MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012804	TC	3	6	183484	183489	0 %	50 %	0 %	50 %	240102250
3502	NC_012804	TGGAA	2	10	183510	183519	40 %	20 %	40 %	0 %	240102250
3503	NC_012804	GAG	2	6	183532	183537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102250
3504	NC_012804	GTG	2	6	184107	184112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102251
3505	NC_012804	CTA	2	6	184148	184153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102251
3506	NC_012804	GAG	2	6	184164	184169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102251
3507	NC_012804	GTG	2	6	184267	184272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102252
3508	NC_012804	CCT	2	6	184327	184332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102252
3509	NC_012804	GGA	2	6	184367	184372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102252
3510	NC_012804	AGG	2	6	184432	184437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102252
3511	NC_012804	GAA	2	6	184463	184468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102252
3512	NC_012804	GTA	2	6	184476	184481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102252
3513	NC_012804	GGA	2	6	184511	184516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102252
3514	NC_012804	CGGC	2	8	184552	184559	0 %	0 %	50 %	50 %	240102252
3515	NC_012804	GAAGA	2	10	184623	184632	60 %	0 %	40 %	0 %	240102252
3516	NC_012804	ACC	2	6	184651	184656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102252
3517	NC_012804	AAG	2	6	184704	184709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102252
3518	NC_012804	T	6	6	184729	184734	0 %	100 %	0 %	0 %	240102253
3519	NC_012804	CCG	2	6	184814	184819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102253
3520	NC_012804	CCCT	2	8	184828	184835	0 %	25 %	0 %	75 %	240102253
3521	NC_012804	ACG	2	6	184876	184881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102253
3522	NC_012804	GAT	2	6	184968	184973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102253
3523	NC_012804	ATG	2	6	184999	185004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102253
3524	NC_012804	CAT	2	6	185010	185015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102253
3525	NC_012804	TC	3	6	185037	185042	0 %	50 %	0 %	50 %	240102253
3526	NC_012804	CGT	2	6	185069	185074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102253
3527	NC_012804	GAT	3	9	185127	185135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102253
3528	NC_012804	ACC	2	6	185152	185157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102253
3529	NC_012804	GCCC	2	8	185307	185314	0 %	0 %	25 %	75 %	240102253
3530	NC_012804	GAC	2	6	185469	185474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102253
3531	NC_012804	AGG	2	6	185494	185499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102253
3532	NC_012804	TCC	2	6	185625	185630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102253
3533	NC_012804	TTCAC	2	10	185645	185654	20 %	40 %	0 %	40 %	240102253
3534	NC_012804	TAT	2	6	185684	185689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102254
3535	NC_012804	C	6	6	185756	185761	0 %	0 %	0 %	100 %	240102254
3536	NC_012804	CCT	2	6	186031	186036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102254
3537	NC_012804	CTC	2	6	186080	186085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102254
3538	NC_012804	AGG	2	6	186153	186158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102254
3539	NC_012804	GCC	2	6	186254	186259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102254
3540	NC_012804	CAT	2	6	186281	186286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102254
3541	NC_012804	ATC	2	6	186360	186365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102254
3542	NC_012804	CCT	2	6	186467	186472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102254
3543	NC_012804	TCC	2	6	186523	186528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102254
3544	NC_012804	TCCCTC	2	12	186549	186560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102254
3545	NC_012804	CGG	2	6	186633	186638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102254
3546	NC_012804	TCT	2	6	186644	186649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102254
3547	NC_012804	CGT	2	6	186674	186679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102254
3548	NC_012804	T	6	6	186790	186795	0 %	100 %	0 %	0 %	240102255
3549	NC_012804	CAT	2	6	186872	186877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102255
3550	NC_012804	TTG	2	6	187023	187028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102255
3551	NC_012804	TCC	2	6	187078	187083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3552	NC_012804	CTT	2	6	187094	187099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102255
3553	NC_012804	CTG	2	6	187101	187106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3554	NC_012804	ATG	2	6	187122	187127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
3555	NC_012804	ATT	2	6	187149	187154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102255
3556	NC_012804	CGG	2	6	187169	187174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102255
3557	NC_012804	TCC	2	6	187269	187274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3558	NC_012804	CTG	2	6	187430	187435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3559	NC_012804	CCTTC	2	10	187484	187493	0 %	40 %	0 %	60 %	240102255
3560	NC_012804	CGGT	2	8	187623	187630	0 %	25 %	50 %	25 %	240102255
3561	NC_012804	TGA	2	6	187660	187665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
3562	NC_012804	CTC	2	6	187667	187672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3563	NC_012804	CCT	2	6	187768	187773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3564	NC_012804	TTC	2	6	187785	187790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102255
3565	NC_012804	TTA	2	6	187807	187812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102255
3566	NC_012804	CTC	2	6	187860	187865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3567	NC_012804	GAC	2	6	187874	187879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3568	NC_012804	TATG	2	8	187898	187905	25 %	50 %	25 %	0 %	240102255
3569	NC_012804	CAG	2	6	187940	187945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3570	NC_012804	GTC	2	6	187946	187951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3571	NC_012804	GA	3	6	187956	187961	50 %	0 %	50 %	0 %	240102255
3572	NC_012804	ACC	2	6	188055	188060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102255
3573	NC_012804	GCTC	2	8	188089	188096	0 %	25 %	25 %	50 %	240102255
3574	NC_012804	GGAA	2	8	188100	188107	50 %	0 %	50 %	0 %	240102255
3575	NC_012804	TCG	2	6	188148	188153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3576	NC_012804	GTA	2	6	188168	188173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
3577	NC_012804	TCCG	2	8	188174	188181	0 %	25 %	25 %	50 %	240102255
3578	NC_012804	GAG	2	6	188201	188206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102255
3579	NC_012804	TTGA	2	8	188268	188275	25 %	50 %	25 %	0 %	240102255
3580	NC_012804	GAG	2	6	188276	188281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102255
3581	NC_012804	AGG	2	6	188297	188302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102255
3582	NC_012804	CGT	2	6	188308	188313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3583	NC_012804	GTA	2	6	188351	188356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
3584	NC_012804	CAC	2	6	188474	188479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102255
3585	NC_012804	GAA	2	6	188498	188503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102255
3586	NC_012804	GGGT	2	8	188505	188512	0 %	25 %	75 %	0 %	240102255
3587	NC_012804	CGTCCT	2	12	188537	188548	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240102255
3588	NC_012804	CCTT	2	8	188578	188585	0 %	50 %	0 %	50 %	240102255
3589	NC_012804	TG	3	6	188603	188608	0 %	50 %	50 %	0 %	240102255
3590	NC_012804	GAC	2	6	188639	188644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3591	NC_012804	TCG	2	6	188661	188666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3592	NC_012804	CTC	2	6	188726	188731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3593	NC_012804	CGA	2	6	188860	188865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3594	NC_012804	GTC	2	6	188906	188911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3595	NC_012804	CGG	2	6	188942	188947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102255
3596	NC_012804	CCG	2	6	188992	188997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102255
3597	NC_012804	CGCT	2	8	189018	189025	0 %	25 %	25 %	50 %	240102255
3598	NC_012804	GTC	3	9	189057	189065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3599	NC_012804	ACC	2	6	189080	189085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102255
3600	NC_012804	TCCA	2	8	189119	189126	25 %	25 %	0 %	50 %	240102255
3601	NC_012804	GCC	2	6	189144	189149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102255
3602	NC_012804	GAT	2	6	189185	189190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
3603	NC_012804	CTT	2	6	189203	189208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102255
3604	NC_012804	GAG	2	6	189296	189301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102255
3605	NC_012804	CTG	2	6	189308	189313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102255
3606	NC_012804	TCC	2	6	189319	189324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3607	NC_012804	CCTC	2	8	189331	189338	0 %	25 %	0 %	75 %	240102255
3608	NC_012804	GAT	2	6	189350	189355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
3609	NC_012804	CTC	2	6	189371	189376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3610	NC_012804	TTGT	2	8	189435	189442	0 %	75 %	25 %	0 %	240102255
3611	NC_012804	CCT	2	6	189571	189576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3612	NC_012804	CTTC	2	8	189608	189615	0 %	50 %	0 %	50 %	240102255
3613	NC_012804	TC	3	6	189614	189619	0 %	50 %	0 %	50 %	240102255
3614	NC_012804	ATCT	2	8	189644	189651	25 %	50 %	0 %	25 %	240102255
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3617	NC_012804	TC	3	6	189832	189837	0 %	50 %	0 %	50 %	240102255
3618	NC_012804	GGTTTG	2	12	189864	189875	0 %	50 %	50 %	0 %	240102255
3619	NC_012804	CCGTGC	2	12	189931	189942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240102255
3620	NC_012804	T	6	6	190001	190006	0 %	100 %	0 %	0 %	240102255
3621	NC_012804	GGCT	2	8	190007	190014	0 %	25 %	50 %	25 %	240102255
3622	NC_012804	TCT	2	6	190017	190022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102255
3623	NC_012804	CT	4	8	190028	190035	0 %	50 %	0 %	50 %	240102255
3624	NC_012804	TCC	3	9	190037	190045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3625	NC_012804	TCC	2	6	190077	190082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
3626	NC_012804	TGA	2	6	190094	190099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102255
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3630	NC_012804	T	6	6	190226	190231	0 %	100 %	0 %	0 %	240102255
3631	NC_012804	CTC	2	6	190232	190237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102255
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3634	NC_012804	TCTTTT	2	12	190321	190332	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	240102255
3635	NC_012804	CCA	2	6	190333	190338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102255
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3640	NC_012804	GTT	2	6	190477	190482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102256
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3642	NC_012804	CTGT	2	8	190495	190502	0 %	50 %	25 %	25 %	240102256
3643	NC_012804	G	6	6	190553	190558	0 %	0 %	100 %	0 %	240102256
3644	NC_012804	CGTTG	2	10	190638	190647	0 %	40 %	40 %	20 %	240102256
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3647	NC_012804	C	6	6	190897	190902	0 %	0 %	0 %	100 %	240102256
3648	NC_012804	CGTT	2	8	190943	190950	0 %	50 %	25 %	25 %	240102256
3649	NC_012804	TGTA	2	8	190978	190985	25 %	50 %	25 %	0 %	240102256
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3653	NC_012804	AT	3	6	191160	191165	50 %	50 %	0 %	0 %	240102256
3654	NC_012804	TCA	2	6	191240	191245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102256
3655	NC_012804	CTC	2	6	191298	191303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102256
3656	NC_012804	AAC	2	6	191332	191337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102256
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3664	NC_012804	ATG	2	6	191819	191824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102257
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3666	NC_012804	TGG	2	6	191892	191897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102257
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3680	NC_012804	GCG	2	6	192712	192717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102257
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3747	NC_012804	TCT	2	6	195908	195913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102262
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3857	NC_012804	TC	3	6	202319	202324	0 %	50 %	0 %	50 %	240102269
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3987	NC_012804	CTC	3	9	210474	210482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102276
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3990	NC_012804	CTT	2	6	210651	210656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102276
3991	NC_012804	TTA	2	6	211044	211049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102277
3992	NC_012804	CTG	2	6	211088	211093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102277
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