MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013889	GGTT	2	8	185010	185017	0 %	50 %	50 %	0 %	289207363
4003	NC_013889	GC	3	6	185037	185042	0 %	0 %	50 %	50 %	289207363
4004	NC_013889	ACC	2	6	185059	185064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207363
4005	NC_013889	GCC	2	6	185088	185093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207363
4006	NC_013889	CGT	2	6	185114	185119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207363
4007	NC_013889	GCA	2	6	185153	185158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207363
4008	NC_013889	CCA	2	6	185171	185176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207363
4009	NC_013889	CCT	2	6	185192	185197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207363
4010	NC_013889	CTC	2	6	185211	185216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207363
4011	NC_013889	CAC	2	6	185220	185225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207363
4012	NC_013889	CGG	2	6	185321	185326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207363
4013	NC_013889	GCG	2	6	185383	185388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207363
4014	NC_013889	GGC	2	6	185412	185417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207363
4015	NC_013889	AGC	2	6	185501	185506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207363
4016	NC_013889	GCC	2	6	185507	185512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207363
4017	NC_013889	CGG	2	6	185513	185518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207363
4018	NC_013889	CCA	2	6	185531	185536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207363
4019	NC_013889	GCG	2	6	185549	185554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207363
4020	NC_013889	GGCCAG	2	12	185595	185606	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207363
4021	NC_013889	CG	3	6	185659	185664	0 %	0 %	50 %	50 %	289207363
4022	NC_013889	CCAGG	2	10	185724	185733	20 %	0 %	40 %	40 %	289207363
4023	NC_013889	CCG	2	6	185746	185751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207363
4024	NC_013889	ATG	2	6	185773	185778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207363
4025	NC_013889	TCG	2	6	185837	185842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207364
4026	NC_013889	GCG	2	6	185843	185848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4027	NC_013889	TCG	3	9	185858	185866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207364
4028	NC_013889	GCC	2	6	185875	185880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207364
4029	NC_013889	CGG	2	6	185892	185897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4030	NC_013889	CGG	2	6	185910	185915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4031	NC_013889	GAA	2	6	185941	185946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207364
4032	NC_013889	TCG	2	6	185987	185992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207364
4033	NC_013889	GCC	2	6	185993	185998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207364
4034	NC_013889	GC	3	6	186013	186018	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4035	NC_013889	CACC	2	8	186045	186052	25 %	0 %	0 %	75 %	289207364
4036	NC_013889	GC	3	6	186153	186158	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4037	NC_013889	CAG	2	6	186217	186222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207364
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4039	NC_013889	GC	3	6	186255	186260	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4040	NC_013889	CGGG	2	8	186267	186274	0 %	0 %	75 %	25 %	289207364
4041	NC_013889	TTC	2	6	186293	186298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207364
4042	NC_013889	GGC	2	6	186301	186306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4043	NC_013889	GC	3	6	186318	186323	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4044	NC_013889	GGC	2	6	186363	186368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4045	NC_013889	GAT	2	6	186415	186420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207364
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4047	NC_013889	GGTC	2	8	186441	186448	0 %	25 %	50 %	25 %	289207364
4048	NC_013889	GCCAC	2	10	186491	186500	20 %	0 %	20 %	60 %	289207364
4049	NC_013889	GGC	2	6	186562	186567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
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4052	NC_013889	GC	3	6	186668	186673	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4053	NC_013889	GGC	2	6	186790	186795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4054	NC_013889	GC	3	6	186802	186807	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4055	NC_013889	CGC	2	6	186820	186825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207364
4056	NC_013889	CAG	2	6	186883	186888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207364
4057	NC_013889	TGG	2	6	186909	186914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207364
4058	NC_013889	GC	3	6	186947	186952	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4059	NC_013889	CCG	2	6	186965	186970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207364
4060	NC_013889	CCT	2	6	186990	186995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207364
4061	NC_013889	GC	3	6	187012	187017	0 %	0 %	50 %	50 %	289207364
4062	NC_013889	CAC	2	6	187045	187050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207364
4063	NC_013889	CAG	2	6	187051	187056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207364
4064	NC_013889	CGG	2	6	187063	187068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207364
4065	NC_013889	CGC	2	6	187106	187111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207364
4066	NC_013889	TCCA	2	8	187156	187163	25 %	25 %	0 %	50 %	289207364
4067	NC_013889	GTT	2	6	187210	187215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207364
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4069	NC_013889	GCGG	2	8	187228	187235	0 %	0 %	75 %	25 %	289207364
4070	NC_013889	CCG	2	6	187238	187243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207364
4071	NC_013889	TCT	2	6	187302	187307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207364
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4073	NC_013889	CCGA	2	8	187873	187880	25 %	0 %	25 %	50 %	289207365
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4082	NC_013889	GGT	2	6	188220	188225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207365
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4084	NC_013889	CAT	2	6	188349	188354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207365
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4087	NC_013889	ACG	2	6	188399	188404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207365
4088	NC_013889	CAG	2	6	188542	188547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207365
4089	NC_013889	CTT	2	6	188598	188603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207365
4090	NC_013889	CGT	2	6	188666	188671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207366
4091	NC_013889	GC	3	6	188679	188684	0 %	0 %	50 %	50 %	289207366
4092	NC_013889	ACT	2	6	188686	188691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207366
4093	NC_013889	ACA	2	6	188692	188697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207366
4094	NC_013889	TGG	2	6	188876	188881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207366
4095	NC_013889	TC	3	6	188933	188938	0 %	50 %	0 %	50 %	289207366
4096	NC_013889	CAA	2	6	188969	188974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207366
4097	NC_013889	CGA	2	6	189029	189034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207366
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4100	NC_013889	AGG	2	6	189115	189120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207366
4101	NC_013889	CG	4	8	189122	189129	0 %	0 %	50 %	50 %	289207366
4102	NC_013889	TGGC	2	8	189143	189150	0 %	25 %	50 %	25 %	289207366
4103	NC_013889	CGATC	2	10	189200	189209	20 %	20 %	20 %	40 %	289207366
4104	NC_013889	GGC	2	6	189260	189265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207366
4105	NC_013889	CCAG	2	8	189307	189314	25 %	0 %	25 %	50 %	289207366
4106	NC_013889	GCA	2	6	189419	189424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207366
4107	NC_013889	CGG	2	6	189434	189439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207366
4108	NC_013889	CTTCCG	2	12	189467	189478	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	289207366
4109	NC_013889	GCCG	2	8	189482	189489	0 %	0 %	50 %	50 %	289207366
4110	NC_013889	GGC	2	6	189539	189544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207367
4111	NC_013889	GCC	2	6	189662	189667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207367
4112	NC_013889	A	6	6	189733	189738	100 %	0 %	0 %	0 %	289207367
4113	NC_013889	CGGT	2	8	189769	189776	0 %	25 %	50 %	25 %	289207367
4114	NC_013889	CCA	2	6	189788	189793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207367
4115	NC_013889	CGG	2	6	189805	189810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207367
4116	NC_013889	TCG	2	6	189862	189867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207367
4117	NC_013889	GCC	3	9	189885	189893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207367
4118	NC_013889	G	6	6	189976	189981	0 %	0 %	100 %	0 %	289207367
4119	NC_013889	GCG	2	6	190023	190028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207367
4120	NC_013889	GTG	2	6	190098	190103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207367
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4122	NC_013889	GC	3	6	190158	190163	0 %	0 %	50 %	50 %	289207367
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4243	NC_013889	GCCA	2	8	195212	195219	25 %	0 %	25 %	50 %	289207370
4244	NC_013889	CCG	2	6	195282	195287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207370
4245	NC_013889	GCA	2	6	195325	195330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207370
4246	NC_013889	CG	3	6	195343	195348	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4247	NC_013889	GC	3	6	195371	195376	0 %	0 %	50 %	50 %	289207370
4248	NC_013889	GAA	2	6	195419	195424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207370
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4250	NC_013889	GGC	2	6	195442	195447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207370
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4255	NC_013889	GGA	2	6	195574	195579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207370
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4264	NC_013889	ATC	2	6	195854	195859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207371
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4358	NC_013889	GTT	2	6	199556	199561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207375
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4360	NC_013889	TGC	2	6	199641	199646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207375
4361	NC_013889	GACT	2	8	199665	199672	25 %	25 %	25 %	25 %	289207375
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4365	NC_013889	CTG	2	6	199787	199792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207375
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4481	NC_013889	GGCTG	2	10	205746	205755	0 %	20 %	60 %	20 %	289207382
4482	NC_013889	TGG	2	6	205768	205773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207382
4483	NC_013889	CGC	2	6	205864	205869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207382
4484	NC_013889	ACC	2	6	205877	205882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207382
4485	NC_013889	CGG	2	6	205953	205958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207382
4486	NC_013889	GAT	2	6	205987	205992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207382
4487	NC_013889	GTG	2	6	206018	206023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207382
4488	NC_013889	TCG	2	6	206031	206036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207382
4489	NC_013889	CGA	2	6	206056	206061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207382
4490	NC_013889	TGC	2	6	206118	206123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207382
4491	NC_013889	CTCCGG	2	12	206627	206638	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289207383
4492	NC_013889	CTG	3	9	206646	206654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207383
4493	NC_013889	CG	3	6	206655	206660	0 %	0 %	50 %	50 %	289207383
4494	NC_013889	CTGG	2	8	206697	206704	0 %	25 %	50 %	25 %	289207383
4495	NC_013889	TGG	2	6	206775	206780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207383
4496	NC_013889	GAT	2	6	206793	206798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207383
4497	NC_013889	CCG	2	6	206806	206811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207383
4498	NC_013889	TGC	2	6	206830	206835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207383
4499	NC_013889	CTG	2	6	206838	206843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207383
4500	NC_013889	GCG	2	6	206899	206904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207383

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