MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 35255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013525	CT	3	6	29530	29535	0 %	50 %	0 %	50 %	269925150
502	NC_013525	AGA	2	6	29554	29559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925150
503	NC_013525	ATA	2	6	29580	29585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925150
504	NC_013525	TCA	2	6	29989	29994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925150
505	NC_013525	TAA	2	6	30040	30045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925150
506	NC_013525	TGA	2	6	30068	30073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925150
507	NC_013525	CAG	2	6	30354	30359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925151
508	NC_013525	TCT	2	6	30472	30477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925152
509	NC_013525	TCC	2	6	30478	30483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925152
510	NC_013525	AGGA	2	8	30486	30493	50 %	0 %	50 %	0 %	269925152
511	NC_013525	CTT	2	6	30497	30502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925152
512	NC_013525	TAC	2	6	30591	30596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925152
513	NC_013525	AGC	2	6	30612	30617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925152
514	NC_013525	TTTA	2	8	30639	30646	25 %	75 %	0 %	0 %	269925152
515	NC_013525	AAGA	2	8	30675	30682	75 %	0 %	25 %	0 %	269925152
516	NC_013525	CT	3	6	30953	30958	0 %	50 %	0 %	50 %	269925153
517	NC_013525	TACT	2	8	31084	31091	25 %	50 %	0 %	25 %	269925153
518	NC_013525	TAC	2	6	31125	31130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925153
519	NC_013525	GGC	2	6	31131	31136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925153
520	NC_013525	AG	3	6	31172	31177	50 %	0 %	50 %	0 %	269925153
521	NC_013525	AGC	2	6	31183	31188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
522	NC_013525	GCAA	2	8	31232	31239	50 %	0 %	25 %	25 %	269925153
523	NC_013525	TGG	2	6	31304	31309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925153
524	NC_013525	T	6	6	31358	31363	0 %	100 %	0 %	0 %	269925153
525	NC_013525	GA	4	8	31379	31386	50 %	0 %	50 %	0 %	269925153
526	NC_013525	AGC	2	6	31426	31431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
527	NC_013525	ATT	2	6	31446	31451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925153
528	NC_013525	AG	3	6	31473	31478	50 %	0 %	50 %	0 %	269925153
529	NC_013525	AG	3	6	31497	31502	50 %	0 %	50 %	0 %	269925153
530	NC_013525	CGA	2	6	31508	31513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
531	NC_013525	CTAT	2	8	31523	31530	25 %	50 %	0 %	25 %	269925153
532	NC_013525	AGC	2	6	31562	31567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
533	NC_013525	ACC	2	6	31614	31619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925153
534	NC_013525	TCT	2	6	31654	31659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925153
535	NC_013525	TGC	2	6	31736	31741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925153
536	NC_013525	AGG	2	6	31759	31764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925153
537	NC_013525	GAA	2	6	31805	31810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925153
538	NC_013525	GTG	2	6	31861	31866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925153
539	NC_013525	AGG	2	6	31921	31926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925153
540	NC_013525	TAA	2	6	31961	31966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925153
541	NC_013525	GAC	2	6	32036	32041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
542	NC_013525	GGA	2	6	32066	32071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925153
543	NC_013525	CGA	2	6	32123	32128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925153
544	NC_013525	ACAG	2	8	32154	32161	50 %	0 %	25 %	25 %	269925153
545	NC_013525	TAC	2	6	32265	32270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925154
546	NC_013525	GCT	2	6	32293	32298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925154
547	NC_013525	CCA	2	6	32337	32342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925154
548	NC_013525	TAC	2	6	32367	32372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925154
549	NC_013525	ATC	2	6	32382	32387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925154
550	NC_013525	GA	3	6	32436	32441	50 %	0 %	50 %	0 %	269925154
551	NC_013525	GGCT	2	8	32606	32613	0 %	25 %	50 %	25 %	269925154
552	NC_013525	CGG	2	6	32870	32875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269925154
553	NC_013525	CT	3	6	32897	32902	0 %	50 %	0 %	50 %	269925154
554	NC_013525	AC	3	6	32954	32959	50 %	0 %	0 %	50 %	269925154
555	NC_013525	CAG	2	6	33009	33014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925154
556	NC_013525	CG	3	6	33104	33109	0 %	0 %	50 %	50 %	269925154
557	NC_013525	AGC	2	6	33153	33158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925154
558	NC_013525	TAC	2	6	33168	33173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925154
559	NC_013525	TAA	2	6	33199	33204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925154
560	NC_013525	TGC	2	6	33484	33489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925154
561	NC_013525	TCC	2	6	33493	33498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925154
562	NC_013525	AGG	2	6	33507	33512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925154
563	NC_013525	CAC	2	6	33533	33538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925154
564	NC_013525	TA	3	6	33585	33590	50 %	50 %	0 %	0 %	269925154
565	NC_013525	ATG	2	6	33652	33657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925154
566	NC_013525	AGA	2	6	33698	33703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925154
567	NC_013525	GAA	2	6	33726	33731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925154
568	NC_013525	CAG	2	6	33761	33766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925154
569	NC_013525	TGC	3	9	33810	33818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925154
570	NC_013525	CTA	2	6	33854	33859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925154
571	NC_013525	GAC	2	6	33912	33917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925154
572	NC_013525	TAT	2	6	33918	33923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925154
573	NC_013525	TAGG	2	8	33950	33957	25 %	25 %	50 %	0 %	269925154
574	NC_013525	C	7	7	33978	33984	0 %	0 %	0 %	100 %	269925154
575	NC_013525	TTC	2	6	34005	34010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925154
576	NC_013525	GAG	3	9	34024	34032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925154
577	NC_013525	AT	4	8	34190	34197	50 %	50 %	0 %	0 %	269925154
578	NC_013525	TGT	2	6	34319	34324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269925154
579	NC_013525	TA	3	6	34409	34414	50 %	50 %	0 %	0 %	269925155
580	NC_013525	TA	3	6	34462	34467	50 %	50 %	0 %	0 %	269925155
581	NC_013525	TA	3	6	34479	34484	50 %	50 %	0 %	0 %	269925155
582	NC_013525	CAA	3	9	34509	34517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925155
583	NC_013525	TCT	2	6	34567	34572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269925155
584	NC_013525	CAA	2	6	34677	34682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925155
585	NC_013525	TGA	2	6	34722	34727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925155
586	NC_013525	TATCT	2	10	34867	34876	20 %	60 %	0 %	20 %	269925155
587	NC_013525	ATA	2	6	35007	35012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269925156
588	NC_013525	TAAG	2	8	35028	35035	50 %	25 %	25 %	0 %	269925156
589	NC_013525	CAA	2	6	35056	35061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269925156
590	NC_013525	TAG	2	6	35106	35111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925156
591	NC_013525	ACC	2	6	35126	35131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925156
592	NC_013525	ACT	2	6	35186	35191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925156
593	NC_013525	ATT	2	6	35338	35343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925156
594	NC_013525	GATTTT	2	12	35351	35362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	269925156
595	NC_013525	ACT	2	6	35471	35476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925156
596	NC_013525	GAG	2	6	35543	35548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925156
597	NC_013525	GAG	2	6	35708	35713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925156
598	NC_013525	AGT	2	6	35725	35730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925156
599	NC_013525	TTA	2	6	35757	35762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269925156
600	NC_013525	AGG	2	6	35779	35784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925156
601	NC_013525	TGG	2	6	35787	35792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925156
602	NC_013525	TGG	2	6	35857	35862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269925157
603	NC_013525	AGC	2	6	36099	36104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925157
604	NC_013525	GCT	2	6	36115	36120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269925157
605	NC_013525	CA	3	6	36168	36173	50 %	0 %	0 %	50 %	269925157
606	NC_013525	CAGC	2	8	36226	36233	25 %	0 %	25 %	50 %	269925157
607	NC_013525	TAG	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925157
608	NC_013525	GAT	3	9	36263	36271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925157
609	NC_013525	CCTAT	2	10	36324	36333	20 %	40 %	0 %	40 %	269925157
610	NC_013525	CT	3	6	36350	36355	0 %	50 %	0 %	50 %	269925157
611	NC_013525	GTA	2	6	36569	36574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925158
612	NC_013525	CTAC	2	8	36629	36636	25 %	25 %	0 %	50 %	269925158
613	NC_013525	CAT	2	6	36661	36666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925158
614	NC_013525	GCA	2	6	36671	36676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925158
615	NC_013525	ACC	2	6	36694	36699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269925158
616	NC_013525	AGC	2	6	36700	36705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925158
617	NC_013525	ACT	2	6	36713	36718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925158
618	NC_013525	CCAT	2	8	36786	36793	25 %	25 %	0 %	50 %	269925158
619	NC_013525	TAG	2	6	36807	36812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269925158
620	NC_013525	CGA	2	6	36818	36823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925158
621	NC_013525	TA	3	6	36833	36838	50 %	50 %	0 %	0 %	269925158
622	NC_013525	CTA	2	6	36861	36866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925158
623	NC_013525	TCA	2	6	37001	37006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269925158
624	NC_013525	GCCAC	2	10	37160	37169	20 %	0 %	20 %	60 %	269925158
625	NC_013525	ACG	2	6	37259	37264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269925158
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627	NC_013525	CCT	2	6	37341	37346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269925158
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756	NC_013525	GAG	2	6	45799	45804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269925165
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758	NC_013525	ACCA	2	8	45911	45918	50 %	0 %	0 %	50 %	269925165
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763	NC_013525	TATC	2	8	46081	46088	25 %	50 %	0 %	25 %	269925165
764	NC_013525	TGACT	2	10	46106	46115	20 %	40 %	20 %	20 %	269925165
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771	NC_013525	TTTC	2	8	46560	46567	0 %	75 %	0 %	25 %	269925166
772	NC_013525	GAA	2	6	46580	46585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925166
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784	NC_013525	TAGC	2	8	47169	47176	25 %	25 %	25 %	25 %	269925167
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878	NC_013525	AAG	2	6	52515	52520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269925172
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