MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 40761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011959	GCT	2	6	266437	266442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632294
5502	NC_011959	TC	3	6	266443	266448	0 %	50 %	0 %	50 %	221632294
5503	NC_011959	GCC	3	9	266474	266482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632294
5504	NC_011959	TCG	2	6	266520	266525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632294
5505	NC_011959	CGC	2	6	266532	266537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632294
5506	NC_011959	GGAG	2	8	266599	266606	25 %	0 %	75 %	0 %	221632294
5507	NC_011959	TGCG	2	8	266631	266638	0 %	25 %	50 %	25 %	221632294
5508	NC_011959	AGCG	2	8	266650	266657	25 %	0 %	50 %	25 %	221632294
5509	NC_011959	GTCG	2	8	266662	266669	0 %	25 %	50 %	25 %	221632294
5510	NC_011959	GTC	2	6	266701	266706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632294
5511	NC_011959	GCAGC	2	10	266792	266801	20 %	0 %	40 %	40 %	221632294
5512	NC_011959	GC	3	6	267128	267133	0 %	0 %	50 %	50 %	221632295
5513	NC_011959	CGT	2	6	267162	267167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5514	NC_011959	ACG	2	6	267168	267173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5515	NC_011959	CTGC	2	8	267202	267209	0 %	25 %	25 %	50 %	221632295
5516	NC_011959	CTC	2	6	267247	267252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632295
5517	NC_011959	CG	3	6	267255	267260	0 %	0 %	50 %	50 %	221632295
5518	NC_011959	GTCG	2	8	267280	267287	0 %	25 %	50 %	25 %	221632295
5519	NC_011959	GAC	2	6	267294	267299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5520	NC_011959	GCG	2	6	267378	267383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632295
5521	NC_011959	CG	3	6	267411	267416	0 %	0 %	50 %	50 %	221632295
5522	NC_011959	GCA	2	6	267427	267432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5523	NC_011959	GCGA	2	8	267450	267457	25 %	0 %	50 %	25 %	221632295
5524	NC_011959	GCG	2	6	267512	267517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632295
5525	NC_011959	TCG	2	6	267565	267570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5526	NC_011959	GCT	2	6	267586	267591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5527	NC_011959	TCG	2	6	267639	267644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5528	NC_011959	GCG	2	6	267679	267684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632295
5529	NC_011959	TGA	2	6	267714	267719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632295
5530	NC_011959	CGA	2	6	267747	267752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5531	NC_011959	TGT	2	6	267806	267811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221632295
5532	NC_011959	GCG	2	6	267831	267836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632295
5533	NC_011959	CG	3	6	267859	267864	0 %	0 %	50 %	50 %	221632295
5534	NC_011959	ATC	2	6	267905	267910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632295
5535	NC_011959	TGC	2	6	267916	267921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5536	NC_011959	GCG	2	6	267927	267932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632295
5537	NC_011959	GAGC	2	8	267983	267990	25 %	0 %	50 %	25 %	221632295
5538	NC_011959	GCTG	2	8	267997	268004	0 %	25 %	50 %	25 %	221632295
5539	NC_011959	TCG	2	6	268032	268037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5540	NC_011959	CAA	2	6	268127	268132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221632295
5541	NC_011959	CTG	2	6	268142	268147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5542	NC_011959	TCG	2	6	268170	268175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5543	NC_011959	CTG	2	6	268195	268200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632295
5544	NC_011959	GC	3	6	268256	268261	0 %	0 %	50 %	50 %	221632295
5545	NC_011959	GC	3	6	268349	268354	0 %	0 %	50 %	50 %	221632295
5546	NC_011959	TCC	2	6	268371	268376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632295
5547	NC_011959	TGG	2	6	268380	268385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632295
5548	NC_011959	CGG	3	9	268407	268415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632295
5549	NC_011959	AGGC	2	8	268417	268424	25 %	0 %	50 %	25 %	221632295
5550	NC_011959	CTGA	2	8	268449	268456	25 %	25 %	25 %	25 %	221632295
5551	NC_011959	GGT	2	6	268495	268500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632296
5552	NC_011959	CT	3	6	268550	268555	0 %	50 %	0 %	50 %	221632296
5553	NC_011959	AAG	2	6	268575	268580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221632296
5554	NC_011959	TGG	3	9	268621	268629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632296
5555	NC_011959	CAG	2	6	268636	268641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632296
5556	NC_011959	GAG	2	6	268685	268690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632296
5557	NC_011959	GCAGAC	2	12	268693	268704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632296
5558	NC_011959	TGG	2	6	268764	268769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632296
5559	NC_011959	CCA	2	6	268816	268821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632296
5560	NC_011959	ACC	2	6	268859	268864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632296
5561	NC_011959	CGCT	2	8	268895	268902	0 %	25 %	25 %	50 %	221632296
5562	NC_011959	TCG	2	6	268959	268964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632296
5563	NC_011959	GTG	2	6	268971	268976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632296
5564	NC_011959	GATC	2	8	268994	269001	25 %	25 %	25 %	25 %	221632296
5565	NC_011959	GTC	2	6	269006	269011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632296
5566	NC_011959	GCCA	2	8	269073	269080	25 %	0 %	25 %	50 %	221632296
5567	NC_011959	GGA	2	6	269086	269091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632296
5568	NC_011959	GTC	2	6	269138	269143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632296
5569	NC_011959	CGGGA	2	10	269231	269240	20 %	0 %	60 %	20 %	221632296
5570	NC_011959	AGTG	2	8	269287	269294	25 %	25 %	50 %	0 %	221632296
5571	NC_011959	GTC	2	6	269330	269335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632296
5572	NC_011959	CGT	2	6	269347	269352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632296
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5578	NC_011959	CGA	2	6	269515	269520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632296
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5581	NC_011959	TCG	2	6	269637	269642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632296
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5584	NC_011959	GCGA	2	8	269722	269729	25 %	0 %	50 %	25 %	221632297
5585	NC_011959	GAC	2	6	269772	269777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632297
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5587	NC_011959	CAC	2	6	269837	269842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632297
5588	NC_011959	TGG	2	6	269964	269969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632297
5589	NC_011959	CGT	2	6	270096	270101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632297
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5591	NC_011959	CG	3	6	270205	270210	0 %	0 %	50 %	50 %	221632297
5592	NC_011959	GAG	2	6	270289	270294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632297
5593	NC_011959	TGC	2	6	270306	270311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632297
5594	NC_011959	GAGC	2	8	270312	270319	25 %	0 %	50 %	25 %	221632297
5595	NC_011959	CTC	2	6	270325	270330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221632297
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5601	NC_011959	CGGCA	2	10	270467	270476	20 %	0 %	40 %	40 %	221632297
5602	NC_011959	TGA	2	6	270491	270496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632297
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5604	NC_011959	CAT	2	6	270696	270701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632297
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5606	NC_011959	CGG	2	6	270758	270763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632297
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5613	NC_011959	GA	3	6	271100	271105	50 %	0 %	50 %	0 %	221632297
5614	NC_011959	CG	3	6	271121	271126	0 %	0 %	50 %	50 %	221632297
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5617	NC_011959	ATC	2	6	271255	271260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632297
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5619	NC_011959	CG	3	6	271279	271284	0 %	0 %	50 %	50 %	221632297
5620	NC_011959	ATGCG	2	10	271294	271303	20 %	20 %	40 %	20 %	221632297
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5622	NC_011959	CCG	2	6	271401	271406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632297
5623	NC_011959	CGC	2	6	271442	271447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632297
5624	NC_011959	CGGC	2	8	271584	271591	0 %	0 %	50 %	50 %	221632297
5625	NC_011959	GAT	2	6	271693	271698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221632298
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5730	NC_011959	CG	4	8	276674	276681	0 %	0 %	50 %	50 %	221632301
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5738	NC_011959	GCG	2	6	277070	277075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632301
5739	NC_011959	GAC	2	6	277087	277092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632301
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5742	NC_011959	CG	3	6	277125	277130	0 %	0 %	50 %	50 %	221632301
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5744	NC_011959	GAC	2	6	277242	277247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632302
5745	NC_011959	GCG	2	6	277366	277371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632302
5746	NC_011959	GAC	2	6	277395	277400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632302
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5753	NC_011959	GCT	2	6	277673	277678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632302
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5765	NC_011959	TCG	2	6	278068	278073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632302
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5768	NC_011959	CCGA	2	8	278493	278500	25 %	0 %	25 %	50 %	221632303
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5772	NC_011959	TCCTG	2	10	278689	278698	0 %	40 %	20 %	40 %	221632303
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5849	NC_011959	CG	5	10	282504	282513	0 %	0 %	50 %	50 %	221632306
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5852	NC_011959	CTG	2	6	282557	282562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632306
5853	NC_011959	TCGG	2	8	282569	282576	0 %	25 %	50 %	25 %	221632306
5854	NC_011959	CAT	2	6	282606	282611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632306
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5856	NC_011959	CGT	2	6	282660	282665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632306
5857	NC_011959	GCA	2	6	282693	282698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632306
5858	NC_011959	CGG	2	6	282792	282797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632306
5859	NC_011959	GC	3	6	282820	282825	0 %	0 %	50 %	50 %	221632306
5860	NC_011959	GTG	2	6	282829	282834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632306
5861	NC_011959	AGG	2	6	282842	282847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632306
5862	NC_011959	CTGGC	2	10	282911	282920	0 %	20 %	40 %	40 %	221632306
5863	NC_011959	TCG	2	6	282980	282985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632306
5864	NC_011959	GGTTC	2	10	283019	283028	0 %	40 %	40 %	20 %	221632307
5865	NC_011959	CGC	2	6	283061	283066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632307
5866	NC_011959	GC	3	6	283095	283100	0 %	0 %	50 %	50 %	221632307
5867	NC_011959	GAG	2	6	283146	283151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632307
5868	NC_011959	TGG	2	6	283198	283203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221632307
5869	NC_011959	GGAC	2	8	283227	283234	25 %	0 %	50 %	25 %	221632307
5870	NC_011959	GCGT	2	8	283252	283259	0 %	25 %	50 %	25 %	221632307
5871	NC_011959	CGG	2	6	283270	283275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632307
5872	NC_011959	CGATCG	2	12	283355	283366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221632307
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5874	NC_011959	CGCT	2	8	283375	283382	0 %	25 %	25 %	50 %	221632307
5875	NC_011959	TCG	2	6	283411	283416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632307
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5878	NC_011959	GGTCGC	2	12	283520	283531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221632307
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5888	NC_011959	CTG	2	6	283752	283757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632307
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5973	NC_011959	CCGCAG	2	12	288201	288212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221632315
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5976	NC_011959	GCT	2	6	288252	288257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632315
5977	NC_011959	CAT	2	6	288268	288273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221632315
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5980	NC_011959	GGTC	2	8	288325	288332	0 %	25 %	50 %	25 %	221632315
5981	NC_011959	CAC	2	6	288385	288390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632315
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5983	NC_011959	GAG	2	6	288451	288456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221632315
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5985	NC_011959	GCAG	2	8	288490	288497	25 %	0 %	50 %	25 %	221632315
5986	NC_011959	GCCAGC	2	12	288609	288620	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	221632315
5987	NC_011959	CGC	2	6	288636	288641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221632315
5988	NC_011959	AGCC	2	8	288645	288652	25 %	0 %	25 %	50 %	221632315
5989	NC_011959	GCG	2	6	288659	288664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221632315
5990	NC_011959	CCAA	2	8	288691	288698	50 %	0 %	0 %	50 %	221632315
5991	NC_011959	ACC	2	6	288716	288721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221632315
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5993	NC_011959	CGA	2	6	288801	288806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221632315
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6000	NC_011959	CGT	2	6	289480	289485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221632316

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