MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 31593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013894	GGA	2	6	232959	232964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548013
5002	NC_013894	TGG	2	6	232990	232995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548013
5003	NC_013894	GAT	2	6	233001	233006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548013
5004	NC_013894	GGAC	2	8	233048	233055	25 %	0 %	50 %	25 %	289548013
5005	NC_013894	AG	3	6	233074	233079	50 %	0 %	50 %	0 %	289548013
5006	NC_013894	GAG	2	6	233114	233119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548013
5007	NC_013894	GGA	2	6	233150	233155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548013
5008	NC_013894	TC	3	6	233189	233194	0 %	50 %	0 %	50 %	289548013
5009	NC_013894	ACG	2	6	233200	233205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548013
5010	NC_013894	GGA	2	6	233210	233215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548013
5011	NC_013894	TCTT	2	8	233295	233302	0 %	75 %	0 %	25 %	289548013
5012	NC_013894	GTG	2	6	233402	233407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548014
5013	NC_013894	AGAAC	2	10	233481	233490	60 %	0 %	20 %	20 %	289548014
5014	NC_013894	GCT	2	6	233501	233506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548014
5015	NC_013894	GAAA	2	8	233519	233526	75 %	0 %	25 %	0 %	289548014
5016	NC_013894	GATA	2	8	233596	233603	50 %	25 %	25 %	0 %	289548014
5017	NC_013894	ACT	2	6	233605	233610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548014
5018	NC_013894	TC	3	6	233663	233668	0 %	50 %	0 %	50 %	289548014
5019	NC_013894	GA	3	6	233682	233687	50 %	0 %	50 %	0 %	289548014
5020	NC_013894	GTG	2	6	233838	233843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548014
5021	NC_013894	AGG	2	6	233847	233852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548014
5022	NC_013894	TGG	2	6	233874	233879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548014
5023	NC_013894	GAAG	2	8	233887	233894	50 %	0 %	50 %	0 %	289548014
5024	NC_013894	AGA	2	6	233902	233907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548014
5025	NC_013894	GAG	2	6	234009	234014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548014
5026	NC_013894	GAC	2	6	234098	234103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548014
5027	NC_013894	TCTG	2	8	234161	234168	0 %	50 %	25 %	25 %	289548014
5028	NC_013894	TCA	2	6	234186	234191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548014
5029	NC_013894	TTC	2	6	234215	234220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548014
5030	NC_013894	GGAGT	2	10	234251	234260	20 %	20 %	60 %	0 %	289548014
5031	NC_013894	TGA	2	6	234268	234273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548014
5032	NC_013894	CCTTT	2	10	234307	234316	0 %	60 %	0 %	40 %	289548014
5033	NC_013894	GAA	2	6	234338	234343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548014
5034	NC_013894	TAC	2	6	234347	234352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548014
5035	NC_013894	GGT	2	6	234385	234390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548014
5036	NC_013894	GGA	2	6	234391	234396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548014
5037	NC_013894	GAA	2	6	234620	234625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548014
5038	NC_013894	TTCC	2	8	234684	234691	0 %	50 %	0 %	50 %	289548014
5039	NC_013894	AGG	2	6	234789	234794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
5040	NC_013894	AGG	2	6	234933	234938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
5041	NC_013894	AAG	2	6	234945	234950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548015
5042	NC_013894	AG	3	6	234949	234954	50 %	0 %	50 %	0 %	289548015
5043	NC_013894	CTG	2	6	234957	234962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548015
5044	NC_013894	GGA	2	6	234979	234984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
5045	NC_013894	A	6	6	234998	235003	100 %	0 %	0 %	0 %	289548015
5046	NC_013894	AGGA	2	8	235010	235017	50 %	0 %	50 %	0 %	289548015
5047	NC_013894	GAA	2	6	235036	235041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548015
5048	NC_013894	AGA	2	6	235042	235047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548015
5049	NC_013894	GGA	2	6	235048	235053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
5050	NC_013894	ACC	2	6	235117	235122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548015
5051	NC_013894	ACC	2	6	235183	235188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548015
5052	NC_013894	AGG	2	6	235263	235268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
5053	NC_013894	AAG	2	6	235269	235274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548015
5054	NC_013894	AGGT	2	8	235287	235294	25 %	25 %	50 %	0 %	289548015
5055	NC_013894	ACC	2	6	235346	235351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548015
5056	NC_013894	CTG	2	6	235352	235357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548015
5057	NC_013894	GCA	2	6	235382	235387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548015
5058	NC_013894	AG	3	6	235388	235393	50 %	0 %	50 %	0 %	289548015
5059	NC_013894	GGA	2	6	235446	235451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
5060	NC_013894	CTT	2	6	235459	235464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548015
5061	NC_013894	AC	3	6	235467	235472	50 %	0 %	0 %	50 %	289548015
5062	NC_013894	CT	3	6	235492	235497	0 %	50 %	0 %	50 %	289548015
5063	NC_013894	TGG	3	9	235536	235544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548015
5064	NC_013894	CGA	2	6	235549	235554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548015
5065	NC_013894	CAT	2	6	235612	235617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548015
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5068	NC_013894	GAG	2	6	235710	235715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
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5070	NC_013894	ACC	2	6	235937	235942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548015
5071	NC_013894	AGG	2	6	235989	235994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548015
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5074	NC_013894	AAG	2	6	236168	236173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548015
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5090	NC_013894	ACG	2	6	236739	236744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548015
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5092	NC_013894	GAGGT	2	10	236774	236783	20 %	20 %	60 %	0 %	289548015
5093	NC_013894	AGA	2	6	236785	236790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548015
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5095	NC_013894	TGG	2	6	236846	236851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548016
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5098	NC_013894	GA	3	6	236976	236981	50 %	0 %	50 %	0 %	289548016
5099	NC_013894	TCA	2	6	237002	237007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548016
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5101	NC_013894	CT	3	6	237041	237046	0 %	50 %	0 %	50 %	289548016
5102	NC_013894	TGG	2	6	237047	237052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548016
5103	NC_013894	GAAG	2	8	237063	237070	50 %	0 %	50 %	0 %	289548016
5104	NC_013894	GGAT	2	8	237116	237123	25 %	25 %	50 %	0 %	289548016
5105	NC_013894	GTGG	2	8	237219	237226	0 %	25 %	75 %	0 %	289548016
5106	NC_013894	CAT	2	6	237249	237254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548016
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5109	NC_013894	AG	3	6	237288	237293	50 %	0 %	50 %	0 %	289548016
5110	NC_013894	GTA	2	6	237295	237300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548016
5111	NC_013894	CAA	2	6	237315	237320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548016
5112	NC_013894	CT	3	6	237341	237346	0 %	50 %	0 %	50 %	289548016
5113	NC_013894	TC	3	6	237367	237372	0 %	50 %	0 %	50 %	289548016
5114	NC_013894	AGGGTT	2	12	237379	237390	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289548016
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5119	NC_013894	GGTT	2	8	237529	237536	0 %	50 %	50 %	0 %	289548017
5120	NC_013894	CCA	2	6	237550	237555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548017
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5122	NC_013894	TTCT	2	8	237791	237798	0 %	75 %	0 %	25 %	289548017
5123	NC_013894	TCT	3	9	237796	237804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548017
5124	NC_013894	TCA	2	6	237967	237972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548017
5125	NC_013894	GATC	2	8	238096	238103	25 %	25 %	25 %	25 %	289548017
5126	NC_013894	TGA	2	6	238150	238155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548017
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5128	NC_013894	ATC	3	9	238232	238240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548017
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5130	NC_013894	TCC	2	6	238293	238298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548017
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5132	NC_013894	ATG	2	6	238410	238415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548017
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5240	NC_013894	CCTT	2	8	243816	243823	0 %	50 %	0 %	50 %	289548022
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5248	NC_013894	TCC	2	6	244221	244226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548022
5249	NC_013894	GAG	2	6	244236	244241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548022
5250	NC_013894	CTC	2	6	244259	244264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548022
5251	NC_013894	TACC	2	8	244276	244283	25 %	25 %	0 %	50 %	289548022
5252	NC_013894	GTA	2	6	244382	244387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548022
5253	NC_013894	GAA	2	6	244436	244441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548022
5254	NC_013894	CCT	2	6	244457	244462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548022
5255	NC_013894	CT	3	6	244469	244474	0 %	50 %	0 %	50 %	289548022
5256	NC_013894	TTA	2	6	244513	244518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548022
5257	NC_013894	TCA	2	6	244533	244538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548022
5258	NC_013894	ATTAGG	2	12	244605	244616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548022
5259	NC_013894	CTT	2	6	244633	244638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548022
5260	NC_013894	TAT	2	6	244659	244664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548023
5261	NC_013894	ACC	2	6	244714	244719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548023
5262	NC_013894	TCC	2	6	244759	244764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548023
5263	NC_013894	TCT	2	6	244765	244770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548023
5264	NC_013894	ATCT	2	8	244823	244830	25 %	50 %	0 %	25 %	289548023
5265	NC_013894	C	6	6	244885	244890	0 %	0 %	0 %	100 %	289548023
5266	NC_013894	TGA	2	6	245014	245019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548023
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5268	NC_013894	TGA	2	6	245051	245056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548023
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5273	NC_013894	C	6	6	245224	245229	0 %	0 %	0 %	100 %	289548023
5274	NC_013894	CCT	2	6	245247	245252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548023
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5277	NC_013894	CAT	2	6	245457	245462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548023
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5280	NC_013894	CAC	2	6	245495	245500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548023
5281	NC_013894	CTG	2	6	245539	245544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548023
5282	NC_013894	CCTTT	2	10	245547	245556	0 %	60 %	0 %	40 %	289548023
5283	NC_013894	CCTG	2	8	245596	245603	0 %	25 %	25 %	50 %	289548023
5284	NC_013894	CTC	2	6	245635	245640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548024
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5370	NC_013894	TTC	2	6	254633	254638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548028
5371	NC_013894	GTAA	2	8	254651	254658	50 %	25 %	25 %	0 %	289548028
5372	NC_013894	GAAG	2	8	254707	254714	50 %	0 %	50 %	0 %	289548028
5373	NC_013894	AG	4	8	254713	254720	50 %	0 %	50 %	0 %	289548028
5374	NC_013894	CCT	2	6	254724	254729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548028
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5378	NC_013894	CCT	2	6	255018	255023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548028
5379	NC_013894	AGGAA	2	10	255025	255034	60 %	0 %	40 %	0 %	289548028
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5383	NC_013894	CTA	2	6	255190	255195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548028
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5391	NC_013894	TGCT	2	8	255569	255576	0 %	50 %	25 %	25 %	289548028
5392	NC_013894	CT	3	6	255575	255580	0 %	50 %	0 %	50 %	289548028
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5399	NC_013894	TCT	2	6	256089	256094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548029
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5478	NC_013894	ATC	2	6	259754	259759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548033
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5481	NC_013894	TAC	2	6	259869	259874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548033
5482	NC_013894	ACCT	2	8	259913	259920	25 %	25 %	0 %	50 %	289548033
5483	NC_013894	AGA	2	6	259975	259980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548033
5484	NC_013894	GCT	2	6	260054	260059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548033
5485	NC_013894	AGA	2	6	260064	260069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548033
5486	NC_013894	TAAGA	2	10	260221	260230	60 %	20 %	20 %	0 %	289548033
5487	NC_013894	G	6	6	260242	260247	0 %	0 %	100 %	0 %	289548033
5488	NC_013894	TAC	2	6	260363	260368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548033
5489	NC_013894	A	6	6	260380	260385	100 %	0 %	0 %	0 %	289548033
5490	NC_013894	GAA	2	6	260393	260398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548033
5491	NC_013894	CCCA	2	8	260429	260436	25 %	0 %	0 %	75 %	289548033
5492	NC_013894	CCA	2	6	260446	260451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548033
5493	NC_013894	TGC	2	6	260490	260495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548033
5494	NC_013894	ACA	2	6	260637	260642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548033
5495	NC_013894	GGA	2	6	260644	260649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548033
5496	NC_013894	A	6	6	260750	260755	100 %	0 %	0 %	0 %	289548033
5497	NC_013894	GGT	2	6	260786	260791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548034
5498	NC_013894	CTTT	2	8	260813	260820	0 %	75 %	0 %	25 %	289548034
5499	NC_013894	CCA	2	6	260917	260922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548034
5500	NC_013894	CTT	2	6	260999	261004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548034

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