MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 47428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011653	ATT	3	9	39264	39272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076168
1002	NC_011653	AGC	2	6	39329	39334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076168
1003	NC_011653	CCA	2	6	39414	39419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076168
1004	NC_011653	A	6	6	39425	39430	100 %	0 %	0 %	0 %	217076168
1005	NC_011653	TTG	2	6	39494	39499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076168
1006	NC_011653	AAT	2	6	39513	39518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076168
1007	NC_011653	CCAAT	2	10	39520	39529	40 %	20 %	0 %	40 %	217076168
1008	NC_011653	ATTA	2	8	39579	39586	50 %	50 %	0 %	0 %	217076168
1009	NC_011653	TTC	2	6	39616	39621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076169
1010	NC_011653	TCA	2	6	39627	39632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076169
1011	NC_011653	TCA	2	6	39635	39640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076169
1012	NC_011653	ACCA	2	8	39671	39678	50 %	0 %	0 %	50 %	217076169
1013	NC_011653	CCTTCA	2	12	39680	39691	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	217076169
1014	NC_011653	ATT	2	6	39730	39735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076169
1015	NC_011653	TGC	2	6	39778	39783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076169
1016	NC_011653	T	6	6	39817	39822	0 %	100 %	0 %	0 %	217076169
1017	NC_011653	CTT	2	6	39825	39830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076169
1018	NC_011653	CTT	2	6	39873	39878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076169
1019	NC_011653	T	6	6	39940	39945	0 %	100 %	0 %	0 %	217076169
1020	NC_011653	A	6	6	40221	40226	100 %	0 %	0 %	0 %	217076170
1021	NC_011653	TGATAT	2	12	40230	40241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217076170
1022	NC_011653	CTT	2	6	40268	40273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076170
1023	NC_011653	TAA	2	6	40310	40315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076170
1024	NC_011653	TAA	2	6	40373	40378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076170
1025	NC_011653	TAA	2	6	40407	40412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076170
1026	NC_011653	TAAT	2	8	40448	40455	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1027	NC_011653	AAG	2	6	40468	40473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076171
1028	NC_011653	AT	4	8	40484	40491	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1029	NC_011653	A	6	6	40498	40503	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1030	NC_011653	TA	3	6	40505	40510	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1031	NC_011653	AT	3	6	40582	40587	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1032	NC_011653	CTT	2	6	40712	40717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076171
1033	NC_011653	A	6	6	40731	40736	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1034	NC_011653	AT	3	6	40780	40785	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1035	NC_011653	AT	3	6	40801	40806	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1036	NC_011653	TAAG	2	8	40846	40853	50 %	25 %	25 %	0 %	217076171
1037	NC_011653	TAA	2	6	40874	40879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076171
1038	NC_011653	ATT	2	6	40882	40887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076171
1039	NC_011653	CTT	2	6	40896	40901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076171
1040	NC_011653	A	6	6	40903	40908	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1041	NC_011653	A	7	7	41022	41028	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1042	NC_011653	A	6	6	41097	41102	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1043	NC_011653	ATC	2	6	41113	41118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076171
1044	NC_011653	TCTT	2	8	41178	41185	0 %	75 %	0 %	25 %	217076171
1045	NC_011653	ATA	2	6	41212	41217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076171
1046	NC_011653	ATT	2	6	41287	41292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076171
1047	NC_011653	GCT	2	6	41308	41313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076171
1048	NC_011653	TCT	2	6	41332	41337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076171
1049	NC_011653	ACC	2	6	41391	41396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076171
1050	NC_011653	ACC	2	6	41400	41405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076171
1051	NC_011653	AAT	2	6	41483	41488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076171
1052	NC_011653	AT	3	6	41492	41497	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1053	NC_011653	ATATA	2	10	41534	41543	60 %	40 %	0 %	0 %	217076171
1054	NC_011653	ATA	2	6	41545	41550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076171
1055	NC_011653	CTA	2	6	41552	41557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076171
1056	NC_011653	TG	3	6	41579	41584	0 %	50 %	50 %	0 %	217076171
1057	NC_011653	TCAT	2	8	41605	41612	25 %	50 %	0 %	25 %	217076171
1058	NC_011653	TA	3	6	41619	41624	50 %	50 %	0 %	0 %	217076171
1059	NC_011653	ATT	2	6	41631	41636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076171
1060	NC_011653	CTT	2	6	41648	41653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076171
1061	NC_011653	TTA	2	6	41749	41754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076171
1062	NC_011653	GCA	2	6	41788	41793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076171
1063	NC_011653	TAAA	2	8	41807	41814	75 %	25 %	0 %	0 %	217076171
1064	NC_011653	T	7	7	41888	41894	0 %	100 %	0 %	0 %	217076171
1065	NC_011653	TAC	2	6	41964	41969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076171
1066	NC_011653	TCA	2	6	42031	42036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076171
1067	NC_011653	TAA	2	6	42129	42134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076171
1068	NC_011653	A	7	7	42152	42158	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1069	NC_011653	A	6	6	42160	42165	100 %	0 %	0 %	0 %	217076171
1070	NC_011653	TCA	2	6	42181	42186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076171
1071	NC_011653	TGA	2	6	42195	42200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076171
1072	NC_011653	ATGTA	2	10	42231	42240	40 %	40 %	20 %	0 %	217076171
1073	NC_011653	TTTCC	2	10	42241	42250	0 %	60 %	0 %	40 %	217076171
1074	NC_011653	TTAC	2	8	42271	42278	25 %	50 %	0 %	25 %	217076171
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1076	NC_011653	ATT	2	6	42404	42409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076172
1077	NC_011653	TAT	2	6	42444	42449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076172
1078	NC_011653	A	7	7	42452	42458	100 %	0 %	0 %	0 %	217076172
1079	NC_011653	AAT	2	6	42478	42483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076172
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1081	NC_011653	TCT	2	6	42526	42531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076172
1082	NC_011653	TCC	2	6	42532	42537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076172
1083	NC_011653	CAA	2	6	42546	42551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076172
1084	NC_011653	CAT	2	6	42564	42569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076172
1085	NC_011653	ATC	2	6	42592	42597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076172
1086	NC_011653	TAG	2	6	42615	42620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076172
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1090	NC_011653	TGAT	2	8	42765	42772	25 %	50 %	25 %	0 %	217076172
1091	NC_011653	TAGT	2	8	42980	42987	25 %	50 %	25 %	0 %	217076173
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1096	NC_011653	TGGAA	2	10	43080	43089	40 %	20 %	40 %	0 %	217076173
1097	NC_011653	ATT	2	6	43155	43160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076173
1098	NC_011653	TAA	3	9	43170	43178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076173
1099	NC_011653	CGA	2	6	43185	43190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076173
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1102	NC_011653	T	6	6	43271	43276	0 %	100 %	0 %	0 %	217076173
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1108	NC_011653	ATT	2	6	43501	43506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076174
1109	NC_011653	T	6	6	43557	43562	0 %	100 %	0 %	0 %	217076174
1110	NC_011653	ATC	2	6	43600	43605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076174
1111	NC_011653	AAT	2	6	43642	43647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076174
1112	NC_011653	TAT	2	6	43717	43722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076174
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1114	NC_011653	ATT	2	6	43762	43767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076174
1115	NC_011653	AAT	2	6	43819	43824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076174
1116	NC_011653	TCAA	2	8	44055	44062	50 %	25 %	0 %	25 %	217076175
1117	NC_011653	T	6	6	44136	44141	0 %	100 %	0 %	0 %	217076175
1118	NC_011653	ATCT	2	8	44144	44151	25 %	50 %	0 %	25 %	217076175
1119	NC_011653	T	6	6	44151	44156	0 %	100 %	0 %	0 %	217076175
1120	NC_011653	AAT	2	6	44157	44162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076175
1121	NC_011653	AAT	2	6	44204	44209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076175
1122	NC_011653	ATA	2	6	44234	44239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076175
1123	NC_011653	GCA	2	6	44251	44256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076175
1124	NC_011653	AT	3	6	44278	44283	50 %	50 %	0 %	0 %	217076175
1125	NC_011653	T	6	6	44313	44318	0 %	100 %	0 %	0 %	217076175
1126	NC_011653	ATT	2	6	44327	44332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076175
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