MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013889	GAA	2	6	117369	117374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207293
2502	NC_013889	TCG	2	6	117511	117516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207293
2503	NC_013889	CGAT	2	8	117526	117533	25 %	25 %	25 %	25 %	289207293
2504	NC_013889	GGT	2	6	117627	117632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207293
2505	NC_013889	TCG	2	6	117733	117738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207293
2506	NC_013889	GGTG	2	8	117763	117770	0 %	25 %	75 %	0 %	289207293
2507	NC_013889	TTG	2	6	117967	117972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207293
2508	NC_013889	GTC	2	6	117990	117995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207293
2509	NC_013889	ATCG	2	8	117996	118003	25 %	25 %	25 %	25 %	289207293
2510	NC_013889	C	6	6	118038	118043	0 %	0 %	0 %	100 %	289207293
2511	NC_013889	CCG	2	6	118088	118093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207293
2512	NC_013889	CG	3	6	118105	118110	0 %	0 %	50 %	50 %	289207293
2513	NC_013889	CAG	2	6	118143	118148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207293
2514	NC_013889	GC	5	10	118155	118164	0 %	0 %	50 %	50 %	289207293
2515	NC_013889	TGT	2	6	118165	118170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207293
2516	NC_013889	CCG	2	6	118172	118177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207293
2517	NC_013889	GCC	2	6	118190	118195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207293
2518	NC_013889	CAGC	2	8	118197	118204	25 %	0 %	25 %	50 %	289207293
2519	NC_013889	TCG	2	6	118213	118218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207293
2520	NC_013889	GTC	2	6	118253	118258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207293
2521	NC_013889	TGG	2	6	118448	118453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207294
2522	NC_013889	CGT	2	6	118594	118599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2523	NC_013889	TTG	2	6	118650	118655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207295
2524	NC_013889	CCGT	2	8	118677	118684	0 %	25 %	25 %	50 %	289207295
2525	NC_013889	GTC	2	6	118844	118849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2526	NC_013889	TGG	2	6	118850	118855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207295
2527	NC_013889	CGG	2	6	118859	118864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207295
2528	NC_013889	GC	3	6	118890	118895	0 %	0 %	50 %	50 %	289207295
2529	NC_013889	CCG	2	6	118896	118901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207295
2530	NC_013889	CTG	2	6	118967	118972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2531	NC_013889	GTC	2	6	118979	118984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2532	NC_013889	CCT	2	6	119185	119190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207295
2533	NC_013889	CAC	2	6	119210	119215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207295
2534	NC_013889	GAC	2	6	119243	119248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2535	NC_013889	GAAC	2	8	119281	119288	50 %	0 %	25 %	25 %	289207295
2536	NC_013889	GGC	2	6	119316	119321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207295
2537	NC_013889	GAT	2	6	119357	119362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207295
2538	NC_013889	GACC	2	8	119395	119402	25 %	0 %	25 %	50 %	289207295
2539	NC_013889	TCG	3	9	119417	119425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2540	NC_013889	GCC	2	6	119485	119490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207295
2541	NC_013889	CGA	2	6	119524	119529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207295
2542	NC_013889	TGG	2	6	119886	119891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207297
2543	NC_013889	GCCG	2	8	119907	119914	0 %	0 %	50 %	50 %	289207297
2544	NC_013889	TGG	2	6	119977	119982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207297
2545	NC_013889	CTG	2	6	120018	120023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207297
2546	NC_013889	T	6	6	120111	120116	0 %	100 %	0 %	0 %	289207297
2547	NC_013889	GTC	2	6	120123	120128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207297
2548	NC_013889	CGG	2	6	120217	120222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207297
2549	NC_013889	T	8	8	120237	120244	0 %	100 %	0 %	0 %	289207297
2550	NC_013889	ACG	2	6	120261	120266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207297
2551	NC_013889	GCGA	2	8	120303	120310	25 %	0 %	50 %	25 %	289207297
2552	NC_013889	GC	3	6	120321	120326	0 %	0 %	50 %	50 %	289207297
2553	NC_013889	GCG	2	6	120354	120359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207298
2554	NC_013889	CCGG	2	8	120360	120367	0 %	0 %	50 %	50 %	289207298
2555	NC_013889	CTGG	2	8	120400	120407	0 %	25 %	50 %	25 %	289207298
2556	NC_013889	CGC	2	6	120498	120503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207298
2557	NC_013889	GAG	2	6	120509	120514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207298
2558	NC_013889	CGGG	2	8	120820	120827	0 %	0 %	75 %	25 %	289207298
2559	NC_013889	TTGG	2	8	120831	120838	0 %	50 %	50 %	0 %	289207298
2560	NC_013889	AGG	2	6	120890	120895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207298
2561	NC_013889	CTCC	2	8	120896	120903	0 %	25 %	0 %	75 %	289207298
2562	NC_013889	GAA	2	6	120935	120940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207298
2563	NC_013889	CG	3	6	121191	121196	0 %	0 %	50 %	50 %	289207298
2564	NC_013889	AGA	2	6	121279	121284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207298
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2569	NC_013889	CTGG	2	8	121461	121468	0 %	25 %	50 %	25 %	289207299
2570	NC_013889	CGG	2	6	121475	121480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207299
2571	NC_013889	CTG	2	6	121592	121597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207299
2572	NC_013889	TGG	2	6	121601	121606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207299
2573	NC_013889	CTG	2	6	121608	121613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207299
2574	NC_013889	GATC	2	8	121625	121632	25 %	25 %	25 %	25 %	289207299
2575	NC_013889	TCG	2	6	121688	121693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207299
2576	NC_013889	TAC	2	6	121708	121713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207299
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2578	NC_013889	GTTT	2	8	121790	121797	0 %	75 %	25 %	0 %	289207299
2579	NC_013889	TC	3	6	121872	121877	0 %	50 %	0 %	50 %	289207299
2580	NC_013889	GAT	2	6	121878	121883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207299
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2584	NC_013889	CTG	2	6	122095	122100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207300
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2589	NC_013889	GC	3	6	122609	122614	0 %	0 %	50 %	50 %	289207301
2590	NC_013889	GGC	2	6	122641	122646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207301
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2592	NC_013889	CGG	2	6	122755	122760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207301
2593	NC_013889	TGG	2	6	122890	122895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207301
2594	NC_013889	GGT	2	6	122900	122905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207301
2595	NC_013889	GCA	2	6	122920	122925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207301
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2597	NC_013889	CGC	2	6	122956	122961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207301
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2600	NC_013889	CG	3	6	123041	123046	0 %	0 %	50 %	50 %	289207301
2601	NC_013889	TTC	2	6	123056	123061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207301
2602	NC_013889	GC	3	6	123074	123079	0 %	0 %	50 %	50 %	289207301
2603	NC_013889	CAG	2	6	123095	123100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207301
2604	NC_013889	TCT	2	6	123139	123144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207301
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2606	NC_013889	GCTG	2	8	123175	123182	0 %	25 %	50 %	25 %	289207301
2607	NC_013889	CGG	2	6	123200	123205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207301
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2610	NC_013889	GCGCGG	2	12	123353	123364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207301
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2612	NC_013889	CGC	2	6	123392	123397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207301
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2619	NC_013889	CGG	2	6	123647	123652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207301
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2621	NC_013889	GCGACG	2	12	123684	123695	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207301
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2984	NC_013889	GAT	2	6	138669	138674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207321
2985	NC_013889	T	6	6	138729	138734	0 %	100 %	0 %	0 %	289207321
2986	NC_013889	CGG	2	6	138749	138754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207321
2987	NC_013889	GAT	2	6	138813	138818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207321
2988	NC_013889	CCG	2	6	138819	138824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207321
2989	NC_013889	CCGGCG	2	12	138826	138837	0 %	0 %	50 %	50 %	289207321
2990	NC_013889	TCG	2	6	138859	138864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207321
2991	NC_013889	CTA	2	6	138878	138883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207321
2992	NC_013889	GTT	2	6	138917	138922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207321
2993	NC_013889	CAG	2	6	138927	138932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207321
2994	NC_013889	G	6	6	138958	138963	0 %	0 %	100 %	0 %	289207321
2995	NC_013889	CAC	2	6	139005	139010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207321
2996	NC_013889	CAG	2	6	139017	139022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207321
2997	NC_013889	GAC	2	6	139077	139082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207321
2998	NC_013889	CG	3	6	139101	139106	0 %	0 %	50 %	50 %	289207321
2999	NC_013889	CAGG	2	8	139189	139196	25 %	0 %	50 %	25 %	289207321
3000	NC_013889	GAT	2	6	139260	139265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207321

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