MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_013889	AGC	2	6	139363	139368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207321
3003	NC_013889	GGC	2	6	139389	139394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207321
3004	NC_013889	CAG	2	6	139410	139415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207321
3005	NC_013889	GGGT	2	8	139477	139484	0 %	25 %	75 %	0 %	289207321
3006	NC_013889	GC	4	8	139498	139505	0 %	0 %	50 %	50 %	289207321
3007	NC_013889	CCA	2	6	139508	139513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207321
3008	NC_013889	CGG	2	6	139519	139524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207321
3009	NC_013889	GCGT	2	8	139539	139546	0 %	25 %	50 %	25 %	289207321
3010	NC_013889	GC	3	6	139706	139711	0 %	0 %	50 %	50 %	289207322
3011	NC_013889	AGG	2	6	139759	139764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207322
3012	NC_013889	CCG	2	6	139766	139771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207322
3013	NC_013889	CG	3	6	139829	139834	0 %	0 %	50 %	50 %	289207322
3014	NC_013889	TCG	2	6	139906	139911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207322
3015	NC_013889	CGT	2	6	139942	139947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207322
3016	NC_013889	CCAG	2	8	139951	139958	25 %	0 %	25 %	50 %	289207322
3017	NC_013889	CGA	2	6	139967	139972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207322
3018	NC_013889	GCA	2	6	139987	139992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207322
3019	NC_013889	CCA	2	6	140077	140082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207322
3020	NC_013889	G	6	6	140099	140104	0 %	0 %	100 %	0 %	289207322
3021	NC_013889	GTG	2	6	140518	140523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207323
3022	NC_013889	GGC	2	6	140532	140537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207323
3023	NC_013889	GC	3	6	140550	140555	0 %	0 %	50 %	50 %	289207323
3024	NC_013889	TGC	3	9	140630	140638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207323
3025	NC_013889	TGA	2	6	140654	140659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207323
3026	NC_013889	TCG	2	6	140660	140665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207323
3027	NC_013889	ATG	2	6	140692	140697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207323
3028	NC_013889	GGAT	2	8	140840	140847	25 %	25 %	50 %	0 %	289207324
3029	NC_013889	AC	3	6	140870	140875	50 %	0 %	0 %	50 %	289207324
3030	NC_013889	TGT	2	6	140957	140962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207324
3031	NC_013889	GCC	2	6	140965	140970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207324
3032	NC_013889	GCT	2	6	141009	141014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207324
3033	NC_013889	GGC	2	6	141054	141059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207324
3034	NC_013889	CG	3	6	141070	141075	0 %	0 %	50 %	50 %	289207324
3035	NC_013889	GCC	2	6	141130	141135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207324
3036	NC_013889	ATCT	2	8	141187	141194	25 %	50 %	0 %	25 %	289207324
3037	NC_013889	CAT	2	6	141198	141203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207324
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3039	NC_013889	GGC	2	6	141279	141284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207324
3040	NC_013889	TCC	2	6	141290	141295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207324
3041	NC_013889	CTG	2	6	141328	141333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207324
3042	NC_013889	GGC	2	6	141342	141347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207324
3043	NC_013889	GCA	2	6	141408	141413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207324
3044	NC_013889	CGA	2	6	141441	141446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207324
3045	NC_013889	GTT	2	6	141483	141488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207324
3046	NC_013889	GAG	3	9	141490	141498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207324
3047	NC_013889	GC	3	6	141502	141507	0 %	0 %	50 %	50 %	289207324
3048	NC_013889	GCCA	2	8	141521	141528	25 %	0 %	25 %	50 %	289207324
3049	NC_013889	ATCGAC	2	12	141544	141555	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289207324
3050	NC_013889	GGC	2	6	141670	141675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207324
3051	NC_013889	TTC	2	6	141682	141687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207324
3052	NC_013889	TGC	3	9	141689	141697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207324
3053	NC_013889	GCAGGC	2	12	141714	141725	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207324
3054	NC_013889	GGC	3	9	141723	141731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207324
3055	NC_013889	CTTTGA	2	12	141759	141770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289207324
3056	NC_013889	GCG	2	6	141780	141785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207324
3057	NC_013889	AAG	2	6	141874	141879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207324
3058	NC_013889	GGA	2	6	142067	142072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207325
3059	NC_013889	CAT	2	6	142125	142130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207325
3060	NC_013889	GCG	2	6	142152	142157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207325
3061	NC_013889	CCA	2	6	142220	142225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207325
3062	NC_013889	GGC	2	6	142260	142265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207325
3063	NC_013889	CTG	2	6	142287	142292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207325
3064	NC_013889	GGC	2	6	142355	142360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207325
3065	NC_013889	GA	3	6	142361	142366	50 %	0 %	50 %	0 %	289207325
3066	NC_013889	GCC	2	6	142375	142380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207325
3067	NC_013889	GGA	2	6	142412	142417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207325
3068	NC_013889	CGA	2	6	142421	142426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207325
3069	NC_013889	AGCG	2	8	142442	142449	25 %	0 %	50 %	25 %	289207325
3070	NC_013889	GCT	2	6	142478	142483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207325
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3072	NC_013889	GCC	2	6	142513	142518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207325
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3074	NC_013889	GCGCTG	2	12	142552	142563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289207325
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3077	NC_013889	CGA	2	6	142814	142819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207326
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3079	NC_013889	TCG	2	6	142984	142989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207326
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3081	NC_013889	TCC	2	6	143035	143040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207326
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3083	NC_013889	CGG	2	6	143114	143119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207326
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3085	NC_013889	TGA	2	6	143141	143146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207326
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3088	NC_013889	ATC	2	6	143392	143397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207326
3089	NC_013889	CGT	2	6	143405	143410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207326
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3091	NC_013889	CAC	2	6	143599	143604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207326
3092	NC_013889	CCG	2	6	143620	143625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207326
3093	NC_013889	CAG	2	6	143651	143656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207326
3094	NC_013889	CAGGT	2	10	143752	143761	20 %	20 %	40 %	20 %	289207326
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3102	NC_013889	GAT	2	6	144045	144050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207326
3103	NC_013889	CG	3	6	144051	144056	0 %	0 %	50 %	50 %	289207326
3104	NC_013889	CACG	2	8	144074	144081	25 %	0 %	25 %	50 %	289207326
3105	NC_013889	GCA	2	6	144140	144145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207326
3106	NC_013889	GC	3	6	144166	144171	0 %	0 %	50 %	50 %	289207326
3107	NC_013889	GTT	2	6	144186	144191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207326
3108	NC_013889	TGA	2	6	144224	144229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207326
3109	NC_013889	GC	3	6	144275	144280	0 %	0 %	50 %	50 %	289207326
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3113	NC_013889	TCG	2	6	144391	144396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207326
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3117	NC_013889	CGGG	2	8	144606	144613	0 %	0 %	75 %	25 %	289207326
3118	NC_013889	CGG	2	6	144632	144637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207326
3119	NC_013889	GC	3	6	145025	145030	0 %	0 %	50 %	50 %	289207327
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3121	NC_013889	GAC	2	6	145074	145079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207327
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3242	NC_013889	CCGAT	2	10	150380	150389	20 %	20 %	20 %	40 %	289207330
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3365	NC_013889	CGA	2	6	156949	156954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207337
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3484	NC_013889	GC	3	6	161466	161471	0 %	0 %	50 %	50 %	289207342
3485	NC_013889	CTG	2	6	161472	161477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207342
3486	NC_013889	GCCT	2	8	161503	161510	0 %	25 %	25 %	50 %	289207342
3487	NC_013889	G	6	6	161596	161601	0 %	0 %	100 %	0 %	289207342
3488	NC_013889	GTG	2	6	161610	161615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207342
3489	NC_013889	GGC	2	6	161634	161639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207342
3490	NC_013889	GC	3	6	161717	161722	0 %	0 %	50 %	50 %	289207343
3491	NC_013889	CGGG	2	8	161737	161744	0 %	0 %	75 %	25 %	289207343
3492	NC_013889	TGC	2	6	161772	161777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207343
3493	NC_013889	GCT	2	6	161797	161802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207343
3494	NC_013889	GGCGC	2	10	161884	161893	0 %	0 %	60 %	40 %	289207343
3495	NC_013889	CGG	2	6	161943	161948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207343
3496	NC_013889	TGG	2	6	161966	161971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207343
3497	NC_013889	GT	3	6	161987	161992	0 %	50 %	50 %	0 %	289207343
3498	NC_013889	GCG	2	6	162050	162055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207343
3499	NC_013889	GTG	2	6	162061	162066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207343
3500	NC_013889	GCG	2	6	162097	162102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207343

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