MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 24055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013525	AAG	2	6	267	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925124
2	NC_013525	GTA	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925124
3	NC_013525	TGC	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925124
4	NC_013525	CTG	2	6	586	591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925124
5	NC_013525	GAT	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925124
6	NC_013525	AGG	2	6	785	790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925124
7	NC_013525	TTC	2	6	793	798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925124
8	NC_013525	TGA	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925124
9	NC_013525	ACC	2	6	855	860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925124
10	NC_013525	GGC	2	6	907	912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925124
11	NC_013525	TGA	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925124
12	NC_013525	GAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925124
13	NC_013525	CTA	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925124
14	NC_013525	GCT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925124
15	NC_013525	CAT	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925124
16	NC_013525	GGT	2	6	1336	1341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925124
17	NC_013525	AAC	2	6	1447	1452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925124
18	NC_013525	CAG	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925125
19	NC_013525	CTT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925125
20	NC_013525	CTA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925125
21	NC_013525	ATC	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925125
22	NC_013525	AAC	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925125
23	NC_013525	TAG	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925125
24	NC_013525	TCT	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925125
25	NC_013525	GCT	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925125
26	NC_013525	TTC	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925125
27	NC_013525	TCC	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925125
28	NC_013525	TGG	2	6	1781	1786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925125
29	NC_013525	ACG	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925125
30	NC_013525	TAC	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925125
31	NC_013525	CAG	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925125
32	NC_013525	AGG	2	6	2166	2171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925125
33	NC_013525	GAA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925126
34	NC_013525	AGC	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925126
35	NC_013525	ATC	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925126
36	NC_013525	ACA	2	6	2740	2745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925126
37	NC_013525	GGA	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925126
38	NC_013525	AGG	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925126
39	NC_013525	ATA	2	6	2901	2906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925126
40	NC_013525	CAG	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925126
41	NC_013525	TTA	2	6	3163	3168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925126
42	NC_013525	CTA	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925126
43	NC_013525	TGA	2	6	3410	3415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925127
44	NC_013525	GTA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925127
45	NC_013525	CCT	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925127
46	NC_013525	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925127
47	NC_013525	CTA	2	6	3571	3576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925127
48	NC_013525	ACA	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925127
49	NC_013525	CTT	2	6	3704	3709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925127
50	NC_013525	CTA	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925128
51	NC_013525	GAA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925128
52	NC_013525	CAT	2	6	4043	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925128
53	NC_013525	ACG	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925128
54	NC_013525	AGC	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925128
55	NC_013525	GCT	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925128
56	NC_013525	AGT	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925129
57	NC_013525	CAT	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925129
58	NC_013525	GAT	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925129
59	NC_013525	GAG	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925129
60	NC_013525	AAG	2	6	5098	5103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925129
61	NC_013525	AGA	2	6	5109	5114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925129
62	NC_013525	AAG	2	6	5229	5234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925129
63	NC_013525	GCT	2	6	5280	5285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925129
64	NC_013525	TGC	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925129
65	NC_013525	AGG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925129
66	NC_013525	CTT	2	6	5555	5560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925129
67	NC_013525	TCC	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925129
68	NC_013525	GCT	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925129
69	NC_013525	CAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925129
70	NC_013525	GAT	2	6	5977	5982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925129
71	NC_013525	TGG	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925129
72	NC_013525	GAG	3	9	6366	6374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925129
73	NC_013525	GCT	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925130
74	NC_013525	ACC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925130
75	NC_013525	ATC	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925130
76	NC_013525	CAT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925130
77	NC_013525	TAC	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925130
78	NC_013525	ATG	2	6	7042	7047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925130
79	NC_013525	CAT	2	6	7080	7085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925130
80	NC_013525	CCA	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925130
81	NC_013525	TAG	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925130
82	NC_013525	CAC	2	6	7262	7267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925130
83	NC_013525	GGA	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925130
84	NC_013525	ATC	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925130
85	NC_013525	TGA	2	6	7358	7363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925130
86	NC_013525	TCC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925130
87	NC_013525	CTA	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925130
88	NC_013525	GAA	2	6	7578	7583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925130
89	NC_013525	CAG	2	6	7601	7606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925130
90	NC_013525	AGC	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925130
91	NC_013525	GTA	2	6	7859	7864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925130
92	NC_013525	AAC	2	6	7884	7889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925131
93	NC_013525	ATA	2	6	7900	7905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925131
94	NC_013525	CTG	2	6	8113	8118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925131
95	NC_013525	CAC	2	6	8221	8226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925131
96	NC_013525	CCT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925131
97	NC_013525	TCC	2	6	8538	8543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925132
98	NC_013525	GTA	2	6	8565	8570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
99	NC_013525	GCA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925132
100	NC_013525	CGG	2	6	8598	8603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925132
101	NC_013525	ACT	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
102	NC_013525	TGA	2	6	8904	8909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
103	NC_013525	TTA	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925132
104	NC_013525	TAC	2	6	9108	9113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
105	NC_013525	TGG	2	6	9133	9138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925132
106	NC_013525	ATC	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
107	NC_013525	TTA	2	6	9368	9373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925132
108	NC_013525	CTA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
109	NC_013525	TAG	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
110	NC_013525	TCC	2	6	9620	9625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925132
111	NC_013525	GCT	2	6	9677	9682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925132
112	NC_013525	AGC	2	6	9705	9710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925132
113	NC_013525	CCT	2	6	9719	9724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925132
114	NC_013525	AGT	2	6	9780	9785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
115	NC_013525	GTA	3	9	9823	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
116	NC_013525	ATT	2	6	9865	9870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925132
117	NC_013525	GTG	2	6	9908	9913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925132
118	NC_013525	CCA	2	6	10115	10120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925132
119	NC_013525	ACT	2	6	10169	10174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
120	NC_013525	CAT	2	6	10206	10211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
121	NC_013525	CAT	2	6	10251	10256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925132
122	NC_013525	CAG	2	6	10356	10361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925132
123	NC_013525	AGC	2	6	10408	10413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925132
124	NC_013525	GAC	2	6	10418	10423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925132
125	NC_013525	CTC	2	6	10436	10441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925132
126	NC_013525	TAG	2	6	10464	10469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
127	NC_013525	TGA	2	6	10509	10514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925132
128	NC_013525	AGC	2	6	10790	10795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925133
129	NC_013525	TGA	2	6	11030	11035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925133
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253	NC_013525	CAC	2	6	20675	20680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925142
254	NC_013525	CCT	2	6	20716	20721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925142
255	NC_013525	TGA	2	6	20844	20849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925142
256	NC_013525	TCT	2	6	21222	21227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925142
257	NC_013525	ACT	2	6	21279	21284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925142
258	NC_013525	ACT	2	6	21297	21302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925142
259	NC_013525	CTT	2	6	21352	21357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925142
260	NC_013525	AAG	2	6	21450	21455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925142
261	NC_013525	CCT	2	6	21487	21492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925142
262	NC_013525	TCT	2	6	21542	21547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925142
263	NC_013525	GAC	2	6	21573	21578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925142
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270	NC_013525	TCA	2	6	22235	22240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925143
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274	NC_013525	CTC	2	6	22455	22460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925143
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283	NC_013525	CAT	2	6	23212	23217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925144
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286	NC_013525	CTT	2	6	23594	23599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925145
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372	NC_013525	CGA	2	6	31508	31513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
373	NC_013525	AGC	2	6	31562	31567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
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375	NC_013525	TCT	2	6	31654	31659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925153
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