MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 1149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	TGGGG	3	15	550	564	0 %	20 %	80 %	0 %	269791620
2	NC_013522	CGGGG	2	10	2913	2922	0 %	0 %	80 %	20 %	269791622
3	NC_013522	GTGAG	2	10	5791	5800	20 %	20 %	60 %	0 %	269791624
4	NC_013522	GGTCC	2	10	7118	7127	0 %	20 %	40 %	40 %	269791625
5	NC_013522	GTGGC	2	10	9421	9430	0 %	20 %	60 %	20 %	269791627
6	NC_013522	GTGGC	2	10	11272	11281	0 %	20 %	60 %	20 %	269791628
7	NC_013522	TGGGT	2	10	11804	11813	0 %	40 %	60 %	0 %	269791628
8	NC_013522	GGGCT	2	10	17417	17426	0 %	20 %	60 %	20 %	269791634
9	NC_013522	TCGGA	2	10	19266	19275	20 %	20 %	40 %	20 %	269791635
10	NC_013522	GCTGG	2	10	20317	20326	0 %	20 %	60 %	20 %	269791636
11	NC_013522	GGGTT	2	10	20756	20765	0 %	40 %	60 %	0 %	269791637
12	NC_013522	CAAGG	2	10	21036	21045	40 %	0 %	40 %	20 %	269791637
13	NC_013522	AAGAT	2	10	21301	21310	60 %	20 %	20 %	0 %	269791637
14	NC_013522	CAGGG	2	10	23598	23607	20 %	0 %	60 %	20 %	269791638
15	NC_013522	GGCTT	2	10	27344	27353	0 %	40 %	40 %	20 %	269791641
16	NC_013522	TGGTG	2	10	28241	28250	0 %	40 %	60 %	0 %	269791642
17	NC_013522	CGGGA	2	10	29094	29103	20 %	0 %	60 %	20 %	269791642
18	NC_013522	GGGTG	2	10	30566	30575	0 %	20 %	80 %	0 %	269791644
19	NC_013522	TTCGG	2	10	30580	30589	0 %	40 %	40 %	20 %	269791644
20	NC_013522	CCTGA	2	10	30861	30870	20 %	20 %	20 %	40 %	269791644
21	NC_013522	AGTCG	2	10	32099	32108	20 %	20 %	40 %	20 %	269791645
22	NC_013522	TCCCC	2	10	35626	35635	0 %	20 %	0 %	80 %	269791648
23	NC_013522	CCACC	2	10	35708	35717	20 %	0 %	0 %	80 %	269791648
24	NC_013522	ACCGC	2	10	40015	40024	20 %	0 %	20 %	60 %	269791650
25	NC_013522	CGATC	2	10	40208	40217	20 %	20 %	20 %	40 %	269791650
26	NC_013522	CAGGG	2	10	41182	41191	20 %	0 %	60 %	20 %	269791651
27	NC_013522	GGAGG	2	10	44395	44404	20 %	0 %	80 %	0 %	269791654
28	NC_013522	AACCT	2	10	44543	44552	40 %	20 %	0 %	40 %	269791654
29	NC_013522	CCTGG	2	10	45793	45802	0 %	20 %	40 %	40 %	269791655
30	NC_013522	CCGAA	2	10	47592	47601	40 %	0 %	20 %	40 %	269791657
31	NC_013522	CCTGG	2	10	54330	54339	0 %	20 %	40 %	40 %	269791662
32	NC_013522	GGGAG	2	10	55210	55219	20 %	0 %	80 %	0 %	269791664
33	NC_013522	GTGAC	2	10	55235	55244	20 %	20 %	40 %	20 %	269791664
34	NC_013522	CCAGG	2	10	56076	56085	20 %	0 %	40 %	40 %	269791665
35	NC_013522	GAGTA	2	10	56251	56260	40 %	20 %	40 %	0 %	269791665
36	NC_013522	GCCTC	2	10	56573	56582	0 %	20 %	20 %	60 %	269791665
37	NC_013522	CCGGG	2	10	58263	58272	0 %	0 %	60 %	40 %	269791667
38	NC_013522	CGGAT	2	10	59155	59164	20 %	20 %	40 %	20 %	269791667
39	NC_013522	ACCCC	2	10	59191	59200	20 %	0 %	0 %	80 %	269791667
40	NC_013522	CCAGG	2	10	59513	59522	20 %	0 %	40 %	40 %	269791667
41	NC_013522	GCTTC	2	10	61464	61473	0 %	40 %	20 %	40 %	269791669
42	NC_013522	GCCCC	2	10	61763	61772	0 %	0 %	20 %	80 %	269791669
43	NC_013522	AAGCT	2	10	62178	62187	40 %	20 %	20 %	20 %	269791670
44	NC_013522	GTCCT	2	10	64246	64255	0 %	40 %	20 %	40 %	269791672
45	NC_013522	GCGGA	2	10	66545	66554	20 %	0 %	60 %	20 %	269791675
46	NC_013522	CCCCT	2	10	66830	66839	0 %	20 %	0 %	80 %	269791675
47	NC_013522	GGTCC	2	10	69799	69808	0 %	20 %	40 %	40 %	269791677
48	NC_013522	TGGGA	2	10	70571	70580	20 %	20 %	60 %	0 %	269791677
49	NC_013522	CCTAC	2	10	71593	71602	20 %	20 %	0 %	60 %	269791678
50	NC_013522	TACCG	2	10	71971	71980	20 %	20 %	20 %	40 %	269791679
51	NC_013522	TTCCA	2	10	72052	72061	20 %	40 %	0 %	40 %	269791679
52	NC_013522	GCGGG	2	10	73632	73641	0 %	0 %	80 %	20 %	269791679
53	NC_013522	GGTGC	2	10	74880	74889	0 %	20 %	60 %	20 %	269791680
54	NC_013522	GGCGC	2	10	78617	78626	0 %	0 %	60 %	40 %	269791685
55	NC_013522	ATGGT	2	10	79025	79034	20 %	40 %	40 %	0 %	269791686
56	NC_013522	GATCC	2	10	79432	79441	20 %	20 %	20 %	40 %	269791686
57	NC_013522	AGCCC	2	10	80477	80486	20 %	0 %	20 %	60 %	269791687
58	NC_013522	AGCCC	2	10	83060	83069	20 %	0 %	20 %	60 %	269791689
59	NC_013522	AGGCT	2	10	83934	83943	20 %	20 %	40 %	20 %	269791690
60	NC_013522	GGGGC	2	10	86217	86226	0 %	0 %	80 %	20 %	269791692
61	NC_013522	TTGGA	2	10	88397	88406	20 %	40 %	40 %	0 %	269791695
62	NC_013522	GGTGA	2	10	88410	88419	20 %	20 %	60 %	0 %	269791695
63	NC_013522	GCTGG	2	10	88734	88743	0 %	20 %	60 %	20 %	269791696
64	NC_013522	GGAGT	2	10	89056	89065	20 %	20 %	60 %	0 %	269791696
65	NC_013522	GGGAC	2	10	89278	89287	20 %	0 %	60 %	20 %	269791697
66	NC_013522	GGCCA	2	10	90498	90507	20 %	0 %	40 %	40 %	269791698
67	NC_013522	GGTGG	2	10	92679	92688	0 %	20 %	80 %	0 %	269791701
68	NC_013522	GGCTG	2	10	92977	92986	0 %	20 %	60 %	20 %	269791701
69	NC_013522	GGTCA	2	10	93110	93119	20 %	20 %	40 %	20 %	269791701
70	NC_013522	CCTTG	2	10	95984	95993	0 %	40 %	20 %	40 %	269791705
71	NC_013522	CCCCG	2	10	100167	100176	0 %	0 %	20 %	80 %	269791709
72	NC_013522	ACCTC	2	10	102872	102881	20 %	20 %	0 %	60 %	269791712
73	NC_013522	ACGGT	2	10	104438	104447	20 %	20 %	40 %	20 %	269791714
74	NC_013522	CACCT	2	10	104449	104458	20 %	20 %	0 %	60 %	269791714
75	NC_013522	TCCGC	2	10	104594	104603	0 %	20 %	20 %	60 %	269791714
76	NC_013522	CGGGG	2	10	107328	107337	0 %	0 %	80 %	20 %	269791716
77	NC_013522	ATGTC	2	10	107632	107641	20 %	40 %	20 %	20 %	269791717
78	NC_013522	ATGGG	2	10	107667	107676	20 %	20 %	60 %	0 %	269791717
79	NC_013522	GAAGC	2	10	110219	110228	40 %	0 %	40 %	20 %	269791718
80	NC_013522	GTCCC	2	10	110978	110987	0 %	20 %	20 %	60 %	269791719
81	NC_013522	GATCC	2	10	114912	114921	20 %	20 %	20 %	40 %	269791723
82	NC_013522	ATCCC	2	10	115054	115063	20 %	20 %	0 %	60 %	269791723
83	NC_013522	CTCCA	2	10	119003	119012	20 %	20 %	0 %	60 %	269791729
84	NC_013522	TCCTC	2	10	119211	119220	0 %	40 %	0 %	60 %	269791729
85	NC_013522	GATCT	2	10	119990	119999	20 %	40 %	20 %	20 %	269791730
86	NC_013522	CAGGG	2	10	121049	121058	20 %	0 %	60 %	20 %	269791730
87	NC_013522	CAGGC	2	10	121368	121377	20 %	0 %	40 %	40 %	269791730
88	NC_013522	TCCGC	2	10	121819	121828	0 %	20 %	20 %	60 %	269791731
89	NC_013522	CGATC	2	10	121922	121931	20 %	20 %	20 %	40 %	269791731
90	NC_013522	GTGGA	2	10	122439	122448	20 %	20 %	60 %	0 %	269791731
91	NC_013522	TGCGG	2	10	122466	122475	0 %	20 %	60 %	20 %	269791731
92	NC_013522	AGGCC	2	10	132974	132983	20 %	0 %	40 %	40 %	269791741
93	NC_013522	TACCG	2	10	133479	133488	20 %	20 %	20 %	40 %	269791742
94	NC_013522	CATTC	2	10	139992	140001	20 %	40 %	0 %	40 %	269791748
95	NC_013522	GCCCT	2	10	140802	140811	0 %	20 %	20 %	60 %	269791750
96	NC_013522	CCGGA	2	10	142337	142346	20 %	0 %	40 %	40 %	269791751
97	NC_013522	CCCCG	2	10	145374	145383	0 %	0 %	20 %	80 %	269791755
98	NC_013522	ATGTC	2	10	146348	146357	20 %	40 %	20 %	20 %	269791755
99	NC_013522	GGTAC	2	10	146855	146864	20 %	20 %	40 %	20 %	269791756
100	NC_013522	TCTAG	2	10	148136	148145	20 %	40 %	20 %	20 %	269791756
101	NC_013522	CGGGG	2	10	150653	150662	0 %	0 %	80 %	20 %	269791759
102	NC_013522	GGGGA	2	10	154020	154029	20 %	0 %	80 %	0 %	269791761
103	NC_013522	CCGGG	2	10	155227	155236	0 %	0 %	60 %	40 %	269791763
104	NC_013522	GGGAT	2	10	157038	157047	20 %	20 %	60 %	0 %	269791764
105	NC_013522	AGCGG	2	10	157737	157746	20 %	0 %	60 %	20 %	269791764
106	NC_013522	AGTCC	2	10	161142	161151	20 %	20 %	20 %	40 %	269791768
107	NC_013522	CCCTG	2	10	161172	161181	0 %	20 %	20 %	60 %	269791768
108	NC_013522	TCCGA	2	10	164384	164393	20 %	20 %	20 %	40 %	269791770
109	NC_013522	CAGGC	2	10	167510	167519	20 %	0 %	40 %	40 %	269791773
110	NC_013522	CAGGC	2	10	169005	169014	20 %	0 %	40 %	40 %	269791774
111	NC_013522	CCTGG	2	10	169363	169372	0 %	20 %	40 %	40 %	269791775
112	NC_013522	GGCGG	2	10	169855	169864	0 %	0 %	80 %	20 %	269791775
113	NC_013522	CCGGA	2	10	169982	169991	20 %	0 %	40 %	40 %	269791775
114	NC_013522	GGGGA	2	10	170088	170097	20 %	0 %	80 %	0 %	269791775
115	NC_013522	TGACC	2	10	171256	171265	20 %	20 %	20 %	40 %	269791775
116	NC_013522	CGTGG	2	10	173875	173884	0 %	20 %	60 %	20 %	269791777
117	NC_013522	CCAGG	2	10	175183	175192	20 %	0 %	40 %	40 %	269791778
118	NC_013522	TCCTC	2	10	177029	177038	0 %	40 %	0 %	60 %	269791779
119	NC_013522	CCTGG	2	10	178465	178474	0 %	20 %	40 %	40 %	269791780
120	NC_013522	GTCCT	2	10	180111	180120	0 %	40 %	20 %	40 %	269791780
121	NC_013522	GCCGG	2	10	180955	180964	0 %	0 %	60 %	40 %	269791781
122	NC_013522	CTGCC	2	10	186476	186485	0 %	20 %	20 %	60 %	269791784
123	NC_013522	GAGGT	2	10	186589	186598	20 %	20 %	60 %	0 %	269791784
124	NC_013522	GGAAG	2	10	187938	187947	40 %	0 %	60 %	0 %	269791785
125	NC_013522	GGGAG	2	10	188237	188246	20 %	0 %	80 %	0 %	269791786
126	NC_013522	GGGGA	2	10	190498	190507	20 %	0 %	80 %	0 %	269791787
127	NC_013522	GGATC	2	10	191108	191117	20 %	20 %	40 %	20 %	269791787
128	NC_013522	CCGGT	2	10	191574	191583	0 %	20 %	40 %	40 %	269791788
129	NC_013522	TCCCC	2	10	197756	197765	0 %	20 %	0 %	80 %	269791799
130	NC_013522	GGCCT	2	10	200430	200439	0 %	20 %	40 %	40 %	269791803
131	NC_013522	TATGC	2	10	201651	201660	20 %	40 %	20 %	20 %	269791804
132	NC_013522	GTCCG	2	10	203162	203171	0 %	20 %	40 %	40 %	269791805
133	NC_013522	CGGTC	2	10	203774	203783	0 %	20 %	40 %	40 %	269791806
134	NC_013522	CGGGG	2	10	204249	204258	0 %	0 %	80 %	20 %	269791806
135	NC_013522	AGCCT	2	10	208257	208266	20 %	20 %	20 %	40 %	269791809
136	NC_013522	GACCG	2	10	208550	208559	20 %	0 %	40 %	40 %	269791809
137	NC_013522	GGCCC	2	10	209667	209676	0 %	0 %	40 %	60 %	269791810
138	NC_013522	ACCGG	2	10	211753	211762	20 %	0 %	40 %	40 %	269791811
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142	NC_013522	TCCGG	2	10	225143	225152	0 %	20 %	40 %	40 %	269791821
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150	NC_013522	CTGGT	2	10	236510	236519	0 %	40 %	40 %	20 %	269791833
151	NC_013522	GGGCT	2	10	236618	236627	0 %	20 %	60 %	20 %	269791833
152	NC_013522	GATGG	2	10	238517	238526	20 %	20 %	60 %	0 %	269791834
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173	NC_013522	CCGCC	2	10	282764	282773	0 %	0 %	20 %	80 %	269791874
174	NC_013522	CAGGG	2	10	283529	283538	20 %	0 %	60 %	20 %	269791875
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246	NC_013522	GGACG	2	10	391200	391209	20 %	0 %	60 %	20 %	269791980
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253	NC_013522	CGGTC	2	10	401870	401879	0 %	20 %	40 %	40 %	269791988
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261	NC_013522	TCCCT	2	10	416538	416547	0 %	40 %	0 %	60 %	269792007
262	NC_013522	CCCCG	2	10	416975	416984	0 %	0 %	20 %	80 %	269792007
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264	NC_013522	TGGAC	2	10	419462	419471	20 %	20 %	40 %	20 %	269792011
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