MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_011959	TCA	2	6	96236	96241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632119
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2005	NC_011959	GC	4	8	96277	96284	0 %	0 %	50 %	50 %	221632119
2006	NC_011959	TGA	2	6	96383	96388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632119
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2120	NC_011959	GTC	2	6	102300	102305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632126
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2124	NC_011959	TCGG	2	8	102496	102503	0 %	25 %	50 %	25 %	221632126
2125	NC_011959	TCG	2	6	102637	102642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632126
2126	NC_011959	CG	3	6	102650	102655	0 %	0 %	50 %	50 %	221632126
2127	NC_011959	GACGA	2	10	102657	102666	40 %	0 %	40 %	20 %	221632126
2128	NC_011959	CGC	2	6	102667	102672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632126
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2131	NC_011959	CGA	2	6	102818	102823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632126
2132	NC_011959	CGCT	2	8	102837	102844	0 %	25 %	25 %	50 %	221632126
2133	NC_011959	GCT	2	6	102923	102928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632126
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2146	NC_011959	GCTC	2	8	103530	103537	0 %	25 %	25 %	50 %	221632128
2147	NC_011959	GCG	2	6	103572	103577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632128
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2149	NC_011959	TCC	2	6	103631	103636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632128
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2243	NC_011959	GCTC	2	8	108679	108686	0 %	25 %	25 %	50 %	221632135
2244	NC_011959	TCG	2	6	108715	108720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632135
2245	NC_011959	TGA	2	6	108800	108805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632135
2246	NC_011959	CGA	2	6	108839	108844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632135
2247	NC_011959	GTT	2	6	108867	108872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632135
2248	NC_011959	TCC	2	6	108958	108963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632135
2249	NC_011959	GAG	2	6	108984	108989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632135
2250	NC_011959	GAA	2	6	109020	109025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632135
2251	NC_011959	GCT	2	6	109042	109047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632135
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2253	NC_011959	CGG	2	6	109236	109241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632136
2254	NC_011959	CTG	2	6	109281	109286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632136
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2259	NC_011959	TCGC	2	8	110432	110439	0 %	25 %	25 %	50 %	221632137
2260	NC_011959	TCG	2	6	110471	110476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2265	NC_011959	GAC	2	6	110595	110600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2267	NC_011959	TGGG	2	8	110681	110688	0 %	25 %	75 %	0 %	221632137
2268	NC_011959	CG	3	6	110732	110737	0 %	0 %	50 %	50 %	221632137
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2271	NC_011959	TCC	2	6	110783	110788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632137
2272	NC_011959	TCG	2	6	110789	110794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2275	NC_011959	CCA	2	6	110935	110940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632137
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2282	NC_011959	TCG	2	6	111359	111364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2284	NC_011959	GTC	2	6	111430	111435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632137
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2352	NC_011959	TCG	2	6	114748	114753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632141
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2354	NC_011959	ATC	2	6	114792	114797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632141
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2358	NC_011959	CG	3	6	114939	114944	0 %	0 %	50 %	50 %	221632141
2359	NC_011959	TCGA	2	8	114955	114962	25 %	25 %	25 %	25 %	221632141
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2363	NC_011959	CCAG	2	8	115006	115013	25 %	0 %	25 %	50 %	221632142
2364	NC_011959	CGA	2	6	115027	115032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632142
2365	NC_011959	CCG	2	6	115123	115128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632142
2366	NC_011959	TTG	2	6	115160	115165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632142
2367	NC_011959	TCG	2	6	115173	115178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632142
2368	NC_011959	GCC	2	6	115179	115184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632142
2369	NC_011959	CA	3	6	115275	115280	50 %	0 %	0 %	50 %	221632142
2370	NC_011959	CAA	2	6	115285	115290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632142
2371	NC_011959	CG	3	6	115332	115337	0 %	0 %	50 %	50 %	221632142
2372	NC_011959	GCA	2	6	115360	115365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632142
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2486	NC_011959	CTG	2	6	120089	120094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632149
2487	NC_011959	AG	3	6	120124	120129	50 %	0 %	50 %	0 %	221632149
2488	NC_011959	CCA	2	6	120167	120172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632149
2489	NC_011959	CGCT	2	8	120176	120183	0 %	25 %	25 %	50 %	221632149
2490	NC_011959	CGA	2	6	120280	120285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632149
2491	NC_011959	CTT	2	6	120305	120310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632149
2492	NC_011959	GCG	2	6	120317	120322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632149
2493	NC_011959	ATC	2	6	120336	120341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632149
2494	NC_011959	CG	3	6	120961	120966	0 %	0 %	50 %	50 %	221632150
2495	NC_011959	ACC	2	6	121001	121006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632150
2496	NC_011959	CAC	2	6	121073	121078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632150
2497	NC_011959	GTC	2	6	121099	121104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632150
2498	NC_011959	CGT	2	6	121115	121120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632150
2499	NC_011959	GGT	2	6	121121	121126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632150
2500	NC_011959	GTC	2	6	121517	121522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632151

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