MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 38800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010483	CTT	2	6	189507	189512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288000
4002	NC_010483	GAA	2	6	189531	189536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288000
4003	NC_010483	CGA	2	6	189555	189560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288000
4004	NC_010483	TCG	2	6	189584	189589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288000
4005	NC_010483	CTT	2	6	189783	189788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288001
4006	NC_010483	AGT	2	6	189814	189819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288001
4007	NC_010483	TCTG	2	8	189820	189827	0 %	50 %	25 %	25 %	170288001
4008	NC_010483	CCT	2	6	189859	189864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288001
4009	NC_010483	CTC	2	6	189871	189876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288001
4010	NC_010483	GAA	3	9	189893	189901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288001
4011	NC_010483	TTC	2	6	189917	189922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288001
4012	NC_010483	ATC	2	6	189945	189950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288001
4013	NC_010483	TTC	2	6	189957	189962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288001
4014	NC_010483	AAG	2	6	189974	189979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288001
4015	NC_010483	CTT	2	6	190015	190020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288001
4016	NC_010483	AAG	2	6	190034	190039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288001
4017	NC_010483	TGC	2	6	190066	190071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288001
4018	NC_010483	TCT	2	6	190122	190127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288001
4019	NC_010483	CTT	2	6	190191	190196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288001
4020	NC_010483	AGG	2	6	190211	190216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288001
4021	NC_010483	AGA	2	6	190237	190242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288001
4022	NC_010483	AGA	2	6	190322	190327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288002
4023	NC_010483	GAA	2	6	190343	190348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288002
4024	NC_010483	AAG	2	6	190493	190498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288002
4025	NC_010483	ACA	2	6	190543	190548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288002
4026	NC_010483	GA	3	6	190576	190581	50 %	0 %	50 %	0 %	170288002
4027	NC_010483	GCCA	2	8	190633	190640	25 %	0 %	25 %	50 %	170288002
4028	NC_010483	TCT	3	9	190648	190656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288002
4029	NC_010483	CAA	2	6	190676	190681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288002
4030	NC_010483	TTC	2	6	190716	190721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288002
4031	NC_010483	ACC	2	6	190729	190734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288002
4032	NC_010483	CT	3	6	190748	190753	0 %	50 %	0 %	50 %	170288002
4033	NC_010483	CAC	2	6	190772	190777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288003
4034	NC_010483	ACG	2	6	190869	190874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288003
4035	NC_010483	TTC	2	6	190880	190885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4036	NC_010483	T	7	7	190956	190962	0 %	100 %	0 %	0 %	170288003
4037	NC_010483	ACC	2	6	190974	190979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288003
4038	NC_010483	TCCTG	2	10	191035	191044	0 %	40 %	20 %	40 %	170288003
4039	NC_010483	TTC	2	6	191052	191057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4040	NC_010483	CCT	2	6	191072	191077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288003
4041	NC_010483	CTAT	2	8	191166	191173	25 %	50 %	0 %	25 %	170288003
4042	NC_010483	TCT	3	9	191206	191214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4043	NC_010483	T	6	6	191241	191246	0 %	100 %	0 %	0 %	170288003
4044	NC_010483	TGC	2	6	191281	191286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288003
4045	NC_010483	GAA	2	6	191303	191308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288003
4046	NC_010483	TTCC	2	8	191344	191351	0 %	50 %	0 %	50 %	170288003
4047	NC_010483	CTT	2	6	191362	191367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4048	NC_010483	TTCCT	2	10	191408	191417	0 %	60 %	0 %	40 %	170288003
4049	NC_010483	TCT	2	6	191456	191461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4050	NC_010483	TTG	2	6	191529	191534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288003
4051	NC_010483	ATT	2	6	191538	191543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288003
4052	NC_010483	CAA	2	6	191545	191550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288003
4053	NC_010483	TG	3	6	191630	191635	0 %	50 %	50 %	0 %	170288003
4054	NC_010483	TTCT	2	8	191729	191736	0 %	75 %	0 %	25 %	170288003
4055	NC_010483	CT	3	6	191793	191798	0 %	50 %	0 %	50 %	170288003
4056	NC_010483	CTTT	2	8	191829	191836	0 %	75 %	0 %	25 %	170288003
4057	NC_010483	TG	3	6	191936	191941	0 %	50 %	50 %	0 %	170288003
4058	NC_010483	GAGC	2	8	191942	191949	25 %	0 %	50 %	25 %	170288003
4059	NC_010483	TGT	2	6	192013	192018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288003
4060	NC_010483	GGT	2	6	192044	192049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288003
4061	NC_010483	TTC	2	6	192092	192097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4062	NC_010483	T	6	6	192101	192106	0 %	100 %	0 %	0 %	170288003
4063	NC_010483	TCC	2	6	192124	192129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288003
4064	NC_010483	TAA	2	6	192138	192143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288003
4065	NC_010483	TC	4	8	192231	192238	0 %	50 %	0 %	50 %	170288003
4066	NC_010483	CGA	2	6	192253	192258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288003
4067	NC_010483	TCC	2	6	192279	192284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288003
4068	NC_010483	CTT	2	6	192395	192400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4069	NC_010483	TGT	2	6	192433	192438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288003
4070	NC_010483	TCT	2	6	192477	192482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4071	NC_010483	T	6	6	192499	192504	0 %	100 %	0 %	0 %	170288003
4072	NC_010483	TCT	2	6	192517	192522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288003
4073	NC_010483	TGC	2	6	192559	192564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288003
4074	NC_010483	TTCT	2	8	192611	192618	0 %	75 %	0 %	25 %	170288003
4075	NC_010483	GAG	2	6	192809	192814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288003
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4078	NC_010483	T	8	8	192840	192847	0 %	100 %	0 %	0 %	170288003
4079	NC_010483	CT	3	6	192860	192865	0 %	50 %	0 %	50 %	170288003
4080	NC_010483	CT	3	6	193304	193309	0 %	50 %	0 %	50 %	170288004
4081	NC_010483	TCA	2	6	193315	193320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288004
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4086	NC_010483	GTGCA	2	10	193670	193679	20 %	20 %	40 %	20 %	170288004
4087	NC_010483	AAG	2	6	193811	193816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288004
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4092	NC_010483	AGA	2	6	194206	194211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288005
4093	NC_010483	TC	3	6	194258	194263	0 %	50 %	0 %	50 %	170288005
4094	NC_010483	CTC	2	6	194357	194362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288005
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4102	NC_010483	GT	3	6	194948	194953	0 %	50 %	50 %	0 %	170288005
4103	NC_010483	TGA	2	6	194957	194962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288005
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4105	NC_010483	TTA	2	6	194969	194974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288005
4106	NC_010483	AG	3	6	195072	195077	50 %	0 %	50 %	0 %	170288005
4107	NC_010483	ACGT	2	8	195094	195101	25 %	25 %	25 %	25 %	170288005
4108	NC_010483	GAA	2	6	195132	195137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288005
4109	NC_010483	TTCT	2	8	195141	195148	0 %	75 %	0 %	25 %	170288005
4110	NC_010483	GAAC	2	8	195380	195387	50 %	0 %	25 %	25 %	170288005
4111	NC_010483	ATCT	2	8	195389	195396	25 %	50 %	0 %	25 %	170288005
4112	NC_010483	TTC	2	6	195402	195407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288005
4113	NC_010483	C	6	6	195425	195430	0 %	0 %	0 %	100 %	170288006
4114	NC_010483	TAC	2	6	195431	195436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288006
4115	NC_010483	GAAC	2	8	195491	195498	50 %	0 %	25 %	25 %	170288006
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4118	NC_010483	TCT	2	6	195544	195549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288006
4119	NC_010483	TCCT	2	8	195604	195611	0 %	50 %	0 %	50 %	170288006
4120	NC_010483	GAT	2	6	195719	195724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288006
4121	NC_010483	TTC	2	6	195725	195730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288006
4122	NC_010483	GGT	2	6	195733	195738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288006
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4124	NC_010483	TCT	2	6	195800	195805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288006
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4245	NC_010483	GAG	2	6	201534	201539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288011
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4248	NC_010483	CCT	2	6	201738	201743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288011
4249	NC_010483	GAG	3	9	201775	201783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288011
4250	NC_010483	TC	3	6	201789	201794	0 %	50 %	0 %	50 %	170288011
4251	NC_010483	TC	3	6	201833	201838	0 %	50 %	0 %	50 %	170288011
4252	NC_010483	GAT	2	6	201867	201872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288011
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4364	NC_010483	TGA	2	6	206429	206434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288017
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4491	NC_010483	ACC	2	6	211874	211879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288021
4492	NC_010483	GAT	2	6	211896	211901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288021
4493	NC_010483	GCC	2	6	211953	211958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288021
4494	NC_010483	CTC	2	6	211966	211971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288021
4495	NC_010483	CCG	2	6	211972	211977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288021
4496	NC_010483	AAG	2	6	212014	212019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288022
4497	NC_010483	AGA	2	6	212033	212038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288022
4498	NC_010483	TTC	2	6	212104	212109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288022
4499	NC_010483	AG	3	6	212140	212145	50 %	0 %	50 %	0 %	170288022
4500	NC_010483	TCT	2	6	212154	212159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288022

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