MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 25200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010483	GTC	2	6	164	169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287808
2	NC_010483	GAA	2	6	208	213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287808
3	NC_010483	TAT	2	6	215	220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287808
4	NC_010483	CTC	2	6	301	306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287808
5	NC_010483	GAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287808
6	NC_010483	TCG	2	6	381	386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287808
7	NC_010483	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170287808
8	NC_010483	TCT	2	6	496	501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287808
9	NC_010483	CGT	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287808
10	NC_010483	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287808
11	NC_010483	AAG	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287808
12	NC_010483	TTC	2	6	651	656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287808
13	NC_010483	GAA	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287808
14	NC_010483	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287808
15	NC_010483	CAT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287808
16	NC_010483	TCG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287808
17	NC_010483	CGT	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287808
18	NC_010483	CTC	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287808
19	NC_010483	CTC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287809
20	NC_010483	AGA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287809
21	NC_010483	CTT	2	6	1565	1570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287809
22	NC_010483	ACG	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287809
23	NC_010483	TTC	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287809
24	NC_010483	TGT	2	6	2011	2016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287809
25	NC_010483	AAC	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287809
26	NC_010483	TCT	2	6	2159	2164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287809
27	NC_010483	ACC	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287809
28	NC_010483	CTT	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287810
29	NC_010483	ATG	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287810
30	NC_010483	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287810
31	NC_010483	TCC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287810
32	NC_010483	ACA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287810
33	NC_010483	AGA	2	6	2873	2878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287810
34	NC_010483	GAA	2	6	3029	3034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287810
35	NC_010483	ACG	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287810
36	NC_010483	CTT	2	6	3127	3132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287810
37	NC_010483	CGT	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287811
38	NC_010483	GAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287811
39	NC_010483	CTC	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287811
40	NC_010483	GTA	3	9	3255	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287811
41	NC_010483	TCT	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287811
42	NC_010483	AAC	2	6	3444	3449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287811
43	NC_010483	AGA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287811
44	NC_010483	TTG	2	6	3755	3760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287811
45	NC_010483	AAG	2	6	3765	3770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287811
46	NC_010483	AAG	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287811
47	NC_010483	CTT	2	6	4031	4036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287811
48	NC_010483	TGA	2	6	4247	4252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287811
49	NC_010483	CCT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
50	NC_010483	TCC	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
51	NC_010483	CCA	2	6	4518	4523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287812
52	NC_010483	TGG	3	9	4534	4542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287812
53	NC_010483	CTC	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
54	NC_010483	GAA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287812
55	NC_010483	TAT	2	6	5039	5044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287812
56	NC_010483	AAC	2	6	5321	5326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287812
57	NC_010483	TAT	2	6	5354	5359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287812
58	NC_010483	ACC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287812
59	NC_010483	TCC	2	6	5468	5473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
60	NC_010483	GAG	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287812
61	NC_010483	TCC	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
62	NC_010483	GTT	2	6	5597	5602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287812
63	NC_010483	TCC	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
64	NC_010483	TCC	3	9	5652	5660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287812
65	NC_010483	AAC	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287812
66	NC_010483	TCA	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287812
67	NC_010483	AGC	2	6	5878	5883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287813
68	NC_010483	ATG	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287813
69	NC_010483	CTT	2	6	6010	6015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287813
70	NC_010483	GAA	2	6	6071	6076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287813
71	NC_010483	ATC	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287813
72	NC_010483	TAA	2	6	6167	6172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170287813
73	NC_010483	CTC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287813
74	NC_010483	TCT	2	6	6278	6283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287814
75	NC_010483	TTC	2	6	6354	6359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287814
76	NC_010483	GCC	2	6	6417	6422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287814
77	NC_010483	TCT	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287814
78	NC_010483	GTA	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287814
79	NC_010483	GTT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287814
80	NC_010483	AGG	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287814
81	NC_010483	GGC	2	6	6706	6711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170287814
82	NC_010483	GGT	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287814
83	NC_010483	TCC	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287814
84	NC_010483	TCG	2	6	7159	7164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287814
85	NC_010483	ATC	2	6	7179	7184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287814
86	NC_010483	GAA	2	6	7204	7209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287814
87	NC_010483	TAC	2	6	7221	7226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287814
88	NC_010483	AAG	2	6	7242	7247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287814
89	NC_010483	CTA	2	6	7250	7255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287814
90	NC_010483	TCC	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287814
91	NC_010483	GAA	2	6	7367	7372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287815
92	NC_010483	TTC	2	6	7507	7512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287815
93	NC_010483	CTT	2	6	7668	7673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287815
94	NC_010483	CAT	2	6	7720	7725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287815
95	NC_010483	GCA	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170287816
96	NC_010483	TCT	2	6	7856	7861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
97	NC_010483	TCT	2	6	7940	7945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
98	NC_010483	TCT	2	6	8003	8008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
99	NC_010483	CTT	2	6	8043	8048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
100	NC_010483	TCT	2	6	8150	8155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
101	NC_010483	GCT	2	6	8237	8242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287816
102	NC_010483	CTG	2	6	8364	8369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287816
103	NC_010483	CTC	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287816
104	NC_010483	CTT	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
105	NC_010483	TGT	2	6	8547	8552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170287816
106	NC_010483	TCT	2	6	8568	8573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
107	NC_010483	CTT	2	6	8577	8582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
108	NC_010483	TCT	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
109	NC_010483	ATG	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170287816
110	NC_010483	ATC	2	6	8681	8686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287816
111	NC_010483	CTT	2	6	8706	8711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
112	NC_010483	CTG	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170287816
113	NC_010483	CAT	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170287816
114	NC_010483	CGC	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287816
115	NC_010483	AAG	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287816
116	NC_010483	TCT	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
117	NC_010483	GCC	2	6	9070	9075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170287816
118	NC_010483	AAG	2	6	9145	9150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287816
119	NC_010483	TCC	2	6	9175	9180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287816
120	NC_010483	AAC	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287816
121	NC_010483	GAA	3	9	9377	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287816
122	NC_010483	CTT	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170287816
123	NC_010483	GAG	2	6	9520	9525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287816
124	NC_010483	AAT	2	6	9591	9596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170287816
125	NC_010483	CAA	2	6	9642	9647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287816
126	NC_010483	AAC	2	6	9703	9708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287816
127	NC_010483	CAA	2	6	9797	9802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170287817
128	NC_010483	ACC	2	6	9838	9843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170287817
129	NC_010483	TTA	2	6	9856	9861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170287817
130	NC_010483	GAA	2	6	9936	9941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170287817
131	NC_010483	TCC	2	6	10094	10099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170287817
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256	NC_010483	TGG	2	6	18753	18758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170287826
257	NC_010483	GAG	2	6	18891	18896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170287826
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