MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 35255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013525	AG	3	6	197610	197615	50 %	0 %	50 %	0 %	269925305
3502	NC_013525	ATA	2	6	197721	197726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925305
3503	NC_013525	TCA	2	6	197758	197763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925305
3504	NC_013525	CTA	2	6	197924	197929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925305
3505	NC_013525	GAG	2	6	197939	197944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925305
3506	NC_013525	ACA	2	6	197965	197970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925306
3507	NC_013525	TA	3	6	198005	198010	50 %	50 %	0 %	0 %	269925306
3508	NC_013525	TCA	2	6	198074	198079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925306
3509	NC_013525	TA	3	6	198084	198089	50 %	50 %	0 %	0 %	269925306
3510	NC_013525	GAT	2	6	198093	198098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925306
3511	NC_013525	TA	3	6	198178	198183	50 %	50 %	0 %	0 %	269925306
3512	NC_013525	GAG	2	6	198317	198322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925306
3513	NC_013525	CAT	2	6	198333	198338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925306
3514	NC_013525	ATG	2	6	198349	198354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925306
3515	NC_013525	CAT	2	6	198363	198368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925306
3516	NC_013525	TTG	2	6	198478	198483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925306
3517	NC_013525	AGA	2	6	198516	198521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925306
3518	NC_013525	CAT	2	6	198528	198533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925306
3519	NC_013525	CAA	2	6	198708	198713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925306
3520	NC_013525	CTGG	2	8	198718	198725	0 %	25 %	50 %	25 %	269925306
3521	NC_013525	ATG	3	9	198751	198759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925306
3522	NC_013525	AGA	2	6	199454	199459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925307
3523	NC_013525	AAG	3	9	199464	199472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925307
3524	NC_013525	AAG	2	6	199479	199484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925307
3525	NC_013525	ATG	2	6	199576	199581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925307
3526	NC_013525	GCA	2	6	199644	199649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925307
3527	NC_013525	AGGT	2	8	199675	199682	25 %	25 %	50 %	0 %	269925307
3528	NC_013525	GT	3	6	199681	199686	0 %	50 %	50 %	0 %	269925307
3529	NC_013525	TAG	2	6	199762	199767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925307
3530	NC_013525	TAG	2	6	199828	199833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925307
3531	NC_013525	CTT	2	6	199862	199867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925307
3532	NC_013525	AGGC	2	8	199928	199935	25 %	0 %	50 %	25 %	269925307
3533	NC_013525	GAG	2	6	199977	199982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925307
3534	NC_013525	C	6	6	199995	200000	0 %	0 %	0 %	100 %	269925307
3535	NC_013525	GAG	2	6	200013	200018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925307
3536	NC_013525	AT	3	6	200054	200059	50 %	50 %	0 %	0 %	269925307
3537	NC_013525	AAT	2	6	200072	200077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925307
3538	NC_013525	ATC	2	6	200118	200123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925307
3539	NC_013525	ATG	2	6	200137	200142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925307
3540	NC_013525	ACC	2	6	200184	200189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925307
3541	NC_013525	ACC	2	6	200218	200223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925307
3542	NC_013525	GCAT	2	8	200245	200252	25 %	25 %	25 %	25 %	269925307
3543	NC_013525	TGTAGG	2	12	200297	200308	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	269925307
3544	NC_013525	CG	3	6	200360	200365	0 %	0 %	50 %	50 %	269925307
3545	NC_013525	GAAG	2	8	200441	200448	50 %	0 %	50 %	0 %	269925307
3546	NC_013525	AAG	2	6	200478	200483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925307
3547	NC_013525	GGCT	2	8	200493	200500	0 %	25 %	50 %	25 %	269925307
3548	NC_013525	ACC	2	6	200547	200552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925307
3549	NC_013525	ATG	2	6	200566	200571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925307
3550	NC_013525	AAG	2	6	200586	200591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925307
3551	NC_013525	CCA	2	6	200593	200598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925307
3552	NC_013525	TCGTA	2	10	200609	200618	20 %	40 %	20 %	20 %	269925307
3553	NC_013525	GGC	2	6	200645	200650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925307
3554	NC_013525	AGA	2	6	200756	200761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925307
3555	NC_013525	GTG	2	6	200772	200777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925307
3556	NC_013525	TGG	2	6	200786	200791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925307
3557	NC_013525	CAT	2	6	200855	200860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925307
3558	NC_013525	TTC	2	6	200901	200906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925307
3559	NC_013525	ATC	2	6	200936	200941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925307
3560	NC_013525	ATT	2	6	200947	200952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925307
3561	NC_013525	AGG	2	6	201001	201006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925307
3562	NC_013525	AGC	2	6	201014	201019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925307
3563	NC_013525	ATGA	2	8	201148	201155	50 %	25 %	25 %	0 %	269925307
3564	NC_013525	ATC	2	6	201192	201197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925308
3565	NC_013525	TAG	2	6	201303	201308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925308
3566	NC_013525	GTA	2	6	201338	201343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925308
3567	NC_013525	AGC	2	6	201345	201350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925308
3568	NC_013525	TC	3	6	201504	201509	0 %	50 %	0 %	50 %	269925308
3569	NC_013525	GA	3	6	201653	201658	50 %	0 %	50 %	0 %	269925308
3570	NC_013525	TAC	2	6	201711	201716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925309
3571	NC_013525	TAG	2	6	201829	201834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925309
3572	NC_013525	ACG	2	6	201874	201879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925309
3573	NC_013525	GCA	2	6	201906	201911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925309
3574	NC_013525	ATG	2	6	201930	201935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925309
3575	NC_013525	CTG	2	6	202146	202151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925309
3576	NC_013525	ACAG	2	8	202184	202191	50 %	0 %	25 %	25 %	269925309
3577	NC_013525	AGA	2	6	202253	202258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925309
3578	NC_013525	TGG	2	6	202298	202303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925309
3579	NC_013525	TAG	2	6	202339	202344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925309
3580	NC_013525	AGGG	2	8	202420	202427	25 %	0 %	75 %	0 %	269925309
3581	NC_013525	AAT	2	6	202493	202498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925309
3582	NC_013525	GA	3	6	202613	202618	50 %	0 %	50 %	0 %	269925309
3583	NC_013525	CAGGA	2	10	202620	202629	40 %	0 %	40 %	20 %	269925309
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3586	NC_013525	ACAACC	2	12	202682	202693	50 %	0 %	0 %	50 %	269925309
3587	NC_013525	CAG	2	6	202820	202825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925310
3588	NC_013525	AGGATC	2	12	202830	202841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269925310
3589	NC_013525	AGG	2	6	202884	202889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925310
3590	NC_013525	ACA	2	6	202922	202927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925311
3591	NC_013525	GA	3	6	202930	202935	50 %	0 %	50 %	0 %	269925311
3592	NC_013525	AGC	2	6	202992	202997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925311
3593	NC_013525	GTA	2	6	203099	203104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925311
3594	NC_013525	CGC	2	6	203140	203145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925311
3595	NC_013525	GAGCA	2	10	203163	203172	40 %	0 %	40 %	20 %	269925311
3596	NC_013525	GAT	2	6	203176	203181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925311
3597	NC_013525	CAAGA	2	10	203230	203239	60 %	0 %	20 %	20 %	269925311
3598	NC_013525	AGC	2	6	203254	203259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925311
3599	NC_013525	AGA	2	6	203293	203298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925311
3600	NC_013525	TAA	2	6	203388	203393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925311
3601	NC_013525	CGT	2	6	203485	203490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925311
3602	NC_013525	GA	4	8	203592	203599	50 %	0 %	50 %	0 %	269925311
3603	NC_013525	CT	3	6	203611	203616	0 %	50 %	0 %	50 %	269925311
3604	NC_013525	GAG	2	6	203618	203623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925311
3605	NC_013525	GTG	2	6	203624	203629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925311
3606	NC_013525	CAA	2	6	203659	203664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925311
3607	NC_013525	CTA	2	6	203700	203705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925311
3608	NC_013525	GTCA	2	8	203714	203721	25 %	25 %	25 %	25 %	269925311
3609	NC_013525	CAA	2	6	203746	203751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925311
3610	NC_013525	GAT	3	9	204011	204019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925311
3611	NC_013525	CAG	2	6	204049	204054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925311
3612	NC_013525	AAG	2	6	204057	204062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925311
3613	NC_013525	TACC	2	8	204136	204143	25 %	25 %	0 %	50 %	269925312
3614	NC_013525	CAG	3	9	204279	204287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925312
3615	NC_013525	ATGT	2	8	204288	204295	25 %	50 %	25 %	0 %	269925312
3616	NC_013525	TCC	2	6	204325	204330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925312
3617	NC_013525	TCA	2	6	204343	204348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925312
3618	NC_013525	TA	3	6	204430	204435	50 %	50 %	0 %	0 %	269925312
3619	NC_013525	CCA	2	6	204463	204468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925312
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3621	NC_013525	AT	3	6	204538	204543	50 %	50 %	0 %	0 %	269925312
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3863	NC_013525	CTCTA	2	10	219080	219089	20 %	40 %	0 %	40 %	269925326
3864	NC_013525	GAC	2	6	219166	219171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925326
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3889	NC_013525	CTAT	2	8	220238	220245	25 %	50 %	0 %	25 %	269925326
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3985	NC_013525	ACCAT	2	10	225591	225600	40 %	20 %	0 %	40 %	269925331
3986	NC_013525	TCC	2	6	225624	225629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925331
3987	NC_013525	CATTA	2	10	225638	225647	40 %	40 %	0 %	20 %	269925331
3988	NC_013525	CAT	2	6	225859	225864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925332
3989	NC_013525	TGA	2	6	225921	225926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925332
3990	NC_013525	TATC	2	8	225969	225976	25 %	50 %	0 %	25 %	269925332
3991	NC_013525	TGA	2	6	225988	225993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925332
3992	NC_013525	TCA	2	6	226005	226010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925332
3993	NC_013525	AT	3	6	226022	226027	50 %	50 %	0 %	0 %	269925332
3994	NC_013525	TCG	2	6	226068	226073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925332
3995	NC_013525	CAT	2	6	226135	226140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925332
3996	NC_013525	TG	3	6	226169	226174	0 %	50 %	50 %	0 %	269925332
3997	NC_013525	ATC	2	6	226340	226345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925332
3998	NC_013525	CAG	2	6	226376	226381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925332
3999	NC_013525	GCT	2	6	226467	226472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925332
4000	NC_013525	AGTG	2	8	226499	226506	25 %	25 %	50 %	0 %	269925332

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