MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013526	AGCCC	2	10	1962	1971	20 %	0 %	20 %	60 %	269838916
2	NC_013526	CGCCC	2	10	5410	5419	0 %	0 %	20 %	80 %	269838919
3	NC_013526	GGTGG	2	10	12520	12529	0 %	20 %	80 %	0 %	269838927
4	NC_013526	GCAGG	2	10	14784	14793	20 %	0 %	60 %	20 %	269838931
5	NC_013526	GCATG	2	10	15483	15492	20 %	20 %	40 %	20 %	269838931
6	NC_013526	GCGCT	2	10	16141	16150	0 %	20 %	40 %	40 %	269838931
7	NC_013526	GGCGT	2	10	17744	17753	0 %	20 %	60 %	20 %	269838932
8	NC_013526	AGAGG	2	10	19298	19307	40 %	0 %	60 %	0 %	269838933
9	NC_013526	GACCT	2	10	19388	19397	20 %	20 %	20 %	40 %	269838933
10	NC_013526	CTGCA	2	10	21347	21356	20 %	20 %	20 %	40 %	269838935
11	NC_013526	GTGGA	2	10	22568	22577	20 %	20 %	60 %	0 %	269838937
12	NC_013526	ACCTG	2	10	27137	27146	20 %	20 %	20 %	40 %	269838941
13	NC_013526	CCTAC	2	10	27265	27274	20 %	20 %	0 %	60 %	269838941
14	NC_013526	GGCCA	2	10	28102	28111	20 %	0 %	40 %	40 %	269838942
15	NC_013526	GTGCC	2	10	28573	28582	0 %	20 %	40 %	40 %	269838943
16	NC_013526	TCCCC	2	10	28628	28637	0 %	20 %	0 %	80 %	269838943
17	NC_013526	CTGCC	2	10	29852	29861	0 %	20 %	20 %	60 %	269838944
18	NC_013526	GCCCC	2	10	32819	32828	0 %	0 %	20 %	80 %	269838947
19	NC_013526	GGGGA	2	10	34059	34068	20 %	0 %	80 %	0 %	269838949
20	NC_013526	GTGGC	2	10	34176	34185	0 %	20 %	60 %	20 %	269838949
21	NC_013526	GCAGG	2	10	34327	34336	20 %	0 %	60 %	20 %	269838949
22	NC_013526	TCCGC	2	10	37469	37478	0 %	20 %	20 %	60 %	269838952
23	NC_013526	TTTTA	2	10	39322	39331	20 %	80 %	0 %	0 %	269838955
24	NC_013526	GAAGG	2	10	39347	39356	40 %	0 %	60 %	0 %	269838955
25	NC_013526	CCTCA	2	10	40586	40595	20 %	20 %	0 %	60 %	269838956
26	NC_013526	TCCTC	2	10	44467	44476	0 %	40 %	0 %	60 %	269838960
27	NC_013526	CCACC	2	10	48989	48998	20 %	0 %	0 %	80 %	269838963
28	NC_013526	TCCCG	2	10	49513	49522	0 %	20 %	20 %	60 %	269838964
29	NC_013526	GCCCT	2	10	49924	49933	0 %	20 %	20 %	60 %	269838964
30	NC_013526	GGCTA	2	10	55578	55587	20 %	20 %	40 %	20 %	269838969
31	NC_013526	CTGCA	2	10	59525	59534	20 %	20 %	20 %	40 %	269838973
32	NC_013526	CACGC	2	10	59756	59765	20 %	0 %	20 %	60 %	269838973
33	NC_013526	GCGCT	2	10	60242	60251	0 %	20 %	40 %	40 %	269838974
34	NC_013526	GCTGG	2	10	60393	60402	0 %	20 %	60 %	20 %	269838974
35	NC_013526	GGCCT	2	10	63527	63536	0 %	20 %	40 %	40 %	269838978
36	NC_013526	GCCCC	2	10	65268	65277	0 %	0 %	20 %	80 %	269838979
37	NC_013526	GTTTC	2	10	66167	66176	0 %	60 %	20 %	20 %	269838981
38	NC_013526	GCAGG	2	10	67068	67077	20 %	0 %	60 %	20 %	269838982
39	NC_013526	GATCT	2	10	68858	68867	20 %	40 %	20 %	20 %	269838983
40	NC_013526	GCCGC	2	10	74537	74546	0 %	0 %	40 %	60 %	269838988
41	NC_013526	ATCCC	2	10	74554	74563	20 %	20 %	0 %	60 %	269838988
42	NC_013526	GAGCA	2	10	75388	75397	40 %	0 %	40 %	20 %	269838989
43	NC_013526	GGCAT	2	10	75632	75641	20 %	20 %	40 %	20 %	269838989
44	NC_013526	GATCT	2	10	77102	77111	20 %	40 %	20 %	20 %	269838990
45	NC_013526	CATCT	2	10	79226	79235	20 %	40 %	0 %	40 %	269838992
46	NC_013526	GCCGG	2	10	82484	82493	0 %	0 %	60 %	40 %	269838994
47	NC_013526	TACCA	2	10	83748	83757	40 %	20 %	0 %	40 %	269838995
48	NC_013526	TACCA	2	10	87235	87244	40 %	20 %	0 %	40 %	269838998
49	NC_013526	TGTGA	2	10	88500	88509	20 %	40 %	40 %	0 %	269838999
50	NC_013526	CTCGC	2	10	95603	95612	0 %	20 %	20 %	60 %	269839006
51	NC_013526	AGGAT	2	10	96145	96154	40 %	20 %	40 %	0 %	269839007
52	NC_013526	CGGGG	2	10	98915	98924	0 %	0 %	80 %	20 %	269839010
53	NC_013526	CTGGC	2	10	100451	100460	0 %	20 %	40 %	40 %	269839011
54	NC_013526	GAGAT	2	10	101640	101649	40 %	20 %	40 %	0 %	269839013
55	NC_013526	CTGAT	2	10	101890	101899	20 %	40 %	20 %	20 %	269839013
56	NC_013526	GCCGG	2	10	102117	102126	0 %	0 %	60 %	40 %	269839013
57	NC_013526	AGGGC	2	10	102196	102205	20 %	0 %	60 %	20 %	269839013
58	NC_013526	GCCGT	2	10	104867	104876	0 %	20 %	40 %	40 %	269839016
59	NC_013526	ATGCC	2	10	105073	105082	20 %	20 %	20 %	40 %	269839016
60	NC_013526	ATTGG	2	10	106541	106550	20 %	40 %	40 %	0 %	269839018
61	NC_013526	GCTGT	2	10	107100	107109	0 %	40 %	40 %	20 %	269839020
62	NC_013526	AAGGT	2	10	107473	107482	40 %	20 %	40 %	0 %	269839020
63	NC_013526	ACCTC	2	10	110440	110449	20 %	20 %	0 %	60 %	269839021
64	NC_013526	CGAGC	2	10	112074	112083	20 %	0 %	40 %	40 %	269839022
65	NC_013526	AAGTA	2	10	115557	115566	60 %	20 %	20 %	0 %	269839026
66	NC_013526	GAGCT	2	10	120936	120945	20 %	20 %	40 %	20 %	269839031
67	NC_013526	ACGGC	2	10	122325	122334	20 %	0 %	40 %	40 %	269839032
68	NC_013526	AGGAC	2	10	123911	123920	40 %	0 %	40 %	20 %	269839033
69	NC_013526	GGCTA	2	10	126541	126550	20 %	20 %	40 %	20 %	269839036
70	NC_013526	GTGGA	2	10	126567	126576	20 %	20 %	60 %	0 %	269839036
71	NC_013526	AGGAG	2	10	127268	127277	40 %	0 %	60 %	0 %	269839036
72	NC_013526	GCGAG	2	10	129545	129554	20 %	0 %	60 %	20 %	269839039
73	NC_013526	CTCCG	2	10	129943	129952	0 %	20 %	20 %	60 %	269839040
74	NC_013526	CGAGC	2	10	131244	131253	20 %	0 %	40 %	40 %	269839041
75	NC_013526	GGCCT	2	10	132849	132858	0 %	20 %	40 %	40 %	269839042
76	NC_013526	GCCTG	2	10	133133	133142	0 %	20 %	40 %	40 %	269839042
77	NC_013526	CCAGC	2	10	136194	136203	20 %	0 %	20 %	60 %	269839045
78	NC_013526	GGCCG	2	10	139674	139683	0 %	0 %	60 %	40 %	269839047
79	NC_013526	CGCTG	2	10	140318	140327	0 %	20 %	40 %	40 %	269839048
80	NC_013526	GGGGT	2	10	140409	140418	0 %	20 %	80 %	0 %	269839048
81	NC_013526	GCAAC	2	10	147900	147909	40 %	0 %	20 %	40 %	269839055
82	NC_013526	CGGCG	2	10	156466	156475	0 %	0 %	60 %	40 %	269839064
83	NC_013526	CTGCT	2	10	158343	158352	0 %	40 %	20 %	40 %	269839067
84	NC_013526	GGGGA	2	10	159493	159502	20 %	0 %	80 %	0 %	269839069
85	NC_013526	GGCGT	2	10	165861	165870	0 %	20 %	60 %	20 %	269839072
86	NC_013526	CGACA	2	10	166379	166388	40 %	0 %	20 %	40 %	269839072
87	NC_013526	TACCC	2	10	169416	169425	20 %	20 %	0 %	60 %	269839073
88	NC_013526	TCGGG	2	10	170094	170103	0 %	20 %	60 %	20 %	269839074
89	NC_013526	CCCGA	2	10	171819	171828	20 %	0 %	20 %	60 %	269839076
90	NC_013526	GCTTG	2	10	172587	172596	0 %	40 %	40 %	20 %	269839076
91	NC_013526	AGGCG	2	10	173356	173365	20 %	0 %	60 %	20 %	269839077
92	NC_013526	TGGGC	2	10	174363	174372	0 %	20 %	60 %	20 %	269839078
93	NC_013526	TGGAG	2	10	175850	175859	20 %	20 %	60 %	0 %	269839079
94	NC_013526	CCCAC	2	10	179038	179047	20 %	0 %	0 %	80 %	269839082
95	NC_013526	AGGAG	2	10	179067	179076	40 %	0 %	60 %	0 %	269839082
96	NC_013526	CTGGC	2	10	180073	180082	0 %	20 %	40 %	40 %	269839083
97	NC_013526	CCCTG	2	10	180586	180595	0 %	20 %	20 %	60 %	269839084
98	NC_013526	CCCAG	2	10	180903	180912	20 %	0 %	20 %	60 %	269839084
99	NC_013526	TGCGC	2	10	183756	183765	0 %	20 %	40 %	40 %	269839086
100	NC_013526	TGGAC	2	10	185936	185945	20 %	20 %	40 %	20 %	269839089
101	NC_013526	AGGTC	2	10	186290	186299	20 %	20 %	40 %	20 %	269839090
102	NC_013526	CGTGC	2	10	186468	186477	0 %	20 %	40 %	40 %	269839090
103	NC_013526	GTGCC	2	10	186492	186501	0 %	20 %	40 %	40 %	269839090
104	NC_013526	GGGGT	2	10	187925	187934	0 %	20 %	80 %	0 %	269839091
105	NC_013526	GGCAG	2	10	188903	188912	20 %	0 %	60 %	20 %	269839093
106	NC_013526	CCGCC	2	10	191048	191057	0 %	0 %	20 %	80 %	269839094
107	NC_013526	CTGGA	2	10	192914	192923	20 %	20 %	40 %	20 %	269839095
108	NC_013526	CTGGC	2	10	193930	193939	0 %	20 %	40 %	40 %	269839096
109	NC_013526	AGCCC	2	10	195560	195569	20 %	0 %	20 %	60 %	269839097
110	NC_013526	GAGGG	2	10	196989	196998	20 %	0 %	80 %	0 %	269839098
111	NC_013526	CGCAT	2	10	199735	199744	20 %	20 %	20 %	40 %	269839100
112	NC_013526	TACCG	2	10	200503	200512	20 %	20 %	20 %	40 %	269839102
113	NC_013526	CTGGC	2	10	200723	200732	0 %	20 %	40 %	40 %	269839102
114	NC_013526	CCTGG	2	10	200875	200884	0 %	20 %	40 %	40 %	269839102
115	NC_013526	CAAGC	2	10	202021	202030	40 %	0 %	20 %	40 %	269839102
116	NC_013526	GGTGC	2	10	202999	203008	0 %	20 %	60 %	20 %	269839103
117	NC_013526	ACGTC	2	10	203534	203543	20 %	20 %	20 %	40 %	269839104
118	NC_013526	GGGGC	2	10	205340	205349	0 %	0 %	80 %	20 %	269839106
119	NC_013526	GAGTG	2	10	205741	205750	20 %	20 %	60 %	0 %	269839106
120	NC_013526	AGGAG	2	10	206566	206575	40 %	0 %	60 %	0 %	269839106
121	NC_013526	CTGGC	2	10	209050	209059	0 %	20 %	40 %	40 %	269839108
122	NC_013526	GCCAC	2	10	212078	212087	20 %	0 %	20 %	60 %	269839112
123	NC_013526	ACCCC	2	10	212261	212270	20 %	0 %	0 %	80 %	269839112
124	NC_013526	GCGCC	2	10	213201	213210	0 %	0 %	40 %	60 %	269839113
125	NC_013526	CCGTA	2	10	218127	218136	20 %	20 %	20 %	40 %	269839121
126	NC_013526	GCCTG	2	10	219086	219095	0 %	20 %	40 %	40 %	269839122
127	NC_013526	AGCCC	2	10	219491	219500	20 %	0 %	20 %	60 %	269839122
128	NC_013526	GCCGC	2	10	221424	221433	0 %	0 %	40 %	60 %	269839123
129	NC_013526	GCGCA	2	10	221537	221546	20 %	0 %	40 %	40 %	269839123
130	NC_013526	TCTGC	2	10	226068	226077	0 %	40 %	20 %	40 %	269839128
131	NC_013526	CGATG	2	10	226324	226333	20 %	20 %	40 %	20 %	269839128
132	NC_013526	GGCGC	2	10	230039	230048	0 %	0 %	60 %	40 %	269839130
133	NC_013526	CCCCA	2	10	230232	230241	20 %	0 %	0 %	80 %	269839131
134	NC_013526	GCGAG	2	10	233460	233469	20 %	0 %	60 %	20 %	269839134
135	NC_013526	AGGTG	2	10	236117	236126	20 %	20 %	60 %	0 %	269839137
136	NC_013526	GCTCG	2	10	238099	238108	0 %	20 %	40 %	40 %	269839138
137	NC_013526	TCAGG	2	10	241621	241630	20 %	20 %	40 %	20 %	269839141
138	NC_013526	TCCCC	2	10	244496	244505	0 %	20 %	0 %	80 %	269839142
139	NC_013526	CCCGC	2	10	253212	253221	0 %	0 %	20 %	80 %	269839149
140	NC_013526	GCCCT	2	10	253415	253424	0 %	20 %	20 %	60 %	269839149
141	NC_013526	CAGGT	2	10	254830	254839	20 %	20 %	40 %	20 %	269839150
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144	NC_013526	CGTCT	2	10	259661	259670	0 %	40 %	20 %	40 %	269839153
145	NC_013526	GCCCT	2	10	260436	260445	0 %	20 %	20 %	60 %	269839154
146	NC_013526	GGCAC	2	10	260649	260658	20 %	0 %	40 %	40 %	269839154
147	NC_013526	AGCTG	2	10	263411	263420	20 %	20 %	40 %	20 %	269839156
148	NC_013526	GGACT	2	10	266807	266816	20 %	20 %	40 %	20 %	269839157
149	NC_013526	CGCGG	2	10	269374	269383	0 %	0 %	60 %	40 %	269839158
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151	NC_013526	TGTCC	2	10	273285	273294	0 %	40 %	20 %	40 %	269839163
152	NC_013526	TCCTC	2	10	274833	274842	0 %	40 %	0 %	60 %	269839164
153	NC_013526	ATTAG	2	10	276105	276114	40 %	40 %	20 %	0 %	269839166
154	NC_013526	CTCCC	2	10	277008	277017	0 %	20 %	0 %	80 %	269839167
155	NC_013526	CCACC	2	10	277452	277461	20 %	0 %	0 %	80 %	269839167
156	NC_013526	CCTGG	2	10	281465	281474	0 %	20 %	40 %	40 %	269839171
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158	NC_013526	GCGCG	2	10	283113	283122	0 %	0 %	60 %	40 %	269839172
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164	NC_013526	GGATG	2	10	290293	290302	20 %	20 %	60 %	0 %	269839176
165	NC_013526	CGTGG	2	10	290854	290863	0 %	20 %	60 %	20 %	269839176
166	NC_013526	GCTCA	2	10	291839	291848	20 %	20 %	20 %	40 %	269839177
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169	NC_013526	GGAGG	2	10	295060	295069	20 %	0 %	80 %	0 %	269839178
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172	NC_013526	CCACG	2	10	300270	300279	20 %	0 %	20 %	60 %	269839184
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174	NC_013526	GCCTG	2	10	300897	300906	0 %	20 %	40 %	40 %	269839184
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247	NC_013526	GTACT	2	10	418973	418982	20 %	40 %	20 %	20 %	269839301
248	NC_013526	TCCAC	2	10	419841	419850	20 %	20 %	0 %	60 %	269839303
249	NC_013526	CATGG	2	10	420232	420241	20 %	20 %	40 %	20 %	269839303
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251	NC_013526	CGACA	2	10	424818	424827	40 %	0 %	20 %	40 %	269839307
252	NC_013526	CAGGC	2	10	426813	426822	20 %	0 %	40 %	40 %	269839307
253	NC_013526	GGGCA	2	10	430705	430714	20 %	0 %	60 %	20 %	269839309
254	NC_013526	TACTG	2	10	432371	432380	20 %	40 %	20 %	20 %	269839310
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257	NC_013526	GAGGC	2	10	440748	440757	20 %	0 %	60 %	20 %	269839322
258	NC_013526	TGCGC	2	10	445264	445273	0 %	20 %	40 %	40 %	269839326
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260	NC_013526	GCCGA	2	10	445758	445767	20 %	0 %	40 %	40 %	269839327
261	NC_013526	AGGGT	2	10	447875	447884	20 %	20 %	60 %	0 %	269839330
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