MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012804	CAC	2	6	294966	294971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102368
5502	NC_012804	TGGA	2	8	295002	295009	25 %	25 %	50 %	0 %	240102368
5503	NC_012804	TTC	2	6	295035	295040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102368
5504	NC_012804	GGGC	2	8	295093	295100	0 %	0 %	75 %	25 %	240102368
5505	NC_012804	AAG	2	6	295176	295181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5506	NC_012804	GGT	2	6	295208	295213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102368
5507	NC_012804	ACT	2	6	295228	295233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102368
5508	NC_012804	ACG	2	6	295318	295323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102368
5509	NC_012804	AAG	2	6	295353	295358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5510	NC_012804	GGCG	2	8	295361	295368	0 %	0 %	75 %	25 %	240102368
5511	NC_012804	AGAT	2	8	295375	295382	50 %	25 %	25 %	0 %	240102368
5512	NC_012804	GA	3	6	295383	295388	50 %	0 %	50 %	0 %	240102368
5513	NC_012804	GAG	2	6	295494	295499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5514	NC_012804	CTC	2	6	295623	295628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102368
5515	NC_012804	CGCT	2	8	295675	295682	0 %	25 %	25 %	50 %	240102368
5516	NC_012804	TCG	2	6	295687	295692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102368
5517	NC_012804	GGA	2	6	295742	295747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5518	NC_012804	GA	4	8	295823	295830	50 %	0 %	50 %	0 %	240102368
5519	NC_012804	AAG	3	9	295842	295850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5520	NC_012804	AGG	2	6	295939	295944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5521	NC_012804	GAA	2	6	296009	296014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5522	NC_012804	CTA	2	6	296078	296083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102368
5523	NC_012804	GAC	2	6	296133	296138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102368
5524	NC_012804	GAA	2	6	296220	296225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5525	NC_012804	TCC	2	6	296263	296268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102368
5526	NC_012804	AGG	2	6	296334	296339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5527	NC_012804	CCA	2	6	296354	296359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102368
5528	NC_012804	GC	3	6	296383	296388	0 %	0 %	50 %	50 %	240102368
5529	NC_012804	GAG	2	6	296484	296489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5530	NC_012804	CGT	2	6	296522	296527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102368
5531	NC_012804	GCG	2	6	296608	296613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102368
5532	NC_012804	GAA	2	6	296623	296628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5533	NC_012804	CGG	2	6	296767	296772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102368
5534	NC_012804	AAG	2	6	296817	296822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102368
5535	NC_012804	CCG	2	6	296824	296829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102368
5536	NC_012804	CGG	2	6	296866	296871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102368
5537	NC_012804	TTC	2	6	296877	296882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102368
5538	NC_012804	GGAA	2	8	296890	296897	50 %	0 %	50 %	0 %	240102368
5539	NC_012804	GCC	2	6	297036	297041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102368
5540	NC_012804	AGGA	2	8	297051	297058	50 %	0 %	50 %	0 %	240102368
5541	NC_012804	TCA	2	6	297076	297081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102368
5542	NC_012804	AGGG	2	8	297084	297091	25 %	0 %	75 %	0 %	240102368
5543	NC_012804	ATA	2	6	297150	297155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102368
5544	NC_012804	CGG	2	6	297167	297172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102368
5545	NC_012804	TGGCGG	2	12	297173	297184	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	240102368
5546	NC_012804	AGG	2	6	297232	297237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5547	NC_012804	AGG	2	6	297244	297249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5548	NC_012804	AGG	2	6	297255	297260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102368
5549	NC_012804	GGACG	2	10	297396	297405	20 %	0 %	60 %	20 %	240102369
5550	NC_012804	GAA	2	6	297433	297438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102369
5551	NC_012804	CTT	2	6	297464	297469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102369
5552	NC_012804	ACG	2	6	297497	297502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102369
5553	NC_012804	CTGG	2	8	297566	297573	0 %	25 %	50 %	25 %	240102369
5554	NC_012804	GGA	2	6	297588	297593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102369
5555	NC_012804	CTTC	2	8	297669	297676	0 %	50 %	0 %	50 %	240102369
5556	NC_012804	GTC	2	6	297700	297705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102370
5557	NC_012804	TGG	2	6	297758	297763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102370
5558	NC_012804	C	6	6	297815	297820	0 %	0 %	0 %	100 %	240102370
5559	NC_012804	CGA	2	6	297975	297980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102370
5560	NC_012804	ACC	2	6	297983	297988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102370
5561	NC_012804	GTTGT	2	10	297989	297998	0 %	60 %	40 %	0 %	240102370
5562	NC_012804	GTT	2	6	298165	298170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102370
5563	NC_012804	TAT	2	6	298261	298266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102370
5564	NC_012804	AG	3	6	298305	298310	50 %	0 %	50 %	0 %	240102371
5565	NC_012804	GTC	2	6	298367	298372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102371
5566	NC_012804	CTC	2	6	298517	298522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102371
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5569	NC_012804	GAA	2	6	298580	298585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102371
5570	NC_012804	CAA	2	6	298612	298617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102371
5571	NC_012804	AAG	2	6	298814	298819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102371
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5573	NC_012804	A	6	6	299175	299180	100 %	0 %	0 %	0 %	240102372
5574	NC_012804	CGG	2	6	299223	299228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102372
5575	NC_012804	TGG	2	6	299238	299243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102372
5576	NC_012804	CACT	2	8	299248	299255	25 %	25 %	0 %	50 %	240102372
5577	NC_012804	GAA	2	6	299275	299280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102372
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5580	NC_012804	GAA	2	6	299545	299550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102372
5581	NC_012804	TCG	2	6	299577	299582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102372
5582	NC_012804	CGA	2	6	299613	299618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102372
5583	NC_012804	GGGC	2	8	299622	299629	0 %	0 %	75 %	25 %	240102372
5584	NC_012804	GTT	2	6	299702	299707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102372
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5589	NC_012804	CGA	2	6	300815	300820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102374
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5592	NC_012804	GAA	3	9	301049	301057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102374
5593	NC_012804	CGT	2	6	301073	301078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102374
5594	NC_012804	GAG	2	6	301092	301097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102374
5595	NC_012804	TCA	2	6	301135	301140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102374
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5598	NC_012804	CAGA	2	8	301361	301368	50 %	0 %	25 %	25 %	240102374
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5601	NC_012804	GAG	2	6	301466	301471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102374
5602	NC_012804	GAT	2	6	301484	301489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102374
5603	NC_012804	GAG	2	6	301572	301577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102374
5604	NC_012804	CAC	2	6	301598	301603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102374
5605	NC_012804	CGG	2	6	301622	301627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102374
5606	NC_012804	CGG	2	6	301637	301642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102374
5607	NC_012804	G	6	6	301712	301717	0 %	0 %	100 %	0 %	240102374
5608	NC_012804	CTC	2	6	301782	301787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102374
5609	NC_012804	CCCGG	2	10	301800	301809	0 %	0 %	40 %	60 %	240102374
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5612	NC_012804	AAG	2	6	301875	301880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102374
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5614	NC_012804	AAGG	2	8	302039	302046	50 %	0 %	50 %	0 %	240102374
5615	NC_012804	GAA	2	6	302058	302063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102374
5616	NC_012804	GA	3	6	302151	302156	50 %	0 %	50 %	0 %	240102374
5617	NC_012804	GAG	2	6	302166	302171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102374
5618	NC_012804	GAG	2	6	302187	302192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102374
5619	NC_012804	CAG	2	6	302234	302239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102375
5620	NC_012804	TCC	2	6	302247	302252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102375
5621	NC_012804	CGAG	2	8	302332	302339	25 %	0 %	50 %	25 %	240102375
5622	NC_012804	TCC	2	6	302399	302404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102375
5623	NC_012804	TCG	3	9	302470	302478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102375
5624	NC_012804	ACG	2	6	302520	302525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102375
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5626	NC_012804	ACG	2	6	302643	302648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102375
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5643	NC_012804	CCT	2	6	303837	303842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102377
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5686	NC_012804	CGA	2	6	305895	305900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102379
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5983	NC_012804	AG	3	6	320432	320437	50 %	0 %	50 %	0 %	240102392
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5986	NC_012804	TG	3	6	320545	320550	0 %	50 %	50 %	0 %	240102392
5987	NC_012804	AGC	2	6	320557	320562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102392
5988	NC_012804	CTT	2	6	320627	320632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102393
5989	NC_012804	GGT	2	6	320644	320649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102393
5990	NC_012804	TTA	2	6	320730	320735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102393
5991	NC_012804	TAC	3	9	320840	320848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102393
5992	NC_012804	CAA	2	6	320893	320898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102393
5993	NC_012804	TTC	2	6	321044	321049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102393
5994	NC_012804	GAT	2	6	321088	321093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102393
5995	NC_012804	GTGAG	2	10	321112	321121	20 %	20 %	60 %	0 %	240102393
5996	NC_012804	CGC	2	6	321154	321159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102394
5997	NC_012804	TCT	2	6	321231	321236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102394
5998	NC_012804	TCC	2	6	321285	321290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102394
5999	NC_012804	CTG	2	6	321480	321485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102394
6000	NC_012804	AGA	2	6	321486	321491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102394

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