC_013894	TC	3	6	290556	290561	0 %	50 %	0 %	50 %	289548063
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6123	NC_013894	ACC	2	6	290651	290656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548063
6124	NC_013894	ACC	2	6	290691	290696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548063
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6127	NC_013894	TACGG	2	10	290858	290867	20 %	20 %	40 %	20 %	289548063
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6233	NC_013894	TCG	2	6	295752	295757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548070
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6244	NC_013894	GGA	2	6	296196	296201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548070
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