MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011901	CGC	2	6	45659	45664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933238
1002	NC_011901	CCG	2	6	45735	45740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933238
1003	NC_011901	CCG	2	6	45766	45771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933238
1004	NC_011901	GA	3	6	45852	45857	50 %	0 %	50 %	0 %	220933238
1005	NC_011901	GATC	2	8	46091	46098	25 %	25 %	25 %	25 %	220933239
1006	NC_011901	GAG	2	6	46119	46124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933239
1007	NC_011901	C	6	6	46135	46140	0 %	0 %	0 %	100 %	220933239
1008	NC_011901	CGC	2	6	46170	46175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933239
1009	NC_011901	TG	3	6	46177	46182	0 %	50 %	50 %	0 %	220933239
1010	NC_011901	GCA	2	6	46264	46269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1011	NC_011901	CTG	2	6	46284	46289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1012	NC_011901	CTT	2	6	46304	46309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933239
1013	NC_011901	GC	4	8	46361	46368	0 %	0 %	50 %	50 %	220933239
1014	NC_011901	GCT	2	6	46421	46426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1015	NC_011901	TGG	2	6	46450	46455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933239
1016	NC_011901	TGG	2	6	46513	46518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933239
1017	NC_011901	TGG	2	6	46528	46533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933239
1018	NC_011901	GCC	2	6	46603	46608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933239
1019	NC_011901	GC	3	6	46643	46648	0 %	0 %	50 %	50 %	220933239
1020	NC_011901	CGC	3	9	46655	46663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933239
1021	NC_011901	GC	3	6	46734	46739	0 %	0 %	50 %	50 %	220933239
1022	NC_011901	CTG	2	6	46782	46787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1023	NC_011901	GCCA	2	8	46800	46807	25 %	0 %	25 %	50 %	220933239
1024	NC_011901	CTG	2	6	46809	46814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1025	NC_011901	TCC	2	6	46818	46823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933239
1026	NC_011901	GC	3	6	46832	46837	0 %	0 %	50 %	50 %	220933239
1027	NC_011901	CAC	2	6	46871	46876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933239
1028	NC_011901	ACG	2	6	46921	46926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933239
1029	NC_011901	CAG	3	9	47053	47061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933240
1030	NC_011901	AAC	2	6	47078	47083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933240
1031	NC_011901	GTG	3	9	47092	47100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933240
1032	NC_011901	GCT	2	6	47112	47117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933240
1033	NC_011901	CGG	2	6	47145	47150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933240
1034	NC_011901	TGG	2	6	47159	47164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933240
1035	NC_011901	CGG	2	6	47192	47197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933240
1036	NC_011901	CTG	2	6	47257	47262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933240
1037	NC_011901	CTG	2	6	47395	47400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933240
1038	NC_011901	GCC	2	6	47451	47456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933240
1039	NC_011901	TCATGG	2	12	47462	47473	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220933240
1040	NC_011901	CTG	2	6	47539	47544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933240
1041	NC_011901	GTG	2	6	47548	47553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933240
1042	NC_011901	CCG	2	6	47567	47572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933240
1043	NC_011901	GGC	2	6	47667	47672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933240
1044	NC_011901	TCG	2	6	47723	47728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933240
1045	NC_011901	TGG	2	6	47732	47737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933240
1046	NC_011901	GCG	2	6	47750	47755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933240
1047	NC_011901	GCC	2	6	47815	47820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933240
1048	NC_011901	CGA	2	6	47862	47867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933240
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1050	NC_011901	GC	3	6	47997	48002	0 %	0 %	50 %	50 %	220933241
1051	NC_011901	CGC	2	6	48025	48030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933241
1052	NC_011901	CTG	2	6	48064	48069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933241
1053	NC_011901	GCG	2	6	48070	48075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933241
1054	NC_011901	GCCCC	3	15	48112	48126	0 %	0 %	20 %	80 %	220933241
1055	NC_011901	C	7	7	48123	48129	0 %	0 %	0 %	100 %	220933241
1056	NC_011901	GGC	2	6	48130	48135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933241
1057	NC_011901	CGG	2	6	48144	48149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933241
1058	NC_011901	TGA	2	6	48216	48221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933241
1059	NC_011901	GC	3	6	48225	48230	0 %	0 %	50 %	50 %	220933241
1060	NC_011901	CAC	2	6	48243	48248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933241
1061	NC_011901	C	6	6	48263	48268	0 %	0 %	0 %	100 %	220933241
1062	NC_011901	GCCCC	2	10	48291	48300	0 %	0 %	20 %	80 %	220933241
1063	NC_011901	CTG	2	6	48310	48315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933241
1064	NC_011901	GGC	2	6	48363	48368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933241
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1066	NC_011901	GC	3	6	48376	48381	0 %	0 %	50 %	50 %	220933241
1067	NC_011901	GGC	2	6	48418	48423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933241
1068	NC_011901	GCG	2	6	48433	48438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933241
1069	NC_011901	GGA	2	6	48447	48452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933241
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1071	NC_011901	GCCC	2	8	48527	48534	0 %	0 %	25 %	75 %	220933241
1072	NC_011901	GGCGAC	2	12	48546	48557	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933241
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1074	NC_011901	GCC	2	6	48574	48579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933241
1075	NC_011901	CTG	2	6	48580	48585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933241
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1080	NC_011901	GGAC	2	8	48694	48701	25 %	0 %	50 %	25 %	220933241
1081	NC_011901	GTG	2	6	48709	48714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933241
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1083	NC_011901	C	6	6	48745	48750	0 %	0 %	0 %	100 %	220933241
1084	NC_011901	CCGG	2	8	48810	48817	0 %	0 %	50 %	50 %	220933241
1085	NC_011901	GC	3	6	48822	48827	0 %	0 %	50 %	50 %	220933241
1086	NC_011901	GCTG	2	8	48872	48879	0 %	25 %	50 %	25 %	220933241
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1091	NC_011901	C	7	7	49010	49016	0 %	0 %	0 %	100 %	220933242
1092	NC_011901	CGG	2	6	49039	49044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933242
1093	NC_011901	GCG	2	6	49051	49056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933242
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1095	NC_011901	TGC	2	6	49084	49089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933242
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1100	NC_011901	GCCCC	2	10	49240	49249	0 %	0 %	20 %	80 %	220933242
1101	NC_011901	GC	3	6	49271	49276	0 %	0 %	50 %	50 %	220933242
1102	NC_011901	CG	3	6	49392	49397	0 %	0 %	50 %	50 %	220933242
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1106	NC_011901	GGCG	2	8	49496	49503	0 %	0 %	75 %	25 %	220933243
1107	NC_011901	G	6	6	49514	49519	0 %	0 %	100 %	0 %	220933243
1108	NC_011901	CGG	2	6	49545	49550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1109	NC_011901	G	6	6	49575	49580	0 %	0 %	100 %	0 %	220933243
1110	NC_011901	CTG	2	6	49619	49624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933243
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1112	NC_011901	CCTGGT	2	12	49690	49701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933243
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1121	NC_011901	GC	3	6	49904	49909	0 %	0 %	50 %	50 %	220933243
1122	NC_011901	GCGG	2	8	49912	49919	0 %	0 %	75 %	25 %	220933243
1123	NC_011901	GAC	2	6	49931	49936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933243
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1126	NC_011901	CCT	2	6	50044	50049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933243
1127	NC_011901	GGCCCT	2	12	50062	50073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933243
1128	NC_011901	GCG	2	6	50081	50086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1129	NC_011901	CGG	2	6	50116	50121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1130	NC_011901	CGAGC	2	10	50146	50155	20 %	0 %	40 %	40 %	220933243
1131	NC_011901	ACC	2	6	50174	50179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933243
1132	NC_011901	CCA	2	6	50232	50237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933243
1133	NC_011901	GCC	2	6	50252	50257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933243
1134	NC_011901	GGC	2	6	50260	50265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1135	NC_011901	GCG	2	6	50274	50279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1136	NC_011901	GGC	2	6	50289	50294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1137	NC_011901	CCCCTG	2	12	50303	50314	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220933243
1138	NC_011901	GGC	2	6	50315	50320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933243
1139	NC_011901	GCCCTG	2	12	50321	50332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933243
1140	NC_011901	CA	3	6	50626	50631	50 %	0 %	0 %	50 %	220933244
1141	NC_011901	GCT	2	6	50638	50643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1142	NC_011901	GC	4	8	50650	50657	0 %	0 %	50 %	50 %	220933244
1143	NC_011901	GCT	3	9	50665	50673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1144	NC_011901	GCT	2	6	50689	50694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1145	NC_011901	GGC	2	6	50695	50700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933244
1146	NC_011901	GGC	2	6	50706	50711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933244
1147	NC_011901	GGCC	2	8	50773	50780	0 %	0 %	50 %	50 %	220933244
1148	NC_011901	CTGGC	2	10	50813	50822	0 %	20 %	40 %	40 %	220933244
1149	NC_011901	TGC	2	6	50823	50828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1150	NC_011901	GCC	2	6	50831	50836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
1151	NC_011901	G	6	6	50892	50897	0 %	0 %	100 %	0 %	220933244
1152	NC_011901	TGCTGG	2	12	50910	50921	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220933244
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1154	NC_011901	C	6	6	50955	50960	0 %	0 %	0 %	100 %	220933244
1155	NC_011901	CTG	2	6	50978	50983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933244
1156	NC_011901	G	6	6	51012	51017	0 %	0 %	100 %	0 %	220933244
1157	NC_011901	TGG	2	6	51030	51035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933244
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1159	NC_011901	CGCCC	2	10	51061	51070	0 %	0 %	20 %	80 %	220933244
1160	NC_011901	CCG	2	6	51079	51084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
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1165	NC_011901	GCC	2	6	51260	51265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933244
1166	NC_011901	G	6	6	51325	51330	0 %	0 %	100 %	0 %	220933244
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1202	NC_011901	GGC	2	6	52419	52424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933245
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1236	NC_011901	CTG	2	6	53809	53814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933245
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1240	NC_011901	CATGCC	2	12	54065	54076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220933246
1241	NC_011901	AAG	2	6	54123	54128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933246
1242	NC_011901	GGA	2	6	54152	54157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933246
1243	NC_011901	CAG	2	6	54219	54224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933246
1244	NC_011901	GC	3	6	54287	54292	0 %	0 %	50 %	50 %	220933246
1245	NC_011901	GCG	2	6	54344	54349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933246
1246	NC_011901	CTG	2	6	54359	54364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933246
1247	NC_011901	GTG	2	6	54522	54527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933247
1248	NC_011901	TCA	2	6	54578	54583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933247
1249	NC_011901	CCG	2	6	54586	54591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933247
1250	NC_011901	GGC	2	6	54673	54678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933247
1251	NC_011901	CGGAA	2	10	54704	54713	40 %	0 %	40 %	20 %	220933247
1252	NC_011901	CGC	2	6	54782	54787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933247
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1372	NC_011901	CGC	2	6	60217	60222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933253
1373	NC_011901	GTCATG	2	12	60226	60237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220933253
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1375	NC_011901	GCT	2	6	60303	60308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1376	NC_011901	GCGTG	2	10	60315	60324	0 %	20 %	60 %	20 %	220933253
1377	NC_011901	TCT	2	6	60329	60334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933253
1378	NC_011901	CTT	2	6	60357	60362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933253
1379	NC_011901	GGA	2	6	60411	60416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933253
1380	NC_011901	TCG	2	6	60446	60451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1381	NC_011901	CTT	2	6	60501	60506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933253
1382	NC_011901	CGG	2	6	60560	60565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933253
1383	NC_011901	TGC	3	9	60656	60664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1384	NC_011901	CG	3	6	60678	60683	0 %	0 %	50 %	50 %	220933253
1385	NC_011901	TGC	3	9	60716	60724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1386	NC_011901	AGA	2	6	60725	60730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933253
1387	NC_011901	GCC	2	6	60755	60760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933253
1388	NC_011901	GGACCT	2	12	60771	60782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1389	NC_011901	TGGA	2	8	60814	60821	25 %	25 %	50 %	0 %	220933253
1390	NC_011901	GC	3	6	60837	60842	0 %	0 %	50 %	50 %	220933253
1391	NC_011901	GCCA	2	8	60925	60932	25 %	0 %	25 %	50 %	220933253
1392	NC_011901	TCG	2	6	61008	61013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1393	NC_011901	CAC	2	6	61014	61019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933253
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1395	NC_011901	TCG	2	6	61124	61129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1396	NC_011901	TCT	2	6	61140	61145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933253
1397	NC_011901	CTG	2	6	61156	61161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933253
1398	NC_011901	T	7	7	61531	61537	0 %	100 %	0 %	0 %	220933254
1399	NC_011901	AAG	2	6	61549	61554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933254
1400	NC_011901	GC	3	6	61642	61647	0 %	0 %	50 %	50 %	220933254
1401	NC_011901	TGG	2	6	61712	61717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933254
1402	NC_011901	CGG	2	6	61757	61762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933254
1403	NC_011901	ATG	2	6	61780	61785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933254
1404	NC_011901	CGC	2	6	61788	61793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933254
1405	NC_011901	GTG	2	6	61820	61825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933254
1406	NC_011901	TGG	2	6	62025	62030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933255
1407	NC_011901	TCC	2	6	62118	62123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933255
1408	NC_011901	CAT	3	9	62290	62298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933255
1409	NC_011901	CGG	2	6	62299	62304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933255
1410	NC_011901	CAT	2	6	62323	62328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933255
1411	NC_011901	CGG	2	6	62335	62340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933255
1412	NC_011901	TGCTGG	2	12	62391	62402	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220933255
1413	NC_011901	GGA	2	6	62503	62508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933255
1414	NC_011901	GGC	2	6	62570	62575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933255
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1417	NC_011901	CTG	2	6	62636	62641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933255
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1421	NC_011901	ACC	2	6	62840	62845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933255
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1434	NC_011901	CGC	2	6	63250	63255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933255
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1442	NC_011901	AGA	2	6	63567	63572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933256
1443	NC_011901	CAT	2	6	63628	63633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933256
1444	NC_011901	TG	3	6	63639	63644	0 %	50 %	50 %	0 %	220933256
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1480	NC_011901	ACC	2	6	65925	65930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933260
1481	NC_011901	CTGCAG	2	12	65973	65984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933260
1482	NC_011901	ACAAGG	2	12	66022	66033	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220933260
1483	NC_011901	GCG	2	6	66055	66060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933260
1484	NC_011901	CGTGGG	2	12	66107	66118	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933260
1485	NC_011901	ACC	2	6	66162	66167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933260
1486	NC_011901	GGTGT	2	10	66186	66195	0 %	40 %	60 %	0 %	220933260
1487	NC_011901	GTC	2	6	66201	66206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933260
1488	NC_011901	ACG	2	6	66229	66234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933260
1489	NC_011901	GACC	2	8	66272	66279	25 %	0 %	25 %	50 %	220933260
1490	NC_011901	CTT	2	6	66338	66343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933260
1491	NC_011901	GCA	2	6	66348	66353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933260
1492	NC_011901	TGG	3	9	66461	66469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933260
1493	NC_011901	GCG	2	6	66472	66477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933260
1494	NC_011901	GTG	2	6	66478	66483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933260
1495	NC_011901	GCT	2	6	66827	66832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933261
1496	NC_011901	TC	3	6	66854	66859	0 %	50 %	0 %	50 %	220933261
1497	NC_011901	ACGG	2	8	66894	66901	25 %	0 %	50 %	25 %	220933261
1498	NC_011901	GC	3	6	66990	66995	0 %	0 %	50 %	50 %	220933261
1499	NC_011901	TGCCA	2	10	67008	67017	20 %	20 %	20 %	40 %	220933261
1500	NC_011901	GCC	2	6	67042	67047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933261

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