MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 47428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011653	CAT	2	6	196035	196040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076328
5002	NC_011653	AAAC	2	8	196071	196078	75 %	0 %	0 %	25 %	217076328
5003	NC_011653	CTG	2	6	196197	196202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076328
5004	NC_011653	ATT	3	9	196207	196215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076328
5005	NC_011653	T	6	6	196233	196238	0 %	100 %	0 %	0 %	217076328
5006	NC_011653	TCT	2	6	196256	196261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076328
5007	NC_011653	ATC	2	6	196336	196341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076328
5008	NC_011653	TTA	2	6	196395	196400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076328
5009	NC_011653	ATT	2	6	196445	196450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076328
5010	NC_011653	ACC	2	6	196456	196461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076328
5011	NC_011653	ACT	2	6	196517	196522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076328
5012	NC_011653	TTTTTC	2	12	196548	196559	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217076328
5013	NC_011653	ATCA	2	8	196567	196574	50 %	25 %	0 %	25 %	217076328
5014	NC_011653	CTTTAA	2	12	196601	196612	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217076329
5015	NC_011653	AAT	2	6	196624	196629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076329
5016	NC_011653	AACA	2	8	196659	196666	75 %	0 %	0 %	25 %	217076329
5017	NC_011653	AAT	2	6	196683	196688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076329
5018	NC_011653	ATA	2	6	196728	196733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076329
5019	NC_011653	CAAA	2	8	196772	196779	75 %	0 %	0 %	25 %	217076329
5020	NC_011653	TGC	2	6	196812	196817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076329
5021	NC_011653	TTC	2	6	196842	196847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076329
5022	NC_011653	ATAA	2	8	196860	196867	75 %	25 %	0 %	0 %	217076329
5023	NC_011653	AGT	2	6	196884	196889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076329
5024	NC_011653	ATA	2	6	196903	196908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076329
5025	NC_011653	TAA	2	6	196962	196967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076329
5026	NC_011653	TAT	2	6	196973	196978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076329
5027	NC_011653	GA	3	6	197070	197075	50 %	0 %	50 %	0 %	217076329
5028	NC_011653	CAC	2	6	197150	197155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076329
5029	NC_011653	AGC	2	6	197166	197171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076329
5030	NC_011653	GTT	2	6	197174	197179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076329
5031	NC_011653	TCA	2	6	197185	197190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076329
5032	NC_011653	TTAA	2	8	197206	197213	50 %	50 %	0 %	0 %	217076329
5033	NC_011653	ATC	2	6	197265	197270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076329
5034	NC_011653	T	7	7	197288	197294	0 %	100 %	0 %	0 %	217076329
5035	NC_011653	ACC	2	6	197316	197321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076329
5036	NC_011653	TTAA	2	8	197326	197333	50 %	50 %	0 %	0 %	217076329
5037	NC_011653	TCT	2	6	197335	197340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076329
5038	NC_011653	ACA	2	6	197407	197412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076329
5039	NC_011653	T	6	6	197503	197508	0 %	100 %	0 %	0 %	217076329
5040	NC_011653	CT	3	6	197529	197534	0 %	50 %	0 %	50 %	217076329
5041	NC_011653	TGT	2	6	197604	197609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076329
5042	NC_011653	ACCAA	2	10	197625	197634	60 %	0 %	0 %	40 %	217076329
5043	NC_011653	TGTT	2	8	197727	197734	0 %	75 %	25 %	0 %	217076329
5044	NC_011653	TCT	2	6	197794	197799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076329
5045	NC_011653	CCA	2	6	197860	197865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076329
5046	NC_011653	CTA	2	6	197890	197895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076329
5047	NC_011653	TTG	2	6	197927	197932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217076329
5048	NC_011653	AGC	2	6	197938	197943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076329
5049	NC_011653	GAAA	2	8	197944	197951	75 %	0 %	25 %	0 %	217076329
5050	NC_011653	TAA	2	6	197975	197980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076329
5051	NC_011653	TCT	2	6	198037	198042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076330
5052	NC_011653	TCT	2	6	198061	198066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076330
5053	NC_011653	AT	3	6	198097	198102	50 %	50 %	0 %	0 %	217076330
5054	NC_011653	GTA	2	6	198124	198129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076330
5055	NC_011653	T	7	7	198156	198162	0 %	100 %	0 %	0 %	217076330
5056	NC_011653	CAA	2	6	198179	198184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076330
5057	NC_011653	ACC	2	6	198186	198191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076330
5058	NC_011653	ATC	2	6	198229	198234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076330
5059	NC_011653	CTTT	2	8	198255	198262	0 %	75 %	0 %	25 %	217076330
5060	NC_011653	A	6	6	198277	198282	100 %	0 %	0 %	0 %	217076330
5061	NC_011653	CAT	2	6	198285	198290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076330
5062	NC_011653	A	6	6	198294	198299	100 %	0 %	0 %	0 %	217076330
5063	NC_011653	ACA	2	6	198314	198319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076330
5064	NC_011653	AAT	2	6	198325	198330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076330
5065	NC_011653	CAC	2	6	198362	198367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217076330
5066	NC_011653	T	6	6	198446	198451	0 %	100 %	0 %	0 %	217076331
5067	NC_011653	CTG	2	6	198452	198457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076331
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5069	NC_011653	TAA	2	6	198477	198482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076331
5070	NC_011653	AGT	2	6	198486	198491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076331
5071	NC_011653	CCT	2	6	198505	198510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217076331
5072	NC_011653	CTTC	2	8	198545	198552	0 %	50 %	0 %	50 %	217076331
5073	NC_011653	CTA	2	6	198560	198565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076331
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5080	NC_011653	ACA	2	6	198799	198804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076331
5081	NC_011653	TAC	2	6	198843	198848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076331
5082	NC_011653	CAG	2	6	198854	198859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217076331
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5086	NC_011653	ATTT	2	8	199282	199289	25 %	75 %	0 %	0 %	217076332
5087	NC_011653	TC	3	6	199402	199407	0 %	50 %	0 %	50 %	217076332
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5090	NC_011653	AGT	2	6	199488	199493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217076332
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5094	NC_011653	C	7	7	199632	199638	0 %	0 %	0 %	100 %	217076333
5095	NC_011653	TCA	2	6	199782	199787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076333
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5100	NC_011653	GCTT	2	8	200050	200057	0 %	50 %	25 %	25 %	217076333
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5103	NC_011653	ATT	2	6	200337	200342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217076334
5104	NC_011653	T	7	7	200341	200347	0 %	100 %	0 %	0 %	217076334
5105	NC_011653	TTC	2	6	200354	200359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076334
5106	NC_011653	TTC	2	6	200384	200389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076334
5107	NC_011653	TAA	2	6	200405	200410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217076334
5108	NC_011653	TAAT	2	8	200464	200471	50 %	50 %	0 %	0 %	217076334
5109	NC_011653	T	6	6	200529	200534	0 %	100 %	0 %	0 %	217076334
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5112	NC_011653	AAATTT	2	12	200643	200654	50 %	50 %	0 %	0 %	217076334
5113	NC_011653	T	6	6	200652	200657	0 %	100 %	0 %	0 %	217076334
5114	NC_011653	CAA	2	6	200662	200667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217076334
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5121	NC_011653	ATC	2	6	200852	200857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076334
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5123	NC_011653	GCT	2	6	200892	200897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217076334
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5251	NC_011653	T	6	6	205025	205030	0 %	100 %	0 %	0 %	217076340
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5370	NC_011653	TAC	2	6	209952	209957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076343
5371	NC_011653	TCCA	2	8	210009	210016	25 %	25 %	0 %	50 %	217076343
5372	NC_011653	TCA	2	6	210118	210123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076343
5373	NC_011653	AT	3	6	210143	210148	50 %	50 %	0 %	0 %	217076343
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5375	NC_011653	GAA	2	6	210176	210181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217076343
5376	NC_011653	CAT	2	6	210221	210226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076343
5377	NC_011653	CTT	2	6	210242	210247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217076343
5378	NC_011653	T	7	7	210252	210258	0 %	100 %	0 %	0 %	217076343
5379	NC_011653	CAT	2	6	210281	210286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076343
5380	NC_011653	CAT	2	6	210335	210340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217076343
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