MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 46192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011296	ACAATC	2	12	196249	196260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	206890870
4502	NC_011296	TCT	2	6	196280	196285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890870
4503	NC_011296	CTT	2	6	196295	196300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890870
4504	NC_011296	CGTTC	2	10	196333	196342	0 %	40 %	20 %	40 %	206890870
4505	NC_011296	TTG	2	6	196353	196358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890870
4506	NC_011296	TCT	2	6	196448	196453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890870
4507	NC_011296	A	6	6	196587	196592	100 %	0 %	0 %	0 %	206890870
4508	NC_011296	ATT	2	6	196604	196609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890870
4509	NC_011296	TTC	2	6	196702	196707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890870
4510	NC_011296	CTG	2	6	196710	196715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890870
4511	NC_011296	CAT	2	6	196741	196746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890870
4512	NC_011296	AACTC	2	10	196829	196838	40 %	20 %	0 %	40 %	206890870
4513	NC_011296	TA	3	6	196872	196877	50 %	50 %	0 %	0 %	206890870
4514	NC_011296	TCC	2	6	196885	196890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890870
4515	NC_011296	TCC	2	6	196936	196941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890870
4516	NC_011296	TAAA	2	8	196972	196979	75 %	25 %	0 %	0 %	206890870
4517	NC_011296	GAT	2	6	196980	196985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890870
4518	NC_011296	CTT	2	6	197025	197030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890870
4519	NC_011296	ATT	2	6	197111	197116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890870
4520	NC_011296	T	7	7	197269	197275	0 %	100 %	0 %	0 %	206889735
4521	NC_011296	CAA	2	6	197336	197341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889735
4522	NC_011296	T	6	6	197398	197403	0 %	100 %	0 %	0 %	206889735
4523	NC_011296	GTT	2	6	197422	197427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889735
4524	NC_011296	AGAGCA	2	12	197512	197523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	206889735
4525	NC_011296	CAT	2	6	197543	197548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889735
4526	NC_011296	AAG	2	6	197565	197570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889735
4527	NC_011296	CAA	2	6	197666	197671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889735
4528	NC_011296	TAA	2	6	197680	197685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889735
4529	NC_011296	CTT	2	6	197686	197691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889735
4530	NC_011296	ACC	2	6	197712	197717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206889735
4531	NC_011296	AAGA	2	8	197721	197728	75 %	0 %	25 %	0 %	206889735
4532	NC_011296	ACCA	2	8	197802	197809	50 %	0 %	0 %	50 %	206889735
4533	NC_011296	TCT	2	6	197830	197835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889735
4534	NC_011296	CTA	2	6	197915	197920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889735
4535	NC_011296	TGT	2	6	197976	197981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889735
4536	NC_011296	CT	4	8	198012	198019	0 %	50 %	0 %	50 %	206889735
4537	NC_011296	T	6	6	198066	198071	0 %	100 %	0 %	0 %	206889735
4538	NC_011296	AT	3	6	198120	198125	50 %	50 %	0 %	0 %	206889735
4539	NC_011296	TGTT	2	8	198138	198145	0 %	75 %	25 %	0 %	206889735
4540	NC_011296	AAG	2	6	198150	198155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889735
4541	NC_011296	TTGCC	2	10	198191	198200	0 %	40 %	20 %	40 %	206889735
4542	NC_011296	T	6	6	198201	198206	0 %	100 %	0 %	0 %	206889735
4543	NC_011296	TGC	2	6	198258	198263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889735
4544	NC_011296	AAG	2	6	198267	198272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889735
4545	NC_011296	TGCAT	2	10	198346	198355	20 %	40 %	20 %	20 %	206889735
4546	NC_011296	ATAA	2	8	198366	198373	75 %	25 %	0 %	0 %	206889735
4547	NC_011296	TCT	2	6	198391	198396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889735
4548	NC_011296	GCA	2	6	198427	198432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889735
4549	NC_011296	TGA	2	6	198486	198491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889735
4550	NC_011296	CCT	2	6	198515	198520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889735
4551	NC_011296	ATAA	2	8	198633	198640	75 %	25 %	0 %	0 %	206889735
4552	NC_011296	TCA	2	6	198722	198727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889735
4553	NC_011296	TCTGTG	2	12	198731	198742	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	206889735
4554	NC_011296	GTAA	2	8	198796	198803	50 %	25 %	25 %	0 %	206889735
4555	NC_011296	TGTT	2	8	198867	198874	0 %	75 %	25 %	0 %	206889735
4556	NC_011296	GAG	3	9	199053	199061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890591
4557	NC_011296	TC	3	6	199109	199114	0 %	50 %	0 %	50 %	206890591
4558	NC_011296	AGGG	2	8	199196	199203	25 %	0 %	75 %	0 %	206890591
4559	NC_011296	ATT	2	6	199333	199338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890591
4560	NC_011296	A	7	7	199354	199360	100 %	0 %	0 %	0 %	206890591
4561	NC_011296	TGA	2	6	199499	199504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890271
4562	NC_011296	CTG	2	6	199685	199690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890271
4563	NC_011296	AGTA	2	8	199696	199703	50 %	25 %	25 %	0 %	206890271
4564	NC_011296	A	6	6	199705	199710	100 %	0 %	0 %	0 %	206890271
4565	NC_011296	TGGG	2	8	199779	199786	0 %	25 %	75 %	0 %	206890271
4566	NC_011296	GGT	2	6	199873	199878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890271
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4568	NC_011296	ACT	2	6	199937	199942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890271
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4571	NC_011296	AAG	2	6	200049	200054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890271
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4574	NC_011296	ATT	2	6	200131	200136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890271
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4579	NC_011296	GAATTT	2	12	200335	200346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	206890271
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4589	NC_011296	A	6	6	200860	200865	100 %	0 %	0 %	0 %	206890271
4590	NC_011296	GA	3	6	200882	200887	50 %	0 %	50 %	0 %	206890271
4591	NC_011296	TAAA	2	8	200961	200968	75 %	25 %	0 %	0 %	206890271
4592	NC_011296	AG	4	8	201143	201150	50 %	0 %	50 %	0 %	206889405
4593	NC_011296	ATT	2	6	201244	201249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889405
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4595	NC_011296	CCAG	2	8	201313	201320	25 %	0 %	25 %	50 %	206889405
4596	NC_011296	TGA	2	6	201333	201338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889405
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4598	NC_011296	TAA	2	6	201384	201389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889405
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4602	NC_011296	AAC	2	6	201600	201605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889405
4603	NC_011296	A	7	7	201639	201645	100 %	0 %	0 %	0 %	206889405
4604	NC_011296	TA	3	6	201652	201657	50 %	50 %	0 %	0 %	206889405
4605	NC_011296	ATT	2	6	201676	201681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889405
4606	NC_011296	GAAA	2	8	201763	201770	75 %	0 %	25 %	0 %	206891205
4607	NC_011296	A	7	7	201772	201778	100 %	0 %	0 %	0 %	206891205
4608	NC_011296	A	6	6	201808	201813	100 %	0 %	0 %	0 %	206891205
4609	NC_011296	TGT	2	6	201820	201825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206891205
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4615	NC_011296	TGC	2	6	202202	202207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889969
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4620	NC_011296	A	6	6	202423	202428	100 %	0 %	0 %	0 %	206889969
4621	NC_011296	AGA	2	6	202458	202463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889969
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4623	NC_011296	AAGC	2	8	202490	202497	50 %	0 %	25 %	25 %	206889969
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4752	NC_011296	ATC	2	6	208165	208170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206889920
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4869	NC_011296	CTTT	2	8	213700	213707	0 %	75 %	0 %	25 %	206890226
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4872	NC_011296	AT	3	6	213772	213777	50 %	50 %	0 %	0 %	206890226
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5000	NC_011296	CAG	2	6	218753	218758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890740

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