MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 55741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	CAG	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
2	NC_011901	GGA	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
3	NC_011901	CTG	2	6	259	264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
4	NC_011901	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
5	NC_011901	GCG	2	6	348	353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933194
6	NC_011901	GCC	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
7	NC_011901	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
8	NC_011901	GCC	2	6	466	471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
9	NC_011901	CAA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933194
10	NC_011901	TCG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
11	NC_011901	GCC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
12	NC_011901	CGG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933194
13	NC_011901	GGT	2	6	693	698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
14	NC_011901	GCA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
15	NC_011901	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
16	NC_011901	CTA	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933194
17	NC_011901	GCT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
18	NC_011901	CGA	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
19	NC_011901	TTC	2	6	817	822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
20	NC_011901	TTC	2	6	850	855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
21	NC_011901	CAG	3	9	883	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
22	NC_011901	AGG	2	6	920	925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
23	NC_011901	GGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
24	NC_011901	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
25	NC_011901	CTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
26	NC_011901	GTG	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
27	NC_011901	AGG	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
28	NC_011901	CTG	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
29	NC_011901	ACA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933194
30	NC_011901	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933194
31	NC_011901	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933194
32	NC_011901	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
33	NC_011901	GGT	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
34	NC_011901	CTG	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
35	NC_011901	AGC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
36	NC_011901	GCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
37	NC_011901	TGG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933195
38	NC_011901	CGA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
39	NC_011901	CAG	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
40	NC_011901	TAC	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933195
41	NC_011901	CCT	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933195
42	NC_011901	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933195
43	NC_011901	CTG	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
44	NC_011901	CTG	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
45	NC_011901	TGA	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933195
46	NC_011901	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
47	NC_011901	CTG	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
48	NC_011901	CTC	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933196
49	NC_011901	GGC	3	9	3121	3129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
50	NC_011901	CTG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
51	NC_011901	GCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
52	NC_011901	CCG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933196
53	NC_011901	GCT	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
54	NC_011901	CTG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
55	NC_011901	GCT	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
56	NC_011901	AGA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933196
57	NC_011901	CTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
58	NC_011901	GCC	2	6	3665	3670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933196
59	NC_011901	CAG	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933196
60	NC_011901	GTG	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933196
61	NC_011901	TGG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933196
62	NC_011901	CGG	2	6	3806	3811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
63	NC_011901	TGA	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933196
64	NC_011901	GCA	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
65	NC_011901	CAC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
66	NC_011901	GGT	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
67	NC_011901	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
68	NC_011901	CAA	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
69	NC_011901	ATC	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
70	NC_011901	GAT	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
71	NC_011901	GAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
72	NC_011901	CGC	2	6	4302	4307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
73	NC_011901	TCA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
74	NC_011901	TGC	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
75	NC_011901	CGA	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
76	NC_011901	CGG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
77	NC_011901	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
78	NC_011901	TCT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
79	NC_011901	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
80	NC_011901	AGG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
81	NC_011901	CAA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
82	NC_011901	GAC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
83	NC_011901	TCT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
84	NC_011901	CAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
85	NC_011901	CGC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
86	NC_011901	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
87	NC_011901	CCA	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
88	NC_011901	TGA	2	6	4968	4973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
89	NC_011901	TCC	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933197
90	NC_011901	GTG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
91	NC_011901	ACC	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
92	NC_011901	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
93	NC_011901	TCA	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
94	NC_011901	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
95	NC_011901	CCG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
96	NC_011901	TGG	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
97	NC_011901	CCG	2	6	5312	5317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
98	NC_011901	CGG	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
99	NC_011901	ACC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
100	NC_011901	CAT	4	12	5508	5519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
101	NC_011901	CTG	3	9	5557	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
102	NC_011901	CTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
103	NC_011901	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
104	NC_011901	GAA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
105	NC_011901	CAA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
106	NC_011901	TGC	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
107	NC_011901	GGA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
108	NC_011901	TGA	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
109	NC_011901	CCG	2	6	5749	5754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
110	NC_011901	GCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
111	NC_011901	GGA	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
112	NC_011901	CGC	2	6	5827	5832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
113	NC_011901	CTG	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
114	NC_011901	TCT	2	6	5861	5866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
115	NC_011901	TGG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
116	NC_011901	GCC	2	6	5953	5958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
117	NC_011901	GCC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
118	NC_011901	GGC	2	6	6001	6006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
119	NC_011901	TTC	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
120	NC_011901	GCC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
121	NC_011901	GCT	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
122	NC_011901	CCG	2	6	6219	6224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
123	NC_011901	ACC	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
124	NC_011901	CTG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
125	NC_011901	CAC	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
126	NC_011901	GCG	2	6	6567	6572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933198
127	NC_011901	GCT	2	6	6584	6589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933198
128	NC_011901	CTG	2	6	6681	6686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933198
129	NC_011901	TGT	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933198
130	NC_011901	GAA	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933198
131	NC_011901	GGC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933198
132	NC_011901	GCT	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933198
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134	NC_011901	GGC	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933198
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252	NC_011901	TGT	2	6	16531	16536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933209
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254	NC_011901	TCG	2	6	16678	16683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933209
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256	NC_011901	AAC	2	6	16870	16875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933209
257	NC_011901	CGG	2	6	16954	16959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933209
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