MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 26898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011653	CTG	2	6	693	698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555126
2	NC_011653	ATT	2	6	701	706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
3	NC_011653	CTT	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
4	NC_011653	CCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555126
5	NC_011653	TCC	2	6	764	769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254555126
6	NC_011653	TCT	2	6	815	820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
7	NC_011653	TCT	2	6	959	964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
8	NC_011653	TAT	2	6	976	981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
9	NC_011653	TAA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555126
10	NC_011653	TTG	2	6	1131	1136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555126
11	NC_011653	TTA	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
12	NC_011653	TTA	2	6	1203	1208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
13	NC_011653	ATC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555126
14	NC_011653	AGT	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555126
15	NC_011653	ACT	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555126
16	NC_011653	TTC	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555126
17	NC_011653	TAT	2	6	1458	1463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555126
18	NC_011653	CAT	2	6	1504	1509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555126
19	NC_011653	TCT	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
20	NC_011653	AAT	2	6	1722	1727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076134
21	NC_011653	TTA	2	6	1730	1735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076134
22	NC_011653	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
23	NC_011653	TTC	2	6	1824	1829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
24	NC_011653	TAA	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076134
25	NC_011653	TAT	2	6	1982	1987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076134
26	NC_011653	TAT	3	9	2078	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076134
27	NC_011653	TTC	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076134
28	NC_011653	CAA	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076134
29	NC_011653	CAT	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076134
30	NC_011653	CAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076135
31	NC_011653	TTG	2	6	2231	2236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076135
32	NC_011653	ATT	3	9	2259	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
33	NC_011653	TGA	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076135
34	NC_011653	TAT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
35	NC_011653	TTG	2	6	2612	2617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076135
36	NC_011653	CAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076135
37	NC_011653	ATT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
38	NC_011653	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
39	NC_011653	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076135
40	NC_011653	TTG	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076135
41	NC_011653	TTC	2	6	2867	2872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076135
42	NC_011653	TAA	3	9	2971	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076135
43	NC_011653	ATT	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
44	NC_011653	TCA	2	6	3567	3572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076135
45	NC_011653	AAT	2	6	3574	3579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076135
46	NC_011653	ATT	2	6	3672	3677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
47	NC_011653	TCA	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076135
48	NC_011653	ATT	3	9	3836	3844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
49	NC_011653	CAA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076135
50	NC_011653	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076135
51	NC_011653	ATC	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076136
52	NC_011653	TCA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076136
53	NC_011653	ATA	2	6	4167	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076136
54	NC_011653	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076136
55	NC_011653	AGA	2	6	4252	4257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076136
56	NC_011653	AAT	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
57	NC_011653	TCT	2	6	4399	4404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
58	NC_011653	TTC	2	6	4472	4477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
59	NC_011653	TCA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
60	NC_011653	AAT	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
61	NC_011653	TTA	2	6	4633	4638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
62	NC_011653	TAA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
63	NC_011653	TTA	2	6	4703	4708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
64	NC_011653	ATC	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
65	NC_011653	ATT	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
66	NC_011653	ATT	2	6	4749	4754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
67	NC_011653	TCT	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
68	NC_011653	TAA	2	6	4811	4816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
69	NC_011653	TTA	2	6	4829	4834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
70	NC_011653	TCA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
71	NC_011653	TCA	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
72	NC_011653	GAA	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076137
73	NC_011653	ATA	4	12	4971	4982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
74	NC_011653	TAT	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
75	NC_011653	TAA	2	6	5235	5240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
76	NC_011653	ATT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
77	NC_011653	ATT	2	6	5475	5480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
78	NC_011653	AAT	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
79	NC_011653	ATT	2	6	5559	5564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
80	NC_011653	TAT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
81	NC_011653	ATT	2	6	5745	5750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
82	NC_011653	TCT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
83	NC_011653	TAA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
84	NC_011653	ATA	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076137
85	NC_011653	ATT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
86	NC_011653	TCT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076137
87	NC_011653	TTA	2	6	6016	6021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076137
88	NC_011653	ATC	2	6	6028	6033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
89	NC_011653	AGC	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076137
90	NC_011653	TCA	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076137
91	NC_011653	AGA	2	6	6336	6341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076137
92	NC_011653	TTC	2	6	6803	6808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076138
93	NC_011653	ATT	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
94	NC_011653	CTT	2	6	6941	6946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
95	NC_011653	TAT	2	6	6976	6981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
96	NC_011653	TTC	2	6	7034	7039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
97	NC_011653	ATT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
98	NC_011653	AGC	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076139
99	NC_011653	TAA	3	9	7225	7233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076139
100	NC_011653	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076139
101	NC_011653	ATT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
102	NC_011653	TCA	2	6	7467	7472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076139
103	NC_011653	AAT	2	6	7474	7479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076139
104	NC_011653	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
105	NC_011653	CTT	2	6	7624	7629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
106	NC_011653	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
107	NC_011653	TCT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
108	NC_011653	TCT	2	6	7670	7675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
109	NC_011653	TCA	2	6	7830	7835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076139
110	NC_011653	ATT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
111	NC_011653	TAG	2	6	7903	7908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076139
112	NC_011653	AAC	2	6	7992	7997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076139
113	NC_011653	AAG	2	6	8087	8092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076139
114	NC_011653	ACA	2	6	8103	8108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076139
115	NC_011653	TTC	2	6	8132	8137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
116	NC_011653	ATC	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076139
117	NC_011653	TTC	2	6	8303	8308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
118	NC_011653	CTT	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
119	NC_011653	ACT	2	6	8442	8447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076139
120	NC_011653	TCT	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
121	NC_011653	CTC	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076139
122	NC_011653	TTC	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076139
123	NC_011653	AAT	2	6	8731	8736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076139
124	NC_011653	ATT	2	6	8756	8761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
125	NC_011653	TAA	2	6	8813	8818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076139
126	NC_011653	GTA	2	6	8843	8848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076139
127	NC_011653	AAT	2	6	8972	8977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076139
128	NC_011653	CAA	2	6	9049	9054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076139
129	NC_011653	ATT	2	6	9062	9067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
130	NC_011653	CAT	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076139
131	NC_011653	TTA	2	6	9126	9131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076139
132	NC_011653	TGA	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076139
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258	NC_011653	AAT	2	6	17482	17487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076149
259	NC_011653	CAA	2	6	17492	17497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076149
260	NC_011653	GAT	2	6	17506	17511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076149
261	NC_011653	TAA	2	6	17538	17543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076149
262	NC_011653	CAA	2	6	17555	17560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076149
263	NC_011653	TTA	2	6	17883	17888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
264	NC_011653	TTA	2	6	17912	17917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
265	NC_011653	AAC	2	6	17981	17986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076150
266	NC_011653	TTC	2	6	17998	18003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076150
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268	NC_011653	ATT	2	6	18171	18176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076150
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270	NC_011653	ATA	2	6	18439	18444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076150
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272	NC_011653	TCA	2	6	18600	18605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076151
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279	NC_011653	TAA	2	6	18929	18934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
280	NC_011653	ATA	2	6	18988	18993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
281	NC_011653	AAT	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076151
282	NC_011653	TGA	3	9	19340	19348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076151
283	NC_011653	ATT	2	6	19359	19364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076151
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291	NC_011653	CTA	2	6	19990	19995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076152
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294	NC_011653	AAT	2	6	20331	20336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076152
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381	NC_011653	CTA	2	6	25863	25868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076158
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