MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011959	CG	3	6	121583	121588	0 %	0 %	50 %	50 %	221632151
2502	NC_011959	GC	3	6	121641	121646	0 %	0 %	50 %	50 %	221632151
2503	NC_011959	GAT	2	6	121679	121684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632151
2504	NC_011959	TTCC	2	8	121705	121712	0 %	50 %	0 %	50 %	221632151
2505	NC_011959	CG	3	6	121774	121779	0 %	0 %	50 %	50 %	221632151
2506	NC_011959	CGA	2	6	121804	121809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2507	NC_011959	GCT	2	6	121848	121853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2508	NC_011959	GGC	2	6	121859	121864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632151
2509	NC_011959	CGC	2	6	121870	121875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632151
2510	NC_011959	GATC	2	8	121876	121883	25 %	25 %	25 %	25 %	221632151
2511	NC_011959	GC	3	6	121886	121891	0 %	0 %	50 %	50 %	221632151
2512	NC_011959	GA	3	6	121912	121917	50 %	0 %	50 %	0 %	221632151
2513	NC_011959	TCG	3	9	121924	121932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2514	NC_011959	CAGC	2	8	121969	121976	25 %	0 %	25 %	50 %	221632151
2515	NC_011959	GCC	2	6	121993	121998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632151
2516	NC_011959	GC	3	6	122028	122033	0 %	0 %	50 %	50 %	221632151
2517	NC_011959	CGAG	2	8	122050	122057	25 %	0 %	50 %	25 %	221632151
2518	NC_011959	TCG	2	6	122076	122081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2519	NC_011959	AGC	2	6	122094	122099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2520	NC_011959	CTG	2	6	122134	122139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2521	NC_011959	TCG	2	6	122172	122177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151
2522	NC_011959	CAT	2	6	122192	122197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632151
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2524	NC_011959	CCG	2	6	122259	122264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632151
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2534	NC_011959	CCAT	2	8	122790	122797	25 %	25 %	0 %	50 %	221632151
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2537	NC_011959	GCC	2	6	122954	122959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632152
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2540	NC_011959	CCAG	2	8	122993	123000	25 %	0 %	25 %	50 %	221632152
2541	NC_011959	ATCCG	2	10	123029	123038	20 %	20 %	20 %	40 %	221632152
2542	NC_011959	CCT	2	6	123039	123044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632152
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2549	NC_011959	GCTTC	2	10	123444	123453	0 %	40 %	20 %	40 %	221632152
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2551	NC_011959	GAGC	2	8	123552	123559	25 %	0 %	50 %	25 %	221632152
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2553	NC_011959	CG	3	6	123610	123615	0 %	0 %	50 %	50 %	221632152
2554	NC_011959	CG	3	6	123655	123660	0 %	0 %	50 %	50 %	221632152
2555	NC_011959	GGC	2	6	123838	123843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632152
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2558	NC_011959	CAC	2	6	124030	124035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632152
2559	NC_011959	TCG	2	6	124097	124102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632152
2560	NC_011959	CG	3	6	124195	124200	0 %	0 %	50 %	50 %	221632152
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2562	NC_011959	CGA	2	6	124311	124316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632152
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2574	NC_011959	CGA	2	6	125093	125098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632153
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2582	NC_011959	CG	3	6	126060	126065	0 %	0 %	50 %	50 %	221632154
2583	NC_011959	GAG	2	6	126193	126198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632154
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2588	NC_011959	CAG	2	6	126547	126552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632154
2589	NC_011959	TCG	2	6	126647	126652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632154
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2592	NC_011959	AGG	2	6	126741	126746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632154
2593	NC_011959	GAC	2	6	126748	126753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632154
2594	NC_011959	CCG	2	6	126810	126815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632154
2595	NC_011959	GCA	2	6	126824	126829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632154
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2597	NC_011959	GGCA	2	8	126882	126889	25 %	0 %	50 %	25 %	221632154
2598	NC_011959	AGG	2	6	126908	126913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632154
2599	NC_011959	CGG	3	9	126929	126937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632154
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2602	NC_011959	CGATC	2	10	126975	126984	20 %	20 %	20 %	40 %	221632154
2603	NC_011959	TCG	2	6	127105	127110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
2604	NC_011959	CAT	2	6	127176	127181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632155
2605	NC_011959	GAT	2	6	127230	127235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632155
2606	NC_011959	ATCG	2	8	127257	127264	25 %	25 %	25 %	25 %	221632155
2607	NC_011959	TCG	2	6	127310	127315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
2608	NC_011959	AGG	2	6	127363	127368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632155
2609	NC_011959	TCGG	2	8	127375	127382	0 %	25 %	50 %	25 %	221632155
2610	NC_011959	CCG	2	6	127394	127399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632155
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2612	NC_011959	TCG	2	6	127502	127507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
2613	NC_011959	CGG	2	6	127573	127578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632155
2614	NC_011959	CGG	2	6	127592	127597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632155
2615	NC_011959	CGA	2	6	127601	127606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632155
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2617	NC_011959	GCGT	2	8	127720	127727	0 %	25 %	50 %	25 %	221632155
2618	NC_011959	CGT	2	6	127763	127768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
2619	NC_011959	GT	3	6	127772	127777	0 %	50 %	50 %	0 %	221632155
2620	NC_011959	CGA	2	6	127805	127810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632155
2621	NC_011959	GAGC	2	8	127823	127830	25 %	0 %	50 %	25 %	221632155
2622	NC_011959	GCTCG	2	10	127833	127842	0 %	20 %	40 %	40 %	221632155
2623	NC_011959	GCT	2	6	127897	127902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
2624	NC_011959	TTC	2	6	127905	127910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632155
2625	NC_011959	GTA	2	6	127929	127934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632155
2626	NC_011959	CG	3	6	127994	127999	0 %	0 %	50 %	50 %	221632155
2627	NC_011959	CGG	2	6	128018	128023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632155
2628	NC_011959	CTG	2	6	128037	128042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632155
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2631	NC_011959	GAT	2	6	128169	128174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632155
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2633	NC_011959	CGG	2	6	128300	128305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632156
2634	NC_011959	CCT	2	6	128333	128338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632156
2635	NC_011959	ATGA	2	8	128524	128531	50 %	25 %	25 %	0 %	221632156
2636	NC_011959	TAG	2	6	128585	128590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632156
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2638	NC_011959	CAGT	2	8	128643	128650	25 %	25 %	25 %	25 %	221632156
2639	NC_011959	GAC	2	6	128749	128754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632156
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2641	NC_011959	GAT	2	6	128890	128895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632156
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2650	NC_011959	GTA	2	6	129328	129333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632156
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2661	NC_011959	ATCG	2	8	130032	130039	25 %	25 %	25 %	25 %	221632158
2662	NC_011959	CAG	2	6	130226	130231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632158
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2718	NC_011959	GGCAC	2	10	133090	133099	20 %	0 %	40 %	40 %	221632160
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2730	NC_011959	GCC	2	6	134101	134106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632161
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2735	NC_011959	ACC	2	6	134248	134253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632161
2736	NC_011959	GGACA	2	10	134322	134331	40 %	0 %	40 %	20 %	221632161
2737	NC_011959	CG	3	6	134383	134388	0 %	0 %	50 %	50 %	221632161
2738	NC_011959	GGA	2	6	134504	134509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632161
2739	NC_011959	GGAC	2	8	134525	134532	25 %	0 %	50 %	25 %	221632161
2740	NC_011959	GAG	2	6	134553	134558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632161
2741	NC_011959	GGC	2	6	134609	134614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632161
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2743	NC_011959	GCCG	2	8	134687	134694	0 %	0 %	50 %	50 %	221632161
2744	NC_011959	GGA	2	6	134779	134784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632162
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2747	NC_011959	CGA	2	6	134905	134910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632162
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2864	NC_011959	AGCG	2	8	140408	140415	25 %	0 %	50 %	25 %	221632167
2865	NC_011959	AGTCGG	2	12	140440	140451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221632167
2866	NC_011959	ATC	2	6	140461	140466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632167
2867	NC_011959	GAGC	2	8	140503	140510	25 %	0 %	50 %	25 %	221632168
2868	NC_011959	ACC	2	6	140607	140612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632168
2869	NC_011959	GAG	2	6	140614	140619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632168
2870	NC_011959	TCG	2	6	140695	140700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632168
2871	NC_011959	GA	3	6	140778	140783	50 %	0 %	50 %	0 %	221632168
2872	NC_011959	TTC	2	6	140786	140791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632168
2873	NC_011959	CTC	2	6	140957	140962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632168
2874	NC_011959	TCG	2	6	141088	141093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632168
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2879	NC_011959	GAT	2	6	141301	141306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632168
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2891	NC_011959	ATCG	2	8	142383	142390	25 %	25 %	25 %	25 %	221632169
2892	NC_011959	TTCC	2	8	142396	142403	0 %	50 %	0 %	50 %	221632169
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2896	NC_011959	CTT	2	6	142582	142587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632169
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2984	NC_011959	GAC	2	6	147793	147798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632174
2985	NC_011959	GAT	2	6	147814	147819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632174
2986	NC_011959	TGC	2	6	147827	147832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632174
2987	NC_011959	GCG	2	6	147842	147847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632174
2988	NC_011959	TCG	2	6	147851	147856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632174
2989	NC_011959	GGT	2	6	147928	147933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632174
2990	NC_011959	GCG	2	6	147954	147959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632174
2991	NC_011959	TGG	2	6	147978	147983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632174
2992	NC_011959	GGC	2	6	147988	147993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632174
2993	NC_011959	GAT	2	6	148009	148014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632174
2994	NC_011959	GAGAC	2	10	148024	148033	40 %	0 %	40 %	20 %	221632174
2995	NC_011959	TGGT	2	8	148047	148054	0 %	50 %	50 %	0 %	221632174
2996	NC_011959	CGT	2	6	148089	148094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632175
2997	NC_011959	CCTGT	2	10	148118	148127	0 %	40 %	20 %	40 %	221632175
2998	NC_011959	TC	3	6	148128	148133	0 %	50 %	0 %	50 %	221632175
2999	NC_011959	ACG	3	9	148232	148240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175
3000	NC_011959	AGC	2	6	148247	148252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632175

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