MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011901	GTC	2	6	300622	300627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
6502	NC_011901	GCC	2	6	300670	300675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933458
6503	NC_011901	GCC	2	6	300718	300723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933458
6504	NC_011901	TGG	2	6	300734	300739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933458
6505	NC_011901	GCAT	2	8	300767	300774	25 %	25 %	25 %	25 %	220933458
6506	NC_011901	GCC	2	6	300805	300810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933458
6507	NC_011901	TCG	2	6	300815	300820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
6508	NC_011901	CGTC	2	8	300912	300919	0 %	25 %	25 %	50 %	220933458
6509	NC_011901	CAT	2	6	300967	300972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933458
6510	NC_011901	GGC	2	6	301057	301062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933458
6511	NC_011901	AGC	2	6	301202	301207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933458
6512	NC_011901	CGCGC	2	10	301244	301253	0 %	0 %	40 %	60 %	220933458
6513	NC_011901	CGT	2	6	301258	301263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933458
6514	NC_011901	GAT	2	6	301350	301355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933459
6515	NC_011901	TGG	2	6	301427	301432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933459
6516	NC_011901	TGC	2	6	301490	301495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933459
6517	NC_011901	GCT	2	6	301542	301547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933459
6518	NC_011901	TCC	2	6	301582	301587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933459
6519	NC_011901	TGG	2	6	301616	301621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933459
6520	NC_011901	GCG	2	6	301767	301772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933459
6521	NC_011901	CGC	2	6	301808	301813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933459
6522	NC_011901	TGG	2	6	301835	301840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933459
6523	NC_011901	CAA	2	6	301854	301859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933459
6524	NC_011901	AGCG	2	8	301885	301892	25 %	0 %	50 %	25 %	220933459
6525	NC_011901	CCG	2	6	301931	301936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933459
6526	NC_011901	GCA	3	9	301995	302003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933459
6527	NC_011901	TCG	2	6	302236	302241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933460
6528	NC_011901	GTT	2	6	302279	302284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933460
6529	NC_011901	TGG	3	9	302313	302321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933460
6530	NC_011901	GAA	2	6	302400	302405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933460
6531	NC_011901	GTT	2	6	302408	302413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933460
6532	NC_011901	CTG	2	6	302436	302441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933460
6533	NC_011901	GCG	2	6	302462	302467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933460
6534	NC_011901	CTG	2	6	302652	302657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933460
6535	NC_011901	GTG	2	6	302674	302679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933460
6536	NC_011901	TGC	2	6	302854	302859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933461
6537	NC_011901	ATG	2	6	302876	302881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933461
6538	NC_011901	CGGCG	2	10	302893	302902	0 %	0 %	60 %	40 %	220933461
6539	NC_011901	CAA	2	6	302986	302991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933461
6540	NC_011901	CGC	2	6	303051	303056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933461
6541	NC_011901	CAC	2	6	303172	303177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933461
6542	NC_011901	AGC	2	6	303242	303247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933461
6543	NC_011901	TGGCG	2	10	303260	303269	0 %	20 %	60 %	20 %	220933461
6544	NC_011901	TCA	2	6	303315	303320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933461
6545	NC_011901	GTG	2	6	303341	303346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
6546	NC_011901	ACT	2	6	303360	303365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933461
6547	NC_011901	ACCG	2	8	303388	303395	25 %	0 %	25 %	50 %	220933461
6548	NC_011901	GC	3	6	303436	303441	0 %	0 %	50 %	50 %	220933461
6549	NC_011901	CACCTG	2	12	303481	303492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220933461
6550	NC_011901	GC	3	6	303556	303561	0 %	0 %	50 %	50 %	220933461
6551	NC_011901	TGG	2	6	303596	303601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
6552	NC_011901	TG	3	6	303700	303705	0 %	50 %	50 %	0 %	220933461
6553	NC_011901	CG	3	6	303709	303714	0 %	0 %	50 %	50 %	220933461
6554	NC_011901	ACA	2	6	303756	303761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933461
6555	NC_011901	GCCG	2	8	303778	303785	0 %	0 %	50 %	50 %	220933461
6556	NC_011901	GAT	2	6	303875	303880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933461
6557	NC_011901	GTGCCG	2	12	303894	303905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220933461
6558	NC_011901	CG	4	8	303904	303911	0 %	0 %	50 %	50 %	220933461
6559	NC_011901	GGA	2	6	303952	303957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933461
6560	NC_011901	ACA	2	6	304017	304022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933461
6561	NC_011901	CGC	2	6	304023	304028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933461
6562	NC_011901	GTG	2	6	304035	304040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
6563	NC_011901	CAT	2	6	304075	304080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933461
6564	NC_011901	CGG	2	6	304103	304108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933461
6565	NC_011901	CGG	2	6	304131	304136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933461
6566	NC_011901	CGG	2	6	304147	304152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933461
6567	NC_011901	TCT	2	6	304167	304172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933461
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6569	NC_011901	CAT	2	6	304210	304215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933461
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6572	NC_011901	GAG	2	6	304295	304300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933461
6573	NC_011901	GCT	2	6	304306	304311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933461
6574	NC_011901	CCAG	2	8	304338	304345	25 %	0 %	25 %	50 %	220933461
6575	NC_011901	TGG	2	6	304353	304358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
6576	NC_011901	TCG	2	6	304361	304366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933461
6577	NC_011901	ACA	2	6	304371	304376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933461
6578	NC_011901	GAC	2	6	304385	304390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933461
6579	NC_011901	CTG	2	6	304433	304438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933461
6580	NC_011901	GCTACA	2	12	304461	304472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220933461
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6582	NC_011901	ACAACT	2	12	304509	304520	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	220933461
6583	NC_011901	CCAG	2	8	304596	304603	25 %	0 %	25 %	50 %	220933461
6584	NC_011901	CGTG	2	8	304621	304628	0 %	25 %	50 %	25 %	220933461
6585	NC_011901	TGG	2	6	304638	304643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
6586	NC_011901	CGGCC	2	10	304657	304666	0 %	0 %	40 %	60 %	220933461
6587	NC_011901	GAG	2	6	304691	304696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933461
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6589	NC_011901	GAG	2	6	304772	304777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933461
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6591	NC_011901	TGG	2	6	304872	304877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933461
6592	NC_011901	GAG	2	6	304883	304888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933461
6593	NC_011901	GC	3	6	304894	304899	0 %	0 %	50 %	50 %	220933461
6594	NC_011901	CAA	2	6	304933	304938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933461
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6599	NC_011901	TGGAC	2	10	305097	305106	20 %	20 %	40 %	20 %	220933461
6600	NC_011901	CCTG	2	8	305107	305114	0 %	25 %	25 %	50 %	220933461
6601	NC_011901	GCG	2	6	305123	305128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933461
6602	NC_011901	CTG	2	6	305132	305137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933461
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6604	NC_011901	CGGGTG	2	12	306573	306584	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933462
6605	NC_011901	GGT	2	6	306602	306607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933462
6606	NC_011901	CGAG	2	8	306634	306641	25 %	0 %	50 %	25 %	220933462
6607	NC_011901	GAC	2	6	306699	306704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933462
6608	NC_011901	GCG	2	6	306729	306734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933462
6609	NC_011901	ACT	2	6	306736	306741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933462
6610	NC_011901	ACC	2	6	306742	306747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933462
6611	NC_011901	TGC	3	9	306784	306792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933462
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6614	NC_011901	ACT	2	6	306908	306913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933462
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6618	NC_011901	GTG	2	6	306993	306998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933462
6619	NC_011901	TGCCC	2	10	307053	307062	0 %	20 %	20 %	60 %	220933462
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6621	NC_011901	GGC	3	9	307091	307099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933462
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6863	NC_011901	GGT	2	6	320007	320012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933470
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6865	NC_011901	CTG	2	6	320089	320094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933470
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6881	NC_011901	CGG	2	6	321370	321375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933471
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6982	NC_011901	ATGG	2	8	325350	325357	25 %	25 %	50 %	0 %	220933474
6983	NC_011901	GCA	2	6	325382	325387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933474
6984	NC_011901	CTG	2	6	325389	325394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933474
6985	NC_011901	CGAGG	2	10	325404	325413	20 %	0 %	60 %	20 %	220933474
6986	NC_011901	CGA	2	6	325421	325426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933474
6987	NC_011901	GGCC	2	8	325454	325461	0 %	0 %	50 %	50 %	220933474
6988	NC_011901	TTGACC	2	12	325510	325521	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220933474
6989	NC_011901	CAGG	2	8	325584	325591	25 %	0 %	50 %	25 %	220933474
6990	NC_011901	ATGG	2	8	325593	325600	25 %	25 %	50 %	0 %	220933474
6991	NC_011901	TCC	2	6	325705	325710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933474
6992	NC_011901	CCA	2	6	325748	325753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933474
6993	NC_011901	GCTCAG	2	12	325770	325781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220933474
6994	NC_011901	AGG	2	6	325850	325855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933474
6995	NC_011901	GCCG	2	8	325874	325881	0 %	0 %	50 %	50 %	220933474
6996	NC_011901	CG	3	6	325880	325885	0 %	0 %	50 %	50 %	220933474
6997	NC_011901	TCG	2	6	325921	325926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933474
6998	NC_011901	TCC	2	6	325930	325935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933474
6999	NC_011901	GTA	2	6	325956	325961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933474
7000	NC_011901	GTG	2	6	325996	326001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933474

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