MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 35255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013525	GCA	2	6	170989	170994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925281
3002	NC_013525	ATG	2	6	171001	171006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925281
3003	NC_013525	GGC	2	6	171033	171038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925281
3004	NC_013525	TAG	2	6	171077	171082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925281
3005	NC_013525	TGGA	2	8	171086	171093	25 %	25 %	50 %	0 %	269925281
3006	NC_013525	TAAAG	2	10	171123	171132	60 %	20 %	20 %	0 %	269925281
3007	NC_013525	TGC	2	6	171225	171230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925281
3008	NC_013525	TGC	2	6	171299	171304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925281
3009	NC_013525	GA	3	6	171305	171310	50 %	0 %	50 %	0 %	269925281
3010	NC_013525	AGA	2	6	171312	171317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925281
3011	NC_013525	ACG	2	6	171395	171400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925281
3012	NC_013525	GA	3	6	171443	171448	50 %	0 %	50 %	0 %	269925281
3013	NC_013525	GGA	2	6	171472	171477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925281
3014	NC_013525	AAG	3	9	171511	171519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925281
3015	NC_013525	AGA	3	9	171540	171548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925281
3016	NC_013525	TG	3	6	171632	171637	0 %	50 %	50 %	0 %	269925281
3017	NC_013525	GA	3	6	171640	171645	50 %	0 %	50 %	0 %	269925281
3018	NC_013525	TCT	2	6	171695	171700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925281
3019	NC_013525	AC	3	6	171751	171756	50 %	0 %	0 %	50 %	269925282
3020	NC_013525	TA	3	6	171786	171791	50 %	50 %	0 %	0 %	269925282
3021	NC_013525	TCC	2	6	171899	171904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925282
3022	NC_013525	CTG	2	6	171918	171923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925282
3023	NC_013525	GAC	2	6	171966	171971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925282
3024	NC_013525	GCAG	2	8	171986	171993	25 %	0 %	50 %	25 %	269925282
3025	NC_013525	CAA	2	6	172014	172019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925282
3026	NC_013525	CTA	2	6	172072	172077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925282
3027	NC_013525	G	6	6	172080	172085	0 %	0 %	100 %	0 %	269925282
3028	NC_013525	ATA	2	6	172086	172091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925282
3029	NC_013525	TAC	2	6	172130	172135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925282
3030	NC_013525	CTAA	2	8	172167	172174	50 %	25 %	0 %	25 %	269925282
3031	NC_013525	CGG	2	6	172190	172195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925282
3032	NC_013525	GTC	2	6	172203	172208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925282
3033	NC_013525	GTT	2	6	172238	172243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925282
3034	NC_013525	TACC	2	8	172303	172310	25 %	25 %	0 %	50 %	269925282
3035	NC_013525	ACA	2	6	172367	172372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925282
3036	NC_013525	CAG	2	6	172483	172488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925282
3037	NC_013525	GAA	2	6	172545	172550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925282
3038	NC_013525	CAG	2	6	172555	172560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925282
3039	NC_013525	TAA	2	6	172565	172570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925282
3040	NC_013525	GAT	2	6	172596	172601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925282
3041	NC_013525	ACCT	2	8	172750	172757	25 %	25 %	0 %	50 %	269925282
3042	NC_013525	TCAA	2	8	172781	172788	50 %	25 %	0 %	25 %	269925282
3043	NC_013525	CAGG	2	8	172942	172949	25 %	0 %	50 %	25 %	269925282
3044	NC_013525	GGA	2	6	172956	172961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925282
3045	NC_013525	GCC	2	6	173042	173047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925283
3046	NC_013525	GAC	2	6	173064	173069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925283
3047	NC_013525	GAG	2	6	173124	173129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925283
3048	NC_013525	ATCT	2	8	173151	173158	25 %	50 %	0 %	25 %	269925283
3049	NC_013525	TCC	2	6	173203	173208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925283
3050	NC_013525	GCG	2	6	173257	173262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925283
3051	NC_013525	CCT	2	6	173450	173455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925283
3052	NC_013525	TCCA	2	8	173468	173475	25 %	25 %	0 %	50 %	269925283
3053	NC_013525	TCT	2	6	173486	173491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925283
3054	NC_013525	AGA	2	6	173542	173547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925283
3055	NC_013525	TTC	2	6	173610	173615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925283
3056	NC_013525	CTA	2	6	173632	173637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925283
3057	NC_013525	CAG	2	6	173650	173655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925283
3058	NC_013525	TC	3	6	173751	173756	0 %	50 %	0 %	50 %	269925283
3059	NC_013525	TA	3	6	173787	173792	50 %	50 %	0 %	0 %	269925283
3060	NC_013525	CGC	2	6	173801	173806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925283
3061	NC_013525	CTA	2	6	173838	173843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925283
3062	NC_013525	CTAT	2	8	173857	173864	25 %	50 %	0 %	25 %	269925283
3063	NC_013525	ACG	2	6	173974	173979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925283
3064	NC_013525	AAGG	2	8	174008	174015	50 %	0 %	50 %	0 %	269925283
3065	NC_013525	AG	3	6	174021	174026	50 %	0 %	50 %	0 %	269925283
3066	NC_013525	C	6	6	174063	174068	0 %	0 %	0 %	100 %	269925283
3067	NC_013525	TGT	2	6	174081	174086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925283
3068	NC_013525	AT	3	6	174099	174104	50 %	50 %	0 %	0 %	269925283
3069	NC_013525	GCT	2	6	174123	174128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925283
3070	NC_013525	CTT	2	6	174388	174393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925284
3071	NC_013525	CT	3	6	174447	174452	0 %	50 %	0 %	50 %	269925284
3072	NC_013525	TGG	2	6	174473	174478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925284
3073	NC_013525	GTCT	2	8	174766	174773	0 %	50 %	25 %	25 %	269925284
3074	NC_013525	GTC	2	6	174799	174804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925284
3075	NC_013525	TAG	2	6	174857	174862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925284
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3079	NC_013525	CA	3	6	175123	175128	50 %	0 %	0 %	50 %	269925284
3080	NC_013525	CTGG	2	8	175201	175208	0 %	25 %	50 %	25 %	269925284
3081	NC_013525	AG	3	6	175296	175301	50 %	0 %	50 %	0 %	269925284
3082	NC_013525	AGG	2	6	175344	175349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925284
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3084	NC_013525	AAG	2	6	175407	175412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925284
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3086	NC_013525	ATC	2	6	175420	175425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925284
3087	NC_013525	TTGC	2	8	175429	175436	0 %	50 %	25 %	25 %	269925284
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3089	NC_013525	AGG	2	6	175529	175534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925284
3090	NC_013525	AAC	2	6	175555	175560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925285
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3094	NC_013525	AGA	2	6	175665	175670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925285
3095	NC_013525	CTT	2	6	175692	175697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925285
3096	NC_013525	CAGG	2	8	175698	175705	25 %	0 %	50 %	25 %	269925285
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3098	NC_013525	TAG	2	6	175724	175729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925285
3099	NC_013525	ACATC	2	10	175790	175799	40 %	20 %	0 %	40 %	269925285
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3101	NC_013525	AGC	2	6	175920	175925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925285
3102	NC_013525	TATC	2	8	175944	175951	25 %	50 %	0 %	25 %	269925285
3103	NC_013525	GGA	3	9	175975	175983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925285
3104	NC_013525	ATC	2	6	176171	176176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925285
3105	NC_013525	AC	3	6	176231	176236	50 %	0 %	0 %	50 %	269925285
3106	NC_013525	C	6	6	176240	176245	0 %	0 %	0 %	100 %	269925285
3107	NC_013525	CAT	3	9	176250	176258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925285
3108	NC_013525	CAA	2	6	176275	176280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925285
3109	NC_013525	AT	3	6	176331	176336	50 %	50 %	0 %	0 %	269925285
3110	NC_013525	AT	3	6	176370	176375	50 %	50 %	0 %	0 %	269925285
3111	NC_013525	AT	3	6	176572	176577	50 %	50 %	0 %	0 %	269925286
3112	NC_013525	TA	3	6	176675	176680	50 %	50 %	0 %	0 %	269925286
3113	NC_013525	ACCG	2	8	176684	176691	25 %	0 %	25 %	50 %	269925286
3114	NC_013525	CA	3	6	176705	176710	50 %	0 %	0 %	50 %	269925286
3115	NC_013525	TCT	2	6	176730	176735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925286
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3117	NC_013525	CTG	2	6	176837	176842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925286
3118	NC_013525	GAC	2	6	176960	176965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925286
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3120	NC_013525	GAA	2	6	177068	177073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925286
3121	NC_013525	CT	3	6	177077	177082	0 %	50 %	0 %	50 %	269925286
3122	NC_013525	TGG	2	6	177193	177198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925287
3123	NC_013525	TAC	2	6	177234	177239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925287
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3237	NC_013525	CAAGG	2	10	182689	182698	40 %	0 %	40 %	20 %	269925293
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3243	NC_013525	GGC	2	6	182942	182947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925293
3244	NC_013525	AGA	2	6	182975	182980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925293
3245	NC_013525	GAA	2	6	183039	183044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925293
3246	NC_013525	TAC	2	6	183097	183102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925293
3247	NC_013525	TAT	2	6	183131	183136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925293
3248	NC_013525	GATA	2	8	183183	183190	50 %	25 %	25 %	0 %	269925293
3249	NC_013525	GA	3	6	183201	183206	50 %	0 %	50 %	0 %	269925293
3250	NC_013525	CCG	2	6	183226	183231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269925293
3251	NC_013525	GAA	2	6	183252	183257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925293
3252	NC_013525	AGG	2	6	183352	183357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925293
3253	NC_013525	TATC	2	8	183369	183376	25 %	50 %	0 %	25 %	269925293
3254	NC_013525	CCAAT	2	10	183406	183415	40 %	20 %	0 %	40 %	269925293
3255	NC_013525	AG	3	6	183459	183464	50 %	0 %	50 %	0 %	269925293
3256	NC_013525	GAA	2	6	183469	183474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925293
3257	NC_013525	TC	3	6	183504	183509	0 %	50 %	0 %	50 %	269925293
3258	NC_013525	GA	3	6	183519	183524	50 %	0 %	50 %	0 %	269925293
3259	NC_013525	AGA	2	6	183560	183565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925293
3260	NC_013525	AGC	2	6	183577	183582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925293
3261	NC_013525	GA	3	6	183589	183594	50 %	0 %	50 %	0 %	269925293
3262	NC_013525	ATT	2	6	183643	183648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925294
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3264	NC_013525	CAT	2	6	183833	183838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925294
3265	NC_013525	TGA	2	6	183874	183879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925294
3266	NC_013525	CAT	2	6	183898	183903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925294
3267	NC_013525	CAT	2	6	183928	183933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925294
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3269	NC_013525	T	6	6	183989	183994	0 %	100 %	0 %	0 %	269925294
3270	NC_013525	ATT	2	6	184002	184007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925294
3271	NC_013525	CTC	2	6	184149	184154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925295
3272	NC_013525	AGT	2	6	184262	184267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925295
3273	NC_013525	GA	3	6	184399	184404	50 %	0 %	50 %	0 %	269925295
3274	NC_013525	TCT	2	6	184485	184490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925295
3275	NC_013525	CTG	2	6	184582	184587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925295
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3277	NC_013525	C	6	6	184693	184698	0 %	0 %	0 %	100 %	269925295
3278	NC_013525	GCTA	2	8	184736	184743	25 %	25 %	25 %	25 %	269925295
3279	NC_013525	AT	3	6	184760	184765	50 %	50 %	0 %	0 %	269925295
3280	NC_013525	TAG	2	6	184849	184854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925295
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3283	NC_013525	ATGA	2	8	184916	184923	50 %	25 %	25 %	0 %	269925295
3284	NC_013525	CCAT	2	8	184926	184933	25 %	25 %	0 %	50 %	269925295
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3290	NC_013525	ACT	2	6	185259	185264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925295
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3300	NC_013525	GCA	2	6	185931	185936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925296
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3302	NC_013525	TCAG	2	8	186092	186099	25 %	25 %	25 %	25 %	269925296
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3305	NC_013525	AGT	2	6	186246	186251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925297
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3313	NC_013525	CTGTT	2	10	186719	186728	0 %	60 %	20 %	20 %	269925297
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3318	NC_013525	ATC	2	6	187152	187157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925297
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3322	NC_013525	ATT	2	6	187291	187296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925297
3323	NC_013525	GAA	2	6	187329	187334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925297
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3326	NC_013525	TA	3	6	187459	187464	50 %	50 %	0 %	0 %	269925297
3327	NC_013525	ACGC	2	8	187481	187488	25 %	0 %	25 %	50 %	269925297
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3330	NC_013525	TAG	2	6	187613	187618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925297
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3332	NC_013525	TACG	2	8	187773	187780	25 %	25 %	25 %	25 %	269925297
3333	NC_013525	TGTAA	2	10	187791	187800	40 %	40 %	20 %	0 %	269925297
3334	NC_013525	TCAGA	2	10	188254	188263	40 %	20 %	20 %	20 %	269925298
3335	NC_013525	CAG	2	6	188272	188277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925298
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3340	NC_013525	TCA	2	6	188604	188609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925298
3341	NC_013525	TG	3	6	188652	188657	0 %	50 %	50 %	0 %	269925298
3342	NC_013525	AGA	2	6	188665	188670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925298
3343	NC_013525	ATC	2	6	188726	188731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925298
3344	NC_013525	AGCTAT	2	12	188756	188767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269925298
3345	NC_013525	CTG	2	6	188774	188779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925298
3346	NC_013525	CTC	2	6	188843	188848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925298
3347	NC_013525	GAT	2	6	188927	188932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925298
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3349	NC_013525	TCT	2	6	188948	188953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925298
3350	NC_013525	GAA	2	6	189041	189046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925298
3351	NC_013525	GCTG	2	8	189078	189085	0 %	25 %	50 %	25 %	269925298
3352	NC_013525	GC	3	6	189095	189100	0 %	0 %	50 %	50 %	269925298
3353	NC_013525	CAT	2	6	189161	189166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925298
3354	NC_013525	CAG	2	6	189173	189178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925298
3355	NC_013525	CT	3	6	189231	189236	0 %	50 %	0 %	50 %	269925298
3356	NC_013525	CT	3	6	189278	189283	0 %	50 %	0 %	50 %	269925298
3357	NC_013525	CTT	2	6	189303	189308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925298
3358	NC_013525	CAT	2	6	189323	189328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925298
3359	NC_013525	AGC	2	6	189474	189479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925298
3360	NC_013525	CACC	2	8	189503	189510	25 %	0 %	0 %	75 %	269925299
3361	NC_013525	CTTT	2	8	189514	189521	0 %	75 %	0 %	25 %	269925299
3362	NC_013525	CA	3	6	189539	189544	50 %	0 %	0 %	50 %	269925299
3363	NC_013525	AAC	2	6	189576	189581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925299
3364	NC_013525	ACC	2	6	189656	189661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925299
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3488	NC_013525	GCT	2	6	196606	196611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925304
3489	NC_013525	TAA	2	6	196683	196688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925304
3490	NC_013525	AAT	2	6	196695	196700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925304
3491	NC_013525	TAA	2	6	196736	196741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925304
3492	NC_013525	AGC	2	6	196746	196751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925304
3493	NC_013525	GAG	2	6	196855	196860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925304
3494	NC_013525	GCA	2	6	197001	197006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925305
3495	NC_013525	ATA	2	6	197115	197120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925305
3496	NC_013525	CTA	2	6	197150	197155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925305
3497	NC_013525	TGGG	2	8	197193	197200	0 %	25 %	75 %	0 %	269925305
3498	NC_013525	GA	3	6	197226	197231	50 %	0 %	50 %	0 %	269925305
3499	NC_013525	GCCT	2	8	197284	197291	0 %	25 %	25 %	50 %	269925305
3500	NC_013525	G	6	6	197554	197559	0 %	0 %	100 %	0 %	269925305

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