MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011901	GGC	2	6	23602	23607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933217
502	NC_011901	GCCCT	2	10	23624	23633	0 %	20 %	20 %	60 %	220933217
503	NC_011901	CCTG	2	8	23661	23668	0 %	25 %	25 %	50 %	220933217
504	NC_011901	CCG	2	6	23711	23716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
505	NC_011901	GCC	2	6	23810	23815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
506	NC_011901	TCA	2	6	23826	23831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933217
507	NC_011901	CCCTG	2	10	23835	23844	0 %	20 %	20 %	60 %	220933217
508	NC_011901	GTG	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933217
509	NC_011901	ACG	2	6	23874	23879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933217
510	NC_011901	TGC	2	6	23949	23954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933217
511	NC_011901	GCC	2	6	23964	23969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
512	NC_011901	CGG	2	6	24040	24045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933217
513	NC_011901	CTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933217
514	NC_011901	GAGG	2	8	24127	24134	25 %	0 %	75 %	0 %	220933217
515	NC_011901	CTG	2	6	24152	24157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933217
516	NC_011901	GCG	2	6	24162	24167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933217
517	NC_011901	GC	3	6	24253	24258	0 %	0 %	50 %	50 %	220933217
518	NC_011901	CGC	2	6	24447	24452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
519	NC_011901	GCC	2	6	24464	24469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933217
520	NC_011901	GGA	2	6	24499	24504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933217
521	NC_011901	CAG	2	6	24689	24694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
522	NC_011901	GGGCGC	2	12	24720	24731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
523	NC_011901	GGC	2	6	24793	24798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
524	NC_011901	CAG	3	9	24806	24814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
525	NC_011901	GGC	2	6	24815	24820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
526	NC_011901	TGC	2	6	24831	24836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933218
527	NC_011901	CGG	2	6	24850	24855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
528	NC_011901	GC	3	6	24934	24939	0 %	0 %	50 %	50 %	220933218
529	NC_011901	GCA	2	6	24943	24948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
530	NC_011901	CCA	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933218
531	NC_011901	GGC	2	6	25051	25056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
532	NC_011901	CGGCGT	2	12	25060	25071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933218
533	NC_011901	CGG	2	6	25072	25077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
534	NC_011901	AGC	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
535	NC_011901	GGA	2	6	25135	25140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933218
536	NC_011901	GGCGC	2	10	25145	25154	0 %	0 %	60 %	40 %	220933218
537	NC_011901	GCA	2	6	25162	25167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
538	NC_011901	GGC	2	6	25178	25183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
539	NC_011901	TCGT	2	8	25196	25203	0 %	50 %	25 %	25 %	220933218
540	NC_011901	GC	3	6	25212	25217	0 %	0 %	50 %	50 %	220933218
541	NC_011901	GGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933218
542	NC_011901	CGG	2	6	25383	25388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
543	NC_011901	GCG	2	6	25410	25415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
544	NC_011901	GCG	2	6	25419	25424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933218
545	NC_011901	GC	3	6	25457	25462	0 %	0 %	50 %	50 %	220933218
546	NC_011901	CGGCCT	2	12	25543	25554	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933218
547	NC_011901	CCG	2	6	25581	25586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933218
548	NC_011901	GCA	3	9	25615	25623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
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550	NC_011901	CAG	2	6	25640	25645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
551	NC_011901	CCA	2	6	25654	25659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933218
552	NC_011901	CAG	2	6	25703	25708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
553	NC_011901	GAA	2	6	25730	25735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933218
554	NC_011901	CAG	2	6	25757	25762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
555	NC_011901	CAG	2	6	25781	25786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
556	NC_011901	GCA	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933218
557	NC_011901	CAG	2	6	25820	25825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
558	NC_011901	CGG	2	6	25847	25852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
559	NC_011901	CAG	2	6	25934	25939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
560	NC_011901	CGT	2	6	25975	25980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933219
561	NC_011901	GCA	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
562	NC_011901	GC	3	6	26000	26005	0 %	0 %	50 %	50 %	220933219
563	NC_011901	GCG	2	6	26115	26120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
564	NC_011901	CACC	2	8	26141	26148	25 %	0 %	0 %	75 %	220933219
565	NC_011901	CGGG	2	8	26297	26304	0 %	0 %	75 %	25 %	220933219
566	NC_011901	TCC	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933219
567	NC_011901	CGG	2	6	26329	26334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
568	NC_011901	GCA	2	6	26353	26358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
569	NC_011901	TCG	2	6	26388	26393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933219
570	NC_011901	GCC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933219
571	NC_011901	GC	3	6	26406	26411	0 %	0 %	50 %	50 %	220933219
572	NC_011901	GTC	2	6	26426	26431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933219
573	NC_011901	CAGGCG	2	12	26435	26446	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933219
574	NC_011901	GGC	2	6	26450	26455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
575	NC_011901	GTG	2	6	26508	26513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933219
576	NC_011901	CGGC	2	8	26586	26593	0 %	0 %	50 %	50 %	220933219
577	NC_011901	CGG	2	6	26653	26658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
578	NC_011901	GCG	2	6	26727	26732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
579	NC_011901	CAG	2	6	26747	26752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
580	NC_011901	CAG	2	6	26771	26776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933219
581	NC_011901	GGC	2	6	26777	26782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
582	NC_011901	CGGG	2	8	26793	26800	0 %	0 %	75 %	25 %	220933219
583	NC_011901	CGG	2	6	26824	26829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933219
584	NC_011901	GGT	2	6	26846	26851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933219
585	NC_011901	TTC	2	6	26867	26872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933219
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588	NC_011901	GGA	2	6	26987	26992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933219
589	NC_011901	CTTGTC	2	12	27056	27067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220933219
590	NC_011901	TGC	2	6	27076	27081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933219
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592	NC_011901	ATC	2	6	27118	27123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933220
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594	NC_011901	GCGCG	2	10	27195	27204	0 %	0 %	60 %	40 %	220933220
595	NC_011901	CAG	2	6	27210	27215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933220
596	NC_011901	CCA	2	6	27251	27256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933220
597	NC_011901	GCT	2	6	27282	27287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933220
598	NC_011901	GGC	2	6	27356	27361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933220
599	NC_011901	CCA	2	6	27386	27391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933220
600	NC_011901	CAG	2	6	27420	27425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933220
601	NC_011901	CCG	2	6	27433	27438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933220
602	NC_011901	CGC	2	6	27440	27445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933220
603	NC_011901	TTC	2	6	27489	27494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933220
604	NC_011901	CAG	2	6	27495	27500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933220
605	NC_011901	TGA	2	6	27662	27667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933220
606	NC_011901	GTCG	2	8	27692	27699	0 %	25 %	50 %	25 %	220933220
607	NC_011901	GCCG	2	8	27713	27720	0 %	0 %	50 %	50 %	220933220
608	NC_011901	AGA	2	6	27794	27799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933220
609	NC_011901	TGG	2	6	27808	27813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933220
610	NC_011901	CGGG	2	8	27816	27823	0 %	0 %	75 %	25 %	220933220
611	NC_011901	CTG	3	9	27864	27872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933220
612	NC_011901	GGCT	2	8	27874	27881	0 %	25 %	50 %	25 %	220933220
613	NC_011901	GCCCAG	2	12	27902	27913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220933221
614	NC_011901	CGGCC	2	10	27961	27970	0 %	0 %	40 %	60 %	220933221
615	NC_011901	GCCTCG	2	12	27975	27986	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220933221
616	NC_011901	GC	3	6	28008	28013	0 %	0 %	50 %	50 %	220933221
617	NC_011901	CCA	2	6	28039	28044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933221
618	NC_011901	CGCAGG	2	12	28050	28061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220933221
619	NC_011901	GCC	2	6	28109	28114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933221
620	NC_011901	GCGT	2	8	28121	28128	0 %	25 %	50 %	25 %	220933221
621	NC_011901	CGG	2	6	28141	28146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933221
622	NC_011901	GTC	2	6	28169	28174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933221
623	NC_011901	CGG	2	6	28318	28323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933221
624	NC_011901	GAT	2	6	28328	28333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933221
625	NC_011901	GGC	2	6	28435	28440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933221
626	NC_011901	TCC	2	6	28524	28529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933221
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742	NC_011901	CCG	2	6	33896	33901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933226
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746	NC_011901	GAT	2	6	34107	34112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933226
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750	NC_011901	GC	3	6	34279	34284	0 %	0 %	50 %	50 %	220933226
751	NC_011901	AGC	2	6	34330	34335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933226
752	NC_011901	GGC	2	6	34397	34402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933226
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754	NC_011901	TCG	2	6	34423	34428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933226
755	NC_011901	GGTCCA	2	12	34469	34480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933226
756	NC_011901	GGCG	2	8	34511	34518	0 %	0 %	75 %	25 %	220933226
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