MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 47428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011653	CAA	2	6	114306	114311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076252
3002	NC_011653	AAAT	2	8	114321	114328	75 %	25 %	0 %	0 %	217076252
3003	NC_011653	T	6	6	114354	114359	0 %	100 %	0 %	0 %	217076252
3004	NC_011653	A	6	6	114366	114371	100 %	0 %	0 %	0 %	217076252
3005	NC_011653	T	6	6	114383	114388	0 %	100 %	0 %	0 %	217076252
3006	NC_011653	ATT	2	6	114436	114441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076252
3007	NC_011653	TTTAA	2	10	114443	114452	40 %	60 %	0 %	0 %	217076252
3008	NC_011653	TA	3	6	114493	114498	50 %	50 %	0 %	0 %	217076252
3009	NC_011653	ATT	2	6	114502	114507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076252
3010	NC_011653	T	6	6	114506	114511	0 %	100 %	0 %	0 %	217076252
3011	NC_011653	CAA	2	6	114543	114548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076252
3012	NC_011653	ATC	2	6	114580	114585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076252
3013	NC_011653	AT	3	6	114604	114609	50 %	50 %	0 %	0 %	217076252
3014	NC_011653	TTATCA	2	12	114611	114622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076252
3015	NC_011653	ATA	2	6	114638	114643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076252
3016	NC_011653	TA	3	6	114747	114752	50 %	50 %	0 %	0 %	217076252
3017	NC_011653	T	6	6	114817	114822	0 %	100 %	0 %	0 %	217076252
3018	NC_011653	ATC	2	6	114844	114849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076252
3019	NC_011653	TAT	2	6	114878	114883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076253
3020	NC_011653	TTTCC	2	10	114892	114901	0 %	60 %	0 %	40 %	217076253
3021	NC_011653	TA	3	6	114908	114913	50 %	50 %	0 %	0 %	217076253
3022	NC_011653	TTCT	2	8	114952	114959	0 %	75 %	0 %	25 %	217076253
3023	NC_011653	TA	3	6	114984	114989	50 %	50 %	0 %	0 %	217076253
3024	NC_011653	TAT	2	6	115000	115005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076253
3025	NC_011653	ATC	2	6	115043	115048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076253
3026	NC_011653	ATC	2	6	115058	115063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076253
3027	NC_011653	T	8	8	115072	115079	0 %	100 %	0 %	0 %	217076253
3028	NC_011653	T	7	7	115094	115100	0 %	100 %	0 %	0 %	217076253
3029	NC_011653	GCA	2	6	115123	115128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076253
3030	NC_011653	ATC	2	6	115167	115172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076253
3031	NC_011653	AAAT	2	8	115197	115204	75 %	25 %	0 %	0 %	217076253
3032	NC_011653	TTCT	2	8	115240	115247	0 %	75 %	0 %	25 %	217076253
3033	NC_011653	ATT	2	6	115250	115255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076253
3034	NC_011653	TA	3	6	115277	115282	50 %	50 %	0 %	0 %	217076253
3035	NC_011653	TCT	2	6	115335	115340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076253
3036	NC_011653	TAA	2	6	115352	115357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076253
3037	NC_011653	TAA	2	6	115378	115383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076253
3038	NC_011653	A	6	6	115406	115411	100 %	0 %	0 %	0 %	217076253
3039	NC_011653	TTC	2	6	115558	115563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076254
3040	NC_011653	ATTT	2	8	115569	115576	25 %	75 %	0 %	0 %	217076254
3041	NC_011653	T	6	6	115574	115579	0 %	100 %	0 %	0 %	217076254
3042	NC_011653	TAT	2	6	115674	115679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076254
3043	NC_011653	ATTCT	2	10	115728	115737	20 %	60 %	0 %	20 %	217076254
3044	NC_011653	CCT	2	6	115838	115843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076254
3045	NC_011653	TGC	2	6	115894	115899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076254
3046	NC_011653	CAA	2	6	115917	115922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076254
3047	NC_011653	TATT	2	8	115926	115933	25 %	75 %	0 %	0 %	217076254
3048	NC_011653	CTTT	2	8	116031	116038	0 %	75 %	0 %	25 %	217076254
3049	NC_011653	ATC	2	6	116053	116058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076254
3050	NC_011653	TCA	2	6	116123	116128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076254
3051	NC_011653	TAT	2	6	116182	116187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076254
3052	NC_011653	TA	3	6	116203	116208	50 %	50 %	0 %	0 %	217076254
3053	NC_011653	ATT	2	6	116224	116229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076254
3054	NC_011653	AAC	2	6	116230	116235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076254
3055	NC_011653	T	7	7	116237	116243	0 %	100 %	0 %	0 %	217076254
3056	NC_011653	ATA	2	6	116248	116253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076254
3057	NC_011653	ATT	2	6	116276	116281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076254
3058	NC_011653	CCT	2	6	116295	116300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076255
3059	NC_011653	CAAAAT	2	12	116327	116338	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217076255
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3061	NC_011653	TGC	2	6	116348	116353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076255
3062	NC_011653	TA	3	6	116406	116411	50 %	50 %	0 %	0 %	217076255
3063	NC_011653	A	6	6	116437	116442	100 %	0 %	0 %	0 %	217076255
3064	NC_011653	TAG	2	6	116458	116463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076255
3065	NC_011653	A	6	6	116467	116472	100 %	0 %	0 %	0 %	217076255
3066	NC_011653	TAA	2	6	116525	116530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076255
3067	NC_011653	GTA	2	6	116538	116543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076255
3068	NC_011653	TAA	2	6	116564	116569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076255
3069	NC_011653	GTTTC	2	10	116583	116592	0 %	60 %	20 %	20 %	217076255
3070	NC_011653	CTT	2	6	116650	116655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076255
3071	NC_011653	TTG	2	6	116656	116661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076255
3072	NC_011653	ATT	2	6	116670	116675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076255
3073	NC_011653	CTA	2	6	116812	116817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076255
3074	NC_011653	TCT	2	6	116827	116832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076255
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3078	NC_011653	ACT	3	9	117042	117050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076255
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3080	NC_011653	ATAA	2	8	117119	117126	75 %	25 %	0 %	0 %	217076256
3081	NC_011653	TAA	2	6	117147	117152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076256
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3083	NC_011653	A	6	6	117252	117257	100 %	0 %	0 %	0 %	217076256
3084	NC_011653	TGC	2	6	117273	117278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076256
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3089	NC_011653	TTAA	2	8	117346	117353	50 %	50 %	0 %	0 %	217076256
3090	NC_011653	GTA	2	6	117388	117393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076256
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3092	NC_011653	AATT	2	8	117429	117436	50 %	50 %	0 %	0 %	217076256
3093	NC_011653	AAAG	2	8	117496	117503	75 %	0 %	25 %	0 %	217076256
3094	NC_011653	TAA	3	9	117623	117631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076256
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3097	NC_011653	TAA	2	6	117707	117712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076256
3098	NC_011653	TGA	2	6	117714	117719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076256
3099	NC_011653	AAGTA	2	10	117732	117741	60 %	20 %	20 %	0 %	217076256
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3101	NC_011653	TCA	2	6	117803	117808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076256
3102	NC_011653	CAA	2	6	117827	117832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076256
3103	NC_011653	CTT	2	6	117845	117850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076256
3104	NC_011653	TAAATA	2	12	117851	117862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076256
3105	NC_011653	ACA	2	6	117890	117895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076256
3106	NC_011653	A	6	6	117900	117905	100 %	0 %	0 %	0 %	217076256
3107	NC_011653	ATA	2	6	117927	117932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076256
3108	NC_011653	ATTT	2	8	117946	117953	25 %	75 %	0 %	0 %	217076256
3109	NC_011653	CTA	2	6	117994	117999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076257
3110	NC_011653	T	6	6	118010	118015	0 %	100 %	0 %	0 %	217076257
3111	NC_011653	ATC	2	6	118049	118054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076257
3112	NC_011653	CAA	2	6	118078	118083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076257
3113	NC_011653	TCT	2	6	118173	118178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076257
3114	NC_011653	ATT	2	6	118217	118222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076257
3115	NC_011653	T	6	6	118221	118226	0 %	100 %	0 %	0 %	217076257
3116	NC_011653	T	6	6	118279	118284	0 %	100 %	0 %	0 %	217076257
3117	NC_011653	TA	3	6	118410	118415	50 %	50 %	0 %	0 %	217076257
3118	NC_011653	AT	3	6	118435	118440	50 %	50 %	0 %	0 %	217076257
3119	NC_011653	TTTA	2	8	118457	118464	25 %	75 %	0 %	0 %	217076257
3120	NC_011653	CAA	2	6	118489	118494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076257
3121	NC_011653	T	6	6	118511	118516	0 %	100 %	0 %	0 %	217076257
3122	NC_011653	T	6	6	118528	118533	0 %	100 %	0 %	0 %	217076257
3123	NC_011653	CTTT	2	8	118542	118549	0 %	75 %	0 %	25 %	217076257
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