MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011959	CTG	2	6	52289	52294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1002	NC_011959	CGA	2	6	52297	52302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1003	NC_011959	GGC	2	6	52303	52308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1004	NC_011959	GCA	2	6	52357	52362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1005	NC_011959	GTC	2	6	52365	52370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1006	NC_011959	GC	3	6	52392	52397	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1007	NC_011959	AGA	2	6	52432	52437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632083
1008	NC_011959	CGTC	2	8	52546	52553	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1009	NC_011959	CG	3	6	52573	52578	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1010	NC_011959	CTC	2	6	52631	52636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1011	NC_011959	CCT	2	6	52654	52659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1012	NC_011959	CTGA	2	8	52667	52674	25 %	25 %	25 %	25 %	221632083
1013	NC_011959	GAC	2	6	52712	52717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1014	NC_011959	CGGCT	2	10	52718	52727	0 %	20 %	40 %	40 %	221632083
1015	NC_011959	GCT	2	6	52743	52748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1016	NC_011959	CGA	2	6	52759	52764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1017	NC_011959	TCG	2	6	52866	52871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1018	NC_011959	ACG	2	6	52916	52921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1019	NC_011959	GGAT	2	8	53001	53008	25 %	25 %	50 %	0 %	221632083
1020	NC_011959	CTG	2	6	53033	53038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1021	NC_011959	GCT	2	6	53065	53070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1022	NC_011959	ACGG	2	8	53123	53130	25 %	0 %	50 %	25 %	221632083
1023	NC_011959	GAC	2	6	53150	53155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1024	NC_011959	TCC	2	6	53190	53195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1025	NC_011959	GC	3	6	53217	53222	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1026	NC_011959	GC	3	6	53255	53260	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1027	NC_011959	TCCG	2	8	53270	53277	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1028	NC_011959	CGGA	2	8	53288	53295	25 %	0 %	50 %	25 %	221632083
1029	NC_011959	GCCAGA	2	12	53302	53313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1030	NC_011959	TGC	2	6	53376	53381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1031	NC_011959	CAC	2	6	53561	53566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632083
1032	NC_011959	GCT	2	6	53575	53580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1033	NC_011959	CCA	2	6	53581	53586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632083
1034	NC_011959	CTT	2	6	53620	53625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632083
1035	NC_011959	GC	3	6	53636	53641	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1036	NC_011959	CAG	2	6	53654	53659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1037	NC_011959	CCAGAT	2	12	53714	53725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	221632083
1038	NC_011959	GTC	2	6	53819	53824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1039	NC_011959	GGAT	2	8	53826	53833	25 %	25 %	50 %	0 %	221632083
1040	NC_011959	GAG	2	6	53952	53957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1041	NC_011959	CGA	2	6	53992	53997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1042	NC_011959	TGCTTC	2	12	54011	54022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	221632083
1043	NC_011959	GAG	2	6	54062	54067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1044	NC_011959	CGTC	2	8	54141	54148	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1045	NC_011959	GAAT	2	8	54154	54161	50 %	25 %	25 %	0 %	221632083
1046	NC_011959	GCG	2	6	54178	54183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1047	NC_011959	GCG	2	6	54210	54215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1048	NC_011959	CGG	2	6	54232	54237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1049	NC_011959	TCAG	2	8	54291	54298	25 %	25 %	25 %	25 %	221632083
1050	NC_011959	GGA	2	6	54376	54381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1051	NC_011959	GCT	2	6	54510	54515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1052	NC_011959	ACG	2	6	54519	54524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1053	NC_011959	GAC	2	6	54545	54550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1054	NC_011959	AGG	2	6	54567	54572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1055	NC_011959	CGT	2	6	54611	54616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1056	NC_011959	GGC	2	6	54620	54625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1057	NC_011959	TCG	2	6	54642	54647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1058	NC_011959	GTC	2	6	54675	54680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1059	NC_011959	CTC	2	6	54683	54688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1060	NC_011959	GCT	2	6	54802	54807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1061	NC_011959	GCT	2	6	54844	54849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1062	NC_011959	GAG	2	6	54851	54856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1063	NC_011959	ATCG	2	8	54875	54882	25 %	25 %	25 %	25 %	221632083
1064	NC_011959	GCC	2	6	54908	54913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632083
1065	NC_011959	TCCT	2	8	54932	54939	0 %	50 %	0 %	50 %	221632083
1066	NC_011959	GCT	2	6	54991	54996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1067	NC_011959	ACC	2	6	55012	55017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632083
1068	NC_011959	GCTC	2	8	55081	55088	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1069	NC_011959	CGA	2	6	55117	55122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1070	NC_011959	GAG	2	6	55223	55228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1071	NC_011959	GCC	2	6	55257	55262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632083
1072	NC_011959	GAG	2	6	55289	55294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1073	NC_011959	CG	3	6	55404	55409	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1074	NC_011959	GCTC	2	8	55410	55417	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1075	NC_011959	GCT	2	6	55503	55508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1076	NC_011959	GAC	2	6	55601	55606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1077	NC_011959	GAG	2	6	55607	55612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632083
1078	NC_011959	TCC	2	6	55650	55655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1079	NC_011959	GCTC	2	8	55668	55675	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1080	NC_011959	CGGA	2	8	55773	55780	25 %	0 %	50 %	25 %	221632083
1081	NC_011959	CGCAC	2	10	55786	55795	20 %	0 %	20 %	60 %	221632083
1082	NC_011959	TCG	2	6	55830	55835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1083	NC_011959	TCG	2	6	55950	55955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1084	NC_011959	AGC	2	6	55980	55985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1085	NC_011959	CCT	2	6	56092	56097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1086	NC_011959	CGTC	2	8	56149	56156	0 %	25 %	25 %	50 %	221632083
1087	NC_011959	CGAG	2	8	56218	56225	25 %	0 %	50 %	25 %	221632083
1088	NC_011959	GC	3	6	56247	56252	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1089	NC_011959	TCC	2	6	56280	56285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1090	NC_011959	CAGC	2	8	56317	56324	25 %	0 %	25 %	50 %	221632083
1091	NC_011959	TCC	2	6	56328	56333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632083
1092	NC_011959	GAC	3	9	56411	56419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1093	NC_011959	GCT	2	6	56449	56454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1094	NC_011959	TCGAGT	2	12	56586	56597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	221632083
1095	NC_011959	TGG	2	6	56598	56603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632083
1096	NC_011959	GC	3	6	56605	56610	0 %	0 %	50 %	50 %	221632083
1097	NC_011959	AGT	2	6	56665	56670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632083
1098	NC_011959	CGAC	2	8	56689	56696	25 %	0 %	25 %	50 %	221632083
1099	NC_011959	CGATCT	2	12	56800	56811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	221632083
1100	NC_011959	CAGC	2	8	56831	56838	25 %	0 %	25 %	50 %	221632083
1101	NC_011959	TTC	2	6	56846	56851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632083
1102	NC_011959	ACG	2	6	56863	56868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1103	NC_011959	GCA	2	6	56893	56898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1104	NC_011959	GGC	2	6	56933	56938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632083
1105	NC_011959	GGCT	2	8	56987	56994	0 %	25 %	50 %	25 %	221632083
1106	NC_011959	CGA	2	6	57000	57005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1107	NC_011959	AGC	2	6	57063	57068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1108	NC_011959	CCCG	2	8	57109	57116	0 %	0 %	25 %	75 %	221632083
1109	NC_011959	AGC	2	6	57135	57140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632083
1110	NC_011959	GAGC	2	8	57527	57534	25 %	0 %	50 %	25 %	221632084
1111	NC_011959	CTCG	3	12	57618	57629	0 %	25 %	25 %	50 %	221632084
1112	NC_011959	TCG	2	6	57658	57663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1113	NC_011959	GTG	2	6	57664	57669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632084
1114	NC_011959	TCC	2	6	57682	57687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632084
1115	NC_011959	GTC	2	6	57691	57696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1116	NC_011959	ACG	2	6	57843	57848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1117	NC_011959	CCT	2	6	57908	57913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632084
1118	NC_011959	GGA	2	6	57914	57919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632084
1119	NC_011959	CGC	2	6	57927	57932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632084
1120	NC_011959	G	6	6	57993	57998	0 %	0 %	100 %	0 %	221632084
1121	NC_011959	GCC	2	6	58083	58088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632084
1122	NC_011959	GCG	2	6	58095	58100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632084
1123	NC_011959	TCGAAG	2	12	58111	58122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221632084
1124	NC_011959	GCT	2	6	58205	58210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1125	NC_011959	CGT	2	6	58268	58273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1126	NC_011959	CGG	2	6	58314	58319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632084
1127	NC_011959	CGC	2	6	58366	58371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632084
1128	NC_011959	GGC	2	6	58388	58393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632084
1129	NC_011959	ACG	2	6	58402	58407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1130	NC_011959	CGA	2	6	58433	58438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1131	NC_011959	CTT	2	6	58454	58459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221632084
1132	NC_011959	GC	3	6	58488	58493	0 %	0 %	50 %	50 %	221632084
1133	NC_011959	TGC	2	6	58498	58503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1134	NC_011959	ACG	2	6	58579	58584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632084
1135	NC_011959	CGG	2	6	58600	58605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632084
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1137	NC_011959	GGCG	2	8	58625	58632	0 %	0 %	75 %	25 %	221632084
1138	NC_011959	CCT	2	6	58634	58639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632084
1139	NC_011959	GGA	2	6	58640	58645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632084
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1143	NC_011959	GAA	3	9	58749	58757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632084
1144	NC_011959	AGCT	2	8	58882	58889	25 %	25 %	25 %	25 %	221632084
1145	NC_011959	ATC	2	6	58950	58955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632084
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1149	NC_011959	GCGG	2	8	59028	59035	0 %	0 %	75 %	25 %	221632085
1150	NC_011959	CG	3	6	59038	59043	0 %	0 %	50 %	50 %	221632085
1151	NC_011959	GCG	2	6	59063	59068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632085
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1153	NC_011959	CGA	2	6	59134	59139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632085
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1155	NC_011959	CTG	2	6	59201	59206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632085
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1157	NC_011959	CGA	2	6	59260	59265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632085
1158	NC_011959	CGA	2	6	59290	59295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632085
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1160	NC_011959	CTCG	2	8	59402	59409	0 %	25 %	25 %	50 %	221632085
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1233	NC_011959	TCGA	2	8	63368	63375	25 %	25 %	25 %	25 %	221632089
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1236	NC_011959	TCCG	2	8	63420	63427	0 %	25 %	25 %	50 %	221632089
1237	NC_011959	ACGA	2	8	63566	63573	50 %	0 %	25 %	25 %	221632089
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1239	NC_011959	CCCG	2	8	63638	63645	0 %	0 %	25 %	75 %	221632090
1240	NC_011959	CG	3	6	63681	63686	0 %	0 %	50 %	50 %	221632090
1241	NC_011959	GATC	2	8	63688	63695	25 %	25 %	25 %	25 %	221632090
1242	NC_011959	TCC	2	6	63749	63754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632090
1243	NC_011959	GGT	2	6	63814	63819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632090
1244	NC_011959	TCC	2	6	63843	63848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632090
1245	NC_011959	CG	3	6	63863	63868	0 %	0 %	50 %	50 %	221632090
1246	NC_011959	TCG	3	9	63894	63902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632090
1247	NC_011959	CA	3	6	64076	64081	50 %	0 %	0 %	50 %	221632091
1248	NC_011959	CTG	2	6	64092	64097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632091
1249	NC_011959	GCGCT	2	10	64099	64108	0 %	20 %	40 %	40 %	221632091
1250	NC_011959	CTC	2	6	64120	64125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632091
1251	NC_011959	GGC	2	6	64131	64136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632091
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1255	NC_011959	CCTGC	2	10	64286	64295	0 %	20 %	20 %	60 %	221632091
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1500	NC_011959	GC	3	6	74116	74121	0 %	0 %	50 %	50 %	221632099

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