MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 47428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011653	TAT	2	6	59134	59139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076189
1502	NC_011653	ATT	2	6	59169	59174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076190
1503	NC_011653	A	6	6	59187	59192	100 %	0 %	0 %	0 %	217076190
1504	NC_011653	ACG	2	6	59197	59202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076190
1505	NC_011653	AT	3	6	59213	59218	50 %	50 %	0 %	0 %	217076190
1506	NC_011653	ATA	2	6	59244	59249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076190
1507	NC_011653	TC	3	6	59258	59263	0 %	50 %	0 %	50 %	217076190
1508	NC_011653	AGC	2	6	59264	59269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076190
1509	NC_011653	TTA	2	6	59271	59276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076190
1510	NC_011653	GAG	2	6	59334	59339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217076190
1511	NC_011653	TAA	2	6	59443	59448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076190
1512	NC_011653	GTAT	2	8	59503	59510	25 %	50 %	25 %	0 %	217076190
1513	NC_011653	AT	3	6	59531	59536	50 %	50 %	0 %	0 %	217076190
1514	NC_011653	TGA	2	6	59549	59554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076190
1515	NC_011653	TAA	2	6	59587	59592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076190
1516	NC_011653	AT	3	6	59617	59622	50 %	50 %	0 %	0 %	217076190
1517	NC_011653	ATAGAA	2	12	59632	59643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217076190
1518	NC_011653	TGA	2	6	59651	59656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076190
1519	NC_011653	GTT	3	9	59703	59711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076190
1520	NC_011653	TTG	2	6	59785	59790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076190
1521	NC_011653	ACT	2	6	59799	59804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076190
1522	NC_011653	A	7	7	59901	59907	100 %	0 %	0 %	0 %	217076190
1523	NC_011653	AAT	3	9	59947	59955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076190
1524	NC_011653	TTAATT	2	12	60062	60073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076191
1525	NC_011653	CTT	2	6	60155	60160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076191
1526	NC_011653	CTG	2	6	60181	60186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076191
1527	NC_011653	CTTT	2	8	60193	60200	0 %	75 %	0 %	25 %	217076191
1528	NC_011653	CATA	2	8	60268	60275	50 %	25 %	0 %	25 %	217076191
1529	NC_011653	ATC	2	6	60276	60281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076191
1530	NC_011653	CCA	2	6	60358	60363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076191
1531	NC_011653	TA	3	6	60416	60421	50 %	50 %	0 %	0 %	217076191
1532	NC_011653	A	6	6	60421	60426	100 %	0 %	0 %	0 %	217076191
1533	NC_011653	TAT	2	6	60443	60448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076191
1534	NC_011653	CTTG	2	8	60460	60467	0 %	50 %	25 %	25 %	217076191
1535	NC_011653	AAT	2	6	60559	60564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076191
1536	NC_011653	CTT	2	6	60605	60610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076191
1537	NC_011653	TGCTC	2	10	60700	60709	0 %	40 %	20 %	40 %	217076191
1538	NC_011653	T	6	6	60779	60784	0 %	100 %	0 %	0 %	217076191
1539	NC_011653	TAA	2	6	60866	60871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076191
1540	NC_011653	CAA	2	6	60881	60886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076191
1541	NC_011653	CTT	2	6	60911	60916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076191
1542	NC_011653	T	6	6	60936	60941	0 %	100 %	0 %	0 %	217076191
1543	NC_011653	TC	3	6	60957	60962	0 %	50 %	0 %	50 %	217076192
1544	NC_011653	CTT	2	6	61012	61017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076192
1545	NC_011653	AAC	2	6	61032	61037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076192
1546	NC_011653	ATT	2	6	61051	61056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076192
1547	NC_011653	TTCT	2	8	61076	61083	0 %	75 %	0 %	25 %	217076192
1548	NC_011653	TTC	2	6	61106	61111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076192
1549	NC_011653	TC	3	6	61179	61184	0 %	50 %	0 %	50 %	217076192
1550	NC_011653	CTT	2	6	61193	61198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076192
1551	NC_011653	AAT	2	6	61269	61274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076192
1552	NC_011653	TATAC	2	10	61314	61323	40 %	40 %	0 %	20 %	217076193
1553	NC_011653	AAT	2	6	61348	61353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076193
1554	NC_011653	CTG	2	6	61359	61364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076193
1555	NC_011653	TTC	3	9	61503	61511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076193
1556	NC_011653	TCT	2	6	61595	61600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076193
1557	NC_011653	TC	3	6	61682	61687	0 %	50 %	0 %	50 %	217076193
1558	NC_011653	T	6	6	61703	61708	0 %	100 %	0 %	0 %	217076193
1559	NC_011653	GCAG	2	8	61724	61731	25 %	0 %	50 %	25 %	217076193
1560	NC_011653	ATT	2	6	61732	61737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076193
1561	NC_011653	ATA	2	6	61744	61749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076193
1562	NC_011653	T	6	6	61750	61755	0 %	100 %	0 %	0 %	217076193
1563	NC_011653	CTG	2	6	61809	61814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076193
1564	NC_011653	ATT	2	6	61820	61825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076193
1565	NC_011653	CTTA	2	8	61873	61880	25 %	50 %	0 %	25 %	217076193
1566	NC_011653	CAT	2	6	61882	61887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076193
1567	NC_011653	TCA	2	6	61932	61937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076194
1568	NC_011653	TTCT	2	8	61940	61947	0 %	75 %	0 %	25 %	217076194
1569	NC_011653	AAAT	2	8	61952	61959	75 %	25 %	0 %	0 %	217076194
1570	NC_011653	TCT	2	6	61964	61969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076194
1571	NC_011653	CTTC	2	8	61994	62001	0 %	50 %	0 %	50 %	217076194
1572	NC_011653	AAT	2	6	62034	62039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076194
1573	NC_011653	GAT	2	6	62089	62094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076194
1574	NC_011653	TAA	2	6	62096	62101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076194
1575	NC_011653	TCA	2	6	62133	62138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076194
1576	NC_011653	ATCA	2	8	62171	62178	50 %	25 %	0 %	25 %	217076194
1577	NC_011653	CCA	2	6	62199	62204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076194
1578	NC_011653	TCA	2	6	62232	62237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076194
1579	NC_011653	TCA	2	6	62259	62264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076194
1580	NC_011653	ATT	2	6	62286	62291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076194
1581	NC_011653	ATT	2	6	62330	62335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076194
1582	NC_011653	TCCT	2	8	62341	62348	0 %	50 %	0 %	50 %	217076194
1583	NC_011653	CCG	2	6	62445	62450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217076194
1584	NC_011653	ATC	2	6	62462	62467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076194
1585	NC_011653	TC	3	6	62496	62501	0 %	50 %	0 %	50 %	217076194
1586	NC_011653	T	7	7	62561	62567	0 %	100 %	0 %	0 %	217076194
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1588	NC_011653	T	7	7	62643	62649	0 %	100 %	0 %	0 %	217076195
1589	NC_011653	TATAA	2	10	62668	62677	60 %	40 %	0 %	0 %	217076195
1590	NC_011653	TCT	2	6	62705	62710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076195
1591	NC_011653	TTATTT	2	12	62711	62722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217076195
1592	NC_011653	ACT	2	6	62723	62728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076195
1593	NC_011653	CAT	2	6	62733	62738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076195
1594	NC_011653	TAC	2	6	62739	62744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076195
1595	NC_011653	TCA	2	6	62759	62764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076195
1596	NC_011653	ACA	2	6	62765	62770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076195
1597	NC_011653	TCA	2	6	62789	62794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076195
1598	NC_011653	ATA	2	6	62824	62829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076195
1599	NC_011653	AT	3	6	62867	62872	50 %	50 %	0 %	0 %	217076195
1600	NC_011653	ATTTA	2	10	62920	62929	40 %	60 %	0 %	0 %	217076195
1601	NC_011653	ATG	2	6	62930	62935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076195
1602	NC_011653	TTGTT	2	10	62983	62992	0 %	80 %	20 %	0 %	217076195
1603	NC_011653	T	6	6	62991	62996	0 %	100 %	0 %	0 %	217076195
1604	NC_011653	AAT	2	6	63028	63033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076195
1605	NC_011653	TGCAAC	2	12	63100	63111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217076195
1606	NC_011653	ATC	2	6	63143	63148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076195
1607	NC_011653	ACC	2	6	63151	63156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076196
1608	NC_011653	GTT	2	6	63168	63173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076196
1609	NC_011653	TTC	2	6	63218	63223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076196
1610	NC_011653	T	6	6	63280	63285	0 %	100 %	0 %	0 %	217076196
1611	NC_011653	TTC	2	6	63291	63296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076196
1612	NC_011653	T	6	6	63325	63330	0 %	100 %	0 %	0 %	217076196
1613	NC_011653	ATTT	2	8	63367	63374	25 %	75 %	0 %	0 %	217076196
1614	NC_011653	TCC	2	6	63375	63380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076197
1615	NC_011653	TCA	2	6	63399	63404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076197
1616	NC_011653	ATCAAC	2	12	63491	63502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	217076197
1617	NC_011653	AT	3	6	63510	63515	50 %	50 %	0 %	0 %	217076197
1618	NC_011653	TCT	2	6	63566	63571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076197
1619	NC_011653	CAA	4	12	63583	63594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076197
1620	NC_011653	TTTC	2	8	63614	63621	0 %	75 %	0 %	25 %	217076197
1621	NC_011653	T	6	6	63669	63674	0 %	100 %	0 %	0 %	217076198
1622	NC_011653	T	6	6	63712	63717	0 %	100 %	0 %	0 %	217076198
1623	NC_011653	TCA	2	6	63726	63731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076198
1624	NC_011653	T	7	7	63732	63738	0 %	100 %	0 %	0 %	217076198
1625	NC_011653	AAG	2	6	63757	63762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076198
1626	NC_011653	TTTA	2	8	63763	63770	25 %	75 %	0 %	0 %	217076198
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