MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_013889	CAT	2	6	47689	47694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207227
1003	NC_013889	CGT	2	6	47703	47708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1004	NC_013889	TGC	2	6	47762	47767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1005	NC_013889	GGC	2	6	47833	47838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207227
1006	NC_013889	GCC	2	6	47857	47862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207227
1007	NC_013889	CGC	2	6	47877	47882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207227
1008	NC_013889	CGA	2	6	47886	47891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1009	NC_013889	TCG	2	6	47897	47902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1010	NC_013889	GGT	2	6	47911	47916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207227
1011	NC_013889	GCC	2	6	47939	47944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207227
1012	NC_013889	CGCC	2	8	47982	47989	0 %	0 %	25 %	75 %	289207227
1013	NC_013889	CCTT	2	8	48014	48021	0 %	50 %	0 %	50 %	289207227
1014	NC_013889	GCT	2	6	48033	48038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1015	NC_013889	TGG	2	6	48107	48112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207227
1016	NC_013889	CGCC	2	8	48156	48163	0 %	0 %	25 %	75 %	289207227
1017	NC_013889	GCC	2	6	48167	48172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207227
1018	NC_013889	AGC	2	6	48182	48187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1019	NC_013889	GCA	2	6	48203	48208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1020	NC_013889	AG	3	6	48210	48215	50 %	0 %	50 %	0 %	289207227
1021	NC_013889	AGC	2	6	48734	48739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1022	NC_013889	GGA	2	6	48744	48749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207228
1023	NC_013889	GCC	2	6	48888	48893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207228
1024	NC_013889	GGC	2	6	48905	48910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207228
1025	NC_013889	TGG	2	6	48911	48916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207228
1026	NC_013889	CCG	2	6	48947	48952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207228
1027	NC_013889	GCCAGC	2	12	48953	48964	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207228
1028	NC_013889	GCT	2	6	48975	48980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1029	NC_013889	CG	3	6	48998	49003	0 %	0 %	50 %	50 %	289207228
1030	NC_013889	CGT	2	6	49039	49044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1031	NC_013889	GCT	2	6	49068	49073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1032	NC_013889	CTGC	2	8	49107	49114	0 %	25 %	25 %	50 %	289207228
1033	NC_013889	GGC	2	6	49143	49148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207228
1034	NC_013889	TTC	2	6	49218	49223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207228
1035	NC_013889	GTCA	2	8	49536	49543	25 %	25 %	25 %	25 %	289207229
1036	NC_013889	GAT	2	6	49669	49674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207229
1037	NC_013889	GCG	2	6	49699	49704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207229
1038	NC_013889	AGA	2	6	49710	49715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207229
1039	NC_013889	GCG	2	6	49730	49735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207229
1040	NC_013889	TCT	2	6	49745	49750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207229
1041	NC_013889	AC	3	6	49845	49850	50 %	0 %	0 %	50 %	289207229
1042	NC_013889	GGCA	2	8	49920	49927	25 %	0 %	50 %	25 %	289207229
1043	NC_013889	CGTG	2	8	50001	50008	0 %	25 %	50 %	25 %	289207229
1044	NC_013889	TCG	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207229
1045	NC_013889	CG	3	6	50079	50084	0 %	0 %	50 %	50 %	289207229
1046	NC_013889	GCG	3	9	50082	50090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207229
1047	NC_013889	CAG	2	6	50119	50124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207229
1048	NC_013889	GCG	2	6	50132	50137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207229
1049	NC_013889	ACC	2	6	50138	50143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207229
1050	NC_013889	AGA	2	6	50154	50159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207229
1051	NC_013889	CTG	2	6	50162	50167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207229
1052	NC_013889	TCA	2	6	50192	50197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207230
1053	NC_013889	GGC	2	6	50234	50239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207230
1054	NC_013889	TGCC	2	8	50248	50255	0 %	25 %	25 %	50 %	289207230
1055	NC_013889	GGT	2	6	50288	50293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207230
1056	NC_013889	GT	3	6	50337	50342	0 %	50 %	50 %	0 %	289207230
1057	NC_013889	CCAGGT	2	12	50386	50397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207230
1058	NC_013889	GTT	2	6	50411	50416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207230
1059	NC_013889	CGC	2	6	50429	50434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207230
1060	NC_013889	GCA	2	6	50467	50472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207230
1061	NC_013889	GCG	2	6	50485	50490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207230
1062	NC_013889	CGC	2	6	50509	50514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207230
1063	NC_013889	TGC	2	6	50530	50535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207230
1064	NC_013889	CGG	2	6	50584	50589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207230
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1066	NC_013889	CCAG	2	8	50650	50657	25 %	0 %	25 %	50 %	289207230
1067	NC_013889	GCG	2	6	50658	50663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207230
1068	NC_013889	CGT	2	6	50703	50708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1069	NC_013889	GCCGAC	2	12	50719	50730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207231
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1071	NC_013889	TCC	2	6	50798	50803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207231
1072	NC_013889	CCG	2	6	50805	50810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207231
1073	NC_013889	TCG	2	6	50834	50839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1074	NC_013889	GC	3	6	50857	50862	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1075	NC_013889	CG	3	6	50905	50910	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
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1082	NC_013889	CG	3	6	51126	51131	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1083	NC_013889	GC	3	6	51157	51162	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1084	NC_013889	CG	3	6	51214	51219	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1085	NC_013889	CGG	3	9	51264	51272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207231
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1088	NC_013889	AGT	2	6	51363	51368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207231
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1091	NC_013889	CG	3	6	51406	51411	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1092	NC_013889	GCCG	2	8	51420	51427	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1093	NC_013889	GCC	2	6	51477	51482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207231
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1095	NC_013889	TGC	2	6	51567	51572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207231
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1099	NC_013889	CCT	2	6	51762	51767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207231
1100	NC_013889	CAG	2	6	51802	51807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1101	NC_013889	GCCGA	2	10	51823	51832	20 %	0 %	40 %	40 %	289207231
1102	NC_013889	ATCTCG	2	12	51890	51901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289207231
1103	NC_013889	GCC	2	6	51926	51931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207231
1104	NC_013889	GCAG	2	8	51963	51970	25 %	0 %	50 %	25 %	289207231
1105	NC_013889	GTC	2	6	52159	52164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1106	NC_013889	CG	4	8	52285	52292	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1107	NC_013889	CGAAGG	2	12	52356	52367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289207231
1108	NC_013889	CGA	2	6	52374	52379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1109	NC_013889	GC	3	6	52385	52390	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1110	NC_013889	TCGG	2	8	52429	52436	0 %	25 %	50 %	25 %	289207231
1111	NC_013889	CAG	2	6	52453	52458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1112	NC_013889	CCT	2	6	52473	52478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207231
1113	NC_013889	CG	3	6	52561	52566	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1114	NC_013889	GCG	2	6	52585	52590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207231
1115	NC_013889	CAG	2	6	52600	52605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1116	NC_013889	CG	3	6	52686	52691	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1117	NC_013889	GC	3	6	52715	52720	0 %	0 %	50 %	50 %	289207231
1118	NC_013889	GCC	2	6	52738	52743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207231
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1120	NC_013889	TGT	2	6	52839	52844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207231
1121	NC_013889	CGA	2	6	52875	52880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207231
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1123	NC_013889	GCG	2	6	53027	53032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207231
1124	NC_013889	CGT	2	6	53058	53063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207231
1125	NC_013889	GGC	2	6	53137	53142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207231
1126	NC_013889	CGG	2	6	53158	53163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207231
1127	NC_013889	GTC	2	6	53191	53196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207231
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1130	NC_013889	GCA	2	6	53268	53273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207231
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1233	NC_013889	GGCCTG	2	12	57303	57314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289207236
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1239	NC_013889	GGT	2	6	57589	57594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207237
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1241	NC_013889	TCA	3	9	57672	57680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207237
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1245	NC_013889	CG	3	6	57893	57898	0 %	0 %	50 %	50 %	289207237
1246	NC_013889	GCA	2	6	57915	57920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207237
1247	NC_013889	CCG	2	6	58029	58034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207237
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1249	NC_013889	GAGC	2	8	58057	58064	25 %	0 %	50 %	25 %	289207237
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1363	NC_013889	GCG	2	6	63176	63181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207242
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1371	NC_013889	GCA	2	6	63430	63435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207242
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1496	NC_013889	TCC	2	6	69538	69543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207246
1497	NC_013889	GTACC	2	10	69702	69711	20 %	20 %	20 %	40 %	289207246
1498	NC_013889	GGT	2	6	69765	69770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207246
1499	NC_013889	CG	3	6	70080	70085	0 %	0 %	50 %	50 %	289207247
1500	NC_013889	CGG	2	6	70142	70147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207247

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