MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 73430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011901	CAG	2	6	211373	211378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933379
4502	NC_011901	CGGGCG	2	12	211386	211397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933379
4503	NC_011901	CGGT	2	8	211416	211423	0 %	25 %	50 %	25 %	220933379
4504	NC_011901	CCAG	2	8	211492	211499	25 %	0 %	25 %	50 %	220933379
4505	NC_011901	TCCGG	2	10	211564	211573	0 %	20 %	40 %	40 %	220933379
4506	NC_011901	TCG	2	6	211590	211595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933379
4507	NC_011901	TTTCA	2	10	211640	211649	20 %	60 %	0 %	20 %	220933379
4508	NC_011901	TGG	2	6	211660	211665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933380
4509	NC_011901	CGCC	2	8	211675	211682	0 %	0 %	25 %	75 %	220933380
4510	NC_011901	GA	4	8	211684	211691	50 %	0 %	50 %	0 %	220933380
4511	NC_011901	CAC	2	6	211692	211697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933380
4512	NC_011901	CAG	2	6	211719	211724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4513	NC_011901	GGA	2	6	211728	211733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933380
4514	NC_011901	GCA	2	6	211738	211743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4515	NC_011901	GCA	2	6	211901	211906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4516	NC_011901	TCC	2	6	211918	211923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933380
4517	NC_011901	CGT	2	6	211928	211933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4518	NC_011901	CGG	2	6	211934	211939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933380
4519	NC_011901	CCA	2	6	211943	211948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933380
4520	NC_011901	TGGA	2	8	211999	212006	25 %	25 %	50 %	0 %	220933380
4521	NC_011901	GCGG	2	8	212049	212056	0 %	0 %	75 %	25 %	220933380
4522	NC_011901	GCC	2	6	212080	212085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933380
4523	NC_011901	CCA	3	9	212087	212095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933380
4524	NC_011901	TGA	2	6	212117	212122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933380
4525	NC_011901	GCG	2	6	212130	212135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933380
4526	NC_011901	CCA	2	6	212258	212263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933380
4527	NC_011901	TGG	2	6	212270	212275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933380
4528	NC_011901	CGC	2	6	212276	212281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933380
4529	NC_011901	TGG	2	6	212299	212304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933380
4530	NC_011901	GCG	3	9	212305	212313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933380
4531	NC_011901	GGC	2	6	212367	212372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933380
4532	NC_011901	GCGG	2	8	212379	212386	0 %	0 %	75 %	25 %	220933380
4533	NC_011901	CCG	2	6	212395	212400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933380
4534	NC_011901	GGC	2	6	212411	212416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933380
4535	NC_011901	CCA	2	6	212420	212425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933380
4536	NC_011901	CAG	2	6	212445	212450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4537	NC_011901	GCA	2	6	212495	212500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4538	NC_011901	TGG	2	6	212536	212541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933380
4539	NC_011901	GTC	2	6	212565	212570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4540	NC_011901	TGGGC	2	10	212582	212591	0 %	20 %	60 %	20 %	220933380
4541	NC_011901	CGT	2	6	212615	212620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4542	NC_011901	GCC	2	6	212676	212681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933380
4543	NC_011901	AG	3	6	212700	212705	50 %	0 %	50 %	0 %	220933380
4544	NC_011901	GTCCGT	2	12	212760	212771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933380
4545	NC_011901	CAT	2	6	212872	212877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933381
4546	NC_011901	CGC	2	6	212913	212918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933381
4547	NC_011901	TGA	2	6	213009	213014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933381
4548	NC_011901	CCGT	2	8	213071	213078	0 %	25 %	25 %	50 %	220933381
4549	NC_011901	TGT	2	6	213123	213128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933381
4550	NC_011901	CAC	2	6	213181	213186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933381
4551	NC_011901	GC	3	6	213203	213208	0 %	0 %	50 %	50 %	220933381
4552	NC_011901	CAG	2	6	213247	213252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933381
4553	NC_011901	CGC	2	6	213255	213260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933381
4554	NC_011901	GTCG	2	8	213348	213355	0 %	25 %	50 %	25 %	220933381
4555	NC_011901	GTC	2	6	213376	213381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933381
4556	NC_011901	GGC	2	6	213400	213405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933381
4557	NC_011901	CAC	2	6	213427	213432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933381
4558	NC_011901	AGGG	2	8	213479	213486	25 %	0 %	75 %	0 %	220933381
4559	NC_011901	CTC	2	6	213493	213498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933381
4560	NC_011901	GCC	2	6	213544	213549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933381
4561	NC_011901	GTA	2	6	213580	213585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933381
4562	NC_011901	CAC	2	6	213640	213645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933381
4563	NC_011901	CAC	2	6	213718	213723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933381
4564	NC_011901	GCGG	2	8	213767	213774	0 %	0 %	75 %	25 %	220933381
4565	NC_011901	CGGGTG	2	12	213795	213806	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933381
4566	NC_011901	GGGC	2	8	213834	213841	0 %	0 %	75 %	25 %	220933381
4567	NC_011901	CCG	2	6	213857	213862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933381
4568	NC_011901	GGAT	2	8	213917	213924	25 %	25 %	50 %	0 %	220933381
4569	NC_011901	CAT	2	6	213931	213936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933381
4570	NC_011901	GC	3	6	214162	214167	0 %	0 %	50 %	50 %	220933382
4571	NC_011901	CGA	3	9	214186	214194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933382
4572	NC_011901	CGC	2	6	214199	214204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933382
4573	NC_011901	TGG	2	6	214206	214211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933382
4574	NC_011901	ACG	2	6	214233	214238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933382
4575	NC_011901	GCC	2	6	214256	214261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933382
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4577	NC_011901	TCA	2	6	214332	214337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933382
4578	NC_011901	GAG	3	9	214364	214372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933382
4579	NC_011901	GCGCC	2	10	214417	214426	0 %	0 %	40 %	60 %	220933382
4580	NC_011901	CGGGTG	2	12	214430	214441	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220933382
4581	NC_011901	CTG	2	6	214490	214495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933382
4582	NC_011901	CGC	2	6	214557	214562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933382
4583	NC_011901	A	6	6	214583	214588	100 %	0 %	0 %	0 %	220933382
4584	NC_011901	GCA	2	6	214636	214641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933382
4585	NC_011901	TGCCG	2	10	214924	214933	0 %	20 %	40 %	40 %	220933383
4586	NC_011901	GTG	2	6	214967	214972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933383
4587	NC_011901	GGGCGC	2	12	215003	215014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933383
4588	NC_011901	AGC	2	6	215070	215075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933383
4589	NC_011901	GCC	2	6	215144	215149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933383
4590	NC_011901	CTG	2	6	215219	215224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933383
4591	NC_011901	GGCGC	2	10	215232	215241	0 %	0 %	60 %	40 %	220933383
4592	NC_011901	TGC	2	6	215331	215336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933383
4593	NC_011901	TGC	2	6	215415	215420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933383
4594	NC_011901	GGCC	2	8	215443	215450	0 %	0 %	50 %	50 %	220933383
4595	NC_011901	AGGCGG	2	12	215508	215519	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220933383
4596	NC_011901	CCG	3	9	215538	215546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933383
4597	NC_011901	GC	3	6	215563	215568	0 %	0 %	50 %	50 %	220933383
4598	NC_011901	CACC	2	8	215593	215600	25 %	0 %	0 %	75 %	220933383
4599	NC_011901	GCC	2	6	215627	215632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933383
4600	NC_011901	GTG	2	6	215672	215677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933383
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4602	NC_011901	GGC	2	6	215750	215755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933383
4603	NC_011901	CGG	2	6	215766	215771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933383
4604	NC_011901	GGT	2	6	215776	215781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933383
4605	NC_011901	GCT	2	6	215794	215799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933383
4606	NC_011901	CGG	2	6	215812	215817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933383
4607	NC_011901	C	6	6	215956	215961	0 %	0 %	0 %	100 %	220933384
4608	NC_011901	GTC	2	6	215991	215996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
4609	NC_011901	CCTC	2	8	216007	216014	0 %	25 %	0 %	75 %	220933384
4610	NC_011901	TGC	2	6	216022	216027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
4611	NC_011901	CGC	2	6	216028	216033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933384
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4613	NC_011901	CTG	2	6	216132	216137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
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4616	NC_011901	GGT	2	6	216287	216292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933384
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4619	NC_011901	GCC	2	6	216555	216560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933384
4620	NC_011901	GGC	2	6	216575	216580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933384
4621	NC_011901	CGG	2	6	216640	216645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933384
4622	NC_011901	GGC	2	6	216653	216658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933384
4623	NC_011901	GCT	2	6	216662	216667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
4624	NC_011901	GCG	2	6	216705	216710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933384
4625	NC_011901	CTG	2	6	216732	216737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
4626	NC_011901	TGGATG	2	12	216772	216783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220933384
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4628	NC_011901	TGG	2	6	216841	216846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933384
4629	NC_011901	GCG	2	6	216883	216888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933384
4630	NC_011901	CTG	2	6	216903	216908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
4631	NC_011901	GCT	2	6	216959	216964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
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4633	NC_011901	CTG	2	6	217011	217016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
4634	NC_011901	CTG	2	6	217032	217037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
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4636	NC_011901	GCT	2	6	217073	217078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933384
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4641	NC_011901	TGCC	2	8	217314	217321	0 %	25 %	25 %	50 %	220933385
4642	NC_011901	CCGCGC	2	12	217323	217334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933385
4643	NC_011901	CG	3	6	217366	217371	0 %	0 %	50 %	50 %	220933385
4644	NC_011901	CGGG	2	8	217383	217390	0 %	0 %	75 %	25 %	220933385
4645	NC_011901	CTA	2	6	217393	217398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933385
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4647	NC_011901	GGCT	2	8	217505	217512	0 %	25 %	50 %	25 %	220933385
4648	NC_011901	CCA	2	6	217530	217535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933385
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4650	NC_011901	CAG	2	6	217610	217615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933385
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4652	NC_011901	TCCC	2	8	217630	217637	0 %	25 %	0 %	75 %	220933385
4653	NC_011901	ACC	2	6	217643	217648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933385
4654	NC_011901	CTG	2	6	217673	217678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933385
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4661	NC_011901	CGCTG	2	10	217821	217830	0 %	20 %	40 %	40 %	220933385
4662	NC_011901	CTG	2	6	217849	217854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933386
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4741	NC_011901	GGC	2	6	220800	220805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933387
4742	NC_011901	GACGTG	2	12	220818	220829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220933387
4743	NC_011901	GTG	2	6	220833	220838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933387
4744	NC_011901	GCC	2	6	220839	220844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933387
4745	NC_011901	CTA	2	6	220898	220903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933387
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4747	NC_011901	GGA	2	6	220952	220957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933387
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4753	NC_011901	GTG	2	6	221094	221099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933387
4754	NC_011901	CTG	2	6	221106	221111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933387
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4762	NC_011901	GCG	2	6	221383	221388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933387
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4854	NC_011901	CG	3	6	224685	224690	0 %	0 %	50 %	50 %	220933390
4855	NC_011901	CTG	2	6	224692	224697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933390
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4982	NC_011901	GCC	2	6	229790	229795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933396
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4985	NC_011901	GCC	3	9	229939	229947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933396
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