MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011959	GTC	3	9	148283	148291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3002	NC_011959	CGAG	2	8	148356	148363	25 %	0 %	50 %	25 %	221632175
3003	NC_011959	CGA	2	6	148419	148424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3004	NC_011959	TCGC	2	8	148448	148455	0 %	25 %	25 %	50 %	221632175
3005	NC_011959	TGG	2	6	148497	148502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3006	NC_011959	GCA	2	6	148514	148519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3007	NC_011959	GTC	2	6	148541	148546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3008	NC_011959	GGT	2	6	148567	148572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3009	NC_011959	TCG	2	6	148601	148606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3010	NC_011959	CG	3	6	148677	148682	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3011	NC_011959	GTG	2	6	148739	148744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3012	NC_011959	CCGA	2	8	148748	148755	25 %	0 %	25 %	50 %	221632175
3013	NC_011959	GTGAGC	2	12	148988	148999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632175
3014	NC_011959	TCG	2	6	149060	149065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3015	NC_011959	GAG	2	6	149101	149106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632175
3016	NC_011959	CGG	2	6	149107	149112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632175
3017	NC_011959	GTGC	2	8	149227	149234	0 %	25 %	50 %	25 %	221632175
3018	NC_011959	GTTC	2	8	149316	149323	0 %	50 %	25 %	25 %	221632175
3019	NC_011959	GGTC	2	8	149352	149359	0 %	25 %	50 %	25 %	221632175
3020	NC_011959	TCG	2	6	149382	149387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3021	NC_011959	G	6	6	149392	149397	0 %	0 %	100 %	0 %	221632175
3022	NC_011959	ATCG	2	8	149416	149423	25 %	25 %	25 %	25 %	221632175
3023	NC_011959	CTG	2	6	149424	149429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3024	NC_011959	CGA	2	6	149436	149441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3025	NC_011959	TCG	2	6	149444	149449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3026	NC_011959	CGT	2	6	149550	149555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3027	NC_011959	GGT	2	6	149620	149625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3028	NC_011959	CGC	2	6	149703	149708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632175
3029	NC_011959	CGAG	2	8	149709	149716	25 %	0 %	50 %	25 %	221632175
3030	NC_011959	CGAG	2	8	149810	149817	25 %	0 %	50 %	25 %	221632175
3031	NC_011959	TGG	2	6	149847	149852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3032	NC_011959	GCA	2	6	149864	149869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3033	NC_011959	TCGTGA	2	12	149895	149906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632175
3034	NC_011959	GTC	2	6	149950	149955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3035	NC_011959	CGT	2	6	149977	149982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3036	NC_011959	GTC	2	6	150053	150058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3037	NC_011959	GCTG	2	8	150059	150066	0 %	25 %	50 %	25 %	221632175
3038	NC_011959	GA	3	6	150176	150181	50 %	0 %	50 %	0 %	221632175
3039	NC_011959	TG	3	6	150188	150193	0 %	50 %	50 %	0 %	221632175
3040	NC_011959	GC	3	6	150201	150206	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3041	NC_011959	CG	3	6	150301	150306	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3042	NC_011959	GGT	2	6	150439	150444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3043	NC_011959	AG	3	6	150474	150479	50 %	0 %	50 %	0 %	221632175
3044	NC_011959	TCGA	2	8	150550	150557	25 %	25 %	25 %	25 %	221632175
3045	NC_011959	CGT	2	6	150748	150753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3046	NC_011959	AGC	2	6	150766	150771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3047	NC_011959	GATCTG	2	12	150835	150846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632175
3048	NC_011959	CTG	2	6	150854	150859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3049	NC_011959	TGA	2	6	150882	150887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632175
3050	NC_011959	ACC	2	6	150919	150924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632175
3051	NC_011959	GGT	3	9	150982	150990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3052	NC_011959	CCG	3	9	151061	151069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632175
3053	NC_011959	GAG	2	6	151078	151083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632175
3054	NC_011959	TCG	2	6	151200	151205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3055	NC_011959	GC	4	8	151211	151218	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3056	NC_011959	CGT	2	6	151246	151251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3057	NC_011959	CACT	2	8	151263	151270	25 %	25 %	0 %	50 %	221632175
3058	NC_011959	GTC	2	6	151303	151308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3059	NC_011959	TCG	2	6	151326	151331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3060	NC_011959	CGTG	2	8	151435	151442	0 %	25 %	50 %	25 %	221632175
3061	NC_011959	CAC	2	6	151465	151470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632175
3062	NC_011959	CTG	2	6	151540	151545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3063	NC_011959	CG	3	6	151561	151566	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3064	NC_011959	GGT	2	6	151621	151626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632175
3065	NC_011959	CGA	2	6	151653	151658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3066	NC_011959	CG	3	6	151740	151745	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3067	NC_011959	ATGCC	2	10	151769	151778	20 %	20 %	20 %	40 %	221632175
3068	NC_011959	CGA	2	6	151872	151877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3069	NC_011959	GAT	2	6	151965	151970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632175
3070	NC_011959	AAG	2	6	151973	151978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632175
3071	NC_011959	AGC	2	6	152018	152023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3072	NC_011959	GAT	2	6	152083	152088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632175
3073	NC_011959	TCC	2	6	152095	152100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632175
3074	NC_011959	CGG	2	6	152122	152127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632175
3075	NC_011959	CGA	2	6	152184	152189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3076	NC_011959	GTA	2	6	152239	152244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632175
3077	NC_011959	CGT	2	6	152352	152357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3078	NC_011959	CGA	2	6	152376	152381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3079	NC_011959	GCGG	2	8	152399	152406	0 %	0 %	75 %	25 %	221632175
3080	NC_011959	GTC	2	6	152408	152413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3081	NC_011959	TCG	2	6	152418	152423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3082	NC_011959	TCG	2	6	152487	152492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3083	NC_011959	TCA	2	6	152514	152519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632175
3084	NC_011959	GA	3	6	152586	152591	50 %	0 %	50 %	0 %	221632175
3085	NC_011959	TGC	2	6	152650	152655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3086	NC_011959	GTC	2	6	152663	152668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3087	NC_011959	CGC	2	6	152706	152711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632175
3088	NC_011959	CAGA	2	8	152725	152732	50 %	0 %	25 %	25 %	221632175
3089	NC_011959	TCG	2	6	152766	152771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3090	NC_011959	GCT	2	6	152780	152785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3091	NC_011959	GC	3	6	152826	152831	0 %	0 %	50 %	50 %	221632175
3092	NC_011959	GAG	2	6	152836	152841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632175
3093	NC_011959	TCG	2	6	152863	152868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3094	NC_011959	CGG	2	6	153195	153200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632176
3095	NC_011959	GTC	2	6	153205	153210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3096	NC_011959	CTC	2	6	153274	153279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632176
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3098	NC_011959	GCTGAT	2	12	153355	153366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632176
3099	NC_011959	TCG	2	6	153368	153373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3100	NC_011959	GCC	2	6	153412	153417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632176
3101	NC_011959	TGC	2	6	153430	153435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3102	NC_011959	TCG	2	6	153524	153529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3103	NC_011959	CTT	3	9	153546	153554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632176
3104	NC_011959	GCC	2	6	153593	153598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632176
3105	NC_011959	TGG	2	6	153666	153671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632176
3106	NC_011959	CTC	2	6	153679	153684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632176
3107	NC_011959	TCT	2	6	153711	153716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632176
3108	NC_011959	CG	3	6	153735	153740	0 %	0 %	50 %	50 %	221632176
3109	NC_011959	GT	3	6	153750	153755	0 %	50 %	50 %	0 %	221632176
3110	NC_011959	CGA	2	6	153777	153782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3111	NC_011959	CCG	2	6	153818	153823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632176
3112	NC_011959	ACG	2	6	153883	153888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3113	NC_011959	CGA	2	6	153897	153902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3114	NC_011959	CTC	2	6	153928	153933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632176
3115	NC_011959	GC	4	8	153951	153958	0 %	0 %	50 %	50 %	221632176
3116	NC_011959	C	7	7	154005	154011	0 %	0 %	0 %	100 %	221632176
3117	NC_011959	CGG	2	6	154022	154027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632176
3118	NC_011959	AGT	2	6	154053	154058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632176
3119	NC_011959	GGT	2	6	154111	154116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632176
3120	NC_011959	TCGGA	2	10	154148	154157	20 %	20 %	40 %	20 %	221632176
3121	NC_011959	CGA	2	6	154218	154223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632176
3122	NC_011959	CCT	2	6	154318	154323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632177
3123	NC_011959	GCGG	2	8	154360	154367	0 %	0 %	75 %	25 %	221632177
3124	NC_011959	AGCC	2	8	154377	154384	25 %	0 %	25 %	50 %	221632177
3125	NC_011959	CGA	2	6	154447	154452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632177
3126	NC_011959	CGA	2	6	154528	154533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632177
3127	NC_011959	CGG	2	6	154545	154550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632177
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3129	NC_011959	GGCG	2	8	154821	154828	0 %	0 %	75 %	25 %	221632178
3130	NC_011959	GAG	2	6	154858	154863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632178
3131	NC_011959	CGT	2	6	154884	154889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632178
3132	NC_011959	CT	3	6	154946	154951	0 %	50 %	0 %	50 %	221632178
3133	NC_011959	GTG	2	6	154998	155003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632178
3134	NC_011959	TGA	2	6	155010	155015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632178
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3142	NC_011959	GTCG	2	8	155359	155366	0 %	25 %	50 %	25 %	221632179
3143	NC_011959	GT	3	6	155505	155510	0 %	50 %	50 %	0 %	221632180
3144	NC_011959	CCAG	2	8	155511	155518	25 %	0 %	25 %	50 %	221632180
3145	NC_011959	GCT	2	6	155552	155557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632180
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3148	NC_011959	GCA	2	6	155691	155696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632180
3149	NC_011959	TCGC	2	8	155714	155721	0 %	25 %	25 %	50 %	221632180
3150	NC_011959	GTT	2	6	155775	155780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632180
3151	NC_011959	CCAA	2	8	155797	155804	50 %	0 %	0 %	50 %	221632180
3152	NC_011959	TCC	2	6	155920	155925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632181
3153	NC_011959	GCG	2	6	155929	155934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
3154	NC_011959	GAC	2	6	155991	155996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
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3163	NC_011959	TGC	2	6	156249	156254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632181
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3165	NC_011959	GGC	2	6	156399	156404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632181
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3175	NC_011959	GAAG	2	8	156642	156649	50 %	0 %	50 %	0 %	221632181
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3192	NC_011959	CG	4	8	157481	157488	0 %	0 %	50 %	50 %	221632181
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3202	NC_011959	GCA	2	6	157775	157780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632181
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3209	NC_011959	GAGC	2	8	158235	158242	25 %	0 %	50 %	25 %	221632182
3210	NC_011959	GCT	2	6	158327	158332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632182
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3225	NC_011959	TGGG	2	8	159059	159066	0 %	25 %	75 %	0 %	221632183
3226	NC_011959	TCG	2	6	159090	159095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3227	NC_011959	G	6	6	159175	159180	0 %	0 %	100 %	0 %	221632183
3228	NC_011959	AGC	2	6	159191	159196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632183
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3230	NC_011959	AGCCG	2	10	159282	159291	20 %	0 %	40 %	40 %	221632183
3231	NC_011959	GCG	2	6	159293	159298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632183
3232	NC_011959	GGCGC	2	10	159357	159366	0 %	0 %	60 %	40 %	221632183
3233	NC_011959	CG	3	6	159451	159456	0 %	0 %	50 %	50 %	221632183
3234	NC_011959	TCG	2	6	159533	159538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3235	NC_011959	CAG	2	6	159553	159558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3236	NC_011959	GTC	2	6	159580	159585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632183
3237	NC_011959	GTTC	2	8	159624	159631	0 %	50 %	25 %	25 %	221632183
3238	NC_011959	TCC	2	6	159653	159658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632183
3239	NC_011959	ATC	2	6	159715	159720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632184
3240	NC_011959	GCA	2	6	159822	159827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
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3242	NC_011959	CCG	3	9	159937	159945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632184
3243	NC_011959	CAG	2	6	159946	159951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3244	NC_011959	GCA	2	6	159971	159976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632184
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3247	NC_011959	CGT	2	6	160025	160030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632184
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3249	NC_011959	GAG	2	6	160131	160136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632184
3250	NC_011959	CGT	2	6	160137	160142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632184
3251	NC_011959	CGT	2	6	160154	160159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632184
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3351	NC_011959	CGGA	2	8	165681	165688	25 %	0 %	50 %	25 %	221632191
3352	NC_011959	AGCCG	2	10	165737	165746	20 %	0 %	40 %	40 %	221632191
3353	NC_011959	TCCG	2	8	165753	165760	0 %	25 %	25 %	50 %	221632191
3354	NC_011959	TCA	2	6	165854	165859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632191
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3358	NC_011959	ATC	2	6	165915	165920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632192
3359	NC_011959	GTC	2	6	165938	165943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632192
3360	NC_011959	TGGC	2	8	165971	165978	0 %	25 %	50 %	25 %	221632192
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3362	NC_011959	ACC	2	6	166059	166064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632192
3363	NC_011959	CTT	2	6	166082	166087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632192
3364	NC_011959	GAG	2	6	166088	166093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632192
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3366	NC_011959	GCT	2	6	166152	166157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632192
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3479	NC_011959	GCTG	2	8	172132	172139	0 %	25 %	50 %	25 %	221632200
3480	NC_011959	CGAT	2	8	172152	172159	25 %	25 %	25 %	25 %	221632200
3481	NC_011959	GAG	2	6	172295	172300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632200
3482	NC_011959	CGA	2	6	172342	172347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632200
3483	NC_011959	AGA	2	6	172383	172388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632200
3484	NC_011959	CTG	2	6	172451	172456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632200
3485	NC_011959	GTC	2	6	172460	172465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632200
3486	NC_011959	ACA	2	6	172485	172490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632200
3487	NC_011959	AAG	2	6	172509	172514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632200
3488	NC_011959	CTG	2	6	172547	172552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632200
3489	NC_011959	GCC	2	6	172561	172566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632200
3490	NC_011959	GGC	3	9	172606	172614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632200
3491	NC_011959	CGAC	2	8	172635	172642	25 %	0 %	25 %	50 %	221632200
3492	NC_011959	CGGG	2	8	172661	172668	0 %	0 %	75 %	25 %	221632200
3493	NC_011959	TTCCA	2	10	172772	172781	20 %	40 %	0 %	40 %	221632200
3494	NC_011959	GC	3	6	172825	172830	0 %	0 %	50 %	50 %	221632200
3495	NC_011959	ACCGG	2	10	172850	172859	20 %	0 %	40 %	40 %	221632200
3496	NC_011959	CG	3	6	172867	172872	0 %	0 %	50 %	50 %	221632200
3497	NC_011959	CGGC	2	8	172899	172906	0 %	0 %	50 %	50 %	221632200
3498	NC_011959	AGCG	2	8	172925	172932	25 %	0 %	50 %	25 %	221632200
3499	NC_011959	GGA	2	6	173052	173057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632201
3500	NC_011959	CCG	2	6	173079	173084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632201

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