MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011959	CGG	2	6	74123	74128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632099
1502	NC_011959	TCG	2	6	74146	74151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632099
1503	NC_011959	CGG	2	6	74178	74183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632099
1504	NC_011959	AGC	2	6	74203	74208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632099
1505	NC_011959	GTC	2	6	74265	74270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632099
1506	NC_011959	GC	3	6	74275	74280	0 %	0 %	50 %	50 %	221632099
1507	NC_011959	GAC	2	6	74298	74303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632099
1508	NC_011959	CCGGC	2	10	74304	74313	0 %	0 %	40 %	60 %	221632099
1509	NC_011959	GAG	2	6	74328	74333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632099
1510	NC_011959	GGC	2	6	74344	74349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632099
1511	NC_011959	C	7	7	74396	74402	0 %	0 %	0 %	100 %	221632099
1512	NC_011959	GCAG	2	8	74429	74436	25 %	0 %	50 %	25 %	221632099
1513	NC_011959	CTT	2	6	74489	74494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632099
1514	NC_011959	TCC	2	6	74581	74586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632099
1515	NC_011959	GAGATC	2	12	74592	74603	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221632099
1516	NC_011959	CGG	2	6	74654	74659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632100
1517	NC_011959	ATCG	2	8	74715	74722	25 %	25 %	25 %	25 %	221632100
1518	NC_011959	CG	3	6	74755	74760	0 %	0 %	50 %	50 %	221632100
1519	NC_011959	GCTG	2	8	74767	74774	0 %	25 %	50 %	25 %	221632100
1520	NC_011959	CAG	2	6	74840	74845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632100
1521	NC_011959	GGGC	2	8	74848	74855	0 %	0 %	75 %	25 %	221632100
1522	NC_011959	GC	3	6	74878	74883	0 %	0 %	50 %	50 %	221632100
1523	NC_011959	GTC	2	6	74919	74924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632100
1524	NC_011959	GGACG	2	10	74954	74963	20 %	0 %	60 %	20 %	221632100
1525	NC_011959	CCTCG	2	10	75014	75023	0 %	20 %	20 %	60 %	221632100
1526	NC_011959	CTC	2	6	75135	75140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632100
1527	NC_011959	GC	3	6	75219	75224	0 %	0 %	50 %	50 %	221632100
1528	NC_011959	GAG	2	6	75231	75236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632100
1529	NC_011959	TCG	2	6	75272	75277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632100
1530	NC_011959	TCG	2	6	75280	75285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632100
1531	NC_011959	GAA	2	6	75288	75293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632100
1532	NC_011959	CGAT	2	8	75295	75302	25 %	25 %	25 %	25 %	221632100
1533	NC_011959	GA	3	6	75361	75366	50 %	0 %	50 %	0 %	221632100
1534	NC_011959	CTC	2	6	75426	75431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632100
1535	NC_011959	GAG	2	6	75450	75455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632100
1536	NC_011959	GGC	2	6	75458	75463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632100
1537	NC_011959	CTT	2	6	75530	75535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632100
1538	NC_011959	GCA	2	6	75695	75700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632100
1539	NC_011959	GCG	2	6	75701	75706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632100
1540	NC_011959	GCGCC	2	10	75748	75757	0 %	0 %	40 %	60 %	221632101
1541	NC_011959	GC	3	6	75760	75765	0 %	0 %	50 %	50 %	221632101
1542	NC_011959	GTC	2	6	75767	75772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632101
1543	NC_011959	CGT	2	6	75778	75783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632101
1544	NC_011959	TCG	3	9	75810	75818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632101
1545	NC_011959	TCG	2	6	75834	75839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632101
1546	NC_011959	G	6	6	75848	75853	0 %	0 %	100 %	0 %	221632101
1547	NC_011959	GTG	3	9	75875	75883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632101
1548	NC_011959	GAG	2	6	75908	75913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632101
1549	NC_011959	GC	3	6	75917	75922	0 %	0 %	50 %	50 %	221632101
1550	NC_011959	TCGG	3	12	75936	75947	0 %	25 %	50 %	25 %	221632101
1551	NC_011959	CG	3	6	75973	75978	0 %	0 %	50 %	50 %	221632101
1552	NC_011959	GGT	2	6	76039	76044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632101
1553	NC_011959	CGAG	2	8	76057	76064	25 %	0 %	50 %	25 %	221632101
1554	NC_011959	TGGT	2	8	76100	76107	0 %	50 %	50 %	0 %	221632101
1555	NC_011959	GTCT	2	8	76176	76183	0 %	50 %	25 %	25 %	221632101
1556	NC_011959	TCC	2	6	76204	76209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632101
1557	NC_011959	CGC	2	6	76241	76246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632101
1558	NC_011959	TCG	2	6	76305	76310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632101
1559	NC_011959	GCGA	2	8	76314	76321	25 %	0 %	50 %	25 %	221632101
1560	NC_011959	CTG	2	6	76376	76381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632101
1561	NC_011959	GAC	2	6	76489	76494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632102
1562	NC_011959	GGT	2	6	76509	76514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632102
1563	NC_011959	TCG	2	6	76526	76531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632102
1564	NC_011959	GCT	2	6	76558	76563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632102
1565	NC_011959	ATCG	2	8	76571	76578	25 %	25 %	25 %	25 %	221632102
1566	NC_011959	GGA	2	6	76597	76602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632102
1567	NC_011959	CAC	2	6	76632	76637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632103
1568	NC_011959	TTCG	2	8	76652	76659	0 %	50 %	25 %	25 %	221632103
1569	NC_011959	CTC	2	6	76773	76778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632103
1570	NC_011959	GGCC	2	8	76842	76849	0 %	0 %	50 %	50 %	221632103
1571	NC_011959	GC	3	6	76862	76867	0 %	0 %	50 %	50 %	221632103
1572	NC_011959	AG	3	6	76874	76879	50 %	0 %	50 %	0 %	221632103
1573	NC_011959	GCGCG	2	10	76904	76913	0 %	0 %	60 %	40 %	221632103
1574	NC_011959	CGG	2	6	76930	76935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632103
1575	NC_011959	GGT	2	6	76944	76949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632103
1576	NC_011959	GGCG	2	8	76994	77001	0 %	0 %	75 %	25 %	221632103
1577	NC_011959	GGT	2	6	77015	77020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632103
1578	NC_011959	TTTCGA	2	12	77030	77041	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	221632103
1579	NC_011959	CGC	2	6	77055	77060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632103
1580	NC_011959	TGG	2	6	77140	77145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632103
1581	NC_011959	TGC	2	6	77191	77196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632103
1582	NC_011959	CCCGG	2	10	77230	77239	0 %	0 %	40 %	60 %	221632103
1583	NC_011959	CG	3	6	77398	77403	0 %	0 %	50 %	50 %	221632103
1584	NC_011959	ACA	2	6	77410	77415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632103
1585	NC_011959	CGA	3	9	77483	77491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632103
1586	NC_011959	ATC	2	6	77499	77504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632103
1587	NC_011959	GAC	2	6	77510	77515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632103
1588	NC_011959	CGATG	2	10	77525	77534	20 %	20 %	40 %	20 %	221632103
1589	NC_011959	GGACG	2	10	77535	77544	20 %	0 %	60 %	20 %	221632103
1590	NC_011959	GCT	2	6	77562	77567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632103
1591	NC_011959	CGGCG	2	10	77587	77596	0 %	0 %	60 %	40 %	221632103
1592	NC_011959	CGGC	2	8	77637	77644	0 %	0 %	50 %	50 %	221632103
1593	NC_011959	TCC	2	6	77713	77718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632103
1594	NC_011959	GAGAGG	2	12	77728	77739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632103
1595	NC_011959	GC	3	6	77769	77774	0 %	0 %	50 %	50 %	221632104
1596	NC_011959	CG	3	6	77794	77799	0 %	0 %	50 %	50 %	221632104
1597	NC_011959	CGT	2	6	77823	77828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632104
1598	NC_011959	GCC	2	6	77851	77856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632104
1599	NC_011959	TGG	2	6	77896	77901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632104
1600	NC_011959	GCG	2	6	77915	77920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632104
1601	NC_011959	AAG	2	6	77970	77975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632104
1602	NC_011959	CGAG	2	8	78046	78053	25 %	0 %	50 %	25 %	221632104
1603	NC_011959	GGA	2	6	78158	78163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632104
1604	NC_011959	GA	3	6	78172	78177	50 %	0 %	50 %	0 %	221632104
1605	NC_011959	CTC	2	6	78242	78247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632105
1606	NC_011959	TCT	2	6	78331	78336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632105
1607	NC_011959	TCA	2	6	78371	78376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632105
1608	NC_011959	AGG	2	6	78420	78425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632105
1609	NC_011959	AGC	2	6	78429	78434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632105
1610	NC_011959	TGGC	2	8	78436	78443	0 %	25 %	50 %	25 %	221632105
1611	NC_011959	GCC	2	6	78460	78465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632105
1612	NC_011959	GGT	2	6	78487	78492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632105
1613	NC_011959	CGA	2	6	78607	78612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632105
1614	NC_011959	GGC	2	6	78734	78739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632105
1615	NC_011959	CGG	2	6	78745	78750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632105
1616	NC_011959	CGCT	2	8	78777	78784	0 %	25 %	25 %	50 %	221632105
1617	NC_011959	GTC	2	6	78795	78800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632105
1618	NC_011959	CTC	2	6	78869	78874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632105
1619	NC_011959	CGCGC	2	10	78906	78915	0 %	0 %	40 %	60 %	221632105
1620	NC_011959	TCG	2	6	78927	78932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632105
1621	NC_011959	GAGC	2	8	78955	78962	25 %	0 %	50 %	25 %	221632105
1622	NC_011959	GCT	2	6	78963	78968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632105
1623	NC_011959	GGC	2	6	78993	78998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632105
1624	NC_011959	AC	3	6	79030	79035	50 %	0 %	0 %	50 %	221632105
1625	NC_011959	GGT	2	6	79036	79041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632105
1626	NC_011959	CGA	2	6	79069	79074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632105
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1755	NC_011959	TCCA	2	8	85105	85112	25 %	25 %	0 %	50 %	221632111
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