MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 57881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013889	CAG	2	6	232635	232640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207411
5002	NC_013889	GGTC	2	8	232724	232731	0 %	25 %	50 %	25 %	289207411
5003	NC_013889	CGA	2	6	232961	232966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207412
5004	NC_013889	CTG	2	6	232989	232994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207412
5005	NC_013889	TGG	2	6	233014	233019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207412
5006	NC_013889	TAC	2	6	233025	233030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207412
5007	NC_013889	CGG	2	6	233066	233071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207412
5008	NC_013889	GC	3	6	233097	233102	0 %	0 %	50 %	50 %	289207412
5009	NC_013889	TGG	2	6	233131	233136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207412
5010	NC_013889	CGG	2	6	233242	233247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207412
5011	NC_013889	CA	3	6	233283	233288	50 %	0 %	0 %	50 %	289207412
5012	NC_013889	CGT	2	6	233339	233344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207412
5013	NC_013889	TGCCG	2	10	233357	233366	0 %	20 %	40 %	40 %	289207412
5014	NC_013889	AAG	2	6	233394	233399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207412
5015	NC_013889	CCG	2	6	233438	233443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207412
5016	NC_013889	CAC	2	6	233444	233449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207412
5017	NC_013889	GTG	2	6	233484	233489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207412
5018	NC_013889	ACG	2	6	233491	233496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207412
5019	NC_013889	CG	3	6	233502	233507	0 %	0 %	50 %	50 %	289207412
5020	NC_013889	CGGCG	2	10	233540	233549	0 %	0 %	60 %	40 %	289207412
5021	NC_013889	CG	3	6	233572	233577	0 %	0 %	50 %	50 %	289207412
5022	NC_013889	CCA	2	6	233585	233590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207412
5023	NC_013889	CCA	2	6	233608	233613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207412
5024	NC_013889	TCT	2	6	233680	233685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207412
5025	NC_013889	GCA	2	6	233693	233698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207412
5026	NC_013889	CGG	2	6	233735	233740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207412
5027	NC_013889	GAA	2	6	233840	233845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207412
5028	NC_013889	TCG	2	6	233854	233859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207412
5029	NC_013889	CG	3	6	233867	233872	0 %	0 %	50 %	50 %	289207412
5030	NC_013889	TGG	2	6	233884	233889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207412
5031	NC_013889	CGC	2	6	233912	233917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207412
5032	NC_013889	CCG	2	6	233935	233940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207412
5033	NC_013889	GCC	2	6	234070	234075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207413
5034	NC_013889	CAG	2	6	234108	234113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5035	NC_013889	CCA	2	6	234155	234160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207413
5036	NC_013889	CCG	2	6	234161	234166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207413
5037	NC_013889	GCC	2	6	234221	234226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207413
5038	NC_013889	TTC	2	6	234243	234248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207413
5039	NC_013889	CGC	3	9	234273	234281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207413
5040	NC_013889	CG	3	6	234300	234305	0 %	0 %	50 %	50 %	289207413
5041	NC_013889	GGT	2	6	234389	234394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207413
5042	NC_013889	TCG	2	6	234412	234417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5043	NC_013889	CTG	3	9	234420	234428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5044	NC_013889	TCGA	2	8	234469	234476	25 %	25 %	25 %	25 %	289207413
5045	NC_013889	CGC	2	6	234532	234537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207413
5046	NC_013889	GGC	2	6	234560	234565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207413
5047	NC_013889	CGG	2	6	234594	234599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207413
5048	NC_013889	CGT	2	6	234613	234618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5049	NC_013889	CAT	2	6	234648	234653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207413
5050	NC_013889	CGGT	2	8	234664	234671	0 %	25 %	50 %	25 %	289207413
5051	NC_013889	TTG	2	6	234673	234678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207413
5052	NC_013889	GCA	2	6	234848	234853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207413
5053	NC_013889	GGC	2	6	235273	235278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207414
5054	NC_013889	GTGG	2	8	235288	235295	0 %	25 %	75 %	0 %	289207414
5055	NC_013889	GGC	2	6	235318	235323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207414
5056	NC_013889	GCG	2	6	235763	235768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207415
5057	NC_013889	CG	4	8	235767	235774	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5058	NC_013889	TGG	2	6	235780	235785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207415
5059	NC_013889	CG	3	6	235813	235818	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5060	NC_013889	GCTG	2	8	235826	235833	0 %	25 %	50 %	25 %	289207415
5061	NC_013889	CGG	3	9	235834	235842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207415
5062	NC_013889	GC	4	8	235872	235879	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5063	NC_013889	GGA	2	6	235898	235903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207415
5064	NC_013889	CTG	2	6	235920	235925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5065	NC_013889	CGA	2	6	235934	235939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5066	NC_013889	GCCG	2	8	235958	235965	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5067	NC_013889	CGAG	2	8	236005	236012	25 %	0 %	50 %	25 %	289207415
5068	NC_013889	GCGCT	2	10	236046	236055	0 %	20 %	40 %	40 %	289207415
5069	NC_013889	TGG	2	6	236059	236064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207415
5070	NC_013889	GCATGC	2	12	236068	236079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5071	NC_013889	GC	3	6	236082	236087	0 %	0 %	50 %	50 %	289207415
5072	NC_013889	CGA	2	6	236096	236101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207415
5073	NC_013889	GGT	2	6	236447	236452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207416
5074	NC_013889	CG	3	6	236489	236494	0 %	0 %	50 %	50 %	289207416
5075	NC_013889	CTC	2	6	236559	236564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207416
5076	NC_013889	GCA	2	6	236612	236617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207416
5077	NC_013889	GAT	2	6	236625	236630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207416
5078	NC_013889	CGGC	2	8	236675	236682	0 %	0 %	50 %	50 %	289207416
5079	NC_013889	AGC	2	6	236701	236706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207416
5080	NC_013889	GC	3	6	236805	236810	0 %	0 %	50 %	50 %	289207416
5081	NC_013889	GCA	2	6	236846	236851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207416
5082	NC_013889	CCT	2	6	236864	236869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207416
5083	NC_013889	AGG	2	6	236873	236878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207416
5084	NC_013889	GGC	2	6	236923	236928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207416
5085	NC_013889	GTA	2	6	237046	237051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207417
5086	NC_013889	TGC	2	6	237101	237106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5087	NC_013889	GGGC	2	8	237114	237121	0 %	0 %	75 %	25 %	289207417
5088	NC_013889	CAG	2	6	237130	237135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5089	NC_013889	GGC	2	6	237145	237150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207417
5090	NC_013889	GC	3	6	237149	237154	0 %	0 %	50 %	50 %	289207417
5091	NC_013889	TCG	2	6	237197	237202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5092	NC_013889	ACAGGT	2	12	237240	237251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289207417
5093	NC_013889	GCG	2	6	237328	237333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207417
5094	NC_013889	CAT	2	6	237360	237365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207417
5095	NC_013889	TTG	2	6	237416	237421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207417
5096	NC_013889	GC	3	6	237439	237444	0 %	0 %	50 %	50 %	289207417
5097	NC_013889	GAC	2	6	237550	237555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207417
5098	NC_013889	ATC	2	6	237596	237601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207417
5099	NC_013889	GGAC	2	8	237811	237818	25 %	0 %	50 %	25 %	289207418
5100	NC_013889	TCT	2	6	237823	237828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207418
5101	NC_013889	CG	3	6	237911	237916	0 %	0 %	50 %	50 %	289207418
5102	NC_013889	CG	3	6	238042	238047	0 %	0 %	50 %	50 %	289207418
5103	NC_013889	TTC	2	6	238056	238061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207418
5104	NC_013889	TGT	2	6	238099	238104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207418
5105	NC_013889	GCG	2	6	238326	238331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207418
5106	NC_013889	CAT	2	6	238353	238358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207418
5107	NC_013889	TCC	2	6	238438	238443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207418
5108	NC_013889	GCGA	2	8	238444	238451	25 %	0 %	50 %	25 %	289207418
5109	NC_013889	GAA	2	6	238460	238465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207418
5110	NC_013889	CCG	3	9	238466	238474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207418
5111	NC_013889	CAC	2	6	238490	238495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207418
5112	NC_013889	GGC	2	6	238632	238637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207419
5113	NC_013889	GGT	2	6	238691	238696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207419
5114	NC_013889	GTG	2	6	238728	238733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207419
5115	NC_013889	CTG	2	6	238737	238742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207419
5116	NC_013889	ACC	2	6	238771	238776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207419
5117	NC_013889	AGG	2	6	238795	238800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207419
5118	NC_013889	AGC	2	6	238801	238806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207419
5119	NC_013889	GC	3	6	238826	238831	0 %	0 %	50 %	50 %	289207419
5120	NC_013889	TCGA	2	8	238849	238856	25 %	25 %	25 %	25 %	289207419
5121	NC_013889	CCG	2	6	238891	238896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207419
5122	NC_013889	CG	4	8	238904	238911	0 %	0 %	50 %	50 %	289207419
5123	NC_013889	CGGCG	2	10	238977	238986	0 %	0 %	60 %	40 %	289207419
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5240	NC_013889	GCCA	2	8	244792	244799	25 %	0 %	25 %	50 %	289207428
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5242	NC_013889	CGA	3	9	244968	244976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207428
5243	NC_013889	CGG	2	6	244994	244999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207428
5244	NC_013889	GC	3	6	245028	245033	0 %	0 %	50 %	50 %	289207428
5245	NC_013889	CAT	2	6	245079	245084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207428
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5247	NC_013889	GTC	2	6	245311	245316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207429
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5251	NC_013889	GC	3	6	245564	245569	0 %	0 %	50 %	50 %	289207429
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5253	NC_013889	CAGGCG	2	12	245617	245628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207429
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5272	NC_013889	GCA	2	6	246360	246365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207429
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5274	NC_013889	GCA	2	6	246414	246419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207429
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5283	NC_013889	CG	3	6	246741	246746	0 %	0 %	50 %	50 %	289207430
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5485	NC_013889	GCCGGT	2	12	254530	254541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289207433
5486	NC_013889	CCAG	2	8	254580	254587	25 %	0 %	25 %	50 %	289207433
5487	NC_013889	GGC	2	6	254632	254637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207433
5488	NC_013889	GCG	2	6	254666	254671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207433
5489	NC_013889	GGGCA	2	10	254680	254689	20 %	0 %	60 %	20 %	289207433
5490	NC_013889	GGC	3	9	254706	254714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207433
5491	NC_013889	CGC	2	6	254749	254754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207433
5492	NC_013889	GCC	2	6	254760	254765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207433
5493	NC_013889	CGC	2	6	254804	254809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207433
5494	NC_013889	G	6	6	254815	254820	0 %	0 %	100 %	0 %	289207433
5495	NC_013889	GC	3	6	254823	254828	0 %	0 %	50 %	50 %	289207433
5496	NC_013889	AGG	2	6	254831	254836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207433
5497	NC_013889	GTGG	2	8	254847	254854	0 %	25 %	75 %	0 %	289207433
5498	NC_013889	GTA	2	6	254857	254862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207433
5499	NC_013889	TCGCC	2	10	254994	255003	0 %	20 %	20 %	60 %	289207433
5500	NC_013889	CGGT	2	8	255085	255092	0 %	25 %	50 %	25 %	289207433

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