MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 1229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	ATCGA	2	10	5136	5145	40 %	20 %	20 %	20 %	170287812
2	NC_010483	TCTGC	2	10	8274	8283	0 %	40 %	20 %	40 %	170287816
3	NC_010483	CACCG	2	10	9235	9244	20 %	0 %	20 %	60 %	170287816
4	NC_010483	TTTTA	2	10	9777	9786	20 %	80 %	0 %	0 %	170287817
5	NC_010483	AGAAC	2	10	10554	10563	60 %	0 %	20 %	20 %	170287817
6	NC_010483	AGAGA	2	10	14782	14791	60 %	0 %	40 %	0 %	170287822
7	NC_010483	GCTCA	2	10	15370	15379	20 %	20 %	20 %	40 %	170287823
8	NC_010483	TTTAT	2	10	16367	16376	20 %	80 %	0 %	0 %	170287824
9	NC_010483	CTATA	2	10	17706	17715	40 %	40 %	0 %	20 %	170287825
10	NC_010483	GAAGT	2	10	19023	19032	40 %	20 %	40 %	0 %	170287826
11	NC_010483	AAGGA	2	10	22442	22451	60 %	0 %	40 %	0 %	170287829
12	NC_010483	TTGGG	2	10	23137	23146	0 %	40 %	60 %	0 %	170287831
13	NC_010483	TTGAA	2	10	23880	23889	40 %	40 %	20 %	0 %	170287832
14	NC_010483	TTCAT	2	10	25286	25295	20 %	60 %	0 %	20 %	170287835
15	NC_010483	CATCA	2	10	27695	27704	40 %	20 %	0 %	40 %	170287839
16	NC_010483	TCTGC	2	10	30860	30869	0 %	40 %	20 %	40 %	170287843
17	NC_010483	CTGTC	2	10	31926	31935	0 %	40 %	20 %	40 %	170287844
18	NC_010483	TCCCT	2	10	32992	33001	0 %	40 %	0 %	60 %	170287844
19	NC_010483	AGTTC	2	10	33834	33843	20 %	40 %	20 %	20 %	170287845
20	NC_010483	TGGAA	2	10	35262	35271	40 %	20 %	40 %	0 %	170287847
21	NC_010483	TTACT	2	10	36469	36478	20 %	60 %	0 %	20 %	170287848
22	NC_010483	CGCTC	2	10	38636	38645	0 %	20 %	20 %	60 %	170287850
23	NC_010483	GAGAT	2	10	40286	40295	40 %	20 %	40 %	0 %	170287852
24	NC_010483	ATGGA	2	10	41657	41666	40 %	20 %	40 %	0 %	170287853
25	NC_010483	CTTTT	2	10	46525	46534	0 %	80 %	0 %	20 %	170287858
26	NC_010483	TCTCA	2	10	48025	48034	20 %	40 %	0 %	40 %	170287860
27	NC_010483	CACCT	2	10	48257	48266	20 %	20 %	0 %	60 %	170287861
28	NC_010483	ACCAG	2	10	49139	49148	40 %	0 %	20 %	40 %	170287861
29	NC_010483	GAAGA	2	10	51280	51289	60 %	0 %	40 %	0 %	170287862
30	NC_010483	AGCGG	2	10	51675	51684	20 %	0 %	60 %	20 %	170287862
31	NC_010483	CAGAA	2	10	54532	54541	60 %	0 %	20 %	20 %	170287865
32	NC_010483	CTGAT	2	10	55525	55534	20 %	40 %	20 %	20 %	170287867
33	NC_010483	ACTCC	2	10	60436	60445	20 %	20 %	0 %	60 %	170287873
34	NC_010483	ATCAC	2	10	61067	61076	40 %	20 %	0 %	40 %	170287874
35	NC_010483	CGATC	2	10	61606	61615	20 %	20 %	20 %	40 %	170287874
36	NC_010483	ATCCT	2	10	66048	66057	20 %	40 %	0 %	40 %	170287881
37	NC_010483	ATCCT	2	10	67014	67023	20 %	40 %	0 %	40 %	170287881
38	NC_010483	GCAGA	2	10	67451	67460	40 %	0 %	40 %	20 %	170287882
39	NC_010483	CTTTT	2	10	67770	67779	0 %	80 %	0 %	20 %	170287882
40	NC_010483	CGGAG	2	10	70582	70591	20 %	0 %	60 %	20 %	170287885
41	NC_010483	TCCTT	2	10	72251	72260	0 %	60 %	0 %	40 %	170287886
42	NC_010483	CCTCA	2	10	72359	72368	20 %	20 %	0 %	60 %	170287887
43	NC_010483	CTTTT	2	10	72426	72435	0 %	80 %	0 %	20 %	170287887
44	NC_010483	CTTTC	2	10	75677	75686	0 %	60 %	0 %	40 %	170287891
45	NC_010483	CCTGT	2	10	76640	76649	0 %	40 %	20 %	40 %	170287892
46	NC_010483	TTTCT	2	10	76662	76671	0 %	80 %	0 %	20 %	170287892
47	NC_010483	CATCA	2	10	79057	79066	40 %	20 %	0 %	40 %	170287894
48	NC_010483	TTTCT	2	10	80551	80560	0 %	80 %	0 %	20 %	170287896
49	NC_010483	ACCAC	2	10	84544	84553	40 %	0 %	0 %	60 %	170287899
50	NC_010483	CTGTA	2	10	84706	84715	20 %	40 %	20 %	20 %	170287899
51	NC_010483	CTCTT	2	10	86367	86376	0 %	60 %	0 %	40 %	170287901
52	NC_010483	CCCTG	2	10	86417	86426	0 %	20 %	20 %	60 %	170287901
53	NC_010483	GTGTT	2	10	86786	86795	0 %	60 %	40 %	0 %	170287901
54	NC_010483	CGTGC	2	10	87513	87522	0 %	20 %	40 %	40 %	170287901
55	NC_010483	AAGAA	2	10	91176	91185	80 %	0 %	20 %	0 %	170287906
56	NC_010483	CATCG	2	10	92216	92225	20 %	20 %	20 %	40 %	170287907
57	NC_010483	AGAAA	2	10	93570	93579	80 %	0 %	20 %	0 %	170287908
58	NC_010483	TCGAC	2	10	96836	96845	20 %	20 %	20 %	40 %	170287911
59	NC_010483	ATTCC	2	10	97292	97301	20 %	40 %	0 %	40 %	170287911
60	NC_010483	TGATA	2	10	98682	98691	40 %	40 %	20 %	0 %	170287912
61	NC_010483	TCTGA	2	10	98721	98730	20 %	40 %	20 %	20 %	170287912
62	NC_010483	ATTTC	2	10	99391	99400	20 %	60 %	0 %	20 %	170287913
63	NC_010483	CTTTT	2	10	100315	100324	0 %	80 %	0 %	20 %	170287913
64	NC_010483	AGAGA	2	10	102894	102903	60 %	0 %	40 %	0 %	170287916
65	NC_010483	CGGAA	2	10	103446	103455	40 %	0 %	40 %	20 %	170287916
66	NC_010483	AAAGA	2	10	104140	104149	80 %	0 %	20 %	0 %	170287916
67	NC_010483	GAAGA	2	10	104181	104190	60 %	0 %	40 %	0 %	170287916
68	NC_010483	TTTCC	2	10	104940	104949	0 %	60 %	0 %	40 %	170287917
69	NC_010483	GAGAA	2	10	108554	108563	60 %	0 %	40 %	0 %	170287920
70	NC_010483	GAACA	2	10	109740	109749	60 %	0 %	20 %	20 %	170287922
71	NC_010483	TCCAG	2	10	111425	111434	20 %	20 %	20 %	40 %	170287923
72	NC_010483	TCACT	2	10	112235	112244	20 %	40 %	0 %	40 %	170287924
73	NC_010483	GTGAG	2	10	112753	112762	20 %	20 %	60 %	0 %	170287924
74	NC_010483	TTTCG	2	10	115392	115401	0 %	60 %	20 %	20 %	170287927
75	NC_010483	TAGAA	2	10	116116	116125	60 %	20 %	20 %	0 %	170287927
76	NC_010483	AAAAG	2	10	119450	119459	80 %	0 %	20 %	0 %	170287928
77	NC_010483	GGGTT	2	10	119652	119661	0 %	40 %	60 %	0 %	170287929
78	NC_010483	GGTGC	2	10	120210	120219	0 %	20 %	60 %	20 %	170287930
79	NC_010483	TCCTT	2	10	121250	121259	0 %	60 %	0 %	40 %	170287930
80	NC_010483	CCTGC	2	10	121461	121470	0 %	20 %	20 %	60 %	170287930
81	NC_010483	TTCCC	2	10	121686	121695	0 %	40 %	0 %	60 %	170287930
82	NC_010483	CTTCT	2	10	122343	122352	0 %	60 %	0 %	40 %	170287931
83	NC_010483	GCGGT	2	10	122576	122585	0 %	20 %	60 %	20 %	170287931
84	NC_010483	AAAGA	2	10	124151	124160	80 %	0 %	20 %	0 %	170287933
85	NC_010483	CGTCG	2	10	125514	125523	0 %	20 %	40 %	40 %	170287935
86	NC_010483	TACCA	2	10	126511	126520	40 %	20 %	0 %	40 %	170287936
87	NC_010483	CAGAC	2	10	130883	130892	40 %	0 %	20 %	40 %	170287939
88	NC_010483	CCTAT	2	10	131243	131252	20 %	40 %	0 %	40 %	170287940
89	NC_010483	CGATA	2	10	132327	132336	40 %	20 %	20 %	20 %	170287941
90	NC_010483	TTTCT	2	10	133912	133921	0 %	80 %	0 %	20 %	170287943
91	NC_010483	GAAAA	2	10	141320	141329	80 %	0 %	20 %	0 %	170287953
92	NC_010483	TGTGG	2	10	141444	141453	0 %	40 %	60 %	0 %	170287953
93	NC_010483	ACCGC	2	10	142690	142699	20 %	0 %	20 %	60 %	170287956
94	NC_010483	GAAGA	2	10	143121	143130	60 %	0 %	40 %	0 %	170287956
95	NC_010483	AAAGA	2	10	143330	143339	80 %	0 %	20 %	0 %	170287956
96	NC_010483	AGCAG	2	10	143546	143555	40 %	0 %	40 %	20 %	170287956
97	NC_010483	TTTTC	2	10	145751	145760	0 %	80 %	0 %	20 %	170287957
98	NC_010483	TCATC	2	10	146901	146910	20 %	40 %	0 %	40 %	170287960
99	NC_010483	GCGGA	2	10	148566	148575	20 %	0 %	60 %	20 %	170287962
100	NC_010483	AGGAA	2	10	152850	152859	60 %	0 %	40 %	0 %	170287965
101	NC_010483	CTCTT	2	10	153377	153386	0 %	60 %	0 %	40 %	170287965
102	NC_010483	GAAAT	2	10	154018	154027	60 %	20 %	20 %	0 %	170287965
103	NC_010483	AGAGG	2	10	154561	154570	40 %	0 %	60 %	0 %	170287966
104	NC_010483	AACGA	2	10	155800	155809	60 %	0 %	20 %	20 %	170287968
105	NC_010483	CCCAG	2	10	158598	158607	20 %	0 %	20 %	60 %	170287971
106	NC_010483	TTATC	2	10	159365	159374	20 %	60 %	0 %	20 %	170287972
107	NC_010483	ATCTC	2	10	164335	164344	20 %	40 %	0 %	40 %	170287975
108	NC_010483	AGAAA	2	10	164700	164709	80 %	0 %	20 %	0 %	170287975
109	NC_010483	GAAAA	2	10	168722	168731	80 %	0 %	20 %	0 %	170287979
110	NC_010483	GAAAA	2	10	169722	169731	80 %	0 %	20 %	0 %	170287980
111	NC_010483	GAGAA	2	10	172305	172314	60 %	0 %	40 %	0 %	170287982
112	NC_010483	GATGT	2	10	173334	173343	20 %	40 %	40 %	0 %	170287982
113	NC_010483	CGTGT	2	10	173874	173883	0 %	40 %	40 %	20 %	170287983
114	NC_010483	AGGGA	2	10	174536	174545	40 %	0 %	60 %	0 %	170287984
115	NC_010483	GAGCA	2	10	177096	177105	40 %	0 %	40 %	20 %	170287987
116	NC_010483	TGAGG	2	10	177649	177658	20 %	20 %	60 %	0 %	170287988
117	NC_010483	GAAAA	2	10	178226	178235	80 %	0 %	20 %	0 %	170287989
118	NC_010483	CTTTC	2	10	179394	179403	0 %	60 %	0 %	40 %	170287990
119	NC_010483	GAAAA	2	10	180675	180684	80 %	0 %	20 %	0 %	170287992
120	NC_010483	GAAAA	2	10	180903	180912	80 %	0 %	20 %	0 %	170287992
121	NC_010483	ACCTC	2	10	181381	181390	20 %	20 %	0 %	60 %	170287992
122	NC_010483	TCCGA	2	10	183587	183596	20 %	20 %	20 %	40 %	170287994
123	NC_010483	AAGTG	2	10	184085	184094	40 %	20 %	40 %	0 %	170287995
124	NC_010483	CTTTC	2	10	185314	185323	0 %	60 %	0 %	40 %	170287996
125	NC_010483	TTCCC	2	10	188037	188046	0 %	40 %	0 %	60 %	170287998
126	NC_010483	AGAAA	2	10	188121	188130	80 %	0 %	20 %	0 %	170287998
127	NC_010483	TCCTG	2	10	191035	191044	0 %	40 %	20 %	40 %	170288003
128	NC_010483	TTCCT	2	10	191408	191417	0 %	60 %	0 %	40 %	170288003
129	NC_010483	GTGCA	2	10	193670	193679	20 %	20 %	40 %	20 %	170288004
130	NC_010483	TCGGT	2	10	197722	197731	0 %	40 %	40 %	20 %	170288007
131	NC_010483	AAGAA	2	10	197883	197892	80 %	0 %	20 %	0 %	170288008
132	NC_010483	CCCTT	2	10	199216	199225	0 %	40 %	0 %	60 %	170288010
133	NC_010483	GTGAA	2	10	199588	199597	40 %	20 %	40 %	0 %	170288010
134	NC_010483	CTCTT	2	10	201140	201149	0 %	60 %	0 %	40 %	170288010
135	NC_010483	CCGTT	2	10	201989	201998	0 %	40 %	20 %	40 %	170288012
136	NC_010483	CTCTT	2	10	205279	205288	0 %	60 %	0 %	40 %	170288015
137	NC_010483	ACCTC	2	10	205738	205747	20 %	20 %	0 %	60 %	170288017
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139	NC_010483	AAGAT	2	10	207481	207490	60 %	20 %	20 %	0 %	170288018
140	NC_010483	TCGTT	2	10	207540	207549	0 %	60 %	20 %	20 %	170288018
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143	NC_010483	GGAAA	2	10	210790	210799	60 %	0 %	40 %	0 %	170288020
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145	NC_010483	CTGAG	3	15	212568	212582	20 %	20 %	40 %	20 %	170288022
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147	NC_010483	TTCTT	2	10	214192	214201	0 %	80 %	0 %	20 %	170288024
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149	NC_010483	CCGTG	2	10	218094	218103	0 %	20 %	40 %	40 %	170288027
150	NC_010483	TGAGT	2	10	219487	219496	20 %	40 %	40 %	0 %	170288029
151	NC_010483	TCTCA	2	10	222256	222265	20 %	40 %	0 %	40 %	170288031
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157	NC_010483	CTTTT	2	10	229202	229211	0 %	80 %	0 %	20 %	170288042
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167	NC_010483	TCTGA	2	10	251072	251081	20 %	40 %	20 %	20 %	170288066
168	NC_010483	GTGTT	2	10	251892	251901	0 %	60 %	40 %	0 %	170288067
169	NC_010483	TCGAT	2	10	252277	252286	20 %	40 %	20 %	20 %	170288067
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171	NC_010483	TATCA	2	10	253368	253377	40 %	40 %	0 %	20 %	170288069
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177	NC_010483	TCCTC	2	10	262350	262359	0 %	40 %	0 %	60 %	170288081
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192	NC_010483	AATCT	2	10	284618	284627	40 %	40 %	0 %	20 %	170288103
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201	NC_010483	GATCA	2	10	295758	295767	40 %	20 %	20 %	20 %	170288113
202	NC_010483	AGAAA	2	10	298781	298790	80 %	0 %	20 %	0 %	170288116
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234	NC_010483	TGCTC	2	10	347617	347626	0 %	40 %	20 %	40 %	170288162
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249	NC_010483	ATCTT	2	10	373914	373923	20 %	60 %	0 %	20 %	170288186
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252	NC_010483	GAATC	2	10	378645	378654	40 %	20 %	20 %	20 %	170288190
253	NC_010483	TTATC	2	10	378798	378807	20 %	60 %	0 %	20 %	170288190
254	NC_010483	GAAAT	2	10	379223	379232	60 %	20 %	20 %	0 %	170288191
255	NC_010483	ATCTC	2	10	379457	379466	20 %	40 %	0 %	40 %	170288191
256	NC_010483	GAACG	2	10	379608	379617	40 %	0 %	40 %	20 %	170288191
257	NC_010483	AAGGG	2	10	380014	380023	40 %	0 %	60 %	0 %	170288191
258	NC_010483	TCCCT	2	10	386519	386528	0 %	40 %	0 %	60 %	170288197
259	NC_010483	CGAAA	2	10	387746	387755	60 %	0 %	20 %	20 %	170288199
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261	NC_010483	GATCC	2	10	390171	390180	20 %	20 %	20 %	40 %	170288201
262	NC_010483	GCTTT	2	10	391130	391139	0 %	60 %	20 %	20 %	170288201
263	NC_010483	AGATG	2	10	395996	396005	40 %	20 %	40 %	0 %	170288206
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