MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sibiricus MM 739

Total Repeats: 34174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012883	ATGG	2	8	29511	29518	25 %	25 %	50 %	0 %	242398030
502	NC_012883	TA	3	6	29522	29527	50 %	50 %	0 %	0 %	242398030
503	NC_012883	CCTG	2	8	29536	29543	0 %	25 %	25 %	50 %	242398030
504	NC_012883	TGAA	2	8	29613	29620	50 %	25 %	25 %	0 %	242398030
505	NC_012883	TCA	2	6	29710	29715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398030
506	NC_012883	ATA	2	6	29763	29768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398030
507	NC_012883	CAC	2	6	29806	29811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	242398030
508	NC_012883	CAG	2	6	29848	29853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	242398030
509	NC_012883	AGA	2	6	29857	29862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398030
510	NC_012883	AG	3	6	29869	29874	50 %	0 %	50 %	0 %	242398030
511	NC_012883	AG	3	6	29924	29929	50 %	0 %	50 %	0 %	242398030
512	NC_012883	ATT	2	6	29999	30004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398030
513	NC_012883	AGA	2	6	30010	30015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398030
514	NC_012883	GGA	2	6	30053	30058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398030
515	NC_012883	TGA	2	6	30085	30090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398030
516	NC_012883	TTA	2	6	30100	30105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398030
517	NC_012883	AAAG	2	8	30209	30216	75 %	0 %	25 %	0 %	242398030
518	NC_012883	CCT	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	242398030
519	NC_012883	ATACT	2	10	30339	30348	40 %	40 %	0 %	20 %	242398030
520	NC_012883	TGA	2	6	30415	30420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398030
521	NC_012883	GATG	2	8	30464	30471	25 %	25 %	50 %	0 %	242398030
522	NC_012883	CCATT	2	10	30492	30501	20 %	40 %	0 %	40 %	242398030
523	NC_012883	AGA	2	6	30577	30582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398030
524	NC_012883	GAT	2	6	30626	30631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398030
525	NC_012883	GTT	2	6	30641	30646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398030
526	NC_012883	AAC	2	6	30802	30807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398030
527	NC_012883	CTT	2	6	30835	30840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398030
528	NC_012883	GTA	2	6	30857	30862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398030
529	NC_012883	GAA	2	6	30907	30912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398030
530	NC_012883	TGA	2	6	31102	31107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398030
531	NC_012883	AAT	2	6	31252	31257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398030
532	NC_012883	GCC	2	6	31274	31279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	242398030
533	NC_012883	TG	3	6	31280	31285	0 %	50 %	50 %	0 %	242398030
534	NC_012883	TGA	2	6	31327	31332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398030
535	NC_012883	ATT	2	6	31474	31479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398031
536	NC_012883	AG	3	6	31566	31571	50 %	0 %	50 %	0 %	242398031
537	NC_012883	TGA	2	6	31597	31602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398031
538	NC_012883	A	7	7	31602	31608	100 %	0 %	0 %	0 %	242398031
539	NC_012883	TGGT	2	8	31618	31625	0 %	50 %	50 %	0 %	242398031
540	NC_012883	TTTTGG	2	12	31655	31666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398031
541	NC_012883	AGG	2	6	31768	31773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398031
542	NC_012883	AAT	2	6	31851	31856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398031
543	NC_012883	AAAG	2	8	31863	31870	75 %	0 %	25 %	0 %	242398031
544	NC_012883	TTGA	2	8	31944	31951	25 %	50 %	25 %	0 %	242398031
545	NC_012883	GCC	2	6	32159	32164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	242398031
546	NC_012883	AT	3	6	32185	32190	50 %	50 %	0 %	0 %	242398031
547	NC_012883	AAGGGA	2	12	32261	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	242398031
548	NC_012883	TAGTTG	2	12	32329	32340	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	242398031
549	NC_012883	A	6	6	32343	32348	100 %	0 %	0 %	0 %	242398031
550	NC_012883	AGA	2	6	32375	32380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398031
551	NC_012883	AGA	2	6	32392	32397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398031
552	NC_012883	TGA	2	6	32426	32431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398031
553	NC_012883	GAAG	2	8	32490	32497	50 %	0 %	50 %	0 %	242398032
554	NC_012883	TTC	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	242398032
555	NC_012883	ATT	2	6	32587	32592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398032
556	NC_012883	AC	3	6	32649	32654	50 %	0 %	0 %	50 %	242398032
557	NC_012883	CTTCT	2	10	32675	32684	0 %	60 %	0 %	40 %	242398032
558	NC_012883	TGG	2	6	32772	32777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	242398032
559	NC_012883	TAT	2	6	32887	32892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398032
560	NC_012883	ATT	2	6	32987	32992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398032
561	NC_012883	A	7	7	33007	33013	100 %	0 %	0 %	0 %	242398032
562	NC_012883	A	7	7	33039	33045	100 %	0 %	0 %	0 %	242398032
563	NC_012883	GAA	2	6	33105	33110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398033
564	NC_012883	A	6	6	33113	33118	100 %	0 %	0 %	0 %	242398033
565	NC_012883	ATTCAT	2	12	33136	33147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	242398033
566	NC_012883	TTAT	2	8	33155	33162	25 %	75 %	0 %	0 %	242398033
567	NC_012883	TAC	2	6	33165	33170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398033
568	NC_012883	TACTT	2	10	33326	33335	20 %	60 %	0 %	20 %	242398033
569	NC_012883	ATGG	2	8	33380	33387	25 %	25 %	50 %	0 %	242398033
570	NC_012883	GAGACA	2	12	33470	33481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	242398033
571	NC_012883	A	6	6	33481	33486	100 %	0 %	0 %	0 %	242398033
572	NC_012883	GAA	2	6	33487	33492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398033
573	NC_012883	AGTC	2	8	33503	33510	25 %	25 %	25 %	25 %	242398033
574	NC_012883	AAT	2	6	33557	33562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398033
575	NC_012883	GTT	2	6	33626	33631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398033
576	NC_012883	GGT	2	6	33707	33712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	242398033
577	NC_012883	TAA	2	6	33797	33802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398034
578	NC_012883	AG	3	6	33818	33823	50 %	0 %	50 %	0 %	242398034
579	NC_012883	T	6	6	33850	33855	0 %	100 %	0 %	0 %	242398034
580	NC_012883	AAT	2	6	33953	33958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398034
581	NC_012883	ACT	2	6	33969	33974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398034
582	NC_012883	TGGA	2	8	34000	34007	25 %	25 %	50 %	0 %	242398034
583	NC_012883	GAA	2	6	34025	34030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398034
584	NC_012883	ATT	2	6	34280	34285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398035
585	NC_012883	TGAC	2	8	34301	34308	25 %	25 %	25 %	25 %	242398035
586	NC_012883	ATT	2	6	34338	34343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398035
587	NC_012883	TAACA	2	10	34413	34422	60 %	20 %	0 %	20 %	242398035
588	NC_012883	TATC	2	8	34445	34452	25 %	50 %	0 %	25 %	242398035
589	NC_012883	ACAA	2	8	34528	34535	75 %	0 %	0 %	25 %	242398035
590	NC_012883	TGG	2	6	34554	34559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	242398035
591	NC_012883	AGAGG	2	10	34600	34609	40 %	0 %	60 %	0 %	242398036
592	NC_012883	TGCTT	2	10	34628	34637	0 %	60 %	20 %	20 %	242398036
593	NC_012883	TTG	2	6	34648	34653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398036
594	NC_012883	TAAC	2	8	34705	34712	50 %	25 %	0 %	25 %	242398036
595	NC_012883	ATG	2	6	34897	34902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398036
596	NC_012883	ACA	2	6	34968	34973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398036
597	NC_012883	GA	3	6	35011	35016	50 %	0 %	50 %	0 %	242398036
598	NC_012883	A	6	6	35111	35116	100 %	0 %	0 %	0 %	242398036
599	NC_012883	AT	3	6	35127	35132	50 %	50 %	0 %	0 %	242398036
600	NC_012883	ATG	2	6	35191	35196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398036
601	NC_012883	A	6	6	35460	35465	100 %	0 %	0 %	0 %	242398036
602	NC_012883	TGT	2	6	35480	35485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398036
603	NC_012883	AT	3	6	35499	35504	50 %	50 %	0 %	0 %	242398036
604	NC_012883	GA	3	6	35564	35569	50 %	0 %	50 %	0 %	242398036
605	NC_012883	CTA	2	6	35620	35625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398036
606	NC_012883	A	6	6	35625	35630	100 %	0 %	0 %	0 %	242398036
607	NC_012883	TTG	2	6	35719	35724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398036
608	NC_012883	C	6	6	35776	35781	0 %	0 %	0 %	100 %	242398036
609	NC_012883	TAT	2	6	35791	35796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398036
610	NC_012883	GA	3	6	35867	35872	50 %	0 %	50 %	0 %	242398036
611	NC_012883	GAA	2	6	35880	35885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398036
612	NC_012883	TTG	2	6	35911	35916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	242398036
613	NC_012883	AAC	2	6	35934	35939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398036
614	NC_012883	GAG	3	9	36040	36048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	242398036
615	NC_012883	TAT	2	6	36121	36126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	242398037
616	NC_012883	AG	3	6	36335	36340	50 %	0 %	50 %	0 %	242398037
617	NC_012883	TAC	2	6	36419	36424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398037
618	NC_012883	AAC	2	6	36437	36442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	242398037
619	NC_012883	TC	3	6	36498	36503	0 %	50 %	0 %	50 %	242398037
620	NC_012883	CGCTA	2	10	36505	36514	20 %	20 %	20 %	40 %	242398037
621	NC_012883	TCAA	2	8	36534	36541	50 %	25 %	0 %	25 %	242398037
622	NC_012883	ACTTAC	2	12	36599	36610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	242398037
623	NC_012883	ATA	2	6	36659	36664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	242398037
624	NC_012883	AT	3	6	36667	36672	50 %	50 %	0 %	0 %	242398037
625	NC_012883	GAA	2	6	36683	36688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	242398037
626	NC_012883	ATG	2	6	36705	36710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398037
627	NC_012883	TCCT	2	8	36757	36764	0 %	50 %	0 %	50 %	242398037
628	NC_012883	AT	3	6	36766	36771	50 %	50 %	0 %	0 %	242398037
629	NC_012883	TAG	2	6	36814	36819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	242398037
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