MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011901	GCC	2	6	166431	166436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3502	NC_011901	GCG	2	6	166456	166461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3503	NC_011901	GC	3	6	166517	166522	0 %	0 %	50 %	50 %	220933340
3504	NC_011901	TGG	2	6	166588	166593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3505	NC_011901	GGT	2	6	166613	166618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3506	NC_011901	CGGG	2	8	166649	166656	0 %	0 %	75 %	25 %	220933340
3507	NC_011901	TGGA	2	8	166659	166666	25 %	25 %	50 %	0 %	220933340
3508	NC_011901	GCG	2	6	166747	166752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3509	NC_011901	CTG	2	6	166782	166787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3510	NC_011901	CGGC	2	8	166843	166850	0 %	0 %	50 %	50 %	220933340
3511	NC_011901	TCA	2	6	166858	166863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933340
3512	NC_011901	ATC	2	6	166876	166881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933340
3513	NC_011901	GCA	2	6	166961	166966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3514	NC_011901	CGG	2	6	166976	166981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3515	NC_011901	GGC	2	6	167060	167065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3516	NC_011901	TCG	2	6	167074	167079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3517	NC_011901	ACG	2	6	167101	167106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3518	NC_011901	GCC	2	6	167121	167126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3519	NC_011901	GC	3	6	167164	167169	0 %	0 %	50 %	50 %	220933340
3520	NC_011901	GGT	2	6	167183	167188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3521	NC_011901	GAC	2	6	167196	167201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3522	NC_011901	GCA	2	6	167209	167214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3523	NC_011901	TGG	2	6	167299	167304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3524	NC_011901	ATC	2	6	167379	167384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933340
3525	NC_011901	GCT	2	6	167396	167401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3526	NC_011901	CGC	2	6	167424	167429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3527	NC_011901	CGC	2	6	167440	167445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3528	NC_011901	ACA	2	6	167476	167481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933340
3529	NC_011901	GTG	3	9	167499	167507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933340
3530	NC_011901	GTC	2	6	167514	167519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3531	NC_011901	GCT	2	6	167522	167527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3532	NC_011901	GC	3	6	167632	167637	0 %	0 %	50 %	50 %	220933340
3533	NC_011901	CGG	2	6	167695	167700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3534	NC_011901	TGC	3	9	167728	167736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3535	NC_011901	GAC	2	6	167757	167762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933340
3536	NC_011901	GCG	2	6	167779	167784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3537	NC_011901	CGG	2	6	167794	167799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933340
3538	NC_011901	GT	3	6	167815	167820	0 %	50 %	50 %	0 %	220933340
3539	NC_011901	CGC	2	6	167832	167837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933340
3540	NC_011901	TG	3	6	168003	168008	0 %	50 %	50 %	0 %	220933341
3541	NC_011901	TGC	2	6	168012	168017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933341
3542	NC_011901	TGA	2	6	168136	168141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933341
3543	NC_011901	ATG	2	6	168226	168231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933342
3544	NC_011901	GT	4	8	168233	168240	0 %	50 %	50 %	0 %	220933342
3545	NC_011901	CG	3	6	168245	168250	0 %	0 %	50 %	50 %	220933342
3546	NC_011901	TGA	2	6	168299	168304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933342
3547	NC_011901	ATC	2	6	168330	168335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933342
3548	NC_011901	CTG	2	6	168858	168863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3549	NC_011901	CAG	2	6	168896	168901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3550	NC_011901	GAT	2	6	168950	168955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933343
3551	NC_011901	CCGG	2	8	168968	168975	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
3552	NC_011901	GGC	2	6	169004	169009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3553	NC_011901	GC	3	6	169008	169013	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
3554	NC_011901	GCC	2	6	169052	169057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
3555	NC_011901	CGA	2	6	169087	169092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3556	NC_011901	GCCG	2	8	169133	169140	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
3557	NC_011901	GGC	2	6	169187	169192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3558	NC_011901	GCCT	2	8	169217	169224	0 %	25 %	25 %	50 %	220933343
3559	NC_011901	GTC	2	6	169229	169234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3560	NC_011901	CGG	2	6	169317	169322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3561	NC_011901	CTC	2	6	169334	169339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933343
3562	NC_011901	GCC	2	6	169373	169378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
3563	NC_011901	GCC	2	6	169398	169403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
3564	NC_011901	CAG	2	6	169430	169435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3565	NC_011901	GCTC	2	8	169489	169496	0 %	25 %	25 %	50 %	220933343
3566	NC_011901	CCG	2	6	169512	169517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
3567	NC_011901	CGC	2	6	169531	169536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933343
3568	NC_011901	GCG	2	6	169641	169646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3569	NC_011901	CGG	2	6	169654	169659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3570	NC_011901	CGG	2	6	169687	169692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3571	NC_011901	TTCCAG	2	12	169694	169705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933343
3572	NC_011901	GCGCC	2	10	169716	169725	0 %	0 %	40 %	60 %	220933343
3573	NC_011901	CAG	2	6	169739	169744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3574	NC_011901	GGTGC	2	10	169745	169754	0 %	20 %	60 %	20 %	220933343
3575	NC_011901	CGG	2	6	169777	169782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3576	NC_011901	CAG	2	6	169790	169795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3577	NC_011901	GC	3	6	169800	169805	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
3578	NC_011901	CCCG	2	8	169825	169832	0 %	0 %	25 %	75 %	220933343
3579	NC_011901	CCCA	2	8	169857	169864	25 %	0 %	0 %	75 %	220933343
3580	NC_011901	CAC	2	6	169865	169870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933343
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3582	NC_011901	CGGG	2	8	169923	169930	0 %	0 %	75 %	25 %	220933343
3583	NC_011901	CAGGG	2	10	169956	169965	20 %	0 %	60 %	20 %	220933343
3584	NC_011901	CCA	2	6	169984	169989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933343
3585	NC_011901	GCCGC	2	10	169999	170008	0 %	0 %	40 %	60 %	220933343
3586	NC_011901	GGC	2	6	170090	170095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3587	NC_011901	CGCC	2	8	170169	170176	0 %	0 %	25 %	75 %	220933343
3588	NC_011901	GC	3	6	170220	170225	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
3589	NC_011901	GCG	2	6	170265	170270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3590	NC_011901	GCG	2	6	170309	170314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3591	NC_011901	CAG	2	6	170315	170320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3592	NC_011901	CGGGCA	2	12	170335	170346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933343
3593	NC_011901	G	6	6	170369	170374	0 %	0 %	100 %	0 %	220933343
3594	NC_011901	CGG	2	6	170416	170421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
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3596	NC_011901	CCAG	2	8	170485	170492	25 %	0 %	25 %	50 %	220933343
3597	NC_011901	GCG	2	6	170513	170518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
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3600	NC_011901	CGTC	2	8	170596	170603	0 %	25 %	25 %	50 %	220933343
3601	NC_011901	TCC	2	6	170628	170633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933343
3602	NC_011901	CAG	2	6	170648	170653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3603	NC_011901	CAG	2	6	170675	170680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
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3605	NC_011901	GGC	2	6	170759	170764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
3606	NC_011901	CACCCG	2	12	170825	170836	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	220933343
3607	NC_011901	CAG	2	6	170855	170860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
3608	NC_011901	CAG	2	6	170954	170959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933343
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3615	NC_011901	GC	3	6	171291	171296	0 %	0 %	50 %	50 %	220933343
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3621	NC_011901	GCG	2	6	171418	171423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933343
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3864	NC_011901	CGT	2	6	182695	182700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933355
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3971	NC_011901	TC	3	6	186852	186857	0 %	50 %	0 %	50 %	220933358
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3984	NC_011901	CTGG	2	8	188075	188082	0 %	25 %	50 %	25 %	220933360
3985	NC_011901	GCT	2	6	188114	188119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933360
3986	NC_011901	CGA	2	6	188120	188125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933360
3987	NC_011901	TCA	2	6	188146	188151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933360
3988	NC_011901	GAC	2	6	188163	188168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933360
3989	NC_011901	CAA	2	6	188216	188221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933360
3990	NC_011901	TGG	2	6	188485	188490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933360
3991	NC_011901	GCG	2	6	188500	188505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
3992	NC_011901	CGG	2	6	188525	188530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
3993	NC_011901	GCG	2	6	188587	188592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933360
3994	NC_011901	ACC	2	6	188646	188651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933360
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3996	NC_011901	ATCC	2	8	188963	188970	25 %	25 %	0 %	50 %	220933361
3997	NC_011901	CCA	2	6	189031	189036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933361
3998	NC_011901	CAG	2	6	189101	189106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933361
3999	NC_011901	CGTC	2	8	189108	189115	0 %	25 %	25 %	50 %	220933361
4000	NC_011901	GTCCAC	2	12	189158	189169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220933361

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