MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011901	GGC	2	6	189209	189214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933361
4002	NC_011901	TCG	2	6	189279	189284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933361
4003	NC_011901	TCG	2	6	189288	189293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933361
4004	NC_011901	TCC	2	6	189438	189443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933361
4005	NC_011901	GGA	2	6	189478	189483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933361
4006	NC_011901	GTC	2	6	189527	189532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933361
4007	NC_011901	ATG	2	6	189624	189629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933361
4008	NC_011901	GTG	2	6	189642	189647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933361
4009	NC_011901	TCA	2	6	189661	189666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933361
4010	NC_011901	CCA	2	6	189700	189705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933361
4011	NC_011901	CAG	2	6	189773	189778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933361
4012	NC_011901	GC	3	6	189801	189806	0 %	0 %	50 %	50 %	220933361
4013	NC_011901	GCGT	2	8	189809	189816	0 %	25 %	50 %	25 %	220933361
4014	NC_011901	TCG	2	6	189831	189836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933361
4015	NC_011901	GGC	2	6	189898	189903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933361
4016	NC_011901	CCGCTC	2	12	189905	189916	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220933361
4017	NC_011901	TCA	2	6	189976	189981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933361
4018	NC_011901	GCG	2	6	189990	189995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933361
4019	NC_011901	CTC	2	6	190031	190036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933361
4020	NC_011901	GTT	2	6	190115	190120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933361
4021	NC_011901	GAA	2	6	190124	190129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933361
4022	NC_011901	GGC	2	6	190145	190150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933361
4023	NC_011901	CATGGT	2	12	190172	190183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220933361
4024	NC_011901	ATG	2	6	190194	190199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933361
4025	NC_011901	CAGG	2	8	190205	190212	25 %	0 %	50 %	25 %	220933361
4026	NC_011901	CTGG	2	8	190376	190383	0 %	25 %	50 %	25 %	220933361
4027	NC_011901	CTT	2	6	190439	190444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933361
4028	NC_011901	GTCCG	2	10	190463	190472	0 %	20 %	40 %	40 %	220933361
4029	NC_011901	GGCG	2	8	190483	190490	0 %	0 %	75 %	25 %	220933361
4030	NC_011901	CGG	2	6	190529	190534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933362
4031	NC_011901	GC	3	6	190570	190575	0 %	0 %	50 %	50 %	220933362
4032	NC_011901	CCA	2	6	190613	190618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933362
4033	NC_011901	CTC	2	6	190665	190670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933362
4034	NC_011901	CAG	2	6	190722	190727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933362
4035	NC_011901	CCA	2	6	190730	190735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933362
4036	NC_011901	GCG	2	6	190780	190785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933362
4037	NC_011901	G	7	7	190803	190809	0 %	0 %	100 %	0 %	220933362
4038	NC_011901	GCC	2	6	190863	190868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933362
4039	NC_011901	AGA	2	6	190883	190888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933362
4040	NC_011901	CCT	2	6	190904	190909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933362
4041	NC_011901	AGC	2	6	190978	190983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933362
4042	NC_011901	GCG	2	6	191139	191144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933362
4043	NC_011901	GC	3	6	191173	191178	0 %	0 %	50 %	50 %	220933362
4044	NC_011901	CCCG	2	8	191341	191348	0 %	0 %	25 %	75 %	220933362
4045	NC_011901	CCT	2	6	191357	191362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933362
4046	NC_011901	GC	3	6	191385	191390	0 %	0 %	50 %	50 %	220933362
4047	NC_011901	GAA	2	6	191415	191420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933362
4048	NC_011901	TCG	2	6	191434	191439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933362
4049	NC_011901	TCC	2	6	191464	191469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933362
4050	NC_011901	GCC	2	6	191487	191492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933362
4051	NC_011901	CGCC	2	8	191500	191507	0 %	0 %	25 %	75 %	220933362
4052	NC_011901	CGC	2	6	191510	191515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933362
4053	NC_011901	TTG	2	6	191554	191559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933362
4054	NC_011901	CAC	2	6	191565	191570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933362
4055	NC_011901	GGC	2	6	191573	191578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933362
4056	NC_011901	CGG	2	6	191627	191632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933362
4057	NC_011901	TCC	3	9	191644	191652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933362
4058	NC_011901	ACG	2	6	191724	191729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933362
4059	NC_011901	CGA	2	6	191783	191788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933362
4060	NC_011901	CCA	2	6	191837	191842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933363
4061	NC_011901	GGC	2	6	191843	191848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933363
4062	NC_011901	CCA	2	6	191876	191881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933363
4063	NC_011901	GCA	2	6	191951	191956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933363
4064	NC_011901	TCC	2	6	191959	191964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933363
4065	NC_011901	TCT	2	6	192002	192007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933363
4066	NC_011901	AGG	2	6	192011	192016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933363
4067	NC_011901	AGG	2	6	192020	192025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933363
4068	NC_011901	GCC	2	6	192043	192048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933363
4069	NC_011901	GC	3	6	192052	192057	0 %	0 %	50 %	50 %	220933363
4070	NC_011901	CAC	2	6	192069	192074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933363
4071	NC_011901	CGG	2	6	192107	192112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933363
4072	NC_011901	CG	3	6	192147	192152	0 %	0 %	50 %	50 %	220933363
4073	NC_011901	TGA	2	6	192326	192331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933363
4074	NC_011901	CGT	2	6	192343	192348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933363
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4077	NC_011901	CGG	2	6	192416	192421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933363
4078	NC_011901	CGCC	2	8	192506	192513	0 %	0 %	25 %	75 %	220933363
4079	NC_011901	CGT	2	6	192572	192577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933363
4080	NC_011901	CAG	2	6	192648	192653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933363
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4082	NC_011901	GC	3	6	192736	192741	0 %	0 %	50 %	50 %	220933363
4083	NC_011901	GTT	2	6	192789	192794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933363
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4087	NC_011901	GCA	2	6	192923	192928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933363
4088	NC_011901	CCG	2	6	192991	192996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933363
4089	NC_011901	GAG	2	6	193069	193074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933363
4090	NC_011901	GTT	2	6	193083	193088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933363
4091	NC_011901	TCG	2	6	193090	193095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933363
4092	NC_011901	TGGCGA	2	12	193109	193120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933363
4093	NC_011901	CAC	2	6	193149	193154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933363
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4098	NC_011901	CAG	2	6	193413	193418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933363
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4101	NC_011901	GAA	2	6	193464	193469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933363
4102	NC_011901	CGA	2	6	193472	193477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933363
4103	NC_011901	TCC	2	6	193492	193497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933363
4104	NC_011901	GGC	2	6	193605	193610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933363
4105	NC_011901	CGG	3	9	193622	193630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933363
4106	NC_011901	TCG	2	6	193648	193653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933363
4107	NC_011901	GGC	2	6	193671	193676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933363
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4109	NC_011901	CTG	2	6	194433	194438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933364
4110	NC_011901	GC	3	6	194487	194492	0 %	0 %	50 %	50 %	220933364
4111	NC_011901	GAT	2	6	194544	194549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933364
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4113	NC_011901	CGC	2	6	194654	194659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933364
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4115	NC_011901	CCAG	2	8	194717	194724	25 %	0 %	25 %	50 %	220933364
4116	NC_011901	CGCA	2	8	194725	194732	25 %	0 %	25 %	50 %	220933364
4117	NC_011901	TCC	2	6	194788	194793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933364
4118	NC_011901	GTC	2	6	194796	194801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933364
4119	NC_011901	CCA	4	12	194828	194839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933364
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4121	NC_011901	GC	3	6	194916	194921	0 %	0 %	50 %	50 %	220933364
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4242	NC_011901	CTG	2	6	200393	200398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933369
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4482	NC_011901	CAG	2	6	210659	210664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4483	NC_011901	GA	3	6	210667	210672	50 %	0 %	50 %	0 %	220933378
4484	NC_011901	CCA	2	6	210682	210687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933378
4485	NC_011901	GCGCG	2	10	210699	210708	0 %	0 %	60 %	40 %	220933378
4486	NC_011901	CTG	2	6	210710	210715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4487	NC_011901	GCT	2	6	210748	210753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4488	NC_011901	CCT	2	6	210760	210765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933378
4489	NC_011901	GC	3	6	210771	210776	0 %	0 %	50 %	50 %	220933378
4490	NC_011901	ACC	2	6	210795	210800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933378
4491	NC_011901	AGC	2	6	210840	210845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4492	NC_011901	GGTCAG	2	12	210880	210891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933378
4493	NC_011901	CAG	3	9	210896	210904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4494	NC_011901	CCTT	2	8	211008	211015	0 %	50 %	0 %	50 %	220933378
4495	NC_011901	CTTGGC	2	12	211088	211099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4496	NC_011901	CGA	2	6	211108	211113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933378
4497	NC_011901	CGG	2	6	211184	211189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933379
4498	NC_011901	CAT	2	6	211199	211204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933379
4499	NC_011901	GGC	2	6	211223	211228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933379
4500	NC_011901	ATG	2	6	211311	211316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933379

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